Wykład 5 I 6 Flashcards
Co powstaje w wyniku transkrypcji
1-niciowy RNA, w którym sekwencja zasad odpowiada sekwencji DNA nici kodującej, tymina zamienią się w uracyl.
mRNA
Informacyjny lub matrycowy RNA, koduje białka
rRNA
Rybosomalny RNA, formuje podstawową strukturę rybosomu i katalizuje syntezę białka
tRNA
Tranaportowy RNA, kluczowy dla syntezy białek, adaptor pomiędzy mRNA i aminokwasami
snRNA
Mały jądrowy RNA, udział m.in. w obróbce potranskrypcyjnej, wycinaniu intronów z transkryptów
snoRNA
Mały jaderkowy RNA, wpływa na modyfikacje pre-mRNA i rRNA
miRNA
Mikro RNA, reguluje ekspresję genów poprzez blokadę translacji i degraduje specyficzne mRNA
siRNA
Małe interferujące RNA, wyłącza ekspresję genów poprzez degradacje selektywnych mRNA i zagęszczanie chromatyny
piRNA
RNA oddziałujące z białkami PIWI k. Macierzystych i rozrodczych, np. Protekcja przed transpozonami
lncRNA
Długie niekodujące RNA, reguluje strukturę chromosomow, transkrypcje genów, stabilność i translację mRNA oraz modyfikacje post-translacyjne
Inicjacja transkrypcji
1.TFII D wiąże krótka sekwencje TATA
2. TBP, będące podjednostką TFII D wiąże TATA box
3. Załamanie helisy DNA powoduje że jest ona łatwiej dostępna dla innych czynników transkrypcyjnych.
4. W wyniku wiązania kolejnych TFII powstaje kompleks inicjujący transkrypcje
5. TFII H obejmuje helikazę DNA, która rozkręca helisę DNA z udziałem ATP eksponując nić matrycową do syntezy RNA
6. Polimeraza RNA II po przyłączeniu do DNA jest fosforylowana na swoim ogonie i rozpoczyna się Synteza.
Jakie polimerazy RNA nie dodają czapki 5’
Polimeraza RNA I oraz III
Czapka 5’
Przyłączona 5’-5’-trójfosforanowym wiązaniem do końca 5’ łańcucha RNA. Wspomaga dalsze procesowanie i eksportowanie z jądra mRNA, istotna w translacji.
Splicing pre-mRNA
Wycinanie intronów i łączenie eksonów. Intron aby ulec wycięciu musi posiadać miejsce donorowe, czyli sekwencję GU na końcu 5’. Miejsce akceptorowe czyli sekwencje AG na końcu 3’ oraz miejsce rozgałęzienia w którym znajduje się nukleotyf adeninowy
Poliadenylacja 3’
Polimeraza RNA II rozpoznaje specyficzną sekwencje poliadenylacji AAUAAA. Niektóre białka związane z ogonem Polimerazy II wiaza się do tej sekwencji mRNA które jest następnie odcinane. poli-A-polimeraza dodaje około 200 nukleotydów adeninowych
Translacja
Informacja w mRNA zapisana jest w postaci Kodonów. Translacja zaczyna się od inicjatorowego tRNA z metioniną która przyłącza się do małej podjednostki eybosomu w miejscu P. Mała podjednostka przyłącza następnie mRNA w miejscu czapeczki 5’
Kodony stop
UAG, UGA, UAA
Ubikwitynacja
Aczenie geul aminowych reszt lizynowych białka przeznaczonego do degradacji z grupami karboksylowymi ubikwityny
Chaperony
Białka opiekuńcze, czuwają nad prawidłowym zwijaniem białek
Podstawowe sposoby komunikacji komórek
-zależna od bezpośredniego kontaktu komórek
-parakrynna
-Synaptyczna
-endokrynna
Komunikacja parakrybba
Lokalne cząsteczki wydziale są przez jedne komórki by oddziaływać na inne (czasami same na siebie)
Synaptyczna
Aksony wydzielają neurotransmitery często daleko od ciała neuronu
Komunikacja endokrynna
Komórki wydzielnicze sekrecjonujace hormony do krwi, które oddziałują na różne tkanki
Przekaźniki pierwotne
Ligand połączony z receptorów na błonie komórkowej
Przekaźniki wtórne
Przenoszą sygnał od receptora błonowego do wewnatrz komórki na białka efektorowe
Jaka odpowiedź jest najszybsza
Synaptyczna
Jak sygnalizuje się acetylocholina
-spowalnia skurcze komórek serca
-stymuluje produkcję śliny przez ślinianki
-powoduje skurcz komórek w mięśniach szkieletowych
Receptory powiązane z białkami G
Składają się pojedynczego łańcucha polipeptydowego, który przecina błonę siedmiokrotnie
cAMP
odgrywa rolę w ekspresji genów: jego duże stężenie w cytozolu aktywuje PKA.
Białka Gs stymulują jego syntezę a białka Gi hamują
Mechanizm działania tlenku azotu
- Acetylocholina łączy się z GPCR w komórkach śródbłonka
- Następuje aktywacja białek Gq
- Do cytozolu uwalnia się IP3 oraz Ca2+
- Aktywacja syntezy NO. Synteza NO z argininy
- NO dyfunduje z komórek śródbłonka do komórek mięśni gładkich
- W kom. Mięśni gładkich NO aktywuje cyklaze guanylową, która tworzy cykliczne GMP
- cGMP stymuluje rozkurcz mięśni gładkich
Receptory związane z enzymami
Receptory transbłonowe, w których domena cytoplazmatyczne ma aktywność enzymatyczna lub asocjuje bezpośrednio z enzymami