UA2 - Notions de base en biologie clinique Flashcards
Pourquoi est-ce qu’on demande des analyses de laboratoire en contexte médical ? (4)
- Confirmer ou exclure un/des Dx
- Évaluer le degré d’une pathologie (phase active, aigue, chronique, etc.)
- Monitoring d’une thérapie (principale!)
- Médecine préventive (dépistage)
Pourquoi est-ce qu’on demande des analyses de laboratoire en contexte d’une étude clinique ? (7)
- Faire le criblage des sujets recrutés
- Protection des sujets inclus
- Déterminer l’efficacité du mx
- Déterminer la toxicité du mx
- Déterminer l’innocuité du mx
- Déterminer la posologie d’un mx
- Déterminer l’observance au mx
Quelles sont les étapes dans l’exécution d’une analyse de laboratoire ? (3)
- Phase pré-analytique
- Phase analytique
- Phase post-analytique
Pour chaque phase, il y a une source de variabilité qui peut influencer le résultat final de l’analyse ou l’interprétation que l’on fait de ce résultat final. Quelles sont les classifications des causes de variabilité pré-analytique des résultats d’analyse de laboratoire?
- Avant le prélèvement
- Pendant le prélèvement
- Après le prélèvement
Quelles sont les variation prévisibles avant le prélèvement ? (4)
- Variations ultradiennes (sécrétions épisodiques < 20h ; ex. hormone de croissance)
- Variations circadiennes (24h; ex. hormone de croissance)
- Variation infradiennes (> 3 jours ; ex. cycle menstruel)
- Variations circannuelles (1an)
***ce sont toutes des variations cycliques
Comment est-ce que les variations cycliques vont influencer la prescription de l’analyse de laboratoire ? (2)
- Peut nécessiter plusieurs mesures s’il y a des pic et des creux (variations) fréquemment
- Le moment du prélèvement va dépendre de ce qu’on recherche (ex. taux hormonal selon le cycle menstruel)
Quelles sont les variation imprévisibles avant le prélèvement ? (2)
- Variations intra-individuelles
- variation interindividuelles
*** Ce sont toutes des variations biologiques
Quelles sont les variations reliées aux pt avant le prélèvement ? (4)
- Exercice
- Stress
- Posture
- Diète
Quelles sont les sources de variabilité pré-analytique qu’on peut rencontrer pendant le prélèvement ? (3)
- Type d’échantillon
- Contenants et additifs
- Techniques de prélèvement
Quels sont les types d’échantillon qu’on peut utiliser pour un prélèvement ? (7)
- Sang total
- Plasma
- Sérum
- Urine
- Salive
- Autres liquides
- Autres matrices
Quelle est la différence entre le sang total, le plasma et le sérum ?
- Sang total : Présence d’anticoagulants + cellules sanguines
- Plasma : Présence d’anticoagulants
- Sérum : Liquide sans protéine de coagulation
Quels sont les ‘‘autres liquides’’ qui peuvent être prélevés (autre que le sang, l’urine et la salive) ? (5)
- Céphalorachidien (LCR)
- Pleural
- Synovial
- Péricardique
- Ascite
- Etc.
Quels sont les ‘‘autres matrices’’ qui peuvent être prélevés ? (2)
- Selles
- Expectorations
- etc.
Quels sont les types de contenants qu’on peut utiliser lors d’un prélèvement ? (2)
- Anticoagulants (prélèvement sanguin)
- Préservatifs (prélèvement pour la glycémie)
Quels sont les additifs qu’on peut utiliser lors d’un prélèvement ? (3)
- Gel séparateur
- Séparateur mécanique
- Activateur de coagulation
Quels sont les types d’anticoagulants qu’on peut mettre dans un contenant lors d’un prélèvement ? (3)
- EDTA di ou tri-potassique
- Héparine de lithium
- Citrate de sodium
Quels sont les types de préservatifs qu’on peut mettre dans un contenant lors d’un prélèvement ? (2)
- Fluorure de Na
- HCl 6 N
Décrit la technique de prélèvement sanguin (8 étapes)
- Mettre des gants
- Choisir une veine de gros calibre
- Appliquer le garrot pour faire gonfler la veine en le serrant modérément
- Désinfecter l’endroit de la ponction veineuse et laisser l’alcool sécher
- Tenir l’aiguille avec un angle de 30 degrés et piquer 1cm au dessous de la saillie veineuse
- Desserrer le garrot
- Remplir les tubes adéquatement
- Assurer une bonne identification des tubes immédiatement
Pourquoi est-ce qu’on doit desserrer le garrot avant la prise de sang ?
Risque d’hémolyse (encore plus si on a demander au pt de ‘‘pomper le pts’’ avant)
Quelles sont les sources de variabilité pré-analytique qui peuvent se passer après le prélèvement ? (3)
- Transport
- Prétraitement/centrifugation
- Entreposage
Quelles sont les sources de variabilité en lien avec le transport après le prélèvement ? (2)
- Délais
- Température
Quels sont les effets induits par le métabolisme lors d’un délai ou d’une mauvaise conservation des échantillons pendant le transport pour :
- PO2
- PCO2
- pH
- Concentration de Ca2+
- PO2 : Diminue (oxygène est consommé par les cellules sanguines)
- PCO2 : Augmente (cellules sanguines produisent du CO2)
- pH : Diminue (causé par augmentation de PCO2 + glycolyse)
- Ca2+ : Augmente (changement de pH influence les liaisons entre Ca2+ et protéines
Quels sont les effets induits par le métabolisme lors d’un délai ou d’une mauvaise conservation des échantillons pendant le transport pour :
- Concentration glucose
- Concentration lactate
- Glucose : Diminue (par métabolisme du glucose)
- Lactate : Augmente (par glycolyse)
Quelles sont les sources de variations potentielles de la centrifugation après le prélèvement ? (2)
- Vitesse (force)
- Température
Quelles sont les sources de variations potentielles du prétraitement après le prélèvement ? (4)
- Séparation
- Aliquote
- Extraction
- Précipitation
À quelle température est-ce qu’on devrait maintenir un prélèvement à court terme afin d’éviter des variations pré-analytiques?
Température ambiante : 20-24°C
À quelle température est-ce qu’on devrait maintenir un prélèvement à moyen terme afin d’éviter des variations pré-analytiques?
Réfrigération : 2-8°C
À quelle température est-ce qu’on devrait maintenir un prélèvement à long terme afin d’éviter des variations pré-analytiques?
Congélation : -80 à -20°C
Qu’est-ce que l’erreur analytique ?
erreur associée inhérente avec la mesure présente, et ce, même si la mesure a été faite très soigneusement
De quoi dépend l’importance de l’erreur analytique ? (2)
- Précision de l’appareil de mesure
- Calibrage approprié du dispositif ou de l’appareil
Vrai ou Faux : Le non respect des étapes d’une procédure représente une erreur analytique
Faux
Quels sont les facteurs pris en compte lors d’une erreur analytique ? (2)
- Exactitude
- Précision
Qu’est-ce que l’exactitude ?
mesure dont les résultats expérimentaux sont conformes à la valeur vraie ou admise (standard).
En d’autres mot : Décrit la différence entre la valeur obtenue et la valeur réelle
Qu’est-ce qu’une inexactitude ?
Différence entre la valeur obtenue expérimentalement et la valeur vraie
Qu’est-ce que la précision ?
Mesure de la fiabilité de l’expérience ou comment l’expérience est reproductible
Qu’est-ce que l’imprécision ?
Écart-type ou coefficient de variation (%) calculé à partir des résultats obtenus
Quels sont les types d’interférences analytiques qui peuvent affecter les résultats du prélèvement?
- Interférences in vivo (au niveau du pt)
- Interférences in vitro (au niveau des manipulations en labo)
Donne des exemples d’interférences in vivo (6)
- Tabagisme
- Mx
- Drogues/alcool
- Diète
- Menstruations
- Hémolyse
- etc.
Donne des exemples d’interférences in vitro ? (4)
- Interférences spectrophotométriques
- Interférences chimiques
- Interférences immunologiques (interférence des immunoessais)
- Interférences chromatographiques (co-migration)
Quelles sont les interférences spectrophotométriques qui peuvent influencer les résultats d’un prélèvement ? (3)
- Hémolyse
- Lipémie
- Ictère
Qu’est-ce qui peut causer des variations post-analytiques?
Valeurs de références
Quelles sont les méthodes qu’on peut utiliser pour établir des valeurs de référence? (3)
- Hard way
- Soft way
- No way
Comment établir des valeurs de référence avec le ‘‘Hard way’’?
On doit faire une sélection a prori minimum 120 individus sains selon des critères d’inclusion et d’exclusion, puis on fait la moyenne ± 2 écart-types
Comment établir des valeurs de référence avec le ‘‘Soft way’’?
Utilisation des bases de données
Comment établir des valeurs de référence avec le ‘‘No way’’?
Pour certains paramètres, il n’y a pas de valeur de référence. On utilise des seuil consensus (ex. seuil pour Dx le diabète)
Comment déterminer qu’une analyse est utile pour le Dx ?
En étudiant ses caractéristiques
Quels sont les 2 ordres des caractéristiques d’une analyse ?
- Caractéristiques relevant exclusivement du test lui-même (caractéristique intrinsèque)
- Caractéristiques relevant du test lui-même ET de la population à qui il est appliqué (Prévalence de la maladie dans la population considérée)
Nomme 2 exemples d’indices statistiques qui dépendent des caractéristiques intrinsèques
- Sensibilité (Se)
- Spécificité (Sp)
Nomme 2 exemples d’indices statistiques qui dépendent des caractéristiques intrinsèque et de la population étudiée
- Valeur prédictive positive (VPP)
- Valeur prédictive négative (VPN)
Quel indice statistique recherche-t-on dans cette situation : Connaissant le diagnostic, combien (quelle est la proportion) de personnes vraiment atteintes de la maladie est-ce que le test identifie?
Sensibilité
Qu’est-ce que la sensibilité ?
Proportion de vrai positifs chez les malades
En d’autres mots : Probabilité qu’un test soit positif chez un pt atteint de la maladie
Quel indice statistique recherche-t-on dans cette situation : Connaissant le diagnostic, quelle est la probabilité que le test identifiera correctement une personne n’étant pas atteinte de la maladie?
Spécificité
Qu’est-ce que la spécificité?
La portion de vrais négatifs chez les non malades
Quel indice statistique recherche-t-on dans cette situation :
Ne connaissant pas le diagnostic, mais sachant que le résultat du test est positif, quelle est la probabilité que le patient soit atteint de la maladie?
Valeur prédictive positive (VPP)
Qu’est-ce que la valeur prédictive positive (VPP) ?
Probabilité que le sujet soit réellement malade sachant que son test est positif
Quel indice statistique recherche-t-on dans cette situation :
Ne connaissant pas le diagnostic, mais sachant que le résultat du test est négatif, quelle est la probabilité que le patient ne soit pas atteint de la maladie?
Valeur prédictive négative (VPN)
Qu’est-ce que la valeur prédictive négative (VPN) ?
Probabilité qu’un sujet ayant un test négatif soit réellement non atteint de la maladie
Qu’est-ce que le rapport de vraisemblance ?
Rapport de la probabilité d’être malade sur la probabilité de ne pas l’être une fois que je connais le résultat du test
Complète l’énoncé : Le rapport de vraisemblance varie selon que le résultat du test diagnostique est (1)____ ou (2)____
- Positif (rapport de vraisemblance positif)
- Négatif (rapport de vraisemblance négatif)
Comment est-ce qu’on peut calculer le rapport de vraisemblance positif (L+) ?
L+ = Sensibilité / (1- Spécificité)
Comment est-ce qu’on peut calculer le rapport de vraisemblance négatif (L-)
L- = (1- Sensibilité) / Spécificité
Vrai ou Faux : Idéalement ;
L+ = 0
L- = infini
Faux, c’est le contraire
Plus le L+ est élevé, plus il nous permet de confirmer la maladie, alors que plus L- est près de 0, plus il nous permet d’exclure la maladie
Vrai ou Faux : un Odds Ratio (OR) est toujours > ou = à 1
Faux, c’est toujours > ou = à 0
Complète l’énoncé : Si le OR est proche de 0, la maladie est _____ fréquente dans le groupe A que le groupe B
beaucoup moins
Complète l’énoncé : Si le OR est inférieur à 1, la maladie est _____ fréquente dans le groupe A que le groupe B
moins
Complète l’énoncé : Si le OR est bien supérieur à 1, la maladie est _____ fréquente dans le groupe A que le groupe B
beaucoup plus
Complète l’énoncé : Si le OR est supérieur à 1, la maladie est _____ fréquente dans le groupe A que le groupe B
plus
Complète l’énoncé : Si le OR est proche ou égale à 1, la maladie est _____
indépendante du groupe
Quelle analyse diagnostique choisir pour un dépistage ?
Analyse avec une haute sensibilité (Se)
Quelle analyse diagnostique choisir pour confirmer un Dx ?
Analyse avec une grande spécificité (Sp)
Comment construire une courbe ROC (Receiver Operating Characteristic) ?
- Fixer une valeur seuil
- Calculer la sensibilité et la spécificité
- Placer le point sur la courbe ROC
- Répéter à partir d’une autre valeur seuil
Un patient a effectué par erreur deux test de thyreostimuline (TSH) deux semaines de suite et a obtenu des valeurs de 1,4 mUI/L et de 2,6 mUI/L. Pourtant, il n’y a eu aucune modification à son état de santé et il ne prend aucune substance pouvant influencer le résultat. Quels sont les facteurs qui peuvent expliquer cette variation ? (8)
- Variation cyclique
- Variation biologique
- Contenant
- Technique de prélèvement
- Transport de l’échantillon
- Entreposage de l’échantillon
- Prétraitement
- Variabilité du test en soi (exactitude et précision)
Quelle est la différence entre un plasma et un sérum?
Le sérum ne contient pas de protéines de coagulation
Dans un échantillon de sang, la valeur de glucose augmente ou diminue ? Pourquoi ?
La valeur de glucose devrait diminuer puisque les cellules vivantes dans l’échantillon continuent à métaboliser le glucose
Complète l’énoncé : Plus un test de vraisemblance négatif est petit, plus il permet de confirmer l’______ de la maladie
abscence
Vrai ou Faux : Sur une courbe ROC, l’ordonnée (axe vertical) correspond à la fraction des vrais négatifs et l’abscisse (axe horizontal) représente la fraction des faux positifs.
Faux
Vrai ou Faux : Pour le dépistage, une méthode à haute spécificité sera privilégiée
Faux
Vrai ou Faux : Quand le test n’apporte aucune information, le rapport de vraisemblance positif est égal à 0.
Faux
Vrai ou Faux : Sur une courbe ROC, la ligne diagonale représente un test d’apport important
Faux
Vrai ou Faux : La méthode du Reference Change Value (RCV) dépend seulement du coefficient de variation analytique.
Faux
Vrai ou Faux : La méthode du Significant Change Limit (SCL) dépend de l’écart type analytique usuel des 3 à 6 derniers mois et de la variation biologique
Faux
