Transcription de l'ADN Flashcards
V-F. • La transcription est un processus
très différent à la réplication de
l’ADN
F, similaire, mais il y a des différences notables
V-F. L’ARN pol a besoin d’une amorce.
F
V-F. Plusieurs ARN pol peuvent transcrire le même gène en même temps.
V.
V-F. La transcription est moins fidèle que la réplication de l’ADN
V
Combien d’ARN pol ont les eucaryotes?
3 (+2 chez les plantes)
Combien d’ARN pol ont les procaryotes?
1
Que fait l’ARN pol 1?
Transcription des gènes de l’ARNr 45S
Que fait l’ARN pol II?
Transcription des gènes codant les
protéines
Que fait l’ARN pol III?
• Transcription des gènes d’ARNt et d’ARNr 5S
Que font les ARN pol IV et V?
• Transcription d’ARN interférants
V-F. Bien que les ARN pol des procaryotes et des eucarytes soient différentes, elles possèdent des sous-unitées homologues.
V. ARN pol des eucaryotes possèdent plus de sous-unités
V-F. L’ARN pol des procaryotes possèdent 2 ions métalliques non présents chez l’eucaryotes.
F. Présent chez les deux ARN pol. 1 fixe (dans le centre) et un non-fixe : Le 2e ion métallique n’est pas fixe, il est apporté avec chaque nouveau nucléotide
Comment les ARN pol pro et euca se ressemble/différencient?
similaire au niveau du centre catalytique, différente en périphérie
La bulle de transciption sépare combien de base des brins d’ADN
13, autour du site d’initiation
Quelles sont les sous-unités de l’ARN pol minimale?
α2, β ,β’, ω
Que fait σ?
σ converti l’ARN polymérase
minimale dans la forme qui initie
la transcription seulement aux
promoteurs
V-F. -35 et -10 sont t 2 séquences
conservées de 6 nucléotides distancées
de 10 pb.
F. 17-19 pb
Comment la force du promoteur est influencée?
par l’efficacité
• de la liaison initiale de l’ARN pol
• de son isomérisation
• de son détachement du promoteur
V-F. Plus un promoteur est fort, plus son rythme
d’initiation de la transcription est ↑.
V
Que fait le discriminateur?
La
force de l’interaction entre l’ARN pol et le discriminateur influence la
stabilité du complexe promoteur/ARN pol
V-F. La région entre -35 et -10 a des séquences consensus.
F. Pas de séq consensus à cette région
Comment sigma 4,2 s’attache à -35?
Motif hélice-coude-hélice • 1 hélice α s’insère dans le grand sillon et interagit avec les bases de l’élément; • 1 hélice α se place en travers, audessus du sillon, et interagit avec le squelette de l’ADN.
De quel motif est fait la région 3 de sigma?
hélice alpha: s’associe spécifiquement aux 2 pb de la région étendue
Avec quel brin une hélice alpha de sigma 2,4 s’attache?
brin sens : ce qui stabilisent la séparation des
brins de l’ADN à cet endroit.
• 2 bases du brin sens subissent un pivotement et
sont insérés dans des cavités de la protéine σ, ce
qui favorise la fusion de l’ADN.
Quelle est la distance entre le région σ2 et σ4?
7,5nm
Par quoi est attaché l’élément UP?
sous-unité alpha de l’ARN poly, par l’intéermédiaire de son domaine carboxy-terminal (alpha CTD)
V-F. La a-CTD est rlié au a-NTD par un pont flexible.
v
V-F. L’élément UP n’a pas de séquence consensus.
F. il y en a une
Qu’Est que l’isomération concernant la transcription?
-Transition du complexe de la forme fermée à la forme ouverte en séparant les brins d’ADN
L’ouverture des brins de l’ADN lors de l’iosmération se fait entre quelles positions de base?
-11 et +2
V-F. L’isomération est engendré par un changement conformationnel de lenzyme (ARN pol avec sigma)
V (pivotement des bases déstabilise le duplexe d’aDN)
Quelles bases subissent un pivotement lors de l’isomérisation?
A -11 et T-7
Dasn quelle région de sigma les bases subissant un pivotement lors de l’isomération s’insèrent?
région 2 de sigma
V-F. L’isomérisation est réversible.
F. irréversibleL une fois effectué, la transcription sera assurément initiée
Quels sont les canaux dans l’ARN pol?
- Canal d’entrée des NTP vers le site actif
- Canal de sortie de l’ARN
- Canal d’entrée de l’ADN
- Canal NT (sortie du brin sens de l’ADN)
- Canal T (sortie du brin matrice de l’ADN)
Que cause l’isomérisation du complexe sur l’ARN pol?
- Les machoires se referment sur l’ADN
2. Déplacement de la région sigma1.1
Que fait sigma 1,1?
Imite l’ADN lorsque l’ARN pol n’est pas avec l’ADN. -> fortement chargée négativement
L’espace du centre catalytique de l’ARN pol proca est fortement chargé positivement.
V
L’ADN se reforme èn quelle position après le passage de l’ARN pol proca?
position -11
proca. Quels sont les modèles de translocation de l’ARN pol pendant les cycles de transciption avorté?
- excursion transitoire
- mouvement de la chenille arpenteuse
- compression
Proco. V-F. Lors du mécanisme initial compression de la transciption, l’ARN pol demeure stationnaire.
V
Proca. V-F. Le mécanisme initial de la transcription de la chenille arpenteuse veut que l’ADN en aval serait tiré et replié à l’intérieur de l’enzyme.
f. modèle de la transcription
Proca. V-F. Le mécanisme initial de la transcription de la chenille arpenteuse veut qu’il y ai un élément flexible de la polymérase.
V
Proca. Avant l’élongation, l’ARNpol relache des cours transcrits de combien de nucléotides?
moins de 10 (synthèse abortive)
proca. V-F. Après la synthèse abortive, le promoteur est libéré.
V
Proca. pour libéré le promoteur de l’ARN pol, quels liaisons faut-il briser?
- interactions entre la polymérase et le promoteur
- interactions entre le noyau de la polymérase et sigma
Proca. La libération du promoteur par l’ARN pol nécessite l’éjection de quoi du canal de sortie de l’ARN?
région du linker 3/4
proca. Qu’est-ce qui fournit l’énergie nécessaire à la séparation de la polymérase-promoteur et noyau-sigma?
Lors de la libération du promoteur, l’empilement de l’ADN dans l’enzyme est inversé ce qui cause une réduction de la taille de la bulle de transcription de 22-24 à 12-14 nucléotides.
Proca. L’ARN pol du bactériophages T7 possède combien de sous-unités?
1
Proca. L’ARN pol du bactériophages T7 ressemble à quelle autre ARNpol?
ARN pol des mitochondries et chloroplastes
et ADN pol en forma de main droite
V-F. L’ARN pol du bactériophage T7 possède 2 facteur sigma.
F, n’en possède pas : subit un changement conformationnel pour passer au complexe d’élongation -> permet l’ouverture du canal de sortie de l’ARN
Proca. Que fait l’ARNpol lors de l’élongation?
- syntétise l’ARN
2. Corrige l’ARN
Proca. V-F. L’ARN pol avance 10 pb à la fois lors de l’élongation.
Faux. 1 à a fois
Proca. V-F. lors de l’élongation, la taille de la bulle de transcription varie.
F. constante
Quel sont les 2 types de correction sur épreuve sont effectués par l’ARN pol?
- Correction pyrophospholytique
2. Correction hydrolytique
proca. En quoi consiste la correction pyrophospholytique?
Retrait d’un ribonucléotide incorrect par incorporation de PPi (2 P)
Proca. En quoi consiste la correction hydrolytique?
L’ARN pol recule d’un ou plusieurs nucléotides et clive l’ARN, enlevant la séquence qui contient l’erreur
Proca. La correction hydrolotique est stimulée par quel facteur?
Gre : stimule aussi l’élongation
Chez les procaryotes, que fait Nus?
Se joint à la ARN pol à la phase d’élongation et favorissent l’élongation et la terminaison
proca. Lors de la phase d’élongation, combine de nucléotides d’ARN demeurent associés à la matrice d’ADN en tout temps?
8-9
Proca. Qu’est-ce qui retire les ARN pol bloquées sur un brin d’ADN?
TRCF
Quelles sont les fonction de la TRCF?
- enlève les polymérase bloqué (ARN pol proca)
- recrute les ezymes de réparation de l’ADN
V-F. TRCF n’utilise pas d’ATP.
F. activité ATPase
V-F. TRCF s’associe `a l’ADNdb en aval de la polymérase bloquée et se déplace sur l’aDN jusqu’à ce qu’elle percute l’ARN pol.
F. en amont (va dans le même sens que l’ARN pol)
VF. Une fois percuté par TRCF, l’ARN pol s’en va et arrête la transcription dans tous les cas.
F. peut aussi avancer et poursuivre la transcription
TRCF recrute quoi pour faire la réparation couplée à la transciption?
UVR(A)BCD
proca. Quels sont les deux types de terminaison de la transcription?
- rho-dépendant
- rho-indépendant
Proca. Lors de la terminaison rho-dépendante, la protéine rho s’attache à quoi?
rut
Proca. Combien rut a de nucléotides
-40 nucléotides
Proca. V-F. rut n’a pas de structure secondaire.
Vrai
Proca. V-F. rut est riche en G et pauvre en C.
F. contraire : riche en C et pauvre en G
Proca. V-F. rut est composés d’élément d’ARN.
V
Combien de sous-unité a rho?
6
V-F. Les sous-unités de rho sont identiques.
V
V-F. rho est de forme linéaire.
F. forme d’anneau
V-F. Rho peut se fixer à l’ARN devant le ribosome qui fait de la traduction sur le même brin.
F. rho ne peut se fixer aux transcripts en cours de traduction
V-F. Chez les bactéries, la transcription et la traduction sont étroitement couplées.
V
V-F. Parfois, rho induit la terminaison avant qu’un gène soit finis d’être transcrit.
F. rho induit la terminaison uniquement au niveau des transcripts en cours de synthèse au-dela de la fin d’un gène ou d’un opéron.
Est-ce que rho utilise de l’ATP?
oui, activité ARN:ADN hélicase
Comment sont aussi appelé les terminateurs rho-indépendant?
-terminateurs intrinsèques
V-F. Les terminateurs intrinsèque n’ont besoin d’aucun facteur pour fonctionner.
V
De quoi est composé une séquence d’un terminateur indépendant de rho?
- une courte séquencerépétée inversée (20 cucléotides)
- une série d’environ 8 paires de bases A:T
Quelle structure secondaire forme la séquence répété inversé des terminateur indépendant de rho?
-structurre en tige-boucle (épingle à cheveux )
La séquence suivant l’épingle à cheveux d’un terminateur intrinsèque est composé d’une série de quel nucléotide sur l’ARN?
U
Proca. Comment l’épingle à cheveux formées par e terminateur intrinsèque induit la terminaison?
-dsorganisation du complexe d’élongation et extraction du transcrit d’ARN
V-F. Les bactéries n’ont besoin que d’un seul facteur d’initiation additionnel
V : sigma
Les eucaryotes ont besoin de combine de facteurs d’initiation?
Plusieurs! Facteurs généraux de transcription (FGT)
Les FGT sont tjs suffisant pour initier la transcription des ADN
F. seulement in vitro, in vivo doit roblème avec histones
Qu’Est-ce que les FGT ont besoin de plus pour transcrire l’ADN in vivo?
- médiateurs
- enzymes de modification de la chromatine
V-F. Le médiateurs et les enzymes de modifications de la chromatines sont nécessaires en plus des FGT pour lorsque l’ADN est incorporé à des nucléosomes.
V
à quoi servent les ARN 4 et 5
Transcription d’ARN interférants (chez plantes)
Euca. De quoi est formé le promoteur minimal de l’ARN pol II?
- BRE ou TATA
- Inr
- DCE
- DPE
Euca. V-F. les promoterus ont un élément BRE et une boite TATA.
F. soit l’un, soit l’autre
euca. Qu’Est-ce que le promoteur minimal?
Le plus petit ensemble d’éléments de séquence nécessaire pour assurer l’initiation de la transcription par l’ARN pol II
Euca. Un promoteur minimal est composé de combien de nucléotides?
40-60
Euca. V-F. Le promoteur est situé en amont du site de transcription.
f. en amont et en aval (site d’initiation Inr dans le milieu)
Euca. V-F. Les promoteurs contenant une boite TATA ont souvent l’élément DCE
V
Euca. Quel est l’élément le plus commun des promoteurs minimaux?
Inr
Euca. Inr est combiné à …
DCE et TATA
Euca. BRE est lié par quel FGT?
TFII B
Euca. TATA est lié par quel FGT?
TBP
Euca. Inr est lié par quel FGT?
TFII D (TAF)
Euca. DCE est lié par quel FGT?
TFII D (TAF)
Euca. DPE est lié par quel FGT?
TFII D (TAF)
Euca. Combien y a t-il de DCE dans le promoteur minimal?
3
Euca. Combien y a t-il de DPE dans le promoteur minimal?
1, en aval
Euca. Donnez des exemple de séquences régulatrices
- Enhancers
- Silencers
- Isolateurs
Euca. V-F. Les séquences régulatrices se trouvent en aval du promoteur minimal.
f. amont
Euca. Les séquences régulatrices peuvent être catégorisé en fonction de quoi?
- leur position
- fonction
- organisme concerné
Euca. Donner la séquence de FGT pour l’initiation.
- TBP (TFIID)(TATA)
- TAFs (TFIID) (Inr, DPE, DCE,…)
- TFIIA
- TFIIB
- TFIIF avec polymérase
- TFIIE
- TFIIH
V-F. Ensembles. les FGTs joue le rôle de sigma chez les procaryotes.
V
Euca. Que font globalement les FGT?
- Association ARN pol au promoteur
- fusion ADN
- libération ARNpol de son promoteur
Euca. Comment se nomme l’ensemble des FGT et de la polymérase, associé au promoteur et prêt pour l’initiation?
complexe de préinitiation
Combien de base contient TATA et où est-il situé?
- 30pb
- en amont du site d’initiation
Euca. où débute la mise en place du complexe de préinitiation?
sur TATA
Euca. Qu’est-ce qui module la phosphorylation du CTD de la polymérase?
- TFII H
- kinases
- phosphatases
Quelles étapes de la période d’initiation abortive sont absentes chez les bactéries mais présentes chez les eucaryotes?
- Hydrolyse d’ATP permettant :
2. Phosphorylation de la queue CTD de la polymérase
V-F. TFIIH a une activité hélicase.
V
Comment TBP lie TATA?
reconnaissance du petit sillon de la boite TATA par un elarge région constitué d’un feuillet B
Pourquoi TBP sélectionne TATA?
à cause de la capacité de TATA à subir une importante déformation structurelle
Que fait la liaison de TBP sur TATA en ce qui concerne la conformation de TATA?
- élargissement du petit silon de TATA -> configuration presque plane -> pli de l’ADN
V-F. l’élargissement du petit sillon de TATA forme un plus grand angle chez les humain que chez les levures.
V. 105 vs 80 degr`s pour levures
De quoi la spécificité de TBP-TATA dépend?
2 paires de résidus phénylalanine (4) : Chaines latérales s’intercalent enre les paires de bases aux deux extrémité de la boite TATA et entraine la courbure
v-F. Les phenylalanie de TBP s’intercalent à travers TATA.
F. à ses extrémité :
Chaines latérales s’intercalent enre les paires de bases aux deux extrémité de la boite TATA et entraine la courbure
V-F. Il y a interaction entre les a.a basique de TBP et le squelette phosphate de TATA
V
V-F. Il y a beauocup de liaisons H entre TBP et les côtés des bases de TATA.
f. nombre limité
V-F. certains TAFs forment des structures similaires à H2A-H2B.
F. H3-H4
Environ combien de TAF s’associent à TBP?
10
Combine de TAFs se lient à des éléments d’ADN comme Inr et DPE?
2
V-F. Les TAFs ont un rôle de régulation concernant l’association de TBP à l’ADN
V: il a un rabat qui vient masquer la surface de liaison à l’ADN de TBP
Quels sont les rôles de TFIIB?
- contactes TFIIB-TBP, -ADN, -Pol II
- s’insère dans canal de sortie de l’ARN et dans gorge du site actif (semblable à linker 3/4)
- Aide à la formation du complexe ouvert
Comment TBP aide ;a la formation du complexe ouvert?
En stabilisant les brins d’ADN sépérés jusqu’éa la mise en place de l’hybride ARN:ADN
Quels sont les rôle de TFII F
- S’associe à Pol II et est recruté au promoteur avec pol II
- pol II- TFII F stabilise le complexe ADN-TBP-TFIIB
V-F. TFIIF seul se lie à l’ADN .
F. jumelé
a la polymérase avant sont arrivé sur l’ADN.
quels sont les rôle de TFII E?
-recrutement de TFIIH
Quelles sont les fonctions de TFII H?
- 2 de 10 s-u ont des fonctions ATPase
- 1 s-u a une fonction protéines kinase
- contrôle la transition ATP-dépnendante du complexe de prinitiation au complexe ouvert
- rôle dans la libération du promoteur
- impliqué dans la réparation par excision de nucléotides (NER)
Combien de sous-unités a TFIIH?
10
Comment TFIIH controle la transition ATP-dépendante du complexe de préinition au complexe ouvert?
-force l’insertion de l’ADN (en aval de polII) dans la cavité de la polymérase ->fusion de l’ADN
V-F. TFIIH n’utilise pas d’ATP.
F. en utilise.
euca. Qu’est-ce que les activateurs font?
aident au recrutement de la pol II au promoteur en stabilisant la position de la pol II au niveau du promoteur
où s’associe le médiateur?
à la queue CTD de pol II ET aux activateurs liés à l’ADN
V-F. Le médiateur se lie à l’ADN.
F. aux activateurs eux liés à l’aDN et à la queue CTD
Par quoi sont recruté les modificateur de nucléosomes et HAT?
Activateurs
Combien ont de s-u les médiateurs?
au moins 20 s-u
V-F. différents activateurs interagissent avec différentes s-u du médiateurs pour amener Pol II à différents gènes.
V. 1 s-u pour 1 sous-gourpe de gène
V-F. La médiateur régule la fonction CTD kinase de TFIIH
V
Qu’est-ce que Med17 ou Srb4?
une s-u du médiateur
V-F Med 17/Srb4 est essentielle à la transcription de tous les gènes transcrits par Pol II.
V
V-F. la déphosphorylation de la queue CTD de Pol II par TFIIH médie la dissociation du Médiateur de la Pol II au cours de la libération du promoteur.
F. phosphorylation
Euca. Qu’est-ce qui se passe lorsqu’on passe de l’initiation à l’élongation?
- Pol II se débarrasse des FGTs et du médiateur
- De nouveaux facteurs vont les remplacer
V-F. Euca. Durant la phase d’élongation, l’ARN pol II n’a pas besoin d’autres facteurs.
F. FGT remplacer.
- Facteurs d’élongation
- facteur de maturaiton de l’ARN
Euca. par quoi sont remplacer les FGTs à la phase d’élongation?
- Facteurs d’élongations
- Facteurs de maturation de l’ARN
Donnez des exemples de facteurs d’élongations.
TFIIS, STP5, TAT-SF1
V-F. Les facteurs de maturation de l’ARN se lie à l’ARN de coeur.
F. recrutés au niveau de la queue (phosphorylées) CTD de la grosse sous-unité de PolII
V-F. TFIIH phosphoryle les sérines aux positions 2 et 5.
F. 5 et 7
Qu’est-ce qui phosphoryle la sérine en position 2 de la queue CTD de la pol II?
P-TEFb
Que fait P-TEFb?
Stimule l’élongation :
- Phosphorylation de la sérine (position 2) de la queue CTD de la Pol II
- Activation (recrutement) de STP5 en la phosphorylant
- Recrutement de TAT-SF1, un facteur d’élongation
V-F. NusG est le seul facteur de transcription universellement conservé
V : bac. archae, euca
à quoi est comparable STP5?
NusG
Que font NusG/STP5?
favorise la transition vers la phase d’élongation
Comment NusG/STP5 favorise la transition vers la phase d’élongation ?
s’associent à un erégion de leur ARN pol respective chevauchant les sites de liaison des facteurs d’initiation de sigma 4 (bac) et TFIIB(euca).
V-F. Les facteurs d’élongation nusG/STP5 auraitent dans leurs fonctions le déplacement de facteurs d’initiation.
V
TFIIS fait la même chose que quoi?
facteurs de transcription de la famille ELL
Comment TFIIS et ELL stimulent le taux global d’élongation?
réduise le temps de pause de la pol sur des séq qui ont tendance à la ralentir
Quelles séqueuces peuvent sur l’ADN peut ralentir l’ARN pol?
Séq. riche en G/C suivis de séq riches en A/T semble induire la marche arrère et moment s de pauses : à cause température de fusion abruptement réduit : stabilité diminué
Que fait TFIIS?
- stimulent le taux gobal d’élongation (facteur d’élongation)
- contribue à la correction sur épreuve effectuée par la polymérase
Comment TFIIS sontribue à la correction sur épreuve fait par la polymérase?
-stimule une activité ARNase de la pol à l’extérieur du site actif ce uqi permet une voie alternative pour enlever les nucléotides incorrects (semblable à la correction hydrolytique chez bac)
Euca. V-F. L’activité ARNase de l’ARN pol se trouve dans le site actif.
f. à l’extérieur du site actif
Que en en commun TFIIS et GreB?
Syst de réparation de l’ARN semblable (TFIIS fait correction semblable à hydrolytique chez bac) ; interragissent de manière semblable sur leur pol
Qu’ont de différents TFIIS et GreB?
Sont diférents au niveau de la structure et de la séquence
V-F. FACT est utilile in vitro.
F. Pour l’ADN dans nucléosome
Que fait FACT?
facilite la transcription en démentelant les nucléosome en retirant un dimère H2AH2B
FACT contient quelles sous-unités?
Stp16 et SSRP1 (hétérodimère)
Que fait Stp16?
se lie à un dimère H2AH2B
SSRP1 se lie à quoi?
au tétramère H3H4
V-F. FACT interagit avec STP5.
f. avec TFIIS
ESt-ce que FACT réinsère le dimère H2AH2B dans l’histone?
Oui, immédiatement derrière la pol
V-F. FACT est une chaperone.
v: peut réinséré le dimère H2AH2B
Énumérez les enzymes nécessaire à la formation de la coiffe 5’ de l’arn
- ARN triphosphatase
- guanylyltransférase
- méthyltransférase
V-F. La première modification de l’ARN est la formation de la coiffe 5’
V
Que fait l’ARN triphosphatase
retrait d’un groupement phosphate de l’extrémité 5’ de l’ARN
Que fait la guanylyl transférase?
Ajout d’un nucléotide GMP à l’extrémité
V-F. la guanylyltransférase ajoute un GTP à l’extrémité 5’ de l’ARN. e
F. GMP
la méthyltransférase fait la méthylation de quoi et en quelle position ?
méthylation de la guanine (ajout par guanylytransférase) en position 7
En gros, la formation de la coiffe 5’ se par l’jout de…
ajout d’une guanine modifiée (7-méthyl-guanine-triphosphatase)
V-F. L’Ajout de la coiffe 5’ émerge du canal de sortie de l’ARN de la pol lors de la transition de laphase d’initiation à la phase d’élongation
V
V-F. Il y a phosphorylation de la Sérine 7 du CTD après l’ajour de la coiffe pour la désasemblage de la machinerie d’assemble de la coiffe.
F.
- déphosphorylation
- Sérine 5
Quelles modifications l’ARN euca doit subir?
- ajout d’une coiffe à l’extrémité 5’
- polyadénylation de l’axtrémité 3’
- Épissage des introns
V-F. Des protéines participent àl’élongation et aux modifications de l’ARN.
V. ex. STP5 et TAT-SF1
l’enzyme ajoutant la coiffe se position où?
Sur la sérine 5 de la queue CTD de l’ARN pol
V-F. STP5 contribue au recrutement sur le CTD (sérine 5) de l’enzyme ajoutant la coiffe.
V. et stimule l’activité de l’enzyme
Que fait TAT-SF1?
recrute des composantes de la machinerie d’épissage sur lanpolymérase (CTD, sérine 2) après le désasemblage de la machinerie ajoutant la coiffe
V-F. L’élongation, la terminaison et la maturation de l’ARN sont interconnectées, ce uqi assure une coordination
V
V-F. La queue CTD de la polymérase est impliquée dans le recrutement d’enzymes nécessaires à la polyadénylation
Vrai
Qu’est-ce qu’il y à la fin d’un gène?
séquences signaux de polyadénylation (signaux poly-A)
Qu’est-ce qui stimule le transfert des enzymes de terminaison sur l’ARN?
transcription du signaux poly-A
Que fait CPSF?
forme un complexd instaable avec la signal poly-A
Que fait CstF?
a’associe à la séq. riche en G/U après la séq. poly-A
Quand est-ce que CF1 et CF2 s’ajoute?
après que CstF soit associé à la séq. G/U
V-F. PAP n’utilise pas d’ATP.
F.
V-F. PAP ajoute des nucléotides par un mécanisme enzymatique identique à celui de l’ARN pol
V. sau fqu’il n’utilise pas de matrice
Donner la séquences des protéines qui font la terminaison et la polyadénylation sur
3’ et où il s’attache
- CPSF sur signal poly-A
- CstF sur séq. G/U
- CF1 et CF2 sur complexe protéique
- PAP
- PABPII
La longueur de la queue poly-A est déterminé par quoi?
PABPII
CPSF sert à quoi?
- clivage
- polyadénylation
CstF sert à quoi?
-clivage
Que fait CF1 et CF2?
clivage de l’ARN
Que fait PABPII?
- stimule l’activité de la poly-A polymérse (PAP)
- signal d’arrêt de la polyadénylation
V-F. La queue poly-A est essentielle à l’exportation du noyau.
V
Quels sont les deux modèles de terminaison de la transcription
- modèle de la torpille
- modèle allostérique
Le modèle de la torpillle est semblable à quoi chez les eucaryotes?
-terminaison rho-dépendante
Le modèle allostérique est semblable à quoi chez les eucaryotes?
Pas semblable, pas de structure secondaire, terminaison spontanée
Que fait Rat1/Xrn2?
dégrade rapidement l’ARNde 5’ à 3’ jusqu’à ce qu’elle rattrape l’ARN ppolymérase
Que qui charge Rat1/Xrn2 sur l’extrémité libre du second ARN?
Rtt103
En ce qui concerne Rat1/Xrn2, lequel se retouve dans quel organisme?
Rat1 : nom chez la levure
Xrn2: humain
V-F. Rat1/Xrn2 est une ARNase très processive.
V
Qu’est-ce qui fait la terminaison de la transcription dans le modèle allostérique?
L’ARN pol devient moins processive à cause des signaux poly-A à cause de changements conformationnels. Même à une terminaison spontanée
V-F. L’ARN pol I et III transcrivent des gènes encodant des ARN spécialisés
v
Quel est le seul FGT universelle (pol I II III)
TBP
V-F. Les ARN pol I II III ont les mêmes FGT
F. ont leur propre sous-groupe de FGT (sauf TBP universel)
Quels sont les gènes les plus exprimés?
ARNr 45s (par ARN45s)
De quoi est composé les gènes de l’ARNr 45s?
- promoteur central
- UCE
L’initiation de la trasncription par l’ARN pol I nécessite quel facteur?
- SL1 sur le promoteur central
- UBF (2) sur UCE
V-F. Sl1 recrute UBF qui recrute Pol1
F. UBF recrute SL1 ET Pol1 au promoteur
de quoi est composé SL1?
TBP et 3 TAF spécifique pour pol 1
V-F. SL1 se lie au pormoteur central uniquement en présence de UBF
V
UBF se lie à quoi?
UCE
V-F. Les promoteurs de pol III se retrouvent habituellement en amont du site de début de la transcription.
F. Aval
La promoteur d’un ARNt est composé de quoi?
Boite A et B séparé par un court élément
La promoteur d’un ARNr 5S est composé de quoi?
Boite A et C
V-F. Les promoteurs de l’ARN pol III peuvent contenir TATA
V
Quel FGT sont nécessaires pour la transcription d’un gène ARNr 5S?
TFIIIA B et C
Qu’est-ce qui contient TBP dans le transcription avec pol III?
TFIIIB
Dans la transcription d’un ARNt, quel FGT fait quoi.
- TFIIIC recrute TFIIIB en amont du site de début de transcription
- TFIIIB recrute la pol III au site de début de transcription
V-F. Dans la transcription avec l’ARN pol III, TFIIIB se trouve, comme les boites, en aval du site de début de transcription.
F. En amont.
Quel est la seul polymérase qui fait la transcription dans le noyau?
pol I
