Divers

Question 1

C’est quoi un stress nitrosatif ?

Answer 1

C’est une condition de carence en azote

Question 2

C’est quoi MyD88 ?

Answer 2

C’est un effecteur de la voie Toll

Question 3

Quelles sont les voies du SI chez la drosophile ?

Answer 3

IMD (Gram-), Toll (Gram+ et champis) et RNAi (virus)
Toll : Cascade de protéases après reconnaissance du PAMP qui induit la fixation de Spätzle sur Toll receptor qui lui même va induire la production d’un signal, par un complexe dont l’un des composants est MyD88.

Question 4

Comment déterminer les interactions proteines-proteines autrement qu’avec IP ?

Answer 4

FRET, Crosslinking, BiFC, double hybride, Pulldown, ELISA, Phage display

Question 5

C’est quoi la GST ?

Answer 5

Glutathione-S-transférase

Question 6

Comment on Pull-down la GST ?

Answer 6

On fait une protéine de fusion GST qu’on incube avec des extraits cellulaires et qu’on purifie ensuite par affinité sur des billes de Sepharose recouvertes de Gluthation. Et ensuite on élue les protéines

Question 7

D’où vient l’épitope HA ?

Answer 7

Virus influenza de type I

Question 8

A quoi ça sert d’avoir un 3xHA ?

Answer 8

Amplification du signal

Question 9

C’est quoi la différence entre prévalence et incidence ?

Answer 9

Prévalence c’est le nombre de personnes atteintes sur la population susceptible d’être infectée.
Incidence c’est nb de nvx cas observés sur le nombre de sujets à risque

Question 10

Quelle taille fait la GFP ?

Answer 10

27 kDa

Question 11

Comment on sélectionne les mutants par la fluorescence ?

Answer 11

FACS

Question 12

Comment fonctionne le FACS ?

Answer 12

Individual cells are “interrogated” by the laser as in a normal flow cytometer.
The machine is set up so that each individual cell then enters a single droplet as it leaves the nozzle tip. This drop is given an electronic charge, depending on the fluorescence of the cell inside the drop.
Deflection plates attract or repel the cells accordingly into collection tubes.

Question 13

Pourquoi on a pas sélectionné avec le FACS ?

Answer 13

Parce qu’on ne pouvait pas l’utiliser

Question 14

D’où vient la GFP ?

Answer 14

Aquorea victoria

Question 15

C’est quoi la différence entre la GFP et l’EGFP ?

Answer 15

EGFP a une meilleure efficacité de transcription chez les eucaryotes

Question 16

La GFP est exprimée tout de suite dans la cellule ?

Answer 16

Non, il faut d’abord que la protéine soit maturée, modifs post traductionnelles. Ca peut mettre 30 min avant d’être exprimé.

Question 17

D’où vient la fluorescence de la GFP ?

Answer 17

La quasi totalité de la séquence est
nécessaire à la forma4on du
fluorophore (11 feuillets β en
tonneau).

Question 18

Pourquoi on change les tubes des mouches tous les 8 jours ?

Answer 18

Pour renouveller le milieu de culture et parce que les mouches ont pondu

Question 19

C’est quoi la différence entre épifluorescence et confocal ?

Answer 19

pinhole : diaphragme à iris qui bloque physiquement les rayons lumineux provenant
de points excités situés au dessus ou au dessous du point focal

Question 20

C’est quoi le DIC ?

Answer 20

Interférence de 2 rayons lumineux polarisés dans des plans perpendiculaires
Polarisation et contraste de phase
Images en relief - échantillons épais non colorés

Question 21

Comment fonctionne le système FLP-FRT ?

Answer 21

Il y a une séquence FRT qui est insérée de part et d’autre de la séquence d’intérêt et quand on ajoute la recombinase FLP, il y a recombinaison entre les deux sites, et excision de ce qu’il y a entre les 2

Question 22

Quels types de signaux de localisation sont retrouvés en N-ter ?

Answer 22

Signaux de localisation dans les compartiments, comme le peptide signal, ou bien encore les NLS

Question 23

Comment fonctionne Cre-Lox ?

Answer 23

Pareil que FLP-FRT. Il y a une séquence LoxP qui est insérée de part et d’autre de la séquence d’intérêt et quand on ajoute la recombinase Cre, il y a recombinaison entre les deux sites, et excision de ce qu’il y a entre les 2

Question 24

C’est quoi la RNase P ?

Answer 24

C’est endoribonucléoprotéine qui est impliquée dans la maturation des ARNt

Question 25

Comment foncitonne URA-Blaster ?

Answer 25

URA3 avec de chaque coté les séquences hisG. Tu sélectionnes sur Ura- l'intégration de la cassette. Et ensuite, il y a des évenements de recombinaison entre les hisG, du coup ça dégage URA3, et tu sélectionnes les levures sur un milieu 5-FOA

Question 26

C'est quoi un épitope ?

Answer 26

C'est une molécule qui peut être reconnue par un anticorps

Question 27

Est ce que le gène de résistance ne peut pas apporter un biais ?

Answer 27

Si il peut, d'où l'intérêt de mettre en place un système qui permettrait de l'exciser une fois la sélection des souches effectuées

Question 28

Comment c'est comparable l'infection entre mouche et souris ?

Answer 28

 Ils déterminent des scores de virulence, chez la souris, basés sur la charge fongique et le fitness de la levure, et le la droso sur la survie de l’hôte. Et ensuite ils comparent les deux. En gros, ils observent le même comportement, sauf que chez la drosophile, la mouche meurt.

Question 29

Pourquoi il faut insérer une mutation dans le codon stop ?

Answer 29

Parce que sinon, la protéine sera synthétisée normalement et il n'y aura pas d'étiquette.

Question 30

Comment on analyse le transcriptome ?

Answer 30

RNA Seq

Question 31

Comment fonctionne l'ampicilline ?

Answer 31

inhibits bacterial cell-wall synthesis by inactivating transpeptidases on the inner surface of the bacterial cell membrane.

Question 32

C'est quoi le méthylhydrosybenzoate ?

Answer 32

antibactérien/antifongique

Question 33

Pourquoi allonger le temps de régénération des cellules avec la Zéocine ?

Answer 33

Parce que la Zeocine c'est fongicide donc il faut laisser le temps d'exprimer le gène de résistance avant de le mettre sur un milieu sélectif

Question 34

Comment fonctionne la méthode de Bradford ?

Answer 34

La méthode de Bradford est un dosage colorimétrique, basé sur le changement d'absorbance (la mesure se fait à 595 nm), se manifestant par le changement de la couleur du bleu de Coomassie après liaison (complexification) avec les acides aminés basiques (arginine, histidine, lysine) et les résidus hydrophobes des acides aminés présents dans la ou les protéines

Question 35

Comment on calcule le temps de génération ?

Answer 35

taux de croissance µx- coeff directeur de la droite en phase expo : lnxB-lnxA/tB-tA temps génération : il se calcule par G=ln2/µx