UA 1 - Chapitre 3 Flashcards
C’est quoi le pharmacophore ?
Un ensemble de caractéristiques chimiques nécessaires pour assurer les interactions optimales avec une cible biologique spécifique et pour déclencher (ou bloquer) sa réponse biologique.
C’est quoi un produit naturel?
N’importe quelle substance produite par un organisme vivant.
Ce sont en faite plus spécifiquement des métabolites secondaires qui sont désignés.
Fait la distinction entre métabolites primaires vs secondaires
primaire = essentielle à la croissance
secondaire = non essentielle à la croissance (petite quantité)
Explique le circuit pour la commercialisation d’un médicament dérivé d’un produit naturel.
- l’extrait des produits naturels était utilisé pour ses propriétés (mélange non purifié)
- on isole la forme pure
- on modifie la forme pure chimiquement pour en améliorer les propriétés
Il existe 2 approches pour la découverte des médicaments par méthode rationnelle. Nomme-les et leur pré requis
- Basée sur le ligand : avoir plusieurs composés actifs dont on connait le pharmacophore
- Baséee sur la cible : connaitre structure 3D de la cible & site actif
Comment décrire l’approche aléatoire pour la découverte de médicament ?
pas besoin de savoir la structure en 3D, mais on doit connaitre la cible.
Comment on fait le criblage à haute capacité ?
Tester rapidement une grande bibliothèque de composés chimiques contre une cible biologique à l’aide de systèmes automatisés.
Comment définir la RSA (relation structure activité) ?
Relation entre structure 3D & activité biologique de la molécule. On identifie PRÉSENCE ou ABSENCE de RSA.
Quelle est la différence entre la présence et l’absence de RSA ?
- Présence : Les modifications structurales entraînent des différences d’activité mesurables.
- Absence : Tous les analogues ont une activité similaire, due à d’autres facteurs (e.g. interférence).
Quelles sont les trois méthodes pour découvrir les groupes essentiels à l’activité biologique ?
- Par la RSA (relation structure-activité).
- Par résonance magnétique nucléaire (RMN).
- Par diffraction des rayons X.
Quelle est la règle morphine dans un pharmacophore ?
Un arène lié à un carbone quaternaire, suivi de deux carbones et d’une amine tertiaire.
Qu’est-ce que l’optimisation structurelle ?
C’est une modification basée sur la structure cristalline récepteur-ligand pour améliorer l’affinité d’un médicament avec son récepteur.
Quelles sont les étapes principales de l’optimisation structurelle ?
- Identifier les interactions non optimales (ex. poche hydrophobe, répulsion).
- Modifier la structure (ajout d’un groupe hydrophobe ou remplacement d’un groupe répulsif).
Qu’est-ce que la bioisostérie ?
C’est une approche de modification structurelle où des substituants ayant des similitudes stériques et physico-chimiques remplacent une partie d’une molécule pour améliorer ses propriétés sans nuire à son efficacité.
Pourquoi effectuer une modification bioisostérique sur une tête de série ?
- Améliorer l’activité, la sélectivité et réduire les effets secondaires.
- Optimiser les propriétés pharmacocinétiques et la stabilité.
- Simplifier la synthèse ou contourner un brevet.
Quels sont les deux principes fondamentaux des dénominations communes internationales (DCI) ?
- Nom unique (son et orthographe).
- Longueur raisonnable.
Quels sont les principes secondaires des DCI ?
- Emploi de segments clés pour indiquer l’activité thérapeutique ou chimique.
- Simplification orthographique.
- Acides et sels nommés par un seul mot ou un ajout sans modifier l’origine (ex. Atorvastatine calcique).
Que désigne le segment clé « -vastatine » dans un médicament ?
Il désigne un inhibiteur de la HMG-CoA réductase, utilisé comme hypolipidémiant (ex. Atorvastatine, Rosuvastatine)
Que représentent les segments clés « -ciclovir » et « -zepine » ?
-ciclovir : Antiviral, composé bicyclique hétérocyclique (ex. Aciclovir).
-zepine : Composé tricyclique, utilisé comme antidépresseur ou anticonvulsant (ex. Carbamazépine).
Quel est le prérequis pour une approche basée sur le ligand ?
Avoir plusieurs composés actifs dont on connaît le pharmacophore.
Quels outils sont utilisés dans une approche basée sur la cible ?
Modélisation moléculaire, cristallographie (Rayons-X) et RMN
