Divers Flashcards
C’est quoi un stress nitrosatif ?
C’est une condition de carence en azote
C’est quoi MyD88 ?
C’est un effecteur de la voie Toll
Quelles sont les voies du SI chez la drosophile ?
IMD (Gram-), Toll (Gram+ et champis) et RNAi (virus)
Toll : Cascade de protéases après reconnaissance du PAMP qui induit la fixation de Spätzle sur Toll receptor qui lui même va induire la production d’un signal, par un complexe dont l’un des composants est MyD88.
Comment déterminer les interactions proteines-proteines autrement qu’avec IP ?
FRET, Crosslinking, BiFC, double hybride, Pulldown, ELISA, Phage display
C’est quoi la GST ?
Glutathione-S-transférase
Comment on Pull-down la GST ?
On fait une protéine de fusion GST qu’on incube avec des extraits cellulaires et qu’on purifie ensuite par affinité sur des billes de Sepharose recouvertes de Gluthation. Et ensuite on élue les protéines
D’où vient l’épitope HA ?
Virus influenza de type I
A quoi ça sert d’avoir un 3xHA ?
Amplification du signal
C’est quoi la différence entre prévalence et incidence ?
Prévalence c’est le nombre de personnes atteintes sur la population susceptible d’être infectée.
Incidence c’est nb de nvx cas observés sur le nombre de sujets à risque
Quelle taille fait la GFP ?
27 kDa
Comment on sélectionne les mutants par la fluorescence ?
FACS
Comment fonctionne le FACS ?
Individual cells are “interrogated” by the laser as in a normal flow cytometer.
The machine is set up so that each individual cell then enters a single droplet as it leaves the nozzle tip. This drop is given an electronic charge, depending on the fluorescence of the cell inside the drop.
Deflection plates attract or repel the cells accordingly into collection tubes.
Pourquoi on a pas sélectionné avec le FACS ?
Parce qu’on ne pouvait pas l’utiliser
D’où vient la GFP ?
Aquorea victoria
C’est quoi la différence entre la GFP et l’EGFP ?
EGFP a une meilleure efficacité de transcription chez les eucaryotes
La GFP est exprimée tout de suite dans la cellule ?
Non, il faut d’abord que la protéine soit maturée, modifs post traductionnelles. Ca peut mettre 30 min avant d’être exprimé.
D’où vient la fluorescence de la GFP ?
La quasi totalité de la séquence est
nécessaire à la forma4on du
fluorophore (11 feuillets β en
tonneau).
Pourquoi on change les tubes des mouches tous les 8 jours ?
Pour renouveller le milieu de culture et parce que les mouches ont pondu
C’est quoi la différence entre épifluorescence et confocal ?
pinhole : diaphragme à iris qui bloque physiquement les rayons lumineux provenant
de points excités situés au dessus ou au dessous du point focal
C’est quoi le DIC ?
Interférence de 2 rayons lumineux polarisés dans des plans perpendiculaires
Polarisation et contraste de phase
Images en relief - échantillons épais non colorés
Comment fonctionne le système FLP-FRT ?
Il y a une séquence FRT qui est insérée de part et d’autre de la séquence d’intérêt et quand on ajoute la recombinase FLP, il y a recombinaison entre les deux sites, et excision de ce qu’il y a entre les 2
Quels types de signaux de localisation sont retrouvés en N-ter ?
Signaux de localisation dans les compartiments, comme le peptide signal, ou bien encore les NLS
Comment fonctionne Cre-Lox ?
Pareil que FLP-FRT. Il y a une séquence LoxP qui est insérée de part et d’autre de la séquence d’intérêt et quand on ajoute la recombinase Cre, il y a recombinaison entre les deux sites, et excision de ce qu’il y a entre les 2
C’est quoi la RNase P ?
C’est endoribonucléoprotéine qui est impliquée dans la maturation des ARNt
Comment foncitonne URA-Blaster ?
URA3 avec de chaque coté les séquences hisG. Tu sélectionnes sur Ura- l’intégration de la cassette. Et ensuite, il y a des évenements de recombinaison entre les hisG, du coup ça dégage URA3, et tu sélectionnes les levures sur un milieu 5-FOA
C’est quoi un épitope ?
C’est une molécule qui peut être reconnue par un anticorps
Est ce que le gène de résistance ne peut pas apporter un biais ?
Si il peut, d’où l’intérêt de mettre en place un système qui permettrait de l’exciser une fois la sélection des souches effectuées
Comment c’est comparable l’infection entre mouche et souris ?
Ils déterminent des scores de virulence, chez la souris, basés sur la charge fongique et le fitness de la levure, et le la droso sur la survie de l’hôte. Et ensuite ils comparent les deux. En gros, ils observent le même comportement, sauf que chez la drosophile, la mouche meurt.
Pourquoi il faut insérer une mutation dans le codon stop ?
Parce que sinon, la protéine sera synthétisée normalement et il n’y aura pas d’étiquette.
Comment on analyse le transcriptome ?
RNA Seq
Comment fonctionne l’ampicilline ?
inhibits bacterial cell-wall synthesis by inactivating transpeptidases on the inner surface of the bacterial cell membrane.
C’est quoi le méthylhydrosybenzoate ?
antibactérien/antifongique
Pourquoi allonger le temps de régénération des cellules avec la Zéocine ?
Parce que la Zeocine c’est fongicide donc il faut laisser le temps d’exprimer le gène de résistance avant de le mettre sur un milieu sélectif
Comment fonctionne la méthode de Bradford ?
La méthode de Bradford est un dosage colorimétrique, basé sur le changement d’absorbance (la mesure se fait à 595 nm), se manifestant par le changement de la couleur du bleu de Coomassie après liaison (complexification) avec les acides aminés basiques (arginine, histidine, lysine) et les résidus hydrophobes des acides aminés présents dans la ou les protéines
Comment on calcule le temps de génération ?
taux de croissance µx- coeff directeur de la droite en phase expo : lnxB-lnxA/tB-tA
temps génération : il se calcule par G=ln2/µx
