UA 1 - Virologie Flashcards
Surtout définition
Particule virale infectieuse
Virion
Virus qui infecte une bactérie
Bactériophage
- Microorganisme : ARNsb circulaire + SANS capside ou enveloppe
- Réplication autonome
- Utilise ARN polymérase de l’hôte (plantes)
- Forment souvent des ribozymes
Viroïde
Leur réplication requiert la présence d’un virus helper
Virusoïde
- Protéine au repliement anormal (sans matériel génétique)
- Responsable d’encéphalopathies spongiformes chez les animaux et humains
Prion
Comme un viroïde, mais dans le microbiode humain
Obelisks
mais contrairement aux viroïdes, ils peuvent produire une protéine (Oblin-1)
Quels sont les 2 structures principales d’une capside ?
Capside = protège matériel génétique viral
- Sphérique/icosaèdrale
- Cylindrique/hélicoïdale
Quels sont les 6 étapes de la réplication virale ?
- Attachement à la cellule hôte (glycoprotéine virale + récepteur de l’hôte)
- Pénétration dans la cellule hôte (fusion direce ou endocytose médiée par interaction avec récepteur)
- Libération du génome (décapsidation) et enzymes dans le cytoplasme de la cellule hôte
- Production des composantes virales (cytoplasme ou noyau cellulaire)
- Assemblage (formation de nucléocapside/capside et assemblage du génome) et maturation (changement structuraux, action de protéase virales ou céllulaire pour passer de virions immatures à mature)
- Sortie du virus de la cellule hôte (lyse, exocytose ou bourgeonnement)
Qu’est-ce que le tropisme ?
Affinité du virus pour certains récepteurs sur les cellules
- tropisme cellulaire (ex : VIH)
- tropisme tissulaire (ex : influenza)
- tropisme d’hôte (ex : myxoma)
Les rhinovirus forment des pore dans l’endosome ou fusionne avec l’endosome ?
Rhinovirus: formation de pore dans l’endosome (endocytose)
L’influenza et VHC forment des pore dans l’endosome ou fusionne avec l’endosome ?
Influenza, VHC: fusion avec l’endosome
Quels virus répliquent leurs composantes virales dans le cytoplasme ?
- Majorité des virus à ARN (sauf rétrovirus et influenza)
- Poxvirus (un virus à ADN)
Quels virus répliquent leurs composantes virales dans le noyau cellulaire ?
- Virus à ADN (sauf poxvirus)
- Rétrovirus (ex: VIH)
- Influenza
Synthèse d’ARNm : scénarios
Virus ADN double brin
???
Virus ADN simple brin
???
Virus ARN simple brin, polarité +
???
Virus ARN simple brin, polarité –
???
Cas particuliers
Rétrovirus (ex : VIH)
???
Hépatite B
???
Synthèse d’ARNm : scénarios
Virus ADN double brin
Transcription en ARNm
Virus ADN simple brin
ADN polymérase de l’hôte produit de l’ADN double brin →ARNm
Virus ARN simple brin, polarité +
ARN utilisé directement comme de l’ARNm
Virus ARN simple brin, polarité –
ARN polymérase ARN-dépendante (virale)
ARN polarité -→ARNm
Cas particuliers
Rétrovirus (ex : VIH)
ARN simple brin + →ADN simple brin -→ADN double-brin→intégration dans l’ADN de la cellule hôte →ARNm
Enzymes virales impliquées: transcriptase inverse, intégrase
Hépatite B
Double-brin ADN →ARN simple brin →ADN
Enzymes virale impliquée: ADN polymérase (activité ADN polymérase et transcriptase inverse)
Comment les virus matures sortent de l’hôte ?
Virus sans enveloppe
- Libération du virus lors de la lyse de la cellule hôte
- Exocytose
Virus enveloppé:
- Bourgeonnement au niveau d’une membrane cellulaire
Vrai ou Faux
Certains virus peuvent causer le cancer.
Vrai
voir diapo 34
Vrai ou Faux
Plus le virus a un grand génome, plus il y a de risque de mutation.
FAUX
si tu fais trop d’erreur, tu ne peux pas avoir un trop grand génome ça devient non productive.
Donc si tu as réussi à évoluer pour un gros génome tu as évolué pour moins d’erreur.
par exemple, les virus avec une activité exonucléase (corrige les mutations) ont un plus gros génome.
Quelles sont les 3 techniques que le VIH «utilisent» pour varié son génome ?
- transcriptase inverse à faible fidélité
- recombinaison
- désamination de l’ADN viral par les protéines APOBEC3
Quels sont les hôtes selon le sérotype d’influenza ?
Hôtes:
A: humains, porcs, oiseaux, animaux marins, chevaux, chauves-souris
B: humains, phoques
C: humains, porcs
D: bovins, porcs
Qu’est-ce qu’un IRES ?
Ces séquences d’ARN sont appelées IRES (internal ribosome entry site) et présentent des régions fortement structurées, repliées en domaines indépendants. Ces IRES permettent la traduction de certains ARNm viraux ou cellulaires, dans des conditions où la traduction dépendante de la coiffe est bloquée (mécanisme de protéction de l’hôte).
Protéine qui permet l’attachement de l’influenza à la cellule respiratoire via l’acide sialique.
Hémagglutinine (HA)
Protéine qui permet le clivage du lien entre la membrane cellulaire (acide sialique) et l’influenza lors du bourgeonnement
Neuraminidase (NA)
Quelles sont les 2 techniques que l’influenza «utilisent» pour varié son génome ?
Dérive antigénique
une ou quelques mutations de l’ARN viral produisant des légères modifications des antigènes de surface (H et/ou N) ou autres protéines
Shift antigénique
Réassortiment / Recombinaison : modification majeure des gènes codant pour l’HA et/ou NA
voir diapo 63 - image
présence d’une maladie à un taux constant au sein d’une population ou d’une région
Endémie