Transfert génétique Flashcards
Q : Quels sont les deux types de transfert génétique ?
Transfert vertical : de la cellule mère à sa descendance
Transfert horizontal (HGT) : entre bactéries non liées par descendance
Q : Quels sont les trois mécanismes classiques de transfert horizontal ?
Transformation
Conjugaison
Transduction
Q : Quels sont les deux mécanismes récents de transfert ?
Vésicules membranaires
Nanotubes
Q : Quelle est la vitesse moyenne du transfert d’ADN par conjugaison ?
1 minute ≈ 40 kb
100 minutes ≈ 4 200 kb (taille du génome d’E. coli)
Q : Qu’est-ce qu’un plasmide ?
Molécule d’ADN double brin, souvent circulaire, non essentielle, codant des fonctions adaptatives.
Q : Qu’est-ce que le facteur F ?
Plasmide conjugatif de 100 kb chez E. coli permettant le transfert via pilus sexuel.
Q : Quelles sont les 3 formes de donneuses dans la conjugaison ?
F+ : plasmide libre
Hfr : plasmide intégré
F’ : plasmide + ADN chromosomique
Q : Quelles régions importantes trouve-t-on sur le facteur F ?
OriV : origine de réplication
OriT : origine de transfert
Tra : gènes de conjugaison
IS : insertion dans le chromosome
Q : Quelle enzyme coupe l’ADN au niveau de OriT ?
TraI, clive l’ADN au niveau d’OriT et initie le transfert.
Q : Qu’est-ce qu’un IS (Insertion Sequence) ?
Élément génétique transposable simple :
1 gène transposase
2 IR (séquences inversées répétées)
Q : Quels sont les deux types de transposition ?
Conservatrice : couper / coller
Réplicative : copier / coller
Q : Quelle est la définition d’un mérodiploïde ?
Bactérie partiellement diploïde pour un gène (ex : F’ apporte un second exemplaire d’un gène).
Q : Que permet la conjugaison interrompue ?
Cartographier les gènes bactériens
Grâce à : transfert orienté, séquentiel, à vitesse constante
Q : Que faut-il pour contre-sélectionner une donneuse Hfr ?
Streptomycine (Hfr sensible)
Auxotrophie spécifique (ex : Hfr Thr+, receveuse Thr-)
Q : Quels sont les 3 rôles de la région Tra du facteur F ?
Formation du pilus sexuel (gènes traABCEFGH)
Transfert de l’ADN (traI, traD)
Exclusion de surface entre F+ (traS, traT)
Q : Quelle est la fonction principale des vésicules membranaires bactériennes ?
Leurres pour bactériophages
Transport d’ADN, toxines, protéines
Résilience en situation de stress
Q : Quelle est la différence entre les régions OriV et OriT ?
OriV : origine végétative, initiation de la réplication du plasmide
OriT : origine de transfert, début de la conjugaison
Q : Pourquoi une bactérie Hfr ne peut-elle pas transformer une receveuse en donneuse F+ ?
Parce que le facteur F est intégré dans le chromosome. Il faudrait transférer tout le chromosome pour transmettre F, ce qui est très peu probable.
Q : Quels sont les trois critères qui permettent la cartographie par conjugaison interrompue ?
Transfert orienté
Transfert séquentiel
Vitesse constante (~1 min pour 40 kb)
Q : Qu’est-ce qu’un transposon composite ?
Un fragment d’ADN encadré par deux IS identiques, transportant un gène (ex : résistance ATB), qui peut être mobilisé en entier.
Q : Quelles sont les 5 grandes familles d’éléments génétiques transposables bactériens ?
Séquences d’insertion (IS)
Transposons composites
Transposons unitaires
Transposons conjugatifs (chez Gram+)
Phages mutateurs (Mu, D108)
Q : Quelle enzyme est essentielle à la recombinaison homologue entre les séquences IS ?
RecA, qui catalyse les crossing-over entre séquences homologues.
Q : Comment différencier un plasmide d’un chromosome bactérien très petit ?
Le plasmide n’a pas de gènes vitaux
Il possède un réplicon (gène rep)
Peut exister sous forme libre ou intégrée (épisome)