RdRp Flashcards
Wofür ist RdRp ein Akronym?
RNA-dependent RNA-Polymerase
Ist RdRp in +mRNA Viren im Partikel nötig?
Nein, da direkt Transkription beginnen kann
Ist RdRp in -mRNA Viruspartikeln nötig?
Ja
Was sind drei für Viren typische RNA-Strukturen?
- Cloverleaf
- cis-acting RNA Element
- Pseudoknot
Wie wird der Primer der RNA-Replikation bei Polioviren hergestellt?
Protein VPg wird an Cre (Cis-acting RNA element) um Uracil-Basen erweitert
Wie wird die RNA bei Polivirionen repliziert? (Abseits von Primer herstellung)
- Poly A-Binding Protein (Zelle) bindet an Poly A-Schwanz am 3‘-Ende und Cloverleaf (am 5‘- Ende)
- Polymerase bindet an Komplex (am Cloverleaf
- Nimmt von dort aus VPg und produziert -mRNA (start an 3‘)
Welche Proteine produzieren Coronavirionen zuerst?
Was rufen sie hervor?
1a, 1ab
dahinter Stopcodon
induzieren Membranvesikel für Reproduktion
Was sorgt für hohe Rekombination bei Coronaviren?
Bei der Replikation:
- mRNA Synthese beginnt am 3‘, nach jedem ORF chance, zum Ende der Matrix zu springen (da Ende in räumlicher Nähe (gewickelt))
- dadurch entsteht subgenomische -mRNA welche zu +mRNA umgewandelt wird, von welcher aber immer nur das erste ORF von 5‘ aus abgelesen wird
Da immer zum Ende von anderer mRNA gesprungen werden kann -> Rekombination
Wie wird die mRNA bei VSV produziert?
- mRNA besteht aus kürzeren Abschnitten
- mRNA bleibt bei Terminator an Loops hängen -> Poly A Tail
- danach nächste mRNA
Wie wird bei VSV von mRNA zu Replikation gewechselt?
Ein Protein welches viral Synthetisiert wird -> antitermination
ganze +mRNA wird produziert, dann -RNA