Übungen MIX

Question 1

Answer 1

Question 2

Answer 2

Question 3

Answer 3

Question 4

Answer 4

Torsionswinkel des Proteinrückgrats: Nimmt man die C-Kette als Backbone, so sind jeweils die C-N-Bindungen wegen ihres teilweisen Doppelbindungscharakters relativ starr und bilden “Flächen”. Diese “Flächen”tre en sich jeweils am Cα−- Atom und sind gegenüber diesem frei drehbar. Die Torsionswinkel gegenüber dem cα-Atom (Psi (Ψ) = Winkel der Cα − C-Bindung und Phi (Φ) = Winkel der Cα-N Bindung) sind im Ramachandran-Plot gegeneinander aufgetragen. Jeder Punkt im Diagramm eines Proteins entspricht einem Cα-Atom

Question 5

Answer 5

• Bildung von Wassersto brücken
• Hydrophobe WW
• Elektrostatische WW(Coulombsches Gesetz)
• Bildung von Disulfiddbrücken
• Van-der-Waals-WW

Question 6

Answer 6

Die Faltung von kleinen Subdomänen in einem groÿen Protein bezeichnet man als Lokale Faltungspräferenz, die langsamere Faltung von Subdomänen zur globalen Struktur als globale Faltungspräferenz.

Question 7

Answer 7

Question 8

Answer 8

Question 9

Answer 9

τ=1 / k ( alle K bzw. Konstanten)

τfl = 1 /(kfl) = 1/ (kIntersystemcrossing + kInterneKonversion + kradiation + kphotochemie)

Question 10

Answer 10

Question 11

Was versteht man unter der Born-Oppenheimer-Näherung und warum ist diese Nähe- rung für die Spektroskopie von Bedeutung?

Answer 11

Question 12

Answer 12

Question 13

Answer 13

Question 14

Answer 14

Question 15

Answer 15

Question 16

Answer 16

Question 17

Answer 17

Question 18

Answer 18

Question 19

Answer 19

Question 20

Answer 20

Question 21

Answer 21

Question 22

Answer 22

Question 23

Answer 23

Question 24

Answer 24

Question 25

Answer 25

Question 26

Answer 26

Question 27

Answer 27

Question 28

Answer 28

Question 29

Answer 29

Question 30

Answer 30

Mechanische Stress in der Zelle

1. am Nukleus

A. Kraftabhängige Signaltransduction :

–> Zytosolische Signalkaskade, initiiert von Kraft aus Zeltperipherie. => Aktivierung von TF

+ mechanosensitive Kanälen -> Innenfluss kinase pathway

+ Kinase Signalkaskade -> mechanosensitive Zellen deformieren & allosterische Veränderungen führen zu Kinase signal.

B. Direkte Kraftübertragung am Nukleus

–> Kraft wird von Zytoskelett auf Nukleusskelett übertragen, somit zwingt biochemischen Veränderungen einzugehen.

+ LINC -Complex (linkers of the nucleo & cytoskeleton), in perinuclear space forming a bridge that connects both skeletons. = changes in actin cytoskeletal organization

FOCAL ADHESION zur Mechanosensing

–> Integrinen binden am ECM und stopfen die Lücke zur intrazell. Proteinkomplexe.

–> Komplex mit Talin, etc am Zeltperipherie, welches Actin-Filamenten binden kann.

• Proteinkonformationsänderung
• Änderung der Membranspannung
• Auf/Abbau eines Rezeptor/Ligand Komplex
• Entstehen von Molekülcluster

Question 31

Answer 31