Virus Flashcards
Utrotade virusinfektioner + varför
- smittkoppsvirus = Variola major/minor, Poxviridae ds DNA + hölje
- Poliovirus typ 1, 2, 3 = Picornaviridae, +ssRNA, nakna virus
Varför: enbart humana, låg variabilitet i neutralisationskänsliga protein
Virus replikation
- Adhesion (till cell R)
- Penetration
- Avklädning
- Replikation av arvsmassa
- Transkription (vmRNA)
- Translation (vir. prot)
- Assembly
- Egress: lysering/ avknoppning
Influensa A
-ssRNA segmenterat
Helikal nukleokapsid
Yttre hölje: NA (egress) + HA (tropism = fusion endosommembran)
Neuraminidas + Hemaglutinin
Vanligt hos djur, ex. sjöfåglar + grisar
Smittar via aerosol + kontakt —> infekterar luftvägsepitelceller
Ge exempel på virus som kan ge en latent infektion
Herpes virus: herpes simplex, EBV, Varicella zoster
Vad är ett latent virus?
Har arvsmassa i cellens kärna utan att producera strukturella virus protein
Retrovirus (ex. lentivirus)
+ssRNA, Hölje, omvänt transkriptas, kapsid
Arvsmassa kodar för:
1. Kapsidprotein: skyddar arvsmassa
2. Polymeras: Reverse transcriptase (RNA—>DNA), RNas, Proteas: klyver virala protein —> funktionella strukturprotein
3. Hölje: cell receptorer som virus binder till celler med
Orthomyxovirus
¤ -ssRNA, segmenterat,
¤ HA (Tropism internalisering; fusion endosom)
¤ NA (egress: bryta bindning mellan syalinsyra och glykoprtein —> släppa värdcell)
¤ Replikation i nukleus
¤ Typ A (H1-9, N1-9 = human), B (Yamagata/ Victoria), (c)
¤ Förändring arvsmassa:
- antigen drift = punktmutationer HA, NA
- Antigen shift = gensegment byts ut genom att 2 influensavirus infekterar samma cell
Nedbrytning av virus i cytosol
Proteasomdegradering = nedbrytning —> peptider av immunproteasomer —> Ubiquitinering
Immunproteasomer bryter ner viruset till peptider via proteasomdegradering och därefter ubiquiteras dem.
Naket virus- morfologi
- Nukleotidsyror
- Kapsomerer —> kapsid (främst ikosaedral struktur då helikala = instabila) —> sprids fekal-oralt
ex.
DNA: polyom, papillom, adeno, parvo (ss)
+RNA: Picorna (polio), Calici (vinterkräksjuka)
Höljes virus- morfologi
- Nukleotidsyror
- kapsid (helikal + ikosaedral + komplex- bakteriofag)
- Yttre hölje: fosfolipider, protein, glykoprotein)- avknoppning oftast plasmamembran => sprids i kroppsvätskor
ex.
+RNA: Toga, Flavi, Corona
-RNA: ALLA! orthomyxo, paramyxo
Herpes
= DNA virus
persistenta/ latenta infektioner
- Herpesvirus arvsmassa består av linjärt dubbelsträngat DNA (dsDNA).
- Herpesvirus ger initialt en akut (ofta asymtomatisk) infektion som i regel övergår i en
kronisk/latent infektion. - Herpesviruspartikeln är strukturellt uppbyggd av ikosaedral kapsid som är omgiven av ett
tegument och ett yttre hölje.
Orthomyxovirus kodar för 10 virusprotein- vilka 7 viktigaste + funktion?
- RNA dependant RNA polymerase: Transkription -RNA —> +RNA
- NA = Neuraminidas (blå, yta): höljesprotein => klyver virus från salicinsyra receptorer på värdscell => egress
- Kapsidprotein (4:e ring): skyddar vRNA (helikal)
- HA = Hemaglutinin (gul, yta): Virusets cellreceptor bindande protein => Tropism
- Matrixprotein (röd, inre hölje): stabiliserar virus-hölje
- M2-protein (kanal i hölje): jonkanal => replikation IC i endosomerna i cytoplasma
- NS1 (i cytoplasma): skydd mot medfött immunförsvar, hämmar interferonsyntes + RNA degenererande enzym
Angrepp virusinfekterade celler
- NK: hämmas vanligen av MHC1 —> nedregleras vid infektion —> missing self —> aktiv NK, + danger signals från infekterade celler
- CD8+ TC: har TC receptorer —> känner igen viruspeptid som precenteras på MHC 1
Enzym som krävs för -ssRNA virus
RNA dependant RNA polymerase som omvandlar -RNA —> +RNA
Virusfamilj riklig i human arvsmassa (8-10%)
= Retrovirus, reverse transcriptase
+ssRNA —> dsDNA —> integrering i kromosomal DNA
Influensavirus struktur
= orthomyxovirus
Influensavirus är strukturellt uppbyggt med helikal nukleokapsid-struktur omkring sitt
segmenterade RNA och med ett yttre hölje som innehåller dess höljeproteiner HA och NA.
Vilka av influensavirusets virulensfaktorer (i viruspartikeln) brukar man peka ut som essentiella för dess
infektionsförmåga?
Influensavirus virulensfaktorer brukar anges som dess yttre höljeproteiner;
- hemagglutinin (HA) som binder virus till dess cell-receptor,
- neuraminidas (NA) höljeenzym som klipper loss frisatt virus från cellens receptorer vid virusfrisättning,
- M2 jonkanal essentiell för virus-frisättning
och avklädning inne i den infekterade cellen samt
- enzymkomplexet RNA-beroende RNA-polymeras
som krävs för att minus-polariserade RNA virus ska kunna transkribera och replikera sin arvsmassa.
Definiera virus
En mikroorganism innehållande arvsmassan DNA eller RNA, kapsid, med eller utan yttre
hölje.
Kan både influensa- (orthomyxo) och mässlingvirus (paramyxo) variera sin fenotyp genom
”antigenic Shift” och i så fall hur?
Nej, enbart orthomyxovirus kan genomgå antigenic shift. Beror på att dessa virus
arvsmassa är segmenterade.
Redogör kortfattat vad som menas med begreppen viralt Antigen Shift och Antigen Drift.
Antigenic Shift = Utbyte av helt gen-fragment mellan två virus inom samma virusfamilj.
Antigenic drift = Ofta punkt-mutationer som gradvis uppkommer och som ofta aminosyra-föraminosyra
ger förändringar i virala proteiner. Detta sker hela tiden vid virus-replikationer.
