Virus

Question 1

Utrotade virusinfektioner + varför

Answer 1

• smittkoppsvirus = Variola major/minor, Poxviridae ds DNA + hölje
• Poliovirus typ 1, 2, 3 = Picornaviridae, +ssRNA, nakna virus

Varför: enbart humana, låg variabilitet i neutralisationskänsliga protein

Question 2

Virus replikation

Answer 2

1. Adhesion (till cell R)
2. Penetration
3. Avklädning
4. Replikation av arvsmassa
5. Transkription (vmRNA)
6. Translation (vir. prot)
7. Assembly
8. Egress: lysering/ avknoppning

Question 3

Influensa A

Answer 3

-ssRNA segmenterat
Helikal nukleokapsid
Yttre hölje: NA (egress) + HA (tropism = fusion endosommembran)

Neuraminidas + Hemaglutinin

Vanligt hos djur, ex. sjöfåglar + grisar
Smittar via aerosol + kontakt —> infekterar luftvägsepitelceller

Question 4

Ge exempel på virus som kan ge en latent infektion

Answer 4

Herpes virus: herpes simplex, EBV, Varicella zoster

Question 5

Vad är ett latent virus?

Answer 5

Har arvsmassa i cellens kärna utan att producera strukturella virus protein

Question 6

Retrovirus (ex. lentivirus)

Answer 6

+ssRNA, Hölje, omvänt transkriptas, kapsid
Arvsmassa kodar för:
1. Kapsidprotein: skyddar arvsmassa
2. Polymeras: Reverse transcriptase (RNA—>DNA), RNas, Proteas: klyver virala protein —> funktionella strukturprotein
3. Hölje: cell receptorer som virus binder till celler med

Question 7

Orthomyxovirus

Answer 7

¤ -ssRNA, segmenterat,
¤ HA (Tropism internalisering; fusion endosom)
¤ NA (egress: bryta bindning mellan syalinsyra och glykoprtein —> släppa värdcell)
¤ Replikation i nukleus

¤ Typ A (H1-9, N1-9 = human), B (Yamagata/ Victoria), (c)

¤ Förändring arvsmassa:

• antigen drift = punktmutationer HA, NA
• Antigen shift = gensegment byts ut genom att 2 influensavirus infekterar samma cell

Question 8

Nedbrytning av virus i cytosol

Answer 8

Proteasomdegradering = nedbrytning —> peptider av immunproteasomer —> Ubiquitinering

Immunproteasomer bryter ner viruset till peptider via proteasomdegradering och därefter ubiquiteras dem.

Question 9

Naket virus- morfologi

Answer 9

• Nukleotidsyror
• Kapsomerer —> kapsid (främst ikosaedral struktur då helikala = instabila) —> sprids fekal-oralt

ex.
DNA: polyom, papillom, adeno, parvo (ss)
+RNA: Picorna (polio), Calici (vinterkräksjuka)

Question 10

Höljes virus- morfologi

Answer 10

• Nukleotidsyror
• kapsid (helikal + ikosaedral + komplex- bakteriofag)
• Yttre hölje: fosfolipider, protein, glykoprotein)- avknoppning oftast plasmamembran => sprids i kroppsvätskor

ex.
+RNA: Toga, Flavi, Corona
-RNA: ALLA! orthomyxo, paramyxo

Question 11

Herpes

Answer 11

= DNA virus
persistenta/ latenta infektioner

• Herpesvirus arvsmassa består av linjärt dubbelsträngat DNA (dsDNA).
• Herpesvirus ger initialt en akut (ofta asymtomatisk) infektion som i regel övergår i en
  kronisk/latent infektion.
• Herpesviruspartikeln är strukturellt uppbyggd av ikosaedral kapsid som är omgiven av ett
  tegument och ett yttre hölje.

Question 12

Orthomyxovirus kodar för 10 virusprotein- vilka 7 viktigaste + funktion?

Answer 12

1. RNA dependant RNA polymerase: Transkription -RNA —> +RNA
2. NA = Neuraminidas (blå, yta): höljesprotein => klyver virus från salicinsyra receptorer på värdscell => egress
3. Kapsidprotein (4:e ring): skyddar vRNA (helikal)
4. HA = Hemaglutinin (gul, yta): Virusets cellreceptor bindande protein => Tropism
5. Matrixprotein (röd, inre hölje): stabiliserar virus-hölje
6. M2-protein (kanal i hölje): jonkanal => replikation IC i endosomerna i cytoplasma
7. NS1 (i cytoplasma): skydd mot medfött immunförsvar, hämmar interferonsyntes + RNA degenererande enzym

Question 13

Angrepp virusinfekterade celler

Answer 13

1. NK: hämmas vanligen av MHC1 —> nedregleras vid infektion —> missing self —> aktiv NK, + danger signals från infekterade celler
2. CD8+ TC: har TC receptorer —> känner igen viruspeptid som precenteras på MHC 1

Question 14

Enzym som krävs för -ssRNA virus

Answer 14

RNA dependant RNA polymerase som omvandlar -RNA —> +RNA

Question 15

Virusfamilj riklig i human arvsmassa (8-10%)

Answer 15

= Retrovirus, reverse transcriptase

+ssRNA —> dsDNA —> integrering i kromosomal DNA

Question 16

Influensavirus struktur

Answer 16

= orthomyxovirus
Influensavirus är strukturellt uppbyggt med helikal nukleokapsid-struktur omkring sitt
segmenterade RNA och med ett yttre hölje som innehåller dess höljeproteiner HA och NA.

Question 17

Vilka av influensavirusets virulensfaktorer (i viruspartikeln) brukar man peka ut som essentiella för dess
infektionsförmåga?

Answer 17

Influensavirus virulensfaktorer brukar anges som dess yttre höljeproteiner;
- hemagglutinin (HA) som binder virus till dess cell-receptor,
- neuraminidas (NA) höljeenzym som klipper loss frisatt virus från cellens receptorer vid virusfrisättning,
- M2 jonkanal essentiell för virus-frisättning
och avklädning inne i den infekterade cellen samt
- enzymkomplexet RNA-beroende RNA-polymeras
som krävs för att minus-polariserade RNA virus ska kunna transkribera och replikera sin arvsmassa.

Question 18

Definiera virus

Answer 18

En mikroorganism innehållande arvsmassan DNA eller RNA, kapsid, med eller utan yttre
hölje.

Question 19

Kan både influensa- (orthomyxo) och mässlingvirus (paramyxo) variera sin fenotyp genom
”antigenic Shift” och i så fall hur?

Answer 19

Nej, enbart orthomyxovirus kan genomgå antigenic shift. Beror på att dessa virus
arvsmassa är segmenterade.

Question 20

Redogör kortfattat vad som menas med begreppen viralt Antigen Shift och Antigen Drift.

Answer 20

Antigenic Shift = Utbyte av helt gen-fragment mellan två virus inom samma virusfamilj.
Antigenic drift = Ofta punkt-mutationer som gradvis uppkommer och som ofta aminosyra-föraminosyra
ger förändringar i virala proteiner. Detta sker hela tiden vid virus-replikationer.