Transcription/Traduction Flashcards
C’est quoi un UAS ?
C’est une séquence de régulation qui va permettre d’augmenter l’efficacité de transcription d’un gène proche. Elle permet le recrutement de transactivateurs
Séquence consensus Kozak mammifères
GCCA/GCCAUGG (A/G - purine)
Séquence consensus Kozak Levures
AAAAAAATGTCT (6 A en amont ATG)
Equivalent Kozak chez bactéries
Shine Dalgarno
Séquence consensus Shine Dalgarno
AGGAGG
C’est quoi la composition d’un terminateur minimal ?
Efficiency site (TATATA), positionning site (AATAAA) et poly A (TTTCAAA)
Comment fonctionne la transcription ?
Reconnaissance du promoteur de base par les facteurs généraux de transcription qui permet la formation du complexe de préinitiation de la transcription. Pol commence la transcription puis pause pour permettre l’ajout de la coiffe puis élongation puis terminaison par recrutement des facteurs spécifiques.
Quelles sont les différentes polymérases ?
Pol I - ARN ribosomiques (18S, 5,8S et 28S et Pré-rRNA 45S)
Pol II - mRNA et snRNA et miRNA
Pol III - tRNA + 5S rRNA + ncRNA
Pol IV (Plantes) - siARN
Pol V (Plantes) - ncARN pour modification de la chromatine
Pol mitochondriale
2 Pol chloroplastique (1 type bactérienne codée par chloroplaste et 1 type phagique codée par génome)
C’est quoi le promoteur GPD ? Sa particularité ?
C’est un promoteur fort utilisé en génétique pour surexprimer une protéine
C’est quoi le promoteur CYC1 ? Sa particularité ?
C’est un promoteur faible dérivé de S. cerevisiae. C’est le promoteur du cytochrome C
C’est quoi le promoteur GAL1 ? Sa particularité ?
Le promoteur GAL1 est réprimé en présence de glucose
dans le milieu et induit en présence de galactose. Promoteur de la galactokinase
C’est quoi le promoteur TEF1 ? Sa particularité ?
Promoteur d’un facteur d’élongation. Promoteur faible exprimé en présence de glucose.
C’est quoi une TATA Box ? Ca sert à quoi ?
Site de formation du complexe de préinitiation
C’est quoi un TSS ?
Site d’initiation de la transcription
Pourquoi le TSS sur les schémas est aussi long ?
In eukaryotes, the sequence around the TSS, sometimes referred to as the Initiator sequence (Inr), has been described to play an important role in transcription initiation