Transcription de l'ADN Flashcards
V-F. • La transcription est un processus
très différent à la réplication de
l’ADN
F, similaire, mais il y a des différences notables
V-F. L’ARN pol a besoin d’une amorce.
F
V-F. Plusieurs ARN pol peuvent transcrire le même gène en même temps.
V.
V-F. La transcription est moins fidèle que la réplication de l’ADN
V
Combien d’ARN pol ont les eucaryotes?
3 (+2 chez les plantes)
Combien d’ARN pol ont les procaryotes?
1
Que fait l’ARN pol 1?
Transcription des gènes de l’ARNr 45S
Que fait l’ARN pol II?
Transcription des gènes codant les
protéines
Que fait l’ARN pol III?
• Transcription des gènes d’ARNt et d’ARNr 5S
Que font les ARN pol IV et V?
• Transcription d’ARN interférants
V-F. Bien que les ARN pol des procaryotes et des eucarytes soient différentes, elles possèdent des sous-unitées homologues.
V. ARN pol des eucaryotes possèdent plus de sous-unités
V-F. L’ARN pol des procaryotes possèdent 2 ions métalliques non présents chez l’eucaryotes.
F. Présent chez les deux ARN pol. 1 fixe (dans le centre) et un non-fixe : Le 2e ion métallique n’est pas fixe, il est apporté avec chaque nouveau nucléotide
Comment les ARN pol pro et euca se ressemble/différencient?
similaire au niveau du centre catalytique, différente en périphérie
La bulle de transciption sépare combien de base des brins d’ADN
13, autour du site d’initiation
Quelles sont les sous-unités de l’ARN pol minimale?
α2, β ,β’, ω
Que fait σ?
σ converti l’ARN polymérase
minimale dans la forme qui initie
la transcription seulement aux
promoteurs
V-F. -35 et -10 sont t 2 séquences
conservées de 6 nucléotides distancées
de 10 pb.
F. 17-19 pb
Comment la force du promoteur est influencée?
par l’efficacité
• de la liaison initiale de l’ARN pol
• de son isomérisation
• de son détachement du promoteur
V-F. Plus un promoteur est fort, plus son rythme
d’initiation de la transcription est ↑.
V
Que fait le discriminateur?
La
force de l’interaction entre l’ARN pol et le discriminateur influence la
stabilité du complexe promoteur/ARN pol
V-F. La région entre -35 et -10 a des séquences consensus.
F. Pas de séq consensus à cette région
Comment sigma 4,2 s’attache à -35?
Motif hélice-coude-hélice • 1 hélice α s’insère dans le grand sillon et interagit avec les bases de l’élément; • 1 hélice α se place en travers, audessus du sillon, et interagit avec le squelette de l’ADN.
De quel motif est fait la région 3 de sigma?
hélice alpha: s’associe spécifiquement aux 2 pb de la région étendue
Avec quel brin une hélice alpha de sigma 2,4 s’attache?
brin sens : ce qui stabilisent la séparation des
brins de l’ADN à cet endroit.
• 2 bases du brin sens subissent un pivotement et
sont insérés dans des cavités de la protéine σ, ce
qui favorise la fusion de l’ADN.
Quelle est la distance entre le région σ2 et σ4?
7,5nm
Par quoi est attaché l’élément UP?
sous-unité alpha de l’ARN poly, par l’intéermédiaire de son domaine carboxy-terminal (alpha CTD)
V-F. La a-CTD est rlié au a-NTD par un pont flexible.
v
V-F. L’élément UP n’a pas de séquence consensus.
F. il y en a une
Qu’Est que l’isomération concernant la transcription?
-Transition du complexe de la forme fermée à la forme ouverte en séparant les brins d’ADN
L’ouverture des brins de l’ADN lors de l’iosmération se fait entre quelles positions de base?
-11 et +2
V-F. L’isomération est engendré par un changement conformationnel de lenzyme (ARN pol avec sigma)
V (pivotement des bases déstabilise le duplexe d’aDN)
Quelles bases subissent un pivotement lors de l’isomérisation?
A -11 et T-7
Dasn quelle région de sigma les bases subissant un pivotement lors de l’isomération s’insèrent?
région 2 de sigma
V-F. L’isomérisation est réversible.
F. irréversibleL une fois effectué, la transcription sera assurément initiée
Quels sont les canaux dans l’ARN pol?
- Canal d’entrée des NTP vers le site actif
- Canal de sortie de l’ARN
- Canal d’entrée de l’ADN
- Canal NT (sortie du brin sens de l’ADN)
- Canal T (sortie du brin matrice de l’ADN)
Que cause l’isomérisation du complexe sur l’ARN pol?
- Les machoires se referment sur l’ADN
2. Déplacement de la région sigma1.1
Que fait sigma 1,1?
Imite l’ADN lorsque l’ARN pol n’est pas avec l’ADN. -> fortement chargée négativement
L’espace du centre catalytique de l’ARN pol proca est fortement chargé positivement.
V
L’ADN se reforme èn quelle position après le passage de l’ARN pol proca?
position -11
proca. Quels sont les modèles de translocation de l’ARN pol pendant les cycles de transciption avorté?
- excursion transitoire
- mouvement de la chenille arpenteuse
- compression
Proco. V-F. Lors du mécanisme initial compression de la transciption, l’ARN pol demeure stationnaire.
V
Proca. V-F. Le mécanisme initial de la transcription de la chenille arpenteuse veut que l’ADN en aval serait tiré et replié à l’intérieur de l’enzyme.
f. modèle de la transcription
Proca. V-F. Le mécanisme initial de la transcription de la chenille arpenteuse veut qu’il y ai un élément flexible de la polymérase.
V
Proca. Avant l’élongation, l’ARNpol relache des cours transcrits de combien de nucléotides?
moins de 10 (synthèse abortive)
proca. V-F. Après la synthèse abortive, le promoteur est libéré.
V
Proca. pour libéré le promoteur de l’ARN pol, quels liaisons faut-il briser?
- interactions entre la polymérase et le promoteur
- interactions entre le noyau de la polymérase et sigma
Proca. La libération du promoteur par l’ARN pol nécessite l’éjection de quoi du canal de sortie de l’ARN?
région du linker 3/4
proca. Qu’est-ce qui fournit l’énergie nécessaire à la séparation de la polymérase-promoteur et noyau-sigma?
Lors de la libération du promoteur, l’empilement de l’ADN dans l’enzyme est inversé ce qui cause une réduction de la taille de la bulle de transcription de 22-24 à 12-14 nucléotides.
Proca. L’ARN pol du bactériophages T7 possède combien de sous-unités?
1
Proca. L’ARN pol du bactériophages T7 ressemble à quelle autre ARNpol?
ARN pol des mitochondries et chloroplastes
et ADN pol en forma de main droite
V-F. L’ARN pol du bactériophage T7 possède 2 facteur sigma.
F, n’en possède pas : subit un changement conformationnel pour passer au complexe d’élongation -> permet l’ouverture du canal de sortie de l’ARN
Proca. Que fait l’ARNpol lors de l’élongation?
- syntétise l’ARN
2. Corrige l’ARN
Proca. V-F. L’ARN pol avance 10 pb à la fois lors de l’élongation.
Faux. 1 à a fois
Proca. V-F. lors de l’élongation, la taille de la bulle de transcription varie.
F. constante
Quel sont les 2 types de correction sur épreuve sont effectués par l’ARN pol?
- Correction pyrophospholytique
2. Correction hydrolytique
proca. En quoi consiste la correction pyrophospholytique?
Retrait d’un ribonucléotide incorrect par incorporation de PPi (2 P)
Proca. En quoi consiste la correction hydrolytique?
L’ARN pol recule d’un ou plusieurs nucléotides et clive l’ARN, enlevant la séquence qui contient l’erreur
Proca. La correction hydrolotique est stimulée par quel facteur?
Gre : stimule aussi l’élongation
Chez les procaryotes, que fait Nus?
Se joint à la ARN pol à la phase d’élongation et favorissent l’élongation et la terminaison
proca. Lors de la phase d’élongation, combine de nucléotides d’ARN demeurent associés à la matrice d’ADN en tout temps?
8-9
Proca. Qu’est-ce qui retire les ARN pol bloquées sur un brin d’ADN?
TRCF
Quelles sont les fonction de la TRCF?
- enlève les polymérase bloqué (ARN pol proca)
- recrute les ezymes de réparation de l’ADN
V-F. TRCF n’utilise pas d’ATP.
F. activité ATPase
V-F. TRCF s’associe `a l’ADNdb en aval de la polymérase bloquée et se déplace sur l’aDN jusqu’à ce qu’elle percute l’ARN pol.
F. en amont (va dans le même sens que l’ARN pol)
VF. Une fois percuté par TRCF, l’ARN pol s’en va et arrête la transcription dans tous les cas.
F. peut aussi avancer et poursuivre la transcription
TRCF recrute quoi pour faire la réparation couplée à la transciption?
UVR(A)BCD
proca. Quels sont les deux types de terminaison de la transcription?
- rho-dépendant
- rho-indépendant
Proca. Lors de la terminaison rho-dépendante, la protéine rho s’attache à quoi?
rut
Proca. Combien rut a de nucléotides
-40 nucléotides
Proca. V-F. rut n’a pas de structure secondaire.
Vrai
Proca. V-F. rut est riche en G et pauvre en C.
F. contraire : riche en C et pauvre en G
Proca. V-F. rut est composés d’élément d’ARN.
V
Combien de sous-unité a rho?
6
V-F. Les sous-unités de rho sont identiques.
V
V-F. rho est de forme linéaire.
F. forme d’anneau
V-F. Rho peut se fixer à l’ARN devant le ribosome qui fait de la traduction sur le même brin.
F. rho ne peut se fixer aux transcripts en cours de traduction
V-F. Chez les bactéries, la transcription et la traduction sont étroitement couplées.
V
V-F. Parfois, rho induit la terminaison avant qu’un gène soit finis d’être transcrit.
F. rho induit la terminaison uniquement au niveau des transcripts en cours de synthèse au-dela de la fin d’un gène ou d’un opéron.
Est-ce que rho utilise de l’ATP?
oui, activité ARN:ADN hélicase
Comment sont aussi appelé les terminateurs rho-indépendant?
-terminateurs intrinsèques
V-F. Les terminateurs intrinsèque n’ont besoin d’aucun facteur pour fonctionner.
V
De quoi est composé une séquence d’un terminateur indépendant de rho?
- une courte séquencerépétée inversée (20 cucléotides)
- une série d’environ 8 paires de bases A:T
Quelle structure secondaire forme la séquence répété inversé des terminateur indépendant de rho?
-structurre en tige-boucle (épingle à cheveux )
La séquence suivant l’épingle à cheveux d’un terminateur intrinsèque est composé d’une série de quel nucléotide sur l’ARN?
U
Proca. Comment l’épingle à cheveux formées par e terminateur intrinsèque induit la terminaison?
-dsorganisation du complexe d’élongation et extraction du transcrit d’ARN
V-F. Les bactéries n’ont besoin que d’un seul facteur d’initiation additionnel
V : sigma
Les eucaryotes ont besoin de combine de facteurs d’initiation?
Plusieurs! Facteurs généraux de transcription (FGT)
Les FGT sont tjs suffisant pour initier la transcription des ADN
F. seulement in vitro, in vivo doit roblème avec histones
Qu’Est-ce que les FGT ont besoin de plus pour transcrire l’ADN in vivo?
- médiateurs
- enzymes de modification de la chromatine
V-F. Le médiateurs et les enzymes de modifications de la chromatines sont nécessaires en plus des FGT pour lorsque l’ADN est incorporé à des nucléosomes.
V
à quoi servent les ARN 4 et 5
Transcription d’ARN interférants (chez plantes)
Euca. De quoi est formé le promoteur minimal de l’ARN pol II?
- BRE ou TATA
- Inr
- DCE
- DPE
Euca. V-F. les promoterus ont un élément BRE et une boite TATA.
F. soit l’un, soit l’autre
euca. Qu’Est-ce que le promoteur minimal?
Le plus petit ensemble d’éléments de séquence nécessaire pour assurer l’initiation de la transcription par l’ARN pol II