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Biologie moléculaire > Maturation > Flashcards

Maturation Flashcards

1
Q

Quelle modification est impliqué dans le capping du pré-ARNm?

A

L’addition de 7-méthylguanosine en 5’ de l’ARN

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Q

Vrai ou faux

La coiffe est attachée à la molécule d’ARN par une liaison triphosphate?

A

Vrai

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3
Q

Qu’est-ce qui est spécifique aux ARNm?

A

La coiffe m7G

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4
Q

Quelles sont les étapes du Capping?

A

1- Élimination d’un phosphate de l’extrémité 5’
Enzyme : ARN triphosphate
2-Ajout d’une guanosine mono-phosphatée à l’extrémité 5’ à partir du GTP
Enzyme : ARN guanylyltransférase
3-Méthylation du résidu de guanylate en position N7
Enzyme : ARN méthyltransférase
4-Méthylation de la première base adjacente
Enzyme : ARN nucléoside 2’-O-méthyltransférase

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5
Q

Le capping de l’ARN pré-messager se produit de manière co ou post-transcriptionnelle?

A

Co-transcriptionnelle

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6
Q

Le recrutement des enzymes se fait au niveau de quel domaine?

A

Au niveau du domaine CTD phosphorylé de l’ARN Pol II

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7
Q

Quelles sont les fonctions de la structure coiffe?

A

-Stabilité : Protège l’extrémité 5’ de l’ARN contre les attaques des ribonucléases.
-Traduction : Est reconnu par les facteurs d’initiation impliqués dans l’assemblage du ribosome sur l’ARNm mature avant d’initier la traduction.
m7G est reconnu par le facteur d’initiation eIF4E
-Épissage : m7G est requis pour un épissage efficace du pré-ARNm en recrutant le complexe nucléaire CBC qui orchestre l’assemblage du spliceosome
-Export : m7G recrute le complexe CBC qui intéragit avec de nombreux facteurs d’exportation nucléaire

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8
Q

Quelles sont les grandes étapes de la maturation des pré-mARN?

A 
Addition d'une coiffe en 5'
Addition d'une queue polyA en 3'
Épissage
Édition
ARN mature
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9
Q

Quelles sont les caractéristiques de la polyadénylation?

A

L’extrémité 3’ des ARNm est caractérisée par la présence de nombreux résidus A qui forme la queue polyA des ARNm matures.
La queue polyA est composé entre 100-200 nucléotides.
La polyadénylation des ARN se fait post-transcriptionnellement car la queue polyA n’est pas présente au niveau de l’ADN et n’est pas ajoutée par l’ARN polymérase II

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10
Q

Qu’est-ce qui qui permet la purification des ARNm?

A

Queue polyA

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11
Q

Quelles sont les étapes de la polyadénylation?

A

Étape #1: Le clivage
Lorsque la séquence consensus AAUAAA apparait dans une molécule d’ARN pendant la transcription, le pré-ARNm est clivé par un complexe protéique contenant une endonucléase.
Étape #2: Élongation de la queue polyA
L’enzyme PAP ajoute une chaine d’environ 200 nt A, des facteurs additionnels (PAB II) améliorent la processivité de PAP

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12
Q

Le clivage de la polyadénylation se fait à quel endroit?

A

Le clivage a lieu entre la séquence AAUAA et une région riche en GU située à 35 pb en aval de ce signal. L’ARN est coupé environ 20 nt en avanl du signal AAUAAA.

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13
Q

Qu’est-ce qui élimine la polyadénylation des ARN?

A

La délétion de la séquence AAUAAA élimine la polyadénylation des ARN

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14
Q

Quelles sont les fonctions de la polyadénylation?

A

Stabilité : Les ARNm sans queue PolyA sont dégradés rapidement par des aRNases. Importance de la coiffe et de la queue PolyA pour la stabilité des ARNm.Export : La queue polyA aide à exporter les ARNm du noyau vers le cytosol
Traduction : La queue PolyA est reconnu par Pab1p qui intéragit avec le complexe d’initiation de la traduction via eIF4G. Synergie de la coiffe et de la queue PolyA pour la traduction des ARNm.

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15
Q

À quoi sert l’épissage des ARN?

A

L’épissage est un mécanisme de l’ARN qui permet à un ARN pré-messager de se débarasser de séquences non-codantes pour donner un ARNm mature qui sera ensuite traduit en protéine dans le cytoplasme.

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16
Q

À quel endroit a lieu l’épissage des ARN?

A

Dans le noyau des cellules eucaryotes

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17
Q

Les gènes humains ont généralement plus d’ADN consacré aux introns ou aux exons?

A

Aux introns

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18
Q

Quel nucléotide est le résidu du branchement ai site de branchement?

A

L’adénosine est le résidu de branchement

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19
Q

Quelles sont les 2 réactions de l’épissage?

A

Réaction 1 : Le groupement OH du résidu A du site de branchement attaque le groupement phosphoryl du résidu G du site d’épissafe 5’
Réaction 2 : Le groupement OH de l’exon en 5’ attaque le groupement phosphoryl du site d’épissage 3’. Ceci permet la liaison des exons et la libéaration de l’intron sous la forme nommée Lariat.

20
Q

Le processus d’épissage est catalysé par un énorme complexe protéique, lequel?

A

Le spliceosome

21
Q

Qu’est-ce que le spliceosome?

A

Chaque spliceosome est composé d’environ 50 protéines et de 5 ARN.
Les 5 ARN sont des petits ARN nucléaires connus sous le nom de U1, U2, U4,U5 et U6.
Les actions du spliceosome entrainent l’épissage des deux exons et la libération de l’intron sous forme de Lariat.

22
Q

Quelles sont les étapes du spliceosome?

A

Étqpe 1: U1 et U2 se lient au site donneur 5’ et au site de branchement.
Étape 2: U4/U6 et U5 se lient pour fomer un spliceosome inactif
Étape 3: U1 et U4 sont déplacés et le spliceosome devient actif pour les 2 étapes catalytiques soit la formation du lariat et la libération de l’intron

23
Q

Vrai ou faux

Il existe plusieurs types d’épissages dont des auto-épissages?

A

Vrai

24
Q

Toutes les étapes de maturation de l’ARN se produisent de manière co ou trans-transcriptionnelle?

A

Co-transcriptionnelle

25
Q

Qu’est-ce que l’épissage constitutif?

A

Le maintien de tous les exons dans l’ARNm final mature représente l’épissage constitutif

26
Q

Qu’est-ce que l’épissage alternatif?

A

Tous les exons ne sont pas inclus dans l’ARNm et cela constitue l’épissage alternatif

27
Q

Quelles sont les conséquences de l’épissage alternatif?

A

Possibilité de nouveaux partenaires protéiques
Possibilité de nouvelles modifications post-traductionnelles
Possibilité d’une nouvelle localisation cellulaire

28
Q

Ou les exons peuvent être épissés de façon alternative?

A

Dans un tissus conjonctif et/ou une circonstance particulière

29
Q

Certains impacts biologiques de l’épissage alternatif?

A

Supprime l’apoptose
Permet l’apoptose
Décide du sexe de l’animal
Anomalies favorisent la prolifération et la survie des cellules cancéreuses

30
Q

Qu’est-ce que l’édition?

A

La modification de l’ARNm après sa fabrication.
Insertition ou délétion de U
Modification individuelle de base

31
Q

Sur quel réaction les modifications de base dans l’aRNm repose t-elles?

A

Les modifications de base dans l’ARNm repose sur une réaction de désamination
C donne U
A donne I

32
Q

Quelles sont les conséquences de l’édition des ARN?

A

ApoB: Le transcrit peut subit une réaction de désamination spécifique affectant une seule cytidine.
Cette édition permet au gène ApoB de produire 2 protéines : ApoB100 et ApoB48
Une mauvaise régulation de la modification des bases peut compromettre le développement de certains tissus et conduire a des maladies

33
Q

Quelle est la conséquence de l’ensemble des appariement internes au sein d’une molécule simple brin?

A

La strructure secondaire d’un ARN

34
Q

Quand est-ce se produit l’export des ARNm?

A

Les ARNm doivent avoir subi toutes les étapes de maturation pour pouvoir ^tre exporté vers le cytoplasme et être traduits en protéines.

35
Q

Qu’est-ce qui aide à exporter les ARNm vers le cytosol?

A

La coiffe m7G

36
Q

Quelles sont les étapes du mécanisme d’export des ARNm?

A

Étape 1: La coiffe m7G recrute le complexe CBC qui intéragit avec le complexe TREX et le facteur d’export nucléaire Aly
Étape 2: Le complexe TREX recrute les protéines d’adressage au pore TAP et p15
TAP et p15 intéragit avec des protéines spécifiques du pore, les FG-Nups, qui consttituent le panier du pore
Étape 3 : L’ARNm franchit le pore nucléaire grâce à l’ARN hélicase Dbp5 et son cofacteur Gle1

37
Q

Les ARNt et les microARN utilisent quoi pour traverser le pore nucléaire?

A

les exportines

38
Q

Dans quelles circonstances la dégradation des ARNm se produit?

A

L’absence de structure coiffe
Raccourcissement de la queue polyA
Dégradation directe par l’action d’endoribonucléase et exoribonucléase

39
Q

quelles sont les étapes de dégradation des ARNm dépendante de la polyadénylation?

A

Le complexe Lsm1-7 s’associe à l’extréimité 3’ de l’aRNm pour induire le décapage par le complexe DCP1-DCP2. L’arnm est ensuite dégrader par l’exoribonucléase 5’->3’ XRN1
2- L’ARNm déadénylé peut être dégradé dans la direction 3’->5’ par l’exosome et la coiffe est hydrolysée par l’enzyme de décapage DcpS
La queue polyA est éliminé par une activitié déadenylase.

40
Q

Mécanisme de dégradation des ARNm indépendante de la déadenylation

A

Rps28B intéragit avec Edc3 pour activer le complexe décapage DCp1-Dcp2
Aprèes décapage, l’ARNm est dégradé par Xrn1

41
Q

Mécanisme de dégradation des ARNm médiée par endonucléase

A

Une endonucléase provoque le clivage internet de l’ARNm, qui génère deux fragments chacun avec une extrémité non protégée
Les fragments sont dégradés par l’exoribonucléase XRN1 et l’exosome

42
Q

Vrai ou faux

Tous les ARN ont besoin d’être maturer

A

VRAIII

43
Q

À quoi sert principalement l’ARNr?

A

L’ARNr est le constituant principal des ribosomes qui sont en charge de la synthèse des protéines à partir des ARNm

44
Q

À quoi sert principalement l’ARNt?

A

L’ARNt reconnait un codon sur l’ARNm et amène l’acide aminé approprié au ribosome pour permettre la synthèse des protéines

45
Q

Maturation des ARNr

A

Les ARNr sont synthétisés, maturés et assemblés dans le nucléole à partir de pré-ARN transcrits l’ARN polymérase I
L’ARNr 5S est synthétisé dans le nucléoplasme par l’ARN Pol III.
Le pré-ARN 47S est méthylé par la fibrillarine
Laa maturation des ARNr est une succesion d’étapes d’élimination des séquences ETS et ITS

46
Q

Queles sont les 5 régions de l’ARN de transfert?

Avec un dessin

A

Tige acceptrice sur laquelle l’acide aminé correspondant à l’ARNt est associé par le site de fixation
La tige-boucle de l’anticodon qui reconnait et s’associe aux codons de l’ARNm
D-loop
T-loop
Région variable

Biologie moléculaire (4 decks)

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