Trascrizione eucarioti Flashcards
Differenze trascrizione eucariotica - procariotica
Presenza dei fattori trascrizionali (senza i quali il processo non può avere inzio) Tre diverse RNA polimerasi Maggior numero di proteine accessorie Presenza cromatina No operoni policistronici
Caratteristiche RNA pol I?
Trascrizione rRNA; nucleolo; no sensibilità amanitina
Caratteristiche RNA pol II?
Più complessa; mRNA, snoRNA, snRNA e microRNA; nucleoplasma, sensibilità amanitina
Caratteristiche RNA pol III?
tRNA e altri piccoli RNA; nucleoplasma; amanitina
Caratteristica RNA pol in generale?
Proteine multimeriche, conservano subinità beta e beta ‘
Classificazione fattori trascrizionali
Generali (TfII etc)
Inducibili e a monte (coattivatori e corepressori)
Nomina tutte le sequenze regolatorie che conosci
Promotore; elementi prossimali al promotore (UAS); elementi regolatori a lungo raggio: enhancer, silencer, isolatori; boundary elements: LCR e MAR
Famiglie di fattori di regolazione per RNA pol II
Elementi di posizionamento o “basali”: BRE, TATA box, INR, DPE (TATA less) + elementi di regolazione (prossimali ed enhancer)
Cosa sono gli elementi isolatori?
Permettono di marcare il confine tra le regioni di eu- ed eterocromatina, bloccando l’azione di enhancer e di silenziatori in quelle regioni in cui non è necessario che la cromatina modifichi la sua trascrittività
Cosa sono i LCR?
Sono delle regioni analoghe agli enhancer, ma orientamento dipendenti, interagendo con specifici fattori di trascrizione permettono, ad es., di attivare i geni delle globine
Cosa sono le MAR?
Sequenze di controllo che legano i vari fattori proteici, ccontrollano l’associazione del DNA con la matrice e la formazione di domini a loop o anse di DNA
Quale caratteristica rende la RNA pol II diversa dalle altre?
La presenza di CTD, ricco in ser, thr, pro e tyr. Se non è fosforilato la trascrizione può avere inzio, se è fosforilato può avere la fase di allungamento
Qual è il promotore universale per RNA pol II?
TATA box (TATAAA)
Cosa rende possibile l’inizio della trascrizione?
L’interazione della RNA pol II con fattori basali generali per formare PIC
Qual è il primo fattore a legarsi a TATA?
Il fattore THIID; si lega nel solco minore del DNA attraverso un beta foglietto, distorcendo così il DNA (conformazione a “sella di cavallo”) e permettendo l’ingresso della RNA pol II e degli altri fattori di trascrizione. è costituito da TBP e TAF