Translacja Flashcards

1
Q

Co to jest pre-mRNA?

A
  1. Produkt transkrypcji w komórkach eukariotycznych
  2. Cząsteczka mRNA zawierająca odcinki nazywane intronami i eksonami (egzonami).
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Co to jest intron?

A
  1. Odcinek DNA, który nie koduje informacji o łańcuchu polipeptydowym (o aminokwasach)
  2. Informuje na temat realizacji informacji genetycznej
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Podaj przykłady intronów.

A

a) sekwencje startowe
b) sekwencje terminalne
c) wzmacniacze i wyciszacze, czyli sekwencje zwiększające powinowactwo enzymów do transkrypcji konkretnych odcinków DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Co to są eksony?

A
  1. Odcinki kodujące informacje o łańcuchach polipeptydowych
  2. Tylko z nich składa się DNA komórek prokariotycznych, przez co produktem transkrypcji jest u nich mRNA.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Jakiemu procesowi podlega pre-mRNA?

A

Splicing

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Na czym polega splicing?

A
  1. Usunięcie intronów
  2. Połączenie eksonów
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Kiedy występuje splicing alternatywny?

A
  1. Eksony mieszają się kolejnością
  2. Wymieszane łączą się formując mRNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Jakie znaczenie w biologii ma splicing alternatywny?

A
  • 1 odcinek DNA koduje informację o budowie kilku (kilkunastu/kilkuset) różnych polipeptydów.
  • Każda kombinacja eksonów oznacza powstanie innego produktu końcowego.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Co otrzymujemy w wyniku splicingu?

A

mRNA, które jest przystosowane do translacji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Co robi mRNA po obróbce potranslacyjnej?

A

Wychodzi z jądra komórkowego do cytozolu.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Co jest przyłączone do końca 3’ mRNA?

A

Sekwencja Poli(A) - powtarzające się wielokrotnie nukleotydy adeninowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Przed czym chroni sekwencja Poli(A) mRNA?

A

Poli(A) chroni mRNA przed działaniem enzymów hydrolitycznych (głównie nukleaz trawiących kwasy nukleinowe) w cytoplazmie.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Co jest przyłączone do końca 5’ mRNA?

A

CAP (czapeczka)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Co robi czapeczka?

A
  • chroni mRNA przed enzymami obecnymi w cytoplazmie
  • umożliwia mRNA połączenie z małą podjednostką rybosomu
  • inicjuje proces translacji
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Dlaczego translacja to najważniejszy proces biochemiczny?

A
  1. Ponieważ prowadzi bezpośrednio do powstania peptydu z kwasu nukleinowego
  2. Peptyd utworzy białko
  3. Białko to podstawowy element większości procesów biochemicznych
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Co robią białka?

A
  1. Budują
  2. Transportują
  3. Kontrolują wszystko co się dzieje w komórce.

Bez nich życie by nie istniało

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Kiedy rozpoczyna się translacja?

A
  1. Koniec 5’ mRNA (CAP) łączy się z małą podjednostką rybosomu
    a) czyli CAP + mała podjednostka = kompleks “maszyna translacyjna”
  2. Do maszyny translacyjnej dołącza się duża podjednostka rybosomu
    b) czyli mamy: mała podjednostka + mRNA (CAP) + duża podjednostka
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Co jest warunkiem połączenia podjednostek?

A

Odpowiednie stężenie jonów Mg2+ w cytozolu komórki (lub w stromie/matriks).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Jakie kluczowe miejsca zawiera duża podjednostka?

A
  1. miejsce A
  2. miejsce P
  3. miejsce E
20
Q

Co robi mRNA po połączeniu podjednostek?

A

mRNA przemieszcza się między nimi

21
Q

Do jakiego momentu mRNA przemieszcza się między podjednostkami?

A

Do momentu gdy w miejscu P znajdzie się kodon RNA o sekwencji startowej (AUG).

22
Q

Co się dzieje od momentu gdy w miejscu P znajdzie się kodon AUG?

A

Rozpoczyna się tworzenie łańcucha polipeptydowego.

23
Q

Co się znajduje w miejscu A?

A

tRNA, które czeka aż w miejscu P znajdzie się kodon mRNA z informacją o konkretnym aminokwasie.

24
Q

Co się stanie gdy w miejscu P znajdzie się kodon mRNA z informacją o konkretnym amonokwasie?

A

tRNA przenosi odpowiedni aminokwas (który koduje dany kodon w miejscu P) na miejsce P i chwilowo wiąże się z mRNA za pomocą antykodonu.

25
Q

Co się dzieje po połączeniu aminokwasu z peptydem?

A
  • mRNA przesuwa się - na miejsce P wdziera się inny kodon
    (mRNA przesuwa się wraz z tRNA, ale aminokwas zostaje tam gdzie był i dołączają się do niego kolejne wraz z przesuwaniem się nici)
  • tRNA pozbawione aminokwasu wydostaje się z rybosomu przez miejsce E.
26
Q

Co się dzieje w poszczególnych miejscach?

A
  1. miejsce A - tRNA łączy się z aminokwasem
  2. miejsce P - antykodon tRNA rozpoznaje kodon mRNA, powstaje wiązanie peptydowe między aminokwasami
  3. miejsce E - tRNA odłącza się od rybosomu
27
Q

Czym jest antykodon?

A

Specjalna sekwencja nukleotydów na cząsteczce tRNA komplementarna do kodonów mRNA.

28
Q

Co katalizuje rybozym (rRNA)?

A

Rybozym katalizuje reakcję łączenia się aminokwasów - powstawanie wiązań peptydowych.

29
Q

Do jakiego momentu trwa wydłużanie łańcucha peptydowego?

A

Gdy w miejscu P znajdzie się kodon terminalny mRNA.

30
Q

Dlaczego kodon terminalny jest sygnałem do zakończenia translacji?

A

Ponieważ kodony terminalne nie posiadają komplementarnych kodonów tRNA, przez co tRNA nie połączy się z nimi.

31
Q

Co się dzieje z podjednostkami rybosomu po zakończeniu translacji?

A

Podjednostki rybosomu ulegają rozdzieleniu.

32
Q

Co się dzieje z peptydem i mRNA po zakończeniu translacji?

A

Peptyd i mRNA zostają uwolnione, a każde z nich podąża odtąd niezależną ścieżką.

33
Q

Czy powstały po translacji peptyd może od razu odgrywać rolę w metabolizmie?

A

Rzadko. Zwykle ulega szeregowi modyfikacji, które przemieniają go w białko proste (nadają wtórne struktury), a często także złożone.

34
Q

Gdzie dochodzi do modyfikacji potranslacyjnej?

A

W siateczce śródplazmatycznej oraz aparacie Golgiego.

35
Q

Wymień najczęstsze modyfikacje potranslacyjne.

A
  1. Obróbka proteolityczna
  2. N-acetylacja, N-metylacja, N-formylacja
  3. S-nitrozylacja
  4. Hydroksylacja
  5. Fosforylacja
  6. Defosforylacja
  7. Polirybozylacja
  8. Dołączenie lipidów i metali
  9. Glikozylacja
  10. Ubikwitynacja
  11. Sumoilacja
  12. Palmitylacja
36
Q

Obróbka proteolityczna

A

Aktywacja białka poprzez usunięcie pewnych fragmentów łańcucha polipeptydowego (działanie proteaz)

37
Q

N-acetylacja, N-metylacja, N-formylacja

A

Dołączenie grupy acetylowej, matylowej i formylowej

38
Q

S-nitrozylacja

A

Dołączenie tlenku azotu do grupy tiolowej

39
Q

Hydroksylacja

A

Dołączenie grupy hydroksylowej -OH

40
Q

Fosforylacja

A

Aktywacja białka przez dołączenie grupy fosforanowej

41
Q

Defosforylacja

A

Dezaktywacja przez odłączenie grupy fosforanowej

42
Q

Polirybozylacja

A

Dołączenie adeniny

43
Q

Glikozylacja

A

Przyłączenie reszt cukrowych do peptydu

44
Q

Ubikwitynacja

A

Przyłączenie ubikwityny i późniejsza degredacja

45
Q

Sumoilacja

A

Kowalencyjne przyłączenie białek SUMO do białka docelowego, powodujące zmianę jego funkcji i właściwości

46
Q

Palmitynacja

A

Lipidowa modyfikacja białek polegająca na dołączeniu reszty kwasu palmitynowego poprzez resztę aminokwasową cysteiny