Virale DNA-Replikation

Question 1

Was bedeutet „semikonservative Replikation“

Answer 1

Je ein Strang der DNA wird bei der Replikation an einen Doppelstrang weitergegeben

Question 2

In welche Richtung läuft die Elongation ab?

Answer 2

5‘ zu 3‘

Question 3

An welcher Stelle beginnt die Replikation?

Answer 3

ori

Question 4

Muss die DNA-Replikation immer mit Primer gestartet werden?

Answer 4

Nein (Bacteriophage NrS-1)

Question 5

Welche Funktion erfüllen die beiden Metallionen bei der Replikation?

Answer 5

Two-metal-mechanism

1. koordiniert pyrophosphat
2. unterstützt Nucleophilen Angriff auf 3‘-OH Gruppe

Question 6

Wie viele virale Proteine sind mindestens nötig?

Answer 6

Eines

Question 7

Welche Enzyme sind bei der DNA-Replikation involviert?

Answer 7

DNA-Polymerase und akkzessorische Proteine
Origin binding Protein
Helikase
Exonuklease

Question 8

Welche beiden Hauptmechanismen der DNA-Replikation gibt es?

Answer 8

Replikationsgabel

Strand-Displacement

Question 9

Welcher Primer wird bei der Replikationsgabel genutzt?

Answer 9

RNA-Primer

Question 10

Welcher Primer wird beim Strand-Displacement genutzt?

Answer 10

RNA-Primer oder Protein-Primer

Question 11

Wodurch kommt das 5‘-Problem zustande?

Answer 11

Da von 5‘ zu 3‘ synthetisiert
An 5‘ Ende Primer
Wenn entfernt können keine neuen Nukleotide zum auffüllen angebaut werden da kein 3‘-OH für Nukleophilen angriff

Question 12

Wie löst SV40 das 5‘-End Problem?

Answer 12

Zirkuläre DNA, bidirektional von Ori aus
(In eine Richtung an jedem Strang lagging, an dem anderen kontinuierlich)
-> schließen zueinander auf, ersetzen Primer

Question 13

Ablauf DNA-Replikation bei SV40

Answer 13

2 LT-Hexomere binden mit ATP an LT-binding-Site

• > Konformation d. Sequenz ändert sich
  2. 1 ATP wird dephosphorilisiert um Rp-A an Einzelstränge zu binden (durch LT Helikase-Aktivität)
  3. TOP1 bindet an Oligomer

Question 14

Welche Funktion haben Topoisomerasen des Typ 1?

Answer 14

Schneiden einen Strang ohne ATP verbrauch

Question 15

Welche Funktion haben Topoisomerasen des Typ 2?

Answer 15

Schneiden unter ATP-Verbrauch Doppelstrang

Question 16

Welche Funktion erfüllt Topoisomerase Typ 1 während SV40 Replikation?

Answer 16

Schneiden periodisch, verhindern superspiralisierung

Question 17

Welche Funktion erfüllt Topoisomerase Typ 2 während SV40 Replikation?

Answer 17

Zyklische DNA ist am Ende verhakt, löst diese durch einmaligen Schnitt auf

Question 18

Welche Besonderheit hat das Genom der Parvoviren?

Answer 18

ssDNA mit inverted terminal Repeats

Question 19

Erkläre den Ablauf der Parvoviren Replikation?

Answer 19

In Notizen

Question 20

Nach welchem Mechanismus Repliziert Adenovirus DNA?

Answer 20

Strand-Displacement

Question 21

Wie löst Adenovirus das 5‘ Problem beim ersten Doppelstrang?

Answer 21

Protein Primer hybridisiert mit 4. Base von 3‘ aus

2. wird um 2 Basen elongiert
3. rutscht bis zu Anfang des Stranges (komplementäre Sequenz wiederholt sich)
4. von dort aus synthetisiert

Question 22

Wie löst Adenovirus das 5‘-Ende beim zweiten Doppelstrang?

Answer 22

Der Strang wurde mit Proteinen abgedeckt, Enden hybridisieren (ITRs) und nach demselben Mechanismus wie zuvor (Protein-primer) komplementärer Strang

Question 23

Wie löst Herpesvirus 5‘-End problem?

Answer 23

Zelle verbindet Enden -> zirkuläre DNA

2. Nick
3. von 3‘Ende des Nicks komplementär zu weiterhin zirkulärem anderen Strang durchsynthetisieren
4. genickter Strang wird immer länger, mehrere aneinander gehangen
5. anderer Strang diskontinuierlich ransynthetisiert

Question 24

Wo reproduzieren Poxviren?

Answer 24

In Fabriken im Cytoplasma

Question 25

Warum reproduzieren Cytoplasmaviren in Fabriken?

Answer 25

Damit die mRNA nicht mit dem Genom hybridisiert

Question 26

Woraus bestehen oris?

Answer 26

Aus AT reichen Sequenzen

Question 27

Wie bringt SV40 Zellen in die S-Phase (Replikation)

Answer 27

S-Phase durch Rb reguliert
da dieses auch Genomreplikation von SV40 hemmt, wird es durch LT gebunden
weniger Rb-> Zellteilung -> für Replikation bessere Umgebung

Question 28

Wie wird ua. die Zellteilung reguliert?

Answer 28

Durch die Phosphorilierung von Rb

-> keine Rekrutierung von Histone-Deacetylase