Virologie Flashcards
Quels sont les caractéristiques principales des agents infectieux?
Premièrement ils affectent tous les organismes et ils ont des implications dans de nombreuses pathologie.
Il y a la formation de nouveaux virus.
Lorsqu’ils infectent la cellule, ils l’obligent à produire d’autres copies du virus. Le virion est une structure acellulaire.
Aucun gène n’est commun à l’ensemble des virus c’est donc un grand défi.
Ce sont des parasites intracellulaires obligatoires.
Les virus sont-ils vivant?
Les virus ne sont pas vivanst. À l’extérieur d’un hôte il ne peut pas se répliquer seul. Par contre lorsqu’il infecte une cellule sensible il est capable de se répliquer.
À l’extérieur d’une cellule, un virus n’a aucun métabolisme. Il est complètement inerte. C’est un amalgame de molécules organiques.
À l’intérieur d’une cellule, on peut observer des réactions ainsi que des molécules caractéristiques des organismes vivants. On peut observer la réplication d’acide nucléique, la composition protéique est différente.
C’est à la limite entre le vivant et le non-vivant.
Comment expliquer que les virus sont des organismes intracellulaires obligatoires? Qu’est-ce qu’ils font dans la cellule?
Ce sont des parasite intracellulaire obligatoire puisqu’ils monopolisent les activités cellulaire afin de produire des particules virales. En absence d’un hôte il n’y aura pas de réplication du virus.
Quelle est l’unité infectieuse de base de la virologie?
C’est le virion.
Comment caractériser l’origine évolutive des virus?
Il n’y a aucun gène commun au développement des eucaryotes ou des procaryotes. C’est vraiment un groupe à part.
Plusieurs événements auraient générés des virus. C’est compliqué de faire un arbre phylogénique.
Quels sont les constituants de base chez tous les virus? Quels sont les constituants obligatoire et facultatif?
Chez les virions, il y a un nombre limité d’espèces moléculaires.
L’acide nucléique ainsi que la capsule de son deux composants obligatoire.
Une enveloppe est très fréquentes chez les espèces virales par contre ce ne sont pas toutes les espèces virale qui sont enveloppés.
Quelles sont les différences entre les virus et les cellules? Qu’est-ce que l’on retrouve dans la particule infectieuse à l’origine?
Chez les virus on retrouve soit de l’ADN ou de l’ARN mais pas les deux. Dans une cellule normale on retrouve les deux.
De plus l’ADN prend des formes complètement différentes selon les les les espèces virales. Par exemple il peut prendre la forme linéaire, circulaire, unique ou multiples selon les espèces virales.
L’ADN et l’ARN peuvent être sous forme monocaténaire bicaténaires.
Certaines molécules présentes dans les partiucles virales sont absentes de la cellule infectée. Cela a pour conséquence que les enzymes qui sont impliquées dans la réplication de l’ADN de différentes forme ne sont pas présentent d’emblée dans une cellule. Ce sont les virus qui possèdent les gènes qui codent pour ces enzymes, donc une infection de la cellule est nécessaire pour produire les enzymes de réplication de l’ADN des cellules virales.
Vrai ou faux? Aucun gène n’est commun à l’ensemble des virus.
Vrai
Quelles sont les caractéristiques de l’acide nucléique du SARS-CoV2?
C’est de l’ARN sous forme monocaténaire.
Comment caractériser la taille des acides nucléiques chez les virus? Qu’est-ce que cela indique?
La taille varie entre 4 et 1200 kb. Un gène prend environ 1kb.
Par exemple, E. coli a 4x10^3 kb et les humains ont 10^6 kb.
Pour les plus petits virus, seulement quelques gènes peuvent prendre le monopole d’une cellule qui contient des milliers de gènes. C’est très efficace et démontre l’évolution au fil du temps.
Outre la taille, quels sont les caractéristiques du génome des virus? Quel est son rôle?
Premièrement la majorité des virus ont un génome sous forme haploïde. Il existe tout de même quelques diploïdes.
De plus le génome peut être fragmenté. Des fois, plusieurs acides nucléiques comportent le même message viral. Par contre, il y arrive aussi que ce soit un génome unique donc un seul génome contient l’ensemble du message viral.
Le rôle du génome est de porter l’information génétique typique au virus. Cela va permettre au virus la production de protéines de structures ainsi que d’enzymes impliquées dans la reprogrammation cellulaire lors d’une infection.
Vrai ou faux? Ce ne sont pas tous les virus qui ont de l’acide nucléique.
Faux, c’est présent chez tous les virus.
La capside est une structure composée de quoi? Où se situe-t-elle?
Elle est composée d’une structure protéique et se situe de façon externe à l’acide nucléique.
Quelle est la structure de la capside?
Les capsides sont constituées de capsomères qui sont les sous-unités structurales.
Ces sous-unités sont composées d’un assemblage de protomères qui sont les sous-unités protéiques.
Différentes protéines s’associent pour former un protomère. Les protomères s’associent pour former les capsomères. Les capsomères s’assemblent pour générer une capside.
Qu’est-ce qui donne la forme au virion?
C’est l’assemblage des capsomères.
Quelles sont les trois types de symétrie des capsides?
- Polyèdrale
- Hélicoïdale
- Binaire (mixte, complexe, les deux types de symétries sont présentes dans la même particule virale)
Quelles sont les caractéristiques de la symétrie polyèdrale des capsides?
C’est un isocaèdre (formé de 20 côtés). C’est un asemblage de triangles.
Il y a 3 types de capsomères : les faces, les arêtes et les sommets.
Les faces correspondent à un type de capsomère qui s’assemble pour former une structure plane.
Lorsque deux structures planes se rencontrent, il y a formation d’une arête.
Lorsque plusieurs arêtes se rencontrent, il y a formation d’un sommet.
Quel est le type de symétrie polyèdrale la plus fréquente?
C’est l’isocaèdre.
Vrai ou faux? La capside est une structure complètement hermétique.
Vrai.
Les virus qui possèdent des capside en forme de polyèdre ont quel avantage? Donnez des exemples.
Ces virus ont un rapport surface volume très élevé ce qui permet beaucoup d’interaction avec les surface qu’ils rencontrent.
Les virus qui possèdent cette symétrie sont de tailles variées. Par exemple, le virus de la poliomyélite ou celui de la fièvre aphteuse.
Quelles sont les caractéristiques de la structure des virus qui possèdent une capside hélicoïdale? Donnez des exemples de ces virus.
La capside est composée d’un seul type de capsomère qui s’assemble de façon hélicoïdal autour de l’acide nucléique. Cela a comme effet de créer un bâtonnet creux (comme un vide au centre).
Le virus de la mosaïque du tabac, de la rage, des oreillons, de la rougeole, du SARS-CoV2 ainsi que le bactériophage M13 possèdent tous cet arrangement.
Quelles sont les caractéristiques des virus qui possèdent une capside avec une symétrie binaire? C’est exclusif à quel type de virus? Donnez des exemples.
La capside possède les deux types de symétrie. En effet, la tête est polyèdrale tandis que la queue est hélicoïdale.
Cet assemblage est complexe.
EXCLUSIF AUX BACTÉRIOPHAGES.
T paires (2,4,6,…) de E. coli et DT1 de Streptococcus themophilus.
Quelles sont les conséquences de l’assemblage complexe d’une capside qui possède une symétrie binaire?
L’assemblage complexe fait en sorte que la progéniture formée après l’infection est moins importante que pour un virion qui a une structure plus simple. En effet, ça coûte plus cher énergétiquement de faire une structure complexe qu’une structure simple.
Quelles sont les caractéristiques des capsides chez les bactériophages?
Tous les bactériophages n’ont pas une symétrie de type binaire mais si un virion a un assemblage de type binaire c’est sur que c’est un bactériophage.
Quels sont les rôles de la capside?
- Protection de l’acide nucléique (conservation de l’intégrité du message génétique pour pouvoir former d’autres particules virales).
- Attachement à la cellule cible via les protéines de la capside ou dans le cas des bactériophages via les protéines de fibres ou de spicules de la queue.
Vrai ou faux? La symétrie de la capside peut servir à la caractérisation de la particule virale.
Vrai.
Vrai ou faux? Ce ne sont pas toutes les particules virales qui possèdent une capside.
Faux.
Qu’est-ce que l’enveloppe? D’où provient-elle?
C’est une structure fréquente chez les particules virales. Par contre, elle n’est pas toujours présente.
Elle est située à l’extérieur de la capside.
Elle provient de la membrane cytoplasmique ou de la membrane nucléaire de la cellule infectée. Cela dépend du mécanisme de réplicaion de la particule virale et surtout du mécanisme de sortie de la particule virale. Certains virus vont tout simplement bourgeonner et sortir avec une partie de la membrane cytoplasmique ou nucléairede la cellule infectée.
Quels sont les différents composants de l’enveloppe?
Elle est composée de phospholipides, de protéines cellulaires ainsi que de glycoprotéines virales (péplomères). C’est une portion de la membrane, donc la composition est la même que la membrane est la même à partir de laquelle elle s’est formée.
Que sont les péplomères? Quelles sont leurs caractéristiques? Donnez un exemple.
Se sont des glycoprotéines virales qui sont codées par la particule virale et synthétisées par la cellule et intégrées dans la membrane. Le virion va choisir son endroit de sorti afin d’emporter de ces glycoprotéines virales avec lui.
Le virus de l’influenza code pour la glycoprotéine virale : hémagglutinine. C’est une glycoprotéine qui a pour effet d’agglutiner les hématies ce qui permet un camouflage à la particule virale qui va se déplacer dans le sang. Cela empêche le système immunitaire de réagir contre la particule virale.
De plus, ce virus code aussi pour la neuraminidase qui est une glycoprotéine qui digère l’acide neuraminique (sert à l’adhésion celluliare) ce qui facilite une étape de l’infection, soit à pénétrer dans les cellules.