VL5 Genetik Flashcards
1
Q
Nomenklatur in der Genetik
Was sind:
mal, malT, MalT, malEF6, mal*
A
- mal: Phänotyp: Maltose
- malT: Gen
- MalT: Protein
- malEF6: Operon
- mal*: Mutante
2
Q
Was sind Mutation, Wildtyp und Mutante?
A
- Mutation: vererbare Veränderung der DNA, die zu einem veränderten Phänotyp führen kann
- Wildtyp: natürlich vorkommen, aus der Umwelt isoliert
- Mutante: Stamm, dessen Genotyp vom parentalen Ausgangsstamm abweicht
3
Q
Was ist Transformation?
A
- genetische Veränderung durch Gentransfer mittels Aufnahme freier DNA
4
Q
Was bedeutet Kompetenz?
A
- physiologischer Zustand in dem Bakterien über die Fähigkeit verfügen freie DNA aufzunehmen
- Kompetenz genetisch reguliert und ausgelöst durch
- Nährstofflimitation und
- B. subtilis durch Quorum sensing bei vielen Individuen
- viele Stämme müssen künstlich kompetent gemacht werden, da nur geringe natürliche Kompetenz
- Kalziumionen und abkühlen
- Elektroporation
5
Q
Wie läuft die Transformation ab?
A
- kompetente Zelle bindet DNA Teilstücke mit DNA Bindeprotein an Zelloberfläche
- Aufnahme Doppel- oder Einzelstrang
- bei ds Abbau eines Stranges
- Schutz der DNA durch Bindung von kompetenzspezifischen Protein
- ssDNA erreicht Chromosom und wird mittels RecA homolog rekombiniert
6
Q
Was ist Transduktion?
A
- Übertragung von DNA mittels eines bakteriellen Viruses (Bakteriophagen) von einer Zelle in eine andere
7
Q
Wie funktioniert die allgemeine Transduktion
A
- Übertragung
- Donor Zelle wird durch Phagen infiziert und lytischer Kreislauf wird induziert
- Kopien von der Phagen DNA werden in neue Phagen verpackt
- dabei kann versentlich Wirts-DNA verpackt werdem
- transduzierende Partikel, die nicht zur Infektion führen können
- nach Lyse der Zelle können transduzierende Partikel DNA in andere Bakterien injiziern, welche mit Wirts-DNA rekombinieren kann
8
Q
Was ist spezielle Transduktion?
A
- es werden nur spezifische Sequenzen übertragen, weil der Bakteriophage nur an einer bestimmten Stelle integriert
- Bildung eines Prophagen an bestimmter Stelle
- bei Übergang in lytischen Zustand ablösen der Prophagen DNA welche repliziert wird
- bei fehlerhafter Ablösug Mitnahme von bakteriellen Genen welche transduziert werden
9
Q
Was sind mobile genetische Elemente?
A
- DNA Sequenzen deren Position im Genom veränderbar ist
10
Q
Was sind Insertions-Elemente?
A
- enthält nur Transposase Gen
- eingeschlossen von inverted repeats
11
Q
Was ist ein Klasse 1 Transposon?
A
- zusätzlich zu den Transposon Gen weiteres Gen eingeschlossen in 2 IS Elemente
- bspw. Resistenz-Gen
12
Q
Was sind Klasse 2 Transposons?
A
- längerer DNA Abschnitt mit Trasposasegen, weiterem Gen, wie Resistenzgen und Resolvasegen, welches bei der replikativen Transposition die Auflöung des Cointegrats katalysiert
13
Q
Was ist Konjugation?
A
- Transfer von Plasmiden von einer Donator-Zelle zu einer Empfänger-Zelle durch Kontakt
14
Q
Was ist ein Plasmid?
A
- extrachromosomale DNA mit zusätzlichen Genen
- oft Resistenzgene oder Gene für optionalen Stoffwechsel
- besitzen tra-Region
- Region die den Transfer kodiert
- Informationen für Ausbildung von Sex-Pilus enthalten
- oriT-Sequenz ist Startstelle für Transfer
15
Q
Wie verläuft die Konjugation?
A
- Zellen stellen untereinander mittels Pilus Kontakt her
- Pilus wird durch Abbau wieder eingezogen sodass direkter Zell Zell Kontakt entsteht
- Doppelstrang des Plasmids wird am oriT gebrochen und in Empfänger Zelle transferiert
- verbleibende ssDNA wird mittels Rolling Circle Replikation wieder zu dsDNA und ssDNA im Empfänger wird ebenfalls repliziert sodass in jeder Zelle 2 vollständige Plasmide existieren
