ZS6 Flashcards
Verschil tussen eukaryote en prokaryote transcriptie regulatie
- eukaryoten hebben geen operons
Prokaryotic transcription and translation occur simultaneously in the cytoplasm, and regulation occurs at the transcriptional level. Eukaryotic gene expression is regulated during transcription and RNA processing, which take place in the nucleus, and during protein translation, which takes place in the cytoplasm. Further regulation may occur through post-translational modifications of proteins
Gene expression is regulated at many levels (epigenetic, transcriptional, nuclear shuttling, post-transcriptional, translational, and post-translational)
Combinatoire controle
in eukaryote en multicellularie organismes, wordt transcriptie van genen gereguleerd oor veel factoren.
vb: meer dan één activator/repressor eiwit nodig
binding van small effector moleculen nodig
eiwit-eiwit interactie nodig ,….
Geef de componenten van eukaryote promoters
- regulatoire elementen .
- >
- TATA box ( 5’ tataaa 3’) 50-100 bp downstream van regulatoire elementen
- >
- transcriptie start site (25 bp downstrem van tata)
core promotor = tata box + trancriptionele start site. Deze heeft een basale trancriptie, wanneer de enhancer niet actief is
TATA box
- onderdeel van promotor
- 25bp upstrem van transcriptie start site
*bepaalt de startpunt voor transcriptie
The core promotor
TATA box + transcription start site
*zorgt zonder activatie door enhancer voor een basale trancriptie
Transcription start site
*onderdeel van promotor
25 bp verder van TATA box
*tata bepaalt de transcription start site .indien afwezig -> transcriptie beging in radom locaties
Regulatorische elementen
- enhancers en silencers
- vaak 50 tot 100bp upstream van transcriptie start site
*herkend door regulatorische transcriptie factoren (activators en repressors) die initiatie stap van RNA polymerase kunnen beinvloeden
RNA polymerase II
*leest structurele genen af die mRNA maken
Leg uit:
Pre-initiatie complex
en
General transcriptionfactors (GTFs)
*Drie types van eiwitten initieren trancriptie in structurele genen
: RNA polymerase II + general transcriptionfactors (GTFs ) + eiwit complex genaamd mediator
de preinitiatie complex:
*RNA polymerase II en GTFs komen samen op de tatabox. Hierna kan RNA polymerase II binden op de transcriptie startsite
- mediator wikkelt zich rond het pre-initiatie complex en medieert een interactie tussen het pre-initatiecompelx en de regulatorische transcriptiefactoren op de enhancer.
https: //www.youtube.com/watch?v=fXHzI89hPQo&ab_channel=MarissaSarna-Mccarthy
Co-activator
interageert met activator , en zorgen indirect voor verhoogde transcriptie. Binden niet op dna
(vb: small effector molecule)
Allosteric effectors can bind to regulatory proteins involved in RNA transcription in order to change its activity.[1] In this way activator proteins become active to bind to the DNA to promote RNA Polymerase and repressor proteins become inactive and RNA polymerase can bind to the DNA.
https://www.freezingblue.com/flashcards/print_preview.cgi?cardsetID=164362
What is a corepressor?
small molecule tht binds to repressor protein causing the protein to bind to DNA
What is an inhibitor?
small molecule that binds to activator protein preventing it from binding to the DNA
activator
binden op enhancers.
Wanneer een activator bindt op de enhancer, zal het effect hebben op de functie van de GTFs
vb: TFIID is een GTF (general TF). en activator zou de functie van TFIID kunnen verbeteren, zoadt het beter de tata box herkent, en de assembly sneller verloopt
TFIID
- een GTF (general transcription factor)
- herkent de TATA box
- wanneer een activator bindt op de tatabox, kan TFIID de tatabox sneller vinde, , zoadat het preinitiatie complex sneller vormt.
repressors kunnen het omgekeerde doen.
Mediator
- eiwit complex
- wikkelt rond pre-initiatie complex
- medieert de interactie tussen het pre-initatie compelx en de regulatorische TF gebonden op de op de enhancer/silencer
zo kan de werking van rna polymerase beinvloed worden
