Virale DNA-Replikation Flashcards
Was bedeutet „semikonservative Replikation“
Je ein Strang der DNA wird bei der Replikation an einen Doppelstrang weitergegeben
In welche Richtung läuft die Elongation ab?
5‘ zu 3‘
An welcher Stelle beginnt die Replikation?
ori
Muss die DNA-Replikation immer mit Primer gestartet werden?
Nein (Bacteriophage NrS-1)
Welche Funktion erfüllen die beiden Metallionen bei der Replikation?
Two-metal-mechanism
- koordiniert pyrophosphat
- unterstützt Nucleophilen Angriff auf 3‘-OH Gruppe
Wie viele virale Proteine sind mindestens nötig?
Eines
Welche Enzyme sind bei der DNA-Replikation involviert?
DNA-Polymerase und akkzessorische Proteine
Origin binding Protein
Helikase
Exonuklease
Welche beiden Hauptmechanismen der DNA-Replikation gibt es?
Replikationsgabel
Strand-Displacement
Welcher Primer wird bei der Replikationsgabel genutzt?
RNA-Primer
Welcher Primer wird beim Strand-Displacement genutzt?
RNA-Primer oder Protein-Primer
Wodurch kommt das 5‘-Problem zustande?
Da von 5‘ zu 3‘ synthetisiert
An 5‘ Ende Primer
Wenn entfernt können keine neuen Nukleotide zum auffüllen angebaut werden da kein 3‘-OH für Nukleophilen angriff
Wie löst SV40 das 5‘-End Problem?
Zirkuläre DNA, bidirektional von Ori aus
(In eine Richtung an jedem Strang lagging, an dem anderen kontinuierlich)
-> schließen zueinander auf, ersetzen Primer
Ablauf DNA-Replikation bei SV40
2 LT-Hexomere binden mit ATP an LT-binding-Site
- > Konformation d. Sequenz ändert sich
2. 1 ATP wird dephosphorilisiert um Rp-A an Einzelstränge zu binden (durch LT Helikase-Aktivität)
3. TOP1 bindet an Oligomer
Welche Funktion haben Topoisomerasen des Typ 1?
Schneiden einen Strang ohne ATP verbrauch
Welche Funktion haben Topoisomerasen des Typ 2?
Schneiden unter ATP-Verbrauch Doppelstrang
Welche Funktion erfüllt Topoisomerase Typ 1 während SV40 Replikation?
Schneiden periodisch, verhindern superspiralisierung
Welche Funktion erfüllt Topoisomerase Typ 2 während SV40 Replikation?
Zyklische DNA ist am Ende verhakt, löst diese durch einmaligen Schnitt auf
Welche Besonderheit hat das Genom der Parvoviren?
ssDNA mit inverted terminal Repeats
Erkläre den Ablauf der Parvoviren Replikation?
In Notizen
Nach welchem Mechanismus Repliziert Adenovirus DNA?
Strand-Displacement
Wie löst Adenovirus das 5‘ Problem beim ersten Doppelstrang?
Protein Primer hybridisiert mit 4. Base von 3‘ aus
- wird um 2 Basen elongiert
- rutscht bis zu Anfang des Stranges (komplementäre Sequenz wiederholt sich)
- von dort aus synthetisiert
Wie löst Adenovirus das 5‘-Ende beim zweiten Doppelstrang?
Der Strang wurde mit Proteinen abgedeckt, Enden hybridisieren (ITRs) und nach demselben Mechanismus wie zuvor (Protein-primer) komplementärer Strang
Wie löst Herpesvirus 5‘-End problem?
Zelle verbindet Enden -> zirkuläre DNA
- Nick
- von 3‘Ende des Nicks komplementär zu weiterhin zirkulärem anderen Strang durchsynthetisieren
- genickter Strang wird immer länger, mehrere aneinander gehangen
- anderer Strang diskontinuierlich ransynthetisiert
Wo reproduzieren Poxviren?
In Fabriken im Cytoplasma
Warum reproduzieren Cytoplasmaviren in Fabriken?
Damit die mRNA nicht mit dem Genom hybridisiert
Woraus bestehen oris?
Aus AT reichen Sequenzen
Wie bringt SV40 Zellen in die S-Phase (Replikation)
S-Phase durch Rb reguliert
da dieses auch Genomreplikation von SV40 hemmt, wird es durch LT gebunden
weniger Rb-> Zellteilung -> für Replikation bessere Umgebung
Wie wird ua. die Zellteilung reguliert?
Durch die Phosphorilierung von Rb
-> keine Rekrutierung von Histone-Deacetylase
