Week 3 Flashcards

Question

Cy3, Alexa568

Answer 1

A

Transport gebeurt via Nucleocytoplasmic transport

Answer 2

A

Import van nucleaire eiwitten naar nucleus (erin)

2. Export van RNA naar cytoplasma (eruit)

Answer 3

A

Passieve diffusie
a. Kleine moleculen, bv. ionen: geen energie benodigd
Energy-afhankelijke transport. Macro moleculen moeten erdoorheen geduwd worden: kost energie

Answer 4

A

Gigantische structuur
Bestaat uit meer dan 50 eiwitten
Per menselijke celkern wel 3000-4000 stuks
Aan de cytoplasmatische kant zitten cytosolic fibrils
•Aan de nucleus kant zitten nuclear fibrils

Answer 5

A

Eiwitten die naar de nucleus heen moeten bevatten het nuclear localisation signal (NLS).
N-terminus en patch. Bij patch bepaald vouwen of het zichtbaar is of niet.

Answer 6

A

bij de celdeling worden er nieuwe nucear pores gemaakt om de chromosomen heen. Alleen zitten deze nu buiten de celkern (aan de cytosol kant). Dus moeten ze opnieuw de celkern in worden getransporteerd. Hiervoor zijn de signaal peptide nodig.

Answer 7

A

is een klasse van eiwitten die specifiek eiwitten herkent met NLS
Importin bindt aan NLS van nucleaire eiwitten en zorgt voor transport van cytoplasma naar nucleus

Answer 8

A

Deze helpen soms de importin met het herkennen van bepaalde NLS

Answer 9

A

Bijzondere aan nucleaire import eiwitten is dat zij oplosbaar zijn: kunnen in cytoplasma eiwitten binden en brengen naar de kern

Answer 10

A

Eiwitten die de nucleus uit moeten bevatten het NES (Nuclear export signal).
Exportin i.p.v. importin!

Answer 11

A

1)Importin bindt een eiwit met NLS en vormt een complex
Gaat naar nuclear pore complex
2)Bindt aan tip van cytoplasmatische fibril
3)Gaat door nuclear pore heen en eindigt op nuclear basket (is nu binnen)
4)Importin koppelt los van eiwit
a.Eiwit gaat nucleus in
B.Importin gaat terug naar cytoplasmatische kant

Answer 12

A

Met behulp van small GTPase Ran!
Actieve vorm, GTP, alleen in nucleus. Inactieve vorm, GDP, alleen in cytoplasma.
Als Importin + eiwit arriveert in de nucleus > GTPRan bindt aan Importin, eiwit laat los > Importin + GTPase terug naar cytoplasma > Eenmaal terug in cytoplasma wordt GTPase GDPase > Importin laat GDPase los en bindt nieuwe cargo.

Answer 13

A

•GEF heeft een specifieke locatie in de nucleus
Eiwit RCC1: bindt aan chromatine (DNA)
Altijd in de kern dus!
•GAP heeft een specifieke locatie aan cytoplasmatische zijde. Bevindt zich op cytoplasmasmatische fibrillen
Dus altijd buiten de kern (in het cytoplasma)!
•GAP en GEF bepalen dus eigenlijk wat is de binnenkant- & wat is de buitenkant van de nucleus

Answer 14

A

1) Eiwit met NLS wordt gemaakt in het ribosoom
2) Eiwit bindt aan importin en vormt complex
3) Bindt aan de fibril cytoplasmatische zijde
4) Beweegt zich door nuclear pore heen richting basket
5) Ran GTPase bindt aan importin
6) Importin laat eiwit los
7) Importin & GTPase gaan terug naar cytoplasmatische kant
8) Eenmaal in het cytoplasma wordt GTP > GDP en laat los van importin

Answer 15

A

mRNA altijd gecoat met
Heterogenous nuclear RiboNucleoprotein Particle (hnRNP)
mRNA wordt naar cytoplasma geëxporteerd als een groot RNP-complex (verpakt met hnRNP dus).
hnRNP bevatten de NES (signaal voor export)
Zullen alleen worden verplaatst als mRNA ‘rijp’ is voor export (gespliced etc.)
hnRNP eiwitten zullen alleen NES signaal naar voren brengen als het gebonden is met een complete mRNA sequentie
5’ kant van mRNA zullen altijd als eerste de nucleus verlaten

Answer 16

A

1) Eiwit dat het NES bevat (hnRNP eiwit) bindt aan mRNA
2) hnRNP eiwit bindt aan nuclear export receptor
3) Ran GTPase bindt ook aan nuclear export receptor
a. Complex van hnRNP eiwit met mRNA + receptor + Ran GTP
b. Op nuclear fibril
4) Gaat door nuclear envelop heen
5) Komt aan bij cytoplasmatische zijde
a. GAP inactiveert de GTPase (GTPase wordt GDPase)
6) Complex valt uit elkaar
7) Export receptor gerecycled naar nucleus

Answer 17

A

tRNA heeft van zichzelf een unieke 3-D structuur die herkent moet worden door het ribosoom. Dit structuur leidt ertoe dat t-RNA geen hnRNP nodig heeft voor transport.
tRNA bindt direct aan nuclear export receptor: Exportin-t
Alleen een complex van 3 factoren
• Ran-GTP
• Exportin-T
• tRNA
Dus zonder hnRNP!

Answer 18

A

1) tRNA bindt aan nuclear export receptor
2) Ran GTPase bindt ook aan nuclear export receptor
a. Complex van tRNA + receptor + Ran GTP
b. Op nuclear fibril
3) Gaat door nuclear envelop heen
4) Komt aan bij cytoplasmatische zijde
a. GAP inactiveert de GTPase: GTPase wordt GDPase
5) Complex valt uit elkaar
6) Export receptor gerecycled naar nucleus

Answer 19

A

Fluorescentie wordt gebruikt om moleculen binnen een cel te lokaliseren
Gebeurt in combinatie met fluorescentie microscoop
Bij fluorescentie wordt licht opgenomen door atomen waardoor valentie elektronen aanslaan tot een hogere orbitaal (energie)
‘Aangeslagen toestand’
Natuurlijk willen atomen zo weinig mogelijk energie hebben, dus vallen ze terug
Tijdens terugvallen stralen ze licht uit, ze ‘persen’ de extra energie er basically uit
LET OP:
Energie dat erin ging, is altijd meer dan de energie dat eruit komt

Answer 20

A

Lamp die meerdere golflengtes kan uitstralen, vervolgens:

1) First barrier filter: Voor specifieke golflengte doorlaten
2) Beam splitting mirror: Laat een deel wel door en een ander deel van het licht niet
3) Second barrier filter: Verwijderen van ongewild licht om specifieker naar een bepaalde golflengte te kijken

Answer 21

A

Lagere golflengte = hogere frequentie = meer trillingen = meer energie
E= h*f
F= C/y

Answer 22

A

Gebruikmaking van antistoffen
Directe manier: Gebruikmaking van 1 antilichaam waarbij deze fluorescent gelabeld is
Indirecte manier: Gebruikmaking van 2 antilichamen waarbij de tweede antilichaam fluorescent gelabeld is
hierdoor is er een nog sterker signaal

Answer 23

A

DNA kleuring

blauw

Answer 24

A

cytoskelet kleuring

groen