ZS1 en ZS2 : DNA en RNA replicatie Flashcards
origin of replication
-site in een chromosoom die dient als startpunt van DNA replicatie
-gezien eukaryoten geen plasmiden hebben die voldoende hebben aan 1 replicatie vork, zijn er multipele origins of replications.
De replicatie proces bezig in de verschillende origins of replications kunnen samengevoegd worden wanneer ze contact maken
replicatie vork
De replicatie vork is de plaats waar dna ontbonden wordt .
ontbinding gebeurt door DNA helicase. Deze zal bewegen van 5’ naar 3’, richting de replicatie vork
DNA-helicase
ontbinding gebeurt door DNA helicase. Deze zal bewegen van 5’ naar 3’, richting de replicatie vork. Bij het ontbinden zal er een supercoil ontstaan die door dna topoisomerase ontwonden wordt
topoisomerase
ontwindt de supercoil die ontstaat wanneer helicase de dna streng opent
single-strand binding proteins
wanneer helicase het dna opent ,zullen single-strand binding eiwitten vinden op de enkelvoudige strengen, zodat ze niet terug basenparen
werking DNA polymerase
vrije nucleotiden met 3 fosfaatgroepen, genaamd deoxynucloside trifosfaat , zal basenparen met de AT/GC regel (waterstofbruggen) aan de basen die uitsteken van de enkelvoudige streng.
dna polymerase breekt vervolgens de binding tussen de eerste en tweede fosfaat van de dntp.
De pyrofosfaat die vrijkomt dient als energie. De fosfaatgroep achtergebleven op de base zal door polymerase gebonden worden aan de 3’ uiteinde van de groeiende streng door een fosfodiexter binding
DNA primase
legt een primer aan
primer = 10-12 bp lange RNA segment.
komt enkel voor bij bacterien.
Mensen hebben geen primasen. DNA polymerase alfa heeft zijn eigen primase functie
DNA polymerase III
synthetiseert de leading en lagging strand in prokaryoten
DNA polymerase I
verwijdert RNA primers van de leading en lagging strands, en maakt de enkelstrengige regios teurg dubbelstrengig
*in eukaryoten : exonuclease verwijdert de primers aangelegd door primase. Vervolgens komt polymerase alfa het dubbelstrengig maken, en ligase zal de backbone herstellen.
dna ligase
maakt een covalente binding tussen OKAZAKI fragmenten van de lagging strand
DNA ligase is an enzyme which can connect two strands of DNA together by forming a bond between the phosphate group of one strand and the deoxyribose group on another. It is used in cells to join together the Okazaki fragments which are formed on the lagging strand during DNA replication.
structurele gen
maakt mRNA -> eiwit
trancriptie door RNA polymerase II
*bacterien hebben slechts 1 soort RNA polymerase
non-structurele gen
maakt functionele RNA (vb tRNA en rRNA)
transcriptie door RNA polymerase I en III
*bacterien hebben slechts 1 soort RNA polymerase
Waar begint en eindigt transcriptie?
promotor en terminator
wat is sigmafactor
In bacterien zal het sigmafactor de promotor sequentie . Dankzij het sigma factor zal RNA polymerase de promotor herkenne, en daar binden
In de mens worden de general transcription factors gebruikt om RNA transcriptie te initieren.
(compelx van 5 TF)
Bespreek transcriptie in prokaryoten
initiatie : dna streng open thv de promotor. Sigmafactor is gebonden op de promotor
elongatie: RNA-polymerase herkent de promotor dankzij de sigmafactor, en synthetiseert het RNA transcript.
De streng die afgelezen wordt= template strand
Niet afgelezen = coding strand
eens RNA polymerase botst op de terminator ,zal het ontkoppelen
