Translation

Question 1

Hvad er translation?

Answer 1

Translation er en proteinsyntes hvor proteiner dannes. Det dannes udefra mRNA som koder for proteiner. I cytosolen har mRNA en overlevelsestid på få minutter hvor det vigtigt at det i de få minutter koder for et protein.

Question 2

Hvad kan man ellers kalde mRNA?

Answer 2

Man kan kalde det for genetisk RNA da det kan kode for proteiner

Question 3

Giv eksempler på funktionel RNA

Answer 3

Fx tRNA og rRNA som dannes udefra DNA men koder ikke for noget og har bestemte funktioner.

Question 4

Hvor foregår translation?

Answer 4

cytosol

Question 5

Ribosom

Answer 5

Ribosomer translatere proteiner og kan både være en lille subunit og en stor subunit.
Ribosomer består af 2 ting;
1. proteiner
2. ribosomal RNA, rRNA

Question 6

Hvilke 4 molekyler er nødvendig for at starte Initiering?

Answer 6

1. GTP som er det samme som ATP, et molekyle der indeholder 2 energirige bindinger med 3 phosphater
2. mRNA
3. lille ribosomal subunit SRS
4. tRNA som er bundet til en aminosyre der hedder Methionin

Question 7

Hvad sker der i cytosolen?

Answer 7

SRS genkender 5’cap Guanosin - methyl kompleks. SRS er bundet til tRNA, som har en aminosyrer der hedder methionin,

Question 8

Hvad sker der efter SRS har genkendt 5’cap?

Answer 8

SRS som er er bundet til tRNA skal kører på mRNA. Den vil kører indtil den finder noget der passer til tRNA. tRNA har bestemte nukleotider som hedder UAC så den skal havde noget komplementært fx AUG. Den første tRNA har altid nukleotider der hedder UAC som er bundet til metionin.

Question 9

Hvad vil det sige at tRNA skal have noget komplementært der passer til dens nukleotider?

Answer 9

tRNA har en 3’ og 5’ n, så hvis den foldes henover mRNA vil enderne passe da de er antiparallele/komplementært.

Question 10

Hvordan kan komplekset producere proteiner?

Answer 10

Det gør den ved at SRS kører på mRNA men tRNA stopper op når det finder noget der passer komplementært til den som er AUG sekvensen.

Question 11

Hvornår starter proteinsyntesen?

Answer 11

Ved start codon AUG.

Question 12

Hvad sker der når startcodon er fundet?

Answer 12

Når det “klikker”, dvs når SRS har fundet de komplementære nukleotider til tRNA, stopper SRS da proteinsyntesen er startet. Hermed “ringes” der til den store ribosomal subunit LRS. Nu stopper initering

Question 13

Hvad er startcodon?

Answer 13

Start codon er altid AUG og er 3 nukleotider som kan give aminosyrer.

Question 14

Hvad er anticodon?

Answer 14

Anticodon er også 3 nukleotider som kan binde til codon, de findes på tRNA.

Question 15

Hvad er codon?

Answer 15

Alle de nukleotider der er på mRNA kaldes for codon.

Question 16

Hvad er utranslateret region?

Answer 16

mRNA før startcodonkaldes for utranslateret region fordi det ligger før startcodon.

Question 17

Hvordan starter elongering?

Answer 17

Når startcodon AUG er bundet til det komplementære nukleotider UAC, vil E, P og A regioner (LRS) forekomme.

Question 18

Hvad er E, P pg A?

Answer 18

Ens for SRS og LRS er at de begge har 3 rum. For LRS kaldes de 3 ru, får E, P og A.
E står for exit da tRNA skal forlade rummet.
P står for peptidbinding, der dannes peptidbindinger mellem aminosyrene.
A er accceptorrum, det rum der skal acceptere nyt tRNA.

Question 19

Hvornår “klikker” det? hint. hvornår et vilkårligt codon passer til anticodon på tRNA?

Answer 19

Et vilkårligt codon vis nukleotider hedder CCC, skal der komme tRNA som har anticodon der passer til CCC., så vil det sige klik. I cellen diger det ikke klik men der vil være noget energi der frigives ved at anteivodon passer på codonet på mRNA’et som vil simulere ribosomet.

Question 20

Hvad indebære Wobbel-baseparring?

Answer 20

Fx i det eksempel med et vilkårligt codon der har følgende codons CCC, er det vigtigste at de 2 første passer men det sidste gøre ikke så meget hvis den ikke passer 100% så den kaldes for en wobble.

Question 21

Hvad sker der når der kommer nyt tRNA i A site?

Answer 21

Da der allerede er en aminosyre (Methionin) i P site, hvor (GGG er den komplementære anticodon) kommer tRNA med GGG, med en ny aminosyre X.

Question 22

Hvordan får man methionin til at binde aminosyrer X? Hint. klipning

Answer 22

I region P klippes i bindingen mellem methionin og tRNA, for at der dannes en binding mellem metionin og efterfølgende aminosyrer.

Question 23

Hvad for et enzym binder de 2 aminosyrer sammen i P-region?

Answer 23

De to aminosyrer binder via peptidyltransferase.

Question 24

Hvad for et enzym er det der klipper?

Answer 24

Der skal bruges et enzym der er en del af det store ribosomale subunit LRS, som hedder ribozym.

Question 25

Hvad er en Ribozyme?

Answer 25

Er et domæne på det store ribosomal subunit som har enzymatisk aktivitet, og indeholder peptidyltransferase.

Question 26

Hvad er den enzymatiske aktivitet som ribozymet udfører?

Answer 26

Dens enzymatiske aktivitet er at klippe mellem metionin og tRNA og danner bindingen mellem metionin og næste aminosyrer.

Question 27

Hvilken rolle har translokation?

Answer 27

LRS rykker en tak frem. A region vil forblive tom men E og P vil være fyldt. tRNA som var på P site ændres til E site da det skal Exit.

Question 28

hvad sker der med tRNA i dens nye lokalisering i E site?

Answer 28

Der vil være et tomt tRNA da aminosyrene vil være klippet fra. Så den forlader komplekset, og den vil ud og finde et nyt methionin den kan binde til den også komme tilbage igen. Da der ikke er aminosyre på tRNA kan den ikke bruges.

Question 29

Hvad ligger der er i ordet elongering?

Answer 29

Ovenstående process vil foregår igen hvor tRNA med methion vil komme igen i A site vis nukleotider skal passe til mRNA, og når det passer vil det “bindes” sammen via klipning som ribozyme vil udfører. På den måde bliver kæden længer og længere - det bliver elongeret.

Question 30

I hvor lang tid foregår processen?

Answer 30

Processen foregår indtil den rammer en stop-codon som stopper processen.

Question 31

Hvad for nogle 3 stopcodons er der?

Answer 31

1. UGA
2. UAG
3. UAA

Question 32

Hvordan foregår terminering?

Answer 32

På starten af aminosyren vil der altid være en N terminal (Nitrogen gruppe) efterfuldt af eksempelvis 2 aminosyrergrupper, og stopcodon. Der vil komme en releasefaktor.

Question 33

Hvad sker der efter der er kommet en releasefaktor?

Answer 33

Releasefaktoren vil binde til stopcodon som kan være et af det 3
1. UGA
2. UAG
3. UAA
Det danner en hydrolyse det sidste aminosyre, så det kan give slip på tRNA (bindingen mellem aminosyren og tRNA nedbrydes). AMinosyren vil ryge op og der dannes en C-terminal.

Question 34

Hvorfor starter det første aminosyre i hvert protein ikke med metionin?

Answer 34

Først, laver vi et protein, som altid vil starte fra N terminal til C terminal. Første aminosyre i et hvert protein er methionin, som ender med at blive fjernet. Når man eksaminerer aminosyre i kroppen finder man ud af at proteinerne ikke starter med methionin, fordi den kun er med til at starte syntesen men når jeg har det færdigt syntetiseret protein klippes den fra via en protease.

Question 35

Der vil dog være nogle proteiner der starter med methionin, Hvorfor?

Answer 35

Fordi den nok har haft efter start codon som altid starter med AUG, en til AUG som koder for methionin så når vi for klippet methionin fra vil vi beholde det næste som er methionin.

Question 36

Hvor mange nukleotider har vi?

Answer 36

4 nukleotider
DNA: AGCT
mRNA: AGCU

Question 37

Hvor mange codon har vi?

Answer 37

Når der kombineres 3 af dem
4^3=64
1 af dem vil være AUG methionin startcodon

3 af dem vil være stopcodon, UGA, UAG og UAA som ikke koder for nogen aminosyre nonsene ikke nogen sense for aminosyre.

Vi har 60 codons tilbage som går til 19 aminosyre fordi vi har 20 aminosyre i alt og 1 af dem er gået til metionin i startcodon.

Der er flere codons for hver aminosyre undtaget methionin, tRNA binder til aminosyrer som kan få dem til at passe.

Question 38

Hvad er det der kobler aminosyrer til tRNA?

Answer 38

Når aminosyrer fjernes fra tRNA da tRNA skal væk, skal der være noget der kobler tRNA til aminosyre som er følgende enzyme: Aminoacyl tRNA syntetase som bruger 2 energier (fx 2 ATP molekyler eller lign.) for at koble aminosyre til tRNA.