Wykład 5 I 6 Flashcards
Co powstaje w wyniku transkrypcji
1-niciowy RNA, w którym sekwencja zasad odpowiada sekwencji DNA nici kodującej, tymina zamienią się w uracyl.
mRNA
Informacyjny lub matrycowy RNA, koduje białka
rRNA
Rybosomalny RNA, formuje podstawową strukturę rybosomu i katalizuje syntezę białka
tRNA
Tranaportowy RNA, kluczowy dla syntezy białek, adaptor pomiędzy mRNA i aminokwasami
snRNA
Mały jądrowy RNA, udział m.in. w obróbce potranskrypcyjnej, wycinaniu intronów z transkryptów
snoRNA
Mały jaderkowy RNA, wpływa na modyfikacje pre-mRNA i rRNA
miRNA
Mikro RNA, reguluje ekspresję genów poprzez blokadę translacji i degraduje specyficzne mRNA
siRNA
Małe interferujące RNA, wyłącza ekspresję genów poprzez degradacje selektywnych mRNA i zagęszczanie chromatyny
piRNA
RNA oddziałujące z białkami PIWI k. Macierzystych i rozrodczych, np. Protekcja przed transpozonami
lncRNA
Długie niekodujące RNA, reguluje strukturę chromosomow, transkrypcje genów, stabilność i translację mRNA oraz modyfikacje post-translacyjne
Inicjacja transkrypcji
1.TFII D wiąże krótka sekwencje TATA
2. TBP, będące podjednostką TFII D wiąże TATA box
3. Załamanie helisy DNA powoduje że jest ona łatwiej dostępna dla innych czynników transkrypcyjnych.
4. W wyniku wiązania kolejnych TFII powstaje kompleks inicjujący transkrypcje
5. TFII H obejmuje helikazę DNA, która rozkręca helisę DNA z udziałem ATP eksponując nić matrycową do syntezy RNA
6. Polimeraza RNA II po przyłączeniu do DNA jest fosforylowana na swoim ogonie i rozpoczyna się Synteza.
Jakie polimerazy RNA nie dodają czapki 5’
Polimeraza RNA I oraz III
Czapka 5’
Przyłączona 5’-5’-trójfosforanowym wiązaniem do końca 5’ łańcucha RNA. Wspomaga dalsze procesowanie i eksportowanie z jądra mRNA, istotna w translacji.
Splicing pre-mRNA
Wycinanie intronów i łączenie eksonów. Intron aby ulec wycięciu musi posiadać miejsce donorowe, czyli sekwencję GU na końcu 5’. Miejsce akceptorowe czyli sekwencje AG na końcu 3’ oraz miejsce rozgałęzienia w którym znajduje się nukleotyf adeninowy
Poliadenylacja 3’
Polimeraza RNA II rozpoznaje specyficzną sekwencje poliadenylacji AAUAAA. Niektóre białka związane z ogonem Polimerazy II wiaza się do tej sekwencji mRNA które jest następnie odcinane. poli-A-polimeraza dodaje około 200 nukleotydów adeninowych