Virologia speciale Flashcards
quali sono le caratteristiche salienti degli Herpesvirus?
- virus a dsDNA, replicazione nel nucleo
- danno infezione primaria e riattivazione dopo latenza
- gemmano dalla membrana nucleare
Velocità di replicazione, effetto citopatico, sede di latenza e virus della sottofamiglia delle alphaherpesvirinae
- rapida (3-4 gg)
- citolisi
- gangli nervosi sensoriali
- HSV-1, HSV-2 e VZV
Velocità di replicazione, effetto citopatico, sede di latenza e virus della sottofamiglia delle betaherpesvirinae
- molto lenta
- citomegalia
- mesotelio e macrofagi
- CMV e HHV6/7
Velocità di replicazione, effetto citopatico, sede di latenza e virus della sottofamiglia delle gammaherpesvirinae
- Intermedia
- trasformazione e sincizi
- linfociti
- EBV, HHV8
lunghezza del genoma di HSV
150kb
Ospiti di HSV?
solo l’uomo
Come si diffonde HSV-1?
contatto con saliva o liquido lacrimale
Incubazione di HSV-1
4-10 gg
Patologie associate a infezione primaria di HSV-1
1) gengivostomatite acuta
2) cheratocongiuntivite
3) Patereccio cutaneo
[80% asintomatico nell’adulto]
patologie associate a riattivazione di HSV-1
1) herpes labiale
2) herpes oculare (può portare a cheratinizzazione della cornea e cecità)
3) patereccio erpetico
4) complica in meningite ed encefalite
Come si diffonde HSV-2?
trasmissione sessuale (fluidi genitali)
Effetti dell’infezione primaria e della riattivazione di HSV-2
1) ulcere aperte a livello genitale, forma dolente e pruriginosa
2) vescicole a livello genitale e perianale, si associa a sovrainfezione batterica
Percentuale di riattivazione dei HSV
- HSV-1 : 45%
- HSV-2 : 60%
Herpes neonatale: causa, trasmissione e patologia
- HSV-2 (70%), trasmesso nel canale del parto o congenito (5%)
- MALFORMAZIONI: ritardo mentale e microcefalia. Lesioni cutanee e oculari a 2 sett. dalla nascita. Complicanze a polmoni, fegato e reni. Anche fatale
complicazione più grave di HSV
Encefalite da herpes simplex [10% HSV-1, 90% HSV-2]
febbre e convulsioni, mortalità del 70%
Diagnosi di laboratorio di HSV
- sierologica (7gg)
- isolamento (1-3 gg per i risultati)
- ricerca del genoma (PCR), immunofluorescenza, microscopia elettronica delle vescicole
terapia per HSV
- acycolvir (prima scelta)
- famciclovir e valaciclovir
- antimitotici generali (più vechi)
NON è una terapia eradicante
Come si trasmette VZV?
Trasmissione per aerosol
quanti giorni dopo l’esposizione a VZV si hanno viremia (primaria) e manifestazione cinica?
- 3gg
- 14gg
Malattia data da VZV in infezione primaria e riattivazione. quali sono i sintomi?
- Varicella (infezione primaria): eritema maculopapulare con vescicole che diventano croste (possibile sovrainfezione batterica e cicatrice). Può complicarsi in polmonite interstiziale (20%)
- Zoster (o fuoco di Sant’Antonio): vescicole dolenti lungo l’innervazione della fibra da cui si è riattivato. Può complicarsi dando nevralgia posterpetica (dura mesi)
Effetti sul feto di infezione congenita da VZV?
- ipoplasia degli arti
- difetti nervosi
- difetti oculari
- morte prematura nell’infanzia
Come faccio diagnosi di VZV?
- isolamento (raro)
- Immunofluorescenza: striscio di Tzanck (lo distinguo dall’herpes)
- diagnosi molecolare
- diagnosi sierologica (su IgM e/o IgG)
Effetto citopatico di VZV
ballooning
Tipologia del vaccino contro VZV
- attenuato con coltivazione (200/300 passaggi): ceppo OKA
[presente nel tetravalente con anti- morbillo, rosolia, parotite] - a subunità per over 50: Zostavax, per evitare la riattivazione
come si diffonde EBV? cosa implica a livello epidemiologico?
- tramite saliva
- 2 picchi: uno nell’infanzia e uno nell’adolescenza
Recettore e corecettore di EBV
- CD21 (recettore)
- MHCII (corecettore per la fusione)
Incubazione di EBV
4-6 settimane
Patologie causate da EBV
- mononucleosi infettiva
- linfoma di Burkitt
- carcinoma nasofaringeo
- Leucoplachia orale (in pz AIDS)
sintomi della mononucleosi da EBV
[asintomatica nel bambino, sintomatica nel 50% dei casi dell’adolescente e adulto]
- febbre altissima, faringite, placche in gola, splenomegalia, linfoadenopatia (collo!), linfociti T di Downey. Può causare ostruzione faringea
- Si può complicare con rottura della milza o replicazione del virus nel fegato e distruzione degli epatociti. Nel cervello può dare meningocefalite.
Mutazione alla base del linfoma di Burkitt
Traslocazione reciproca 8-14 (o 2-22), c-myc finisce sotto il promotore delle Ig
Concausa necessaria per la trasformazione in vivo (EBV), nel caso del Linfoma di Burkitt?
Reattività alla malaria
Concausa necessaria per la trasformazione in vivo (EBV), nel caso del carcinoma nasofaringeo?
Cibi molto caldi o ricchi di ammine aromatiche
A quali patologie porta l’infezione da EBV in pz AIDS?
- leucoplachia orale
- linfomi non Hodgkin
Come faccio diagnosi di EBV?
- test di prima scelta: ricerca di IgM in assenza di IgG (per escludere riattivazioni)
- ricercadi Ab eterofili (test di Paul Bunnel o monotest)
Contro quali antigeni di EBV si ricercano Ab per fare diagnosi?
- VCA (ag capsidico)
- EBNA (ag nucleare)
- EA (ag precoce)
Come si distinguono infezione primaria, infezione pregressa o riattivazione di EBV?
[suscettibiità: Ig anti VCA -]
- Infezione primaria: IgM anti VCA +, IgG anti EBNA -, Ig anti EA + (98%)
- Infezione pregressa: Ig anti VCA e EBNA +
- Riattivazione: Ig anti EBNA +, Ig anti EA in aumento, IgM anti VCA -
Come viene trasmesso il citomegalovirus?
- contatto diretto
- saliva
- sessualmente
- trasmissione in utero
Quali patologie sono causate dall’infezione congenita da citomegalovirus?
- perinatale: asintomatica
- postnatale: asintomatica o forma simil-mononucleosica
Quali patologie sono causate dall’infezione primaria da citomegalovirus?
Solitamente asintomatica. Se sintomatica assomiglia molto alla mononucleosi: linfonodi ingrossati e febbre molto alta, ma senza Ab eterofili.
Quali patologie sono causate dall’infezione opportunistica da citomegalovirus? In quali soggetti?
Retinite, polmonite interstiziale, colite, infezione dello stomaco, esofagite, encefalite
[tipica degli immunocompromessi, pz con AIDS non trattato o trapiantati, dove riattivandosi può causare rigetto ]
Quale patologia grave si associa a infezione in utero da citomegalovirus?
Malattia da inclusioni citomegaliche
Sintomi: ritardo mentale, epilessia, atrofia oculare, sordità, epatomegalia, ittero, polmonite, miocardite, anemia emolitica.
Come viene fatta la diagnosi di infezione congenita da citomegalovirus?
Presenza di virus nell’urina entro 4 settimane dalla nascita (tecniche molecolari o isolamento)
Come viene fatta la diagnosi di infezione da citomegalovirus nell’adulto?
[Se ho sintomi simil-mononucleosici]
Diagnosi sierologica: cerco IgM (se compresenti alle IgG escludo riattivazione)
Come viene fatta la diagnosi di infezione primaria/riattivazione da citomegalovirus (es donna incinta)?
- test di avidità delle IgG: se sono ad alta affinità è riattivazione perché c’è stata maturazione dell’affinità
Come viene trattato un soggetto trapiantato per evitare infezioni da citomegalovirus?
- 1 sett. prima e 3 mesi dopo il trapianto: ganciclovir preventivo
- monitoro i livelli di attivazione virale (molecolare con qPCR o quantivicazione del genoma, oppure antigenemia per IFA, immunofluorescenza su GB dove il virus si replica)
Terapia per il citomegalovirus
- ganciclovir
- forscarnet e cidofovir (più tossici perché meno selettivi)
prevenzione per citomegalovirus?
- comportamentale: screening dei donatori e riceventi (non esiste vaccino)
Che patologia causa HHV6-7? Sintomi?
Sesta malattia (roseola infantum o exantema subitum)
- Febbre alta per 2 gg e rash cutaneo
come si trasmette HHV6-7?
Saliva e latte
Come si diagnostica l’infezione da HHV6-7?
Diagnosi clinica e IFA indiretto (incubazione di cellule infettate comprate con il siero del pz, misuro la presenza di Ab, non del virus)
In quali casi HHV8 causa patologia? che patologia causa?
- Omosessuali, anziani e pz di AIDS non trattato
- Sarcoma di Kaposi
Caratteristiche principali dei picornavirus
- virus nudi
- ssRNA pol +
- capside icosaedrico
Vecchia classificazione dei picornavirus: qual è e su cosa si basa
- Enterovirus: Poliovirus, Coxsackie A-B, Echovirus, nuovi enterovirus
- Rhinovirus: A, B, C
- Hepatovirus: HAV
- Cardiovirus: virus dell’encefalomiocardite
- Aphtovirus
Nuova classificazione dei picornavirus: qual è e su cosa si basa?
- A: coxsackie A e enterovirus
- B: coxsackie B, Echovirus e alcuni enterovirus
- C: Poliovirus (1, 2, 3), coxsackie e enterovirus
- D: enterovirus
Dimensione del capside e numero di protomeri dei picornavirus
- 25/30 nm
- 60 protomeri identici, associati in 12 pentameri
Dimensioni del genoma dei picornavirus? cosa trovo in 3’ e 5’?
- 7400 nt
- 3’ poliadenilata, 5’ legata covalentemente a VPg (con UTR di 740 nt)
Che proteine sono presenti nei picornaviridae?
- VP1, 2, 3: proteine capsidiche
- VP4: proteina interna che stabilizza il capside (la prima persa nell’interazione con il recettore)
- VPg: proteina genomica
Come entrano nella cellula i picornavirus?
- endocitosi
- inoculo diretto per formazione di un poro sulla membrana e su VP1 (genoma infettivo)
Che funzione ha la proteasi 2A nei picornavirus?
- effettua i tagli proteolitici (dalla poliproteina alle proteine virali funzionali)
- shutoff
effetto citopatico dei picornavirus
Morte cellulare con disgregazione e lisi (già dopo 2 gg). Si osserva ammasso eosinofilo perinucleare
Recettori sfruttati dagli enterovirus
- Car (coxsackie, adenovirus)
- PVR ( polio)
- T/S/P esamero (HAV)
Come si trasmettono gli enterovirus?
Principalmente per via orofecale, ma anche respiratoria (ingestione o aerosol)
Sede di replicazione primaria e secondaria degli enterovirus (picornaviridae)?
- primaria: tessuto linfoide (es placche del Peyer)
- secondaria: dipende dal virus
polio e coxsackie - motoneuroni (encefalite e
paralisi)
HAV - fegato (epatite A)
coxsackie A16 - cute (malattia mani-piedi-bocca)
Patologie associate ad enterovirus (gruppo picornaviridae)
- paralisi flaccida acuta: polio e enterovirus EV68 ed EV71
- meningite: tutti gli enterovirus (bambini sotto i 5 anni)
- encefalite
- febre: tuti gli enterovirus
Malattia causata da EV D86
infezioni respiratorie he danno paralisi flaccida acuta simil-polio con postumi permanenti nel 80% dei casi
Malattia causata da EV A71
malattia mani-piedi-bocca, nel 50% dei casi. in 8 casi su 100.000 evolve in paralisi flaccida.
Che vaccino è l’antipolio di Salk? pro e contro
Vaccino inattivato in formaldeide
- pro: immunità già al primo inoculo (90% al 2° e 99% al 3°), non dà reversione
- contro: l’immunità ha durata limitata
Che vaccino è l’antipolio di Sabin? pro e contro
Vaccino attenuato con passaggi seriali in vitro
- pro: immunità duratura nel tempo, molto efficiente (50% di immunità al 2° e 99% al 3°)
- contro: può dare reversione (soprattutto sierotipi 1 e 3)
Coxsackie A: numero di sierotpi
23
Cosa causano i Coxsackievirus A?
Lesioni dei muscoli volontari
- Herpangina o faringite vescicolare: faringite febbrile, vomito e dolori addominali
- Malattia mani-piedi-bocca (A16): esantema localizzato in tali parti, con vescicole pruriginose e fastidiose
Cosa causano i Coxsackie virus B?
lesioni al cervello
- Malattia di Bornholm (pleurodinia epidemica o mialgia): dolore toracico di tipo pleuritico o addominale di entità severa, febbre
- Miocardite e pericardite: alterata funzionalità cardiaca
- Infezioni perinatali (confuse con setticemia del neonato): a livello di SNC, fegato, miocardio, pancreas o surrene
Coxsackie B: numero di sierotipi
6
Come faccio diagnosi di infezione da Enterovirus (picornaviriade)?
- ricerca diretta (feci o tampone faringeo) + identificazione (molecolare o per effetto citopatico su rene di scimmia)
- sierologia: test di neutralizzazione o fissazione del complemento
Quante specie e sierotipi di rhinovirus si conoscono?
- 3 specie (sulla base del recettore)
- 150 sierotipi
A che temperatura crescono i rhinovirus?
35°C, perciò nel naso
Che virus sono responsabili del raffreddore?
- 35-50% dei casi: rhinovirus
- altri: coronavirus, adenovirus, enterovirus, RSV, influenza e parainfluenza
Come può complicarsi un’infezione da rhinovirus?
Può raggiungere il cervello e dare encefalite
A cosa sono dovuti la maggior parte dei sintomi del raffreddore da rhinovirus?
Infiammazione
Quanto tempo dura il raffreddore da rhinovirus? perché?
- 3 gg
- perché finisce il substrato (epitelio della mucosa nasale) e il virus non si può più replicare
Quali sono i virus epatotropici? Quali invece danno infezione epatica occasionale o rara?
- epatotropici: HAV, HBV, HCV, HDV, HEV, virus della febbre gialla
- occasionali: CMV, EBV, VZV, Dengue
- rari: HSV, parotite, coxsackie, adenovirus, parvovirus
Quali fasi comprende l’epatite virale?
- Incubazione: da 20 gg (HAV) a 6 mesi (HBV)
- pre-itterica: asintomatica o con sintomi simil-influenzali (debolezza, nausea, febbre, malessere generale), 2-4 settimane
- itterica: colorazione gialla di pelle e sclere, urine scure (2-4 settimane)
- convalescenza: scomparsa dei sintomi ma non sempre con eradicazione del virus (può cronicizzare)
[Rara: epatite fulminante con decesso in pochi giorni]
Quali tipi di epatite virale esistono?
- Epatite infettiva (HAV)
- Epatite da siero (HBV, HDV)
- Epatite NANB (HCV, HEV)
[probabilmente altri tipi di epatiti F, G, …]
HAV: fonte del virus, trasmissione, cronicizzazione, prevenzione e coltivabilità
- Feci umane
- Orofecale o per contatto con utensili contaminati da mani sporche (solo uomo come ospite
- Non cronicizza
- Vaccinazione e immunoprofilassi
- Coltivabile
HBV: fonte del virus, trasmissione, cronicizzazione, prevenzione e coltivabilità
- sangue e fluidi biologici
- Permucosale (contatto sessuale 100x HIV), parenterale
- Cronicizza
- Vaccinazione e immunoprofilassi
- Non coltivabile
HCV: fonte del virus, trasmissione, cronicizzazione, prevenzione e coltivabilità
- Sangue
- Percutanea, parenterale
- Cronicizza
- Screening dei donatori, prevenzione comportamentale
- Non coltivabile
HDV: fonte del virus, trasmissione, cronicizzazione, prevenzione e coltivabilità
- Sangue
- Percutanea, parenterale
- Cronicizza
- Screening dei donatori, prevenzione comportamentale
- [?]
HEV: fonte del virus, trasmissione, cronicizzazione, prevenzione e coltivabilità
- Feci umane e animali
- Orofecale o per ingestione di acque contaminare (infetta anche animali)
- Non cronicizza
- Depurazione dell’acqua potabile
- Non coltivabile
HAV: trasmissione, incubazione, probabilità di ittero, complicanze
- Orofecale, spesso da fomiti
- 30 gg (da 15 a 50), dipende dalla carica infettante
- [< 5anni, <10%]; [5-15 anni, 40-50%]; [> 14 anni, 70-80%]
- epatite fulminante, colestasi, ricadute
Che indicatori vedo in un’infezione da HAV alla comparsa dell’ittero?
- Transaminasi e bilirubina alte
- IgM specifice (test di prima scelta)
Test di prima scelta per la diagnosi di HAV? Perché non si effettua l’isolamento?
- Ricerca di IgM specifiche
- Perché anche se è coltivabile ci mette 1 mese a crescere
Pattern globali di prevalenza di HAV. In quali zone è più probabile avere un’infezione clinicamente evidente?
- Zone ad altissima prevalenza: 50% + prima di 1-2 anni (non ho epidemie
- Prevalenza moderata: 50% + intorno a 10 anni (possibili epidemie)
- Prevalenza bassa: 50% + a 30 anni (possibili epidemie)
- Prevalenza molto bassa: 50% + mai (casi ascrivibili a viaggiatori)
Le infezioni clinicamente evidenti si osservano nei paesi a moderata e bassa endemia (probabilità dei sintomi proporzionale all’età di infezione).
Come si fa diagnosi di infezione da HAV?
- criteri clinici: sintomi (affaticamento, nausea, vomito), ittero e transaminasi alte
- Laboratorio: IgM anti-HAV alte o ricerca diretta del virus (sangue o feci)
Esiste un Vaccino per HAV?
Vaccino inattivato (non consigliato in Italia, ma nei paesi endemici)
Di che famiglia fa parte HEV? quali generi sono presenti? come si suddivide HEV in tipi?
hepeviridae: 2 generi
1) Piscihepevirus (pesci)
2) Ortohepevirus: diverse specie. HEV A, genotipi 1, 2 (uomo), 3, 4 (suini e altri animali)
Per cosa codificano le 3 ORF di HEV?
- ORF1: proteine regolatorie
- ORF2: proteine del capside
- ORF3: P113 per morfogenesi e rilascio
Quali sono i veicoli tipici del virus HEV?
- acque infette (genotipi 1 e 2)
- carne di suino cruda (genotipi 3 e 4)
Periodo di incubazione di HEV? Quale percentuale delle infezioni risulta clinicamente evidente?
- 15-60 gg (40 gg in media)
- 40%
Come si fa diagnosi di infezione da HEV?
- criteri clinici: sintomi (affaticamento, nausea, vomito), ittero e transaminasi alte
- Laboratorio: IgM anti-HEV alte
Pattern globali di prevalenza di HEV
- Alta endemia: HEV responsabile >25% casi di epatite NANB
- endemia media: <25% dei casi di epatite NANB
- HEV non endemico
Esiste un Vaccino per HEV? Gli Ab danno immunità per tutta la vita?
No, si potrebbe ottenere un vaccino ricombinante ma ce ne frega poco (malattia che colpisce paesi poveri)
La protezione di Ab dopo infezione con HEV dura 15 anni circa
Che genoma anno HEV e HAV?
ssRNA pol +
Caratteristiche salienti degli hepadnaviridae?
- dsDNA (incompleto)
- tropismo per il fegato
- tendono a dare infezione persistenti
Che generi sono presenti nella famiglia degli Hepadnaviridae?
- Ortohepadnavirus HBV umano, virus di altre specie
- Avihepadnavirus: tipico degli uccelli
Dimensione di HBV e forma del capside
42 nm, icosaedrico
Che proteine sono presenti in HBV?
- HBcAg: antigene capsidico
- HBsAg: antigene di superficie (proteina maggiore, media e grande)
- HBeAg: associato a replicazione attiva
- Polimerasi
- Proteina X: trasformazione cellulare
A che temperature e pH arriva a resistere HBV?
- pH 2.4 per 6 h
- 30°C per 6 mesi, 60°C per 10 h, 98°C per 20 min
Cosa sono le particelle di Dane?
Virioni infettivi di HBV, al ME sono circolari con nucleo scuro
Qual è la concentrazione del virus in pz infettati da HBV?
Altissima: da 10^6/10^7 fino a 10^12 DNA/ml
> è estremamente infettivo
Quanto è lungo il genoma di HBV? quante ORF sono presenti?
- 3000 bp
- 4 ORF (7 proteine)
Per cosa codificano le varie ORF di HBV?
- ORF envelope: 3 codoni di inizio per la proteina maggiore, media e grande (HBsAg)
- ORF polimerasi: pol virale
- ORF capside: precore (dopo maturazione diventa HBeAg) e core (HBcAg)
- ORF non strutturale: gene X, coinvolto nella trasformazione
Che tipi di mRNA di HBV vengono trascritti (RNApol cell)?
- mRNA subgenomici (ORF X, ORF preS1, ORF preS2 + S senza il primo ATG): codificano per l’envelope e la proteina X
- mRNA pregenomici (ORF preC + P, senza il primo ATG): codificano per core e retrotrascrittasi
Come entra HBV nella cellula? qual è il suo recettore?
- adsorbimento al recettore cellulare: endocitosi mediata da recettore (secondo alcuni testi anche fusione)
- NTCP: polipeptide di trasporto del sodio-taurocolato
Come si trasmette HBV?
- Trasmissione sessuale (100 volte maggiore di HIV)
- Trasmissione parenterale (trasfusioni e scambio di siringhe)
- Passaggio nel canale del parto (da madre cronicamente infetta)
Qual è il periodo di incubazione di HBV?
da 60 a 90 gg in media (può andare da 45 a 180 gg)
L’infezione da HBV è sempre sintomatica? da cosa derivano i sintomi? come varia la probabilità di cronicizzazione?
- Molto spesso asintomatica nel bambino, sintomatica in adulti e anziani
- I sintomi sono dati dalla risposta immunitaria al virus. In una piccola % ho epatite fulminante
- La probabilità di cronicizzazione è più alta nel bambino, mentre la risoluzione è tipica dell’adulto
Come si evolvono i casi di epatite cronica da HBV?
- 1% si risolve spontaneamente dopo 6 mesi
- si può avere epatite cronica persistente
- % più piccola, flare di espressione e periodi di ridotta replicazione
A distanza di anni posso avere cirrosi per la cicatrizzazione del fegato, oppure epatocarcinoma cellulare
Tasso di mortalità dell’infezione cronica da HBV. Quali sono le cause di morte?
15-25 %, Per insufficienza epatica o epatocarcinoma
Qual è la probabilità di cronicizzazione dell’infezione da HBV?
- 80% sotto i 6 mesi
- 30% da 6 mesi a 5 anni
- 1% sopra i 5 anni
Su cosa si basa la diagnosi diretta da HBV?
HBsAg alto
Cos’è il periodo finestra dell’HBV?
Non rilevo né HbsAg né Ab anti HBsAg, il pz sembra negativo ma successivamente emergerà il titolo anticorpale
Qual è l’obiettivo della terapia contro l’HBV?
Il contenimento della viremia e l’abbassamento dei livelli di transaminasi, NON l’eradicazione
Qual è la terapia contro HBV?
- PEG - interferone con lamivudina (inibitore della RT)
- inibitori della RT
- PEG- IFN con entecavir e tenofovir (analoghi delle basi del DNA, bloccano l’elongazione della catena)
Qual è la probabilità di sviluppare HCC nei pz cronici di HBV?
x200 rispetto alla popolazione generale
Test di screening e test diagnostico per HBV
- ricerca di HBsAg con ELISA
- diagnosi sierologica + marcatori (transaminasi)
Marcatore di infezione, di protezione/guarigione e di regressione per HBV
- HBsAg
- Ab anti HBs
- Ig anti HBe
Epidemiologia dell’HBV: pattern di prevalenza
- alta prevalenza: > 8%
- prevalenza intermedia: 2-7% (italia)
- bassa prevalenza: <2%
Quanti genotipi di HBV esistono? Quanto genoma li differenzia? Quali particolarità hanno i vari genotipi?
8 genotipi, >8% di differenza
- Gen. C: più aggressivo e cronicizzante, resistente a lamivudina
- Gen. B: prognosi migliore
- Gen. B e D: frequenti mutazioni precore stop
- Gen. D: resistente all’INF-alpha
Qual è la prevenzione per HBV?
Vaccino ricombinante (obbligatorio in Italia). Ha ridotto anche l’incidenza di HCC
Quando si può avere infezione da HDV?
Quando si è infetti da HBV (virus difettivo). Si può avere coinfezione o superinfezione
Qual è la frequenza di HDV nei portatori di epatite B?
6%
Conseguenze della coinfezione da HDV
Malattia acuta grave con bassa probabilità di cronicizzazione
Conseguenze della superinfezione da HDV
Fa cronicizzare l’epatite B, alto rischio di malattia epatica a lungo termine. Aumenta il rischio di cirrosi e epatocarcinoma
Classificazione di HCV (famiglia e genere)
- famiglia: flaviviridae
- genere: hepacivirus
cosa differenzia HCV dagli altri virus della famiglia flaviviridae?
HCV è l’unico a non essere trasmesso da insetti
Quanti genotipi di HCV si conoscono? in cosa si differenziano?
6 genotipi, si differenziano per la prima parte del genoma (5’UTR)
Qual è la probabilità di guarigione di HCV? perché? come risponde alla terapia?
La probabilità di guarigione è bassa perché il virus muta molto. Reagisce male alla terapia perché insorgono spesso variabili resistenti
Omologia fra genotipi, all’interno del genotipo e all’interno della quasispecie (HCV)
- 60-70%
- 77-80%
- 91-99%
Struttura di HCV
- genoma a ssRNA pol +
- capside icosaedrico (proteina C)
- envelope presente (proteine E1 ed E2)
- dimensione media: 60-80 nm
Quali sono le quattro zone del genoma di HCV?
- 5’ UTR
- IRES
- codificante ORF
- poli-A
quali sono i recettori cellulari per HCV?
- CD81
- LDL-R
- SRB-1
Come viene trasmesso HCV?
- 60% siringhe contaminate
[prima del 1988] - 10% trasfusioni - 15% infezione sessuale
altre: infezioni professionali, sconosciute, perinatali etc
Qual è il periodo di incubazione di HCV?
2-4 mesi
Qual è l’esito di un’infezione da HCV?
- 80-90% cronicizza: di questi 80% inf. stabile, 20% vanno incontro a fibrosi epatica e cirrosi [75% progressione lenta, 25% scompenso epatico e carcinoma]
- 10-20% guarisce
quali sono i fattori ambientali che favoriscono la cronicizzazione di HCV?
- consumo di alcol
- assunzione di farmaci (antinfiammatori)
- coinfezioni: HBV, HAV, HIV
Quale % della popolazione mondiale è infettata da HCV? e di quella italiana?
- 3%
- 8%
come avviene la diagnosi da HCV?
Laboratorio:
- test di screening (ELISA con ricerca di Ab)
- test di conferma (RIBA IgG contro peptidi ottimizzati in lab)
- test diagnostico (Nested PCR o ibridazioe in situ, cerco RNA nel siero)
- test di genotipizzazione (LiPA, ibridazione inversa)
Prevenzione e terapia per HCV
- il vaccino non esiste (il virus muta troppo)
- terapia farmacologica (eradicante): DAA, prima del 2011 PEG-interferone e ribavirina
Come valuto la risposta alla terapia antivirale per HCV?
Tempo necessario alla negativizzazione dopo la cessazione della terapia:
- risposta rapida: 4 settimane
- risposta media: 12 settimane
- risposta lenta: 24 settimane
- risposta virologica sostenuta: 6 mesi
- risposta virologica subottimale: non mi negativizzo
Su cosa si basa la terapia anti-HCV?
Su un insieme di farmaci dati in associazione (il virus muta molto)
Che classi di farmaci sono usate contro HCV? con esempi e caratteristiche
- Inibitori delle proteasi NS3/NS4a: suffisso -previr (boceprevir, teleprevir, faldaprevir nuovo). Effetti collaterali: rash. Efficaci contro il genotipo 1, non 3.
- Inibitori delle polimerasi NS5b: suffisso -osbuvir (sofosbuvir). Sono nucleosidici (contro tutti i genotipi) o non nucleosidici
- Inibitori del NS5a (interviene nella sintesi dell’RNA virale): suffisso -asvir (daclatasvir). Dà spesso varianti resistenti, da usare in associazione con altri farmaci
Quale tecnica è stata usata per comprendere la storia di HIV (per capire quando vari isolati si sono differenziati rispetto al progenitore iniziale)?
Analisi molecular clock: confronto di milioni di sequenze e della % di differenza tra esse (più sono diverse, più è lontano il progenitore comune)
Quanti salti di specie hanno interessato HIV? da quali animali e che gruppi hanno formato?
3 salti di specie
- Gruppo M (N e forse O): scimpanzé
- Gruppo P (e forse O): gorilla
- SIV: ha dato HIV-2
Quale gruppo di HIV è responsabile dell’epidemia globale?
Gruppo M tipo B (saltato nel 1921)
Vecchia classificazione dei retrovirus. Su cosa si basa?
Si basa sulla forma dei virioni
- Tipo A (ciambella)
- Tipo B (eccentrico), come MMTV
- Tipo C (centrale), come ALV e RSV
- Tipo D (barra)
- lentivirus (cono) come HIV
Nuova classificazione dei retrovirus. Su cosa si basa?
Si basa sul confronto tra le sequenze dei genomi e la disposizione dei geni.
ORTHORETROVIRINAE
- Alpharetrovirus: ALV, RSV
- Betaretrovirus: solo virus animali
- Gammaretrovirus: solo virus animali
- Deltaretrovirus: HTLV
- Epsilonretrovirus:
- Lentivirus: HIV
SPUMAVIRINAE
- Spumavirus: solo virus animali
Caratteristiche salienti dei retrovirus
- Diametro di 80-120 nm
- Capside icosaedrico (o a simmetria sferica)
- Envelope lipidico
- ssRNA+ diploide
Quanti tipi di HIV si conoscono? Quali gruppi comprendono?
HIV-1 (M, N, O, P) e HIV-2
HIV-1 gruppo M: quanti sottotipi comprende? In cosa differiscono? dove sono diffusi principalmente?
- sottotipi dalla A alla K
- Differiscono per il 15% nel gene gag, per il 25% nel gene env
- America e nord Europa: B; nord Asia e Russia: A; altro: C; in Africa: grande eteroeneità perché mangiano carne di scimmia
Struttura del virione di HIV: cosa contiene?
- 200 molecole di proteina NC: avvolge RNA
- 2 molecole di mRNA
- RT
- p24: avvolge a sua volta NC
- proteina di matrice (sotto il peplos, lo incolla al capside)
- Gp120 e Gp41 (Gp di superficie)
- proteasi
Quante ORF contiene il genoma di HIV? che proteine vengono tradotte a partire da queste?
3 ORF
- gag: viene processata per proteolisi e dà MA (matrice), CA (capsidica) e NC
- Pol: dà proteasi, RT, e integrasi
- env: processata per proteolisi (Gp160), dà Gp120 e Gp41
Qual è il tasso di errore della RT di HIV?
10^-4 per base (tasso di errore alto)
Quale proteina è responsabile del clivaggio di Gp160 in HIV?
Proteasi cellulare furina
Quali sono le funzioni di Gp120 (SU) e Gp41 (TM)?
- Gp41: lega Gp120 all’envelope e media la fusione/penetrazione del virus
- Gp120: recettore che lega il CD4, antigene neutralizzante principale e altamente variabile
Quali dono i geni accessori dei Retrovirus?
- TaT: regola la RT e l’espressione virale
- Rev: trasporta alcuni mRNA fuori dal nucleo (sintesi proteine)
- VPR: importa il complesso di preintegrazione
- Vif: infettività
- Nef: apoptosi e infettività
- VPU: solo in HIV-1, degrada CD4 e rilascia virioni infettivi
- Tev : rara
Quali altre molecole di RNA (oltre lle 2 di mRNA) si trovano nel virione di HIV? a cosa servono?
- 2 tRNA per la lisina
- servono come primer per la RT
Cosa differenzia i retrovirus semplici da quelli complessi? di quali fa parte HIV?
- La presenza di geni accessori
- HIV è un retrovirus complesso (ha diversi geni accessori)
Perché HIV è altamente variabile? che tipi di variabilità si distinguono e a cosa sono dovuti?
Perché viene trascritto da un enzima ad alto tasso di errore + accelerazione di trascrizione con aumento di errori + ricombinazione pretrascrizionale
- Variabilità di popolazione (deriva antigenica)
- Variabilità individuale (deriva antigenica + pressione selettiva data da SI e farmaci)
A quali recettori e corecettori di lega HIV?
- Gp120 si lega al recettore CD4
- Gp41 si lega al corecettore CXCR4 (ceppi linfotropici) o CCR5 (ceppi macrofagotropici)
Qual è l’effetto citopatico di HIV?
Formazione di sincizi (cellule giganti multinucleate)
cos’è la mutazione delta32 del CCR5 e che effetti ha sull’infezione da HIV?
- Produce CCR5 tronco: ad HIV manca il corecettore e non infetta i macrofagi
- eterozigoti per delta32 (10% dei caucasici) hanno una progressione più lenta della malattia; omozigoti delta32 (1%) sono resistenti all’infezione da HIV [ceppi macrofagotropici]
Chi è il pz. di Berlino?
Pz con leucemia e HIV. Riceve donazione di midollo da donatore omozigote delta32, guarisce dalla leucemia e dall’AIDS (ceppo macrofagotropico)
Come vengono classificati i gei di HIV sulla base delle tempistiche di espressione?
- Geni precoci: tat, rev, nef (trascritti dalla RNA pol cellulare)
- gei tardivi: necessitano della proteina rev per essere portati nel citoplasma
Come si trasmette HIV?
- Per discontinuità della cute (tagli, esposizione professionale o accidentale iatrogena)
- Contatto con le mucose (omo- ed eterosessuale, ma anche perinatale e con l’allattamento)
- Iniezione diretta (scambio di siringhe o trasfusioni di sangue infetto)
Numero di virioni di HIV per ml nei tessuti e fluidi dove si ritrova
- Sangue: 18 000
- Sperma: 11 000
- Fluido vaginale: 7 000
- Fluido amniotico: 4 000
- Saliva: 1
Da cosa dipende la probabilità di trasmissione di HIV?
Dalla viremia. Tuttavia gli infetti sono contagiosi in tutte le fasi
Come può una madre infettata da HIV ridurre le probabilità di passarlo al figlio durante il parto? di quanto è ridotta la probabilità?
- Abbassare la viremia con trattamento farmacologico a partire da 3 gg prima del parto
- Da 1:4 a meno 1:10
Quali cellule rappresentano dei santuari o reservoir di HIV?
- CD4 resting
- macrofagi
- microglia
Quali sono le tre fasi dell’infezione da HIV e quanto durano indicativamente?
- Infezione e periodo finestra: 4 sett
- Sieroconversione e periodo asintomatico: da 1 anno a molti anni
- AIDS related illness (pre-AIDS e AIDS conclamato): molto variabile, 5 anni in media
Che sintomi possono comparire nel periodo finestra di HIV (Fase I)?
- esantema
- sintomi influenza-simili: febbre, linfonodi ingrossati, faringite, dolore retrorbitale, meningite, encefalite
- può essere asintomatica
Cosa posso cercare attraverso esami di laboratorio durante la fase 1 (periodo finestra) dell’infezione da HIV?
- Genoma virale: da 20 gg in poi (picco a 30 gg prima che si formino Ab)
- p24: dai 20 ai 40 gg si trova abbondante
- Ab: a partire da 40-50 gg (sieroconversione > passaggio alla fase II)
A distanza di quanto tempo dall’infezione si positivizzano i test sierologici per Ab anti-HIV?
- 99% dei casi 3 mesi
- pochi oltre i 3-6 mesi
Cosa succede durante la fase II (latenza clinica) dell’infezione da HIV?
Il SI produce Ab; i CD8 col tempo iniziano a uccidere i CD4 infetti provocandone una netta diminuzione