Type d'ARN Flashcards

1
Q

Caractéristique des ARNm

A

L’ARNm est utilisé comme intermédiaire par les cellules pour la synthèse des protéines
Les ARNm représentent uniquement 5% de tous les ARNs dans la cellule
L’ARNm est le plus hétérogène des classes d’ARN en terme de séquence, taille et nombre
Subit les étapes de maturation

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Q

Caractéristiques des ARNr

A

Les ARN ribosomiques sont le constituant principal des ribosomes qui sont en charge de la synthèse des protéines
Représentent 80-85% de tous les ARNs dans la cellule
Ils ont une taille, une séquence et un nombre bien précis
Subissent des étapes de maturation après leur transcription

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3
Q

Caractéristiques des ARNt

A

Les ARNt sont les éléments essentiels de traduction, ou leur fonctionnement principal est le transfert des acides aminés pendant la synthèse des protéines
Représentent 10-13% de tous les ARNs dans la cellule
Différents ARNt pour les différents 20 acides aminés
Taille d’environ 70-80 nucléotides
Subissent des étapes de maturation après leur transcription

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4
Q

Caractéristiques des snARN

A

Les petits ARN nucléaires sont le constituant principal du spliceosome responsable de l’épissage des introns des pré-ARNm
Taille entre 60-450 nucléotides
Les complexes ARN-protéines sont nommés petites ribonucléoprotéines nucléaires

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5
Q

Quels sont les 5 principaux snARN?

A

U1,U2,U4,U5,U6

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6
Q

Qu’est-ce que comprend le spliceosome mineur?

A

Ce complexe comprend les snRNa U11, U12 ,U4atac ,U6atac et U5 qui forment des analogues fonctionnels des snRNP utilisé dans le spliceosome principal.
Le spliceosome mineur épisse des introns de type U12 (AT-AC) qui sont différents des introns de type U2 (GT-AG)

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7
Q

Quel est le principal rôle des snARN?

A

Participent principalement à la maturation des ARNm

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8
Q

Caractéristiques des snoARN

A

Les petits ARN nucléolaires sont des ARN présents dans le nucléole des cellules pour aider à la maturation des ARNr.
Taille entre 60-300 nucléotides
Majorité sont codés dans les introns de gènes codant pour des protéines impliquées dans la synthèse ou la traduction des ribosomes.
Situés également dans des régions intergéniques ou ils peuvent être transcrit à partir de leurs propres promoteurs par l’ARN polymérase II

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9
Q

Quelles sont les fonctions des snoARN?

A

Principale fonction : Consiste à modifier post-transcriptionnellement les précurseurs des ARN ribosomiques ou snARN.
Les modifications ajoutées par les snoARN sont essentielles à la maturation des ARNr.

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10
Q

Vrai ou faux

Le pré-ARNr subit plusieurs modifications nucléosidiques avant le clivage par les exo et endonucléase

A

Vrai

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11
Q

Qu’est-ce qui perturbe la structure des ribosomes et altère l’efficacité de la traduction?

A

L’absence des modifications par la perturbation des snoARN

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12
Q

Nommez les deux familles de snoARN et en quoi ils sont responsables

A

-snoARN de type C/D, responsable de la 2-o-méthylation
Complémentarité avec un ARNr en 5’ des boites D et D’ pour la méthylation
-snoARN de type H/ACA, responsable de pseudouridylation
Forme de double épingle à cheveux avec une zone non appariée dans chaque épingle. Cette zone de non-appariement se lie par complémentatirué à un ARNr cible dont deux uridines seront isomérisées en pseudouridines.

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13
Q

Ou se trouve les snoARN chez l’homme?

A

Les snoARN se trouvent dans les introns de gènes codant pour des protéines impliquées dans la synthèse ou la traduction des ribosomes et doivent donc subir une étape de maturation

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14
Q

Quelle est la fonction principale des snoARN?

A

Les snoARN assurent une fonction de guide.
Ils n’ont pas d’activité catalytique et s’associent à des protéines catalytiques incapables de reconnaitre leur cible.
S’associent avec ces protéines catalytiques au cours de leur maturation

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15
Q

Qu’est-ce qui est responsable de la 2-O-méthylation pour les snoARN C/D?

A

La fibrillarine

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16
Q

Qu’est-ce qui est responsable de la pseudouridylation pour les snoARN H/ACA?

A

La dyskérine

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17
Q

Quelles sont les caractéristiques des miARN?

A

Régulent l’expression des gènes
Répriment la production de protéines en déstabilisant leur ARNm cible
ARN simple brin de 19-25 nt codé par le génome
Conservé du point de vue évolutif
Se lient généralement à la région 3’-UTR de leurs ARNm cibles
Inhibe l’expression de plusieurs ARNm du fait d’un appariement imparfait avec ses cibles

18
Q

Quelles sont les caractéristiques des siARN?

A

Régulent l’expression des gènes
Répriment la production de protéines en déstabilisant leur ARNm cible
ARN double brin de 21-23 nt
Considéré comme des ARN exogènes qui sont absorbés par les cellules ou entrent via des vecteurs
Se lient généralement à la région codante de leurs ARNm cibles
Inhibe l’expression d’un seul ARNm car son appariemment est parfait avec sa cible spécifique
Synthétisé en labo**

19
Q

Quels sont les étapes de maturation des miARN?

A

1-Les gènes des miARN sont transcrits par l’ARN Pol II pour former un transcrit miARN primaire.Ce transcrit simple brin adopte une structure secondaire en forme d’une longue épingle à cheveux.
2-Le pri-miARN est traité par le complexe Drosha-DGCR8. L’enzyme Drosha coupe le pri-miARN en une courte molécule d’une centaine de nucléotides toujours en épingle à cheveux : le précurseur miARN. Le pré-miARN est exporté vers le cytoplasme par l’exportine-5.
3-Dans le cytoplasme, le pré-miARN interagit avec le complexe Dicer-TRBP-PACT. Dicer coupe la tête de l’épingle du pré-miARN pour former un miARN mature.
4-Le complexe Dicer-TRBP-PACT aide au pré-chargement des miARN avec la protéine AGO2 puis le complexe RISC qui va dissocier le miARN en un ARN simple brin de - de 20 nt.
5-Le miARN se lie au 3’ UTR des ARNm cibles grâce au complexe RISC, puis inhibe la traduction et dégrade l’ARNm dans les P-bodies contenant des enzymes du décoiffage DCP1 et DCP2.

20
Q

Quelle est la nature de l’enzyme Drosha et Dicer?

A

Ribonucléase qui coupe

21
Q

Quelles sont les étapes de maturation pour les siARN?

A

1-L’ARN double brin exogène est pris en charge par le complexe Dicer-TRBP-PACT. Dicer coupe la structure pour former des siARN double brin.
2-Le complexe Dicer-TRBP-PACT aide au pré-chargement des siARN avec la protéine AGO2 puis le complexe RISC qui va dissocier le duplex siARN en un ARN simple brin d’environ 21 nt.
3-Le siARN se lie à la région codante de ses ARNm cibles grâce au complexe RISC.
4-L’endonucléase AGO2 clive l’ARNm.

22
Q

Quelles sont leurs fonctions principales aux miARN et siARN?

A

Dégradation des ARNm, traduction

23
Q

Caractéristiques des piARN

A

Les piARN se lient spécifiquement à la sous-famille PIWI des protéines Argonaute.
Exprimés seulement dans les gonades bien que les piARN soient nécessaires que chez les mâles.
Majorité sont antisens des séquences de transposons et jouent un rôle pivot dans leur répression et le maintien de l’intégrité génomique pendant la gamétogenèse.
N’ont pas de structure secondaire (linéaire)
Longueur entre 26-31 nt
Ils ont tous une uridine à leur extrémité 5’ et ont une modification à leur extrémité 3’ puisqu’elle augmente la stabilité du piARN.

24
Q

Étapes de la biogénèse des piARN?

A

1-Les précurseurs de piARN sont produits de manière bidirectionnelle à partir de loci de piARN générant des transcrits avec des séquences sens et antisens
2-Les longs précurseurs de piARN sont clivés par une endonucléase, située dans la membrane externe des mitochondries, pour générer l’extrémité 5’ du piARN.
3-Les protéines PIWI ou Aub avec les co-chaperonnes Hsp83 et Shu sélectionnent les fragments de piARN avec un uracile en 5’.
4-Le fragment précurseur de piARN est ensuite coupé à l’extrémité 3’ par une exonucléase Trimmer, et 2-O-méthylé par la méthyltransférase Hen1

25
Q

Quelles sont les étapes du cycle ping-pong?

A

1-Aub chargé du piARN reconnait et clive les ARN complémentaires tels que les ARNm de transposon ou les transcrits dérivés du brin opposé du même cluster de piARN.
2-Ce clivage produit l’extréimité 5’ d’un nouveau piARN qui est chargé sur Ago3 et à son tour peut induire le clivage de l’ARN complémentaire.Cela génère un nouveau piARN qui est identique en séquence au piARN qui a initié le cycle.

26
Q

Vrai ou faux
Le piARN produit dans le cytoplasme peut revenir dans le noyau par un mécanisme inconnu pour réprimer épigénétiquement la transcription des transposons?

A

Vrai

27
Q

La majorité des piARN jouent un rôle pivot dans leur répression pour maintenir l’intégrité génomique et ils sont ANTISENS ou Bon SENS des séquences de transposons?

A

Antisens

28
Q

Quelle est la fonction principale des piARN?

A

Stabilisation du génome (transposons)

29
Q

Quelles sont les caractéristiques des IncARN?

A

L’ARN long non-codant est défini comme un transcrit d’une longueur supérieure à 200 nt qui n’est pas traduit en protéine.
Moyenne de 1000 à 10 000 résidus.
Souvent polyadénylés et épissés comme les ARNm.
Certains se trouvent dans le cytoplasme, la plupart sont localisés dans le noyau
4x plus de IncARN que de ARNm

30
Q

Vrai ou faux

Les IncARN ne comportent pas de coiffe à son extrémité 5’ , ni de queue poly A à l’extrémité 3’.

A

Faux

31
Q

Quelles sont les fonctions des IncARN?

A

Participent à la régulation de l’Expression des gènes controlant :

  • La condensation de la chromatine et des chromosomes au travers des modifications d’histones
  • Le recrutement direct de facteurs de transcription de l’ARN pol II
  • L’épissage alternatif
  • La stabilité des ARNm
  • La disponibilité des miARN
  • Le recrutement des polysomes
  • La modulation de l’expression des gènes des cellules voisines par des vésicules extracellulaires
32
Q

Qu’est-ce que le IncRNA Hotair?

A

Sert d’échafaudage pour au moins deux complexes distincts de modification des histones
Le complexe répressif Polycomb 2 se lie à l’extrémité 5’ de Hotai alors que le complexe LSD1/CoREST se lie à son extrémité 3’
Hotair va ainsi permettre de manière concomittante la triméthylation de H3K27 et la déméthylation de H3K4me2, et ainsi réprimer les gènes.

33
Q

Quelles sont les caractéristiques des eARN?

A

Ils sont transcrits à partir des régions enhancers.
Ne sont pas tous transcrits, ceux non transcrits sont largement plus nombreux.
Longueur entre 500 et 4000 nt.
Après transcription, la majortié restent dans le noyau.
Très instables et activement dégradés par l’exosome nucéaire
Joue un role actif dans la régulation transcriptionnelle

34
Q

Quelles sont les 2 classes de eARN?

A

1D eARN: Transcription unibidirectionnelle
eARN longs qui sont polyadénylé
Génère des eARN polyA+
Rapport H3K4me1/H3K4me3 plus faible
2D eARN: Transcription bidirectionnelle
eARN courts qui sont non polyadénylés
Génère des eARN polyA-
Rapport H3K4me1/H3K4me3 plus élevé

35
Q

Quel type d’ARN a la capacité de recruter l’ARN pol II et les facteurs de transcription pour fomer le complexe de pré-initiation?

A

eARN

36
Q

Quelles sont les fonctions des eARN?

A

Joue un rôle actif dans la régulation transcriptionnelle
Les eARN sortent l’ARN Pol II en pause au niveau des promoteurs en imitant les transcrits naissants. Le eARN peut interagir directement avec NELF agissant comme un leurre pour cette protéine. Il en résulte une perte de NELF au niveau du promoteur et la libération de l’ARN Pol II s’engage dans un allongement productif.

37
Q

Quelles sont les caractéristiques des circARN?

A

ARN simple brin qui forme une boucle continue fermée de manière covalente.
Aucun extrémité 3’ ou 5’
Résistant à la dégradation induite par les exonucléases et sont plus stables que les ARN linéaires
Formés par l’épissage alternatif de pré-ARNm
Consistent en un ou plusieurs exons et peuvent même contenir des séquences d’intron non épissés
Longueur entre 75 et 98 991 nt, moyenne entre 500 et 2000 nt
Conservé au cours de l’évolution

38
Q

Les circARN sont formé lors de quel processus?

A

Les circARN sont formés par épissage alternatif de pré-ARNm dans lequel un accepteur d’épissage en amont est joint à un donneur d’épissage en aval dans un processus appelé épissage arrière ou Backsplicing

39
Q

Quelles sont les fonctions des circARN?

A

-Éponge à miARN
Peuvent influencer le niveau des ARNms en épongeant les miARN ciblant le 3’UTR de ces cibles
-Éponge à protéines
Peuvent réguler la transcription et la traduction en épongeant les protéines de liaison à l’ARN ou d’autres protéines
-Fonction d’ARNm
Peuvent coder pour des protéines lorsqu’ils possèdent un élément permettant l’initiation interne de la traduction et un cadre de lecture.

40
Q

L’ARN peut être…

A
Dégradé = régulation du niveau d'expression
Épissé = diversité protéique
Modifié = Traduction, stabilité de l'ARN, épissage
Plateforme = Régulation de l'expression des gènes
Structuré = Traduction, stabilité de l'ARN, épissage
Édité = Épissage, virus
Actif = activité enzymatique