Transcription de l'ADN Flashcards

1
Q

V-F. • La transcription est un processus
très différent à la réplication de
l’ADN

A

F, similaire, mais il y a des différences notables

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2
Q

V-F. L’ARN pol a besoin d’une amorce.

A

F

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3
Q

V-F. Plusieurs ARN pol peuvent transcrire le même gène en même temps.

A

V.

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4
Q

V-F. La transcription est moins fidèle que la réplication de l’ADN

A

V

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5
Q

Combien d’ARN pol ont les eucaryotes?

A

3 (+2 chez les plantes)

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6
Q

Combien d’ARN pol ont les procaryotes?

A

1

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7
Q

Que fait l’ARN pol 1?

A

Transcription des gènes de l’ARNr 45S

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8
Q

Que fait l’ARN pol II?

A

Transcription des gènes codant les

protéines

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9
Q

Que fait l’ARN pol III?

A

• Transcription des gènes d’ARNt et d’ARNr 5S

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10
Q

Que font les ARN pol IV et V?

A

• Transcription d’ARN interférants

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11
Q

V-F. Bien que les ARN pol des procaryotes et des eucarytes soient différentes, elles possèdent des sous-unitées homologues.

A

V. ARN pol des eucaryotes possèdent plus de sous-unités

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12
Q

V-F. L’ARN pol des procaryotes possèdent 2 ions métalliques non présents chez l’eucaryotes.

A
F. Présent chez les deux ARN pol. 1 fixe (dans le centre) et un non-fixe : Le 2e
ion métallique
n’est pas fixe, il est
apporté avec chaque
nouveau nucléotide
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13
Q

Comment les ARN pol pro et euca se ressemble/différencient?

A

similaire au niveau du centre catalytique, différente en périphérie

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14
Q

La bulle de transciption sépare combien de base des brins d’ADN

A

13, autour du site d’initiation

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15
Q

Quelles sont les sous-unités de l’ARN pol minimale?

A

α2, β ,β’, ω

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16
Q

Que fait σ?

A

σ converti l’ARN polymérase
minimale dans la forme qui initie
la transcription seulement aux
promoteurs

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17
Q

V-F. -35 et -10 sont t 2 séquences
conservées de 6 nucléotides distancées
de 10 pb.

A

F. 17-19 pb

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18
Q

Comment la force du promoteur est influencée?

A

par l’efficacité
• de la liaison initiale de l’ARN pol
• de son isomérisation
• de son détachement du promoteur

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19
Q

V-F. Plus un promoteur est fort, plus son rythme

d’initiation de la transcription est ↑.

A

V

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20
Q

Que fait le discriminateur?

A

La
force de l’interaction entre l’ARN pol et le discriminateur influence la
stabilité du complexe promoteur/ARN pol

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21
Q

V-F. La région entre -35 et -10 a des séquences consensus.

A

F. Pas de séq consensus à cette région

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22
Q

Comment sigma 4,2 s’attache à -35?

A
Motif hélice-coude-hélice
• 1 hélice α s’insère dans le grand
sillon et interagit avec les bases de
l’élément;
• 1 hélice α se place en travers, audessus du sillon, et interagit avec le
squelette de l’ADN.
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23
Q

De quel motif est fait la région 3 de sigma?

A

hélice alpha: s’associe spécifiquement aux 2 pb de la région étendue

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24
Q

Avec quel brin une hélice alpha de sigma 2,4 s’attache?

A

brin sens : ce qui stabilisent la séparation des
brins de l’ADN à cet endroit.
• 2 bases du brin sens subissent un pivotement et
sont insérés dans des cavités de la protéine σ, ce
qui favorise la fusion de l’ADN.

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25
Q

Quelle est la distance entre le région σ2 et σ4?

A

7,5nm

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26
Q

Par quoi est attaché l’élément UP?

A

sous-unité alpha de l’ARN poly, par l’intéermédiaire de son domaine carboxy-terminal (alpha CTD)

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27
Q

V-F. La a-CTD est rlié au a-NTD par un pont flexible.

A

v

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28
Q

V-F. L’élément UP n’a pas de séquence consensus.

A

F. il y en a une

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29
Q

Qu’Est que l’isomération concernant la transcription?

A

-Transition du complexe de la forme fermée à la forme ouverte en séparant les brins d’ADN

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30
Q

L’ouverture des brins de l’ADN lors de l’iosmération se fait entre quelles positions de base?

A

-11 et +2

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31
Q

V-F. L’isomération est engendré par un changement conformationnel de lenzyme (ARN pol avec sigma)

A

V (pivotement des bases déstabilise le duplexe d’aDN)

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32
Q

Quelles bases subissent un pivotement lors de l’isomérisation?

A

A -11 et T-7

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33
Q

Dasn quelle région de sigma les bases subissant un pivotement lors de l’isomération s’insèrent?

A

région 2 de sigma

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34
Q

V-F. L’isomérisation est réversible.

A

F. irréversibleL une fois effectué, la transcription sera assurément initiée

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35
Q

Quels sont les canaux dans l’ARN pol?

A
  1. Canal d’entrée des NTP vers le site actif
  2. Canal de sortie de l’ARN
  3. Canal d’entrée de l’ADN
  4. Canal NT (sortie du brin sens de l’ADN)
  5. Canal T (sortie du brin matrice de l’ADN)
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36
Q

Que cause l’isomérisation du complexe sur l’ARN pol?

A
  1. Les machoires se referment sur l’ADN

2. Déplacement de la région sigma1.1

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37
Q

Que fait sigma 1,1?

A

Imite l’ADN lorsque l’ARN pol n’est pas avec l’ADN. -> fortement chargée négativement

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38
Q

L’espace du centre catalytique de l’ARN pol proca est fortement chargé positivement.

A

V

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39
Q

L’ADN se reforme èn quelle position après le passage de l’ARN pol proca?

A

position -11

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40
Q

proca. Quels sont les modèles de translocation de l’ARN pol pendant les cycles de transciption avorté?

A
  • excursion transitoire
  • mouvement de la chenille arpenteuse
  • compression
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41
Q

Proco. V-F. Lors du mécanisme initial compression de la transciption, l’ARN pol demeure stationnaire.

A

V

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42
Q

Proca. V-F. Le mécanisme initial de la transcription de la chenille arpenteuse veut que l’ADN en aval serait tiré et replié à l’intérieur de l’enzyme.

A

f. modèle de la transcription

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43
Q

Proca. V-F. Le mécanisme initial de la transcription de la chenille arpenteuse veut qu’il y ai un élément flexible de la polymérase.

A

V

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44
Q

Proca. Avant l’élongation, l’ARNpol relache des cours transcrits de combien de nucléotides?

A

moins de 10 (synthèse abortive)

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45
Q

proca. V-F. Après la synthèse abortive, le promoteur est libéré.

A

V

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46
Q

Proca. pour libéré le promoteur de l’ARN pol, quels liaisons faut-il briser?

A
  • interactions entre la polymérase et le promoteur

- interactions entre le noyau de la polymérase et sigma

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47
Q

Proca. La libération du promoteur par l’ARN pol nécessite l’éjection de quoi du canal de sortie de l’ARN?

A

région du linker 3/4

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48
Q

proca. Qu’est-ce qui fournit l’énergie nécessaire à la séparation de la polymérase-promoteur et noyau-sigma?

A

Lors de la libération du promoteur, l’empilement de l’ADN dans l’enzyme est inversé ce qui cause une réduction de la taille de la bulle de transcription de 22-24 à 12-14 nucléotides.

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49
Q

Proca. L’ARN pol du bactériophages T7 possède combien de sous-unités?

A

1

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50
Q

Proca. L’ARN pol du bactériophages T7 ressemble à quelle autre ARNpol?

A

ARN pol des mitochondries et chloroplastes

et ADN pol en forma de main droite

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51
Q

V-F. L’ARN pol du bactériophage T7 possède 2 facteur sigma.

A

F, n’en possède pas : subit un changement conformationnel pour passer au complexe d’élongation -> permet l’ouverture du canal de sortie de l’ARN

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52
Q

Proca. Que fait l’ARNpol lors de l’élongation?

A
  1. syntétise l’ARN

2. Corrige l’ARN

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53
Q

Proca. V-F. L’ARN pol avance 10 pb à la fois lors de l’élongation.

A

Faux. 1 à a fois

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54
Q

Proca. V-F. lors de l’élongation, la taille de la bulle de transcription varie.

A

F. constante

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55
Q

Quel sont les 2 types de correction sur épreuve sont effectués par l’ARN pol?

A
  1. Correction pyrophospholytique

2. Correction hydrolytique

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56
Q

proca. En quoi consiste la correction pyrophospholytique?

A

Retrait d’un ribonucléotide incorrect par incorporation de PPi (2 P)

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57
Q

Proca. En quoi consiste la correction hydrolytique?

A

L’ARN pol recule d’un ou plusieurs nucléotides et clive l’ARN, enlevant la séquence qui contient l’erreur

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58
Q

Proca. La correction hydrolotique est stimulée par quel facteur?

A

Gre : stimule aussi l’élongation

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59
Q

Chez les procaryotes, que fait Nus?

A

Se joint à la ARN pol à la phase d’élongation et favorissent l’élongation et la terminaison

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60
Q

proca. Lors de la phase d’élongation, combine de nucléotides d’ARN demeurent associés à la matrice d’ADN en tout temps?

A

8-9

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61
Q

Proca. Qu’est-ce qui retire les ARN pol bloquées sur un brin d’ADN?

A

TRCF

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62
Q

Quelles sont les fonction de la TRCF?

A
  • enlève les polymérase bloqué (ARN pol proca)

- recrute les ezymes de réparation de l’ADN

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63
Q

V-F. TRCF n’utilise pas d’ATP.

A

F. activité ATPase

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64
Q

V-F. TRCF s’associe `a l’ADNdb en aval de la polymérase bloquée et se déplace sur l’aDN jusqu’à ce qu’elle percute l’ARN pol.

A

F. en amont (va dans le même sens que l’ARN pol)

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65
Q

VF. Une fois percuté par TRCF, l’ARN pol s’en va et arrête la transcription dans tous les cas.

A

F. peut aussi avancer et poursuivre la transcription

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66
Q

TRCF recrute quoi pour faire la réparation couplée à la transciption?

A

UVR(A)BCD

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67
Q

proca. Quels sont les deux types de terminaison de la transcription?

A
  • rho-dépendant

- rho-indépendant

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68
Q

Proca. Lors de la terminaison rho-dépendante, la protéine rho s’attache à quoi?

A

rut

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69
Q

Proca. Combien rut a de nucléotides

A

-40 nucléotides

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70
Q

Proca. V-F. rut n’a pas de structure secondaire.

A

Vrai

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71
Q

Proca. V-F. rut est riche en G et pauvre en C.

A

F. contraire : riche en C et pauvre en G

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72
Q

Proca. V-F. rut est composés d’élément d’ARN.

A

V

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73
Q

Combien de sous-unité a rho?

A

6

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74
Q

V-F. Les sous-unités de rho sont identiques.

A

V

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75
Q

V-F. rho est de forme linéaire.

A

F. forme d’anneau

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76
Q

V-F. Rho peut se fixer à l’ARN devant le ribosome qui fait de la traduction sur le même brin.

A

F. rho ne peut se fixer aux transcripts en cours de traduction

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77
Q

V-F. Chez les bactéries, la transcription et la traduction sont étroitement couplées.

A

V

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78
Q

V-F. Parfois, rho induit la terminaison avant qu’un gène soit finis d’être transcrit.

A

F. rho induit la terminaison uniquement au niveau des transcripts en cours de synthèse au-dela de la fin d’un gène ou d’un opéron.

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79
Q

Est-ce que rho utilise de l’ATP?

A

oui, activité ARN:ADN hélicase

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80
Q

Comment sont aussi appelé les terminateurs rho-indépendant?

A

-terminateurs intrinsèques

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81
Q

V-F. Les terminateurs intrinsèque n’ont besoin d’aucun facteur pour fonctionner.

A

V

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82
Q

De quoi est composé une séquence d’un terminateur indépendant de rho?

A
  • une courte séquencerépétée inversée (20 cucléotides)

- une série d’environ 8 paires de bases A:T

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83
Q

Quelle structure secondaire forme la séquence répété inversé des terminateur indépendant de rho?

A

-structurre en tige-boucle (épingle à cheveux )

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84
Q

La séquence suivant l’épingle à cheveux d’un terminateur intrinsèque est composé d’une série de quel nucléotide sur l’ARN?

A

U

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85
Q

Proca. Comment l’épingle à cheveux formées par e terminateur intrinsèque induit la terminaison?

A

-dsorganisation du complexe d’élongation et extraction du transcrit d’ARN

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86
Q

V-F. Les bactéries n’ont besoin que d’un seul facteur d’initiation additionnel

A

V : sigma

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87
Q

Les eucaryotes ont besoin de combine de facteurs d’initiation?

A

Plusieurs! Facteurs généraux de transcription (FGT)

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88
Q

Les FGT sont tjs suffisant pour initier la transcription des ADN

A

F. seulement in vitro, in vivo doit roblème avec histones

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89
Q

Qu’Est-ce que les FGT ont besoin de plus pour transcrire l’ADN in vivo?

A
  • médiateurs

- enzymes de modification de la chromatine

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90
Q

V-F. Le médiateurs et les enzymes de modifications de la chromatines sont nécessaires en plus des FGT pour lorsque l’ADN est incorporé à des nucléosomes.

A

V

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91
Q

à quoi servent les ARN 4 et 5

A

Transcription d’ARN interférants (chez plantes)

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92
Q

Euca. De quoi est formé le promoteur minimal de l’ARN pol II?

A
  • BRE ou TATA
  • Inr
  • DCE
  • DPE
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93
Q

Euca. V-F. les promoterus ont un élément BRE et une boite TATA.

A

F. soit l’un, soit l’autre

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94
Q

euca. Qu’Est-ce que le promoteur minimal?

A

Le plus petit ensemble d’éléments de séquence nécessaire pour assurer l’initiation de la transcription par l’ARN pol II

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95
Q

Euca. Un promoteur minimal est composé de combien de nucléotides?

A

40-60

96
Q

Euca. V-F. Le promoteur est situé en amont du site de transcription.

A

f. en amont et en aval (site d’initiation Inr dans le milieu)

97
Q

Euca. V-F. Les promoteurs contenant une boite TATA ont souvent l’élément DCE

A

V

98
Q

Euca. Quel est l’élément le plus commun des promoteurs minimaux?

A

Inr

99
Q

Euca. Inr est combiné à …

A

DCE et TATA

100
Q

Euca. BRE est lié par quel FGT?

A

TFII B

101
Q

Euca. TATA est lié par quel FGT?

A

TBP

102
Q

Euca. Inr est lié par quel FGT?

A

TFII D (TAF)

103
Q

Euca. DCE est lié par quel FGT?

A

TFII D (TAF)

104
Q

Euca. DPE est lié par quel FGT?

A

TFII D (TAF)

105
Q

Euca. Combien y a t-il de DCE dans le promoteur minimal?

A

3

106
Q

Euca. Combien y a t-il de DPE dans le promoteur minimal?

A

1, en aval

107
Q

Euca. Donnez des exemple de séquences régulatrices

A
  • Enhancers
  • Silencers
  • Isolateurs
108
Q

Euca. V-F. Les séquences régulatrices se trouvent en aval du promoteur minimal.

A

f. amont

109
Q

Euca. Les séquences régulatrices peuvent être catégorisé en fonction de quoi?

A
  • leur position
  • fonction
  • organisme concerné
110
Q

Euca. Donner la séquence de FGT pour l’initiation.

A
  1. TBP (TFIID)(TATA)
  2. TAFs (TFIID) (Inr, DPE, DCE,…)
  3. TFIIA
  4. TFIIB
  5. TFIIF avec polymérase
  6. TFIIE
  7. TFIIH
111
Q

V-F. Ensembles. les FGTs joue le rôle de sigma chez les procaryotes.

A

V

112
Q

Euca. Que font globalement les FGT?

A
  • Association ARN pol au promoteur
  • fusion ADN
  • libération ARNpol de son promoteur
113
Q

Euca. Comment se nomme l’ensemble des FGT et de la polymérase, associé au promoteur et prêt pour l’initiation?

A

complexe de préinitiation

114
Q

Combien de base contient TATA et où est-il situé?

A
  • 30pb

- en amont du site d’initiation

115
Q

Euca. où débute la mise en place du complexe de préinitiation?

A

sur TATA

116
Q

Euca. Qu’est-ce qui module la phosphorylation du CTD de la polymérase?

A
  • TFII H
  • kinases
  • phosphatases
117
Q

Quelles étapes de la période d’initiation abortive sont absentes chez les bactéries mais présentes chez les eucaryotes?

A
  1. Hydrolyse d’ATP permettant :

2. Phosphorylation de la queue CTD de la polymérase

118
Q

V-F. TFIIH a une activité hélicase.

A

V

119
Q

Comment TBP lie TATA?

A

reconnaissance du petit sillon de la boite TATA par un elarge région constitué d’un feuillet B

120
Q

Pourquoi TBP sélectionne TATA?

A

à cause de la capacité de TATA à subir une importante déformation structurelle

121
Q

Que fait la liaison de TBP sur TATA en ce qui concerne la conformation de TATA?

A
  • élargissement du petit silon de TATA -> configuration presque plane -> pli de l’ADN
122
Q

V-F. l’élargissement du petit sillon de TATA forme un plus grand angle chez les humain que chez les levures.

A

V. 105 vs 80 degr`s pour levures

123
Q

De quoi la spécificité de TBP-TATA dépend?

A

2 paires de résidus phénylalanine (4) : Chaines latérales s’intercalent enre les paires de bases aux deux extrémité de la boite TATA et entraine la courbure

124
Q

v-F. Les phenylalanie de TBP s’intercalent à travers TATA.

A

F. à ses extrémité :

Chaines latérales s’intercalent enre les paires de bases aux deux extrémité de la boite TATA et entraine la courbure

125
Q

V-F. Il y a interaction entre les a.a basique de TBP et le squelette phosphate de TATA

A

V

126
Q

V-F. Il y a beauocup de liaisons H entre TBP et les côtés des bases de TATA.

A

f. nombre limité

127
Q

V-F. certains TAFs forment des structures similaires à H2A-H2B.

A

F. H3-H4

128
Q

Environ combien de TAF s’associent à TBP?

A

10

129
Q

Combine de TAFs se lient à des éléments d’ADN comme Inr et DPE?

A

2

130
Q

V-F. Les TAFs ont un rôle de régulation concernant l’association de TBP à l’ADN

A

V: il a un rabat qui vient masquer la surface de liaison à l’ADN de TBP

131
Q

Quels sont les rôles de TFIIB?

A
  • contactes TFIIB-TBP, -ADN, -Pol II
  • s’insère dans canal de sortie de l’ARN et dans gorge du site actif (semblable à linker 3/4)
  • Aide à la formation du complexe ouvert
132
Q

Comment TBP aide ;a la formation du complexe ouvert?

A

En stabilisant les brins d’ADN sépérés jusqu’éa la mise en place de l’hybride ARN:ADN

133
Q

Quels sont les rôle de TFII F

A
  • S’associe à Pol II et est recruté au promoteur avec pol II

- pol II- TFII F stabilise le complexe ADN-TBP-TFIIB

134
Q

V-F. TFIIF seul se lie à l’ADN .

A

F. jumelé

a la polymérase avant sont arrivé sur l’ADN.

135
Q

quels sont les rôle de TFII E?

A

-recrutement de TFIIH

136
Q

Quelles sont les fonctions de TFII H?

A
  • 2 de 10 s-u ont des fonctions ATPase
  • 1 s-u a une fonction protéines kinase
  • contrôle la transition ATP-dépnendante du complexe de prinitiation au complexe ouvert
  • rôle dans la libération du promoteur
  • impliqué dans la réparation par excision de nucléotides (NER)
137
Q

Combien de sous-unités a TFIIH?

A

10

138
Q

Comment TFIIH controle la transition ATP-dépendante du complexe de préinition au complexe ouvert?

A

-force l’insertion de l’ADN (en aval de polII) dans la cavité de la polymérase ->fusion de l’ADN

139
Q

V-F. TFIIH n’utilise pas d’ATP.

A

F. en utilise.

140
Q

euca. Qu’est-ce que les activateurs font?

A

aident au recrutement de la pol II au promoteur en stabilisant la position de la pol II au niveau du promoteur

141
Q

où s’associe le médiateur?

A

à la queue CTD de pol II ET aux activateurs liés à l’ADN

142
Q

V-F. Le médiateur se lie à l’ADN.

A

F. aux activateurs eux liés à l’aDN et à la queue CTD

143
Q

Par quoi sont recruté les modificateur de nucléosomes et HAT?

A

Activateurs

144
Q

Combien ont de s-u les médiateurs?

A

au moins 20 s-u

145
Q

V-F. différents activateurs interagissent avec différentes s-u du médiateurs pour amener Pol II à différents gènes.

A

V. 1 s-u pour 1 sous-gourpe de gène

146
Q

V-F. La médiateur régule la fonction CTD kinase de TFIIH

A

V

147
Q

Qu’est-ce que Med17 ou Srb4?

A

une s-u du médiateur

148
Q

V-F Med 17/Srb4 est essentielle à la transcription de tous les gènes transcrits par Pol II.

A

V

149
Q

V-F. la déphosphorylation de la queue CTD de Pol II par TFIIH médie la dissociation du Médiateur de la Pol II au cours de la libération du promoteur.

A

F. phosphorylation

150
Q

Euca. Qu’est-ce qui se passe lorsqu’on passe de l’initiation à l’élongation?

A
  • Pol II se débarrasse des FGTs et du médiateur

- De nouveaux facteurs vont les remplacer

151
Q

V-F. Euca. Durant la phase d’élongation, l’ARN pol II n’a pas besoin d’autres facteurs.

A

F. FGT remplacer.

  • Facteurs d’élongation
  • facteur de maturaiton de l’ARN
152
Q

Euca. par quoi sont remplacer les FGTs à la phase d’élongation?

A
  • Facteurs d’élongations

- Facteurs de maturation de l’ARN

153
Q

Donnez des exemples de facteurs d’élongations.

A

TFIIS, STP5, TAT-SF1

154
Q

V-F. Les facteurs de maturation de l’ARN se lie à l’ARN de coeur.

A

F. recrutés au niveau de la queue (phosphorylées) CTD de la grosse sous-unité de PolII

155
Q

V-F. TFIIH phosphoryle les sérines aux positions 2 et 5.

A

F. 5 et 7

156
Q

Qu’est-ce qui phosphoryle la sérine en position 2 de la queue CTD de la pol II?

A

P-TEFb

157
Q

Que fait P-TEFb?

A

Stimule l’élongation :

  1. Phosphorylation de la sérine (position 2) de la queue CTD de la Pol II
  2. Activation (recrutement) de STP5 en la phosphorylant
  3. Recrutement de TAT-SF1, un facteur d’élongation
158
Q

V-F. NusG est le seul facteur de transcription universellement conservé

A

V : bac. archae, euca

159
Q

à quoi est comparable STP5?

A

NusG

160
Q

Que font NusG/STP5?

A

favorise la transition vers la phase d’élongation

161
Q

Comment NusG/STP5 favorise la transition vers la phase d’élongation ?

A

s’associent à un erégion de leur ARN pol respective chevauchant les sites de liaison des facteurs d’initiation de sigma 4 (bac) et TFIIB(euca).

162
Q

V-F. Les facteurs d’élongation nusG/STP5 auraitent dans leurs fonctions le déplacement de facteurs d’initiation.

A

V

163
Q

TFIIS fait la même chose que quoi?

A

facteurs de transcription de la famille ELL

164
Q

Comment TFIIS et ELL stimulent le taux global d’élongation?

A

réduise le temps de pause de la pol sur des séq qui ont tendance à la ralentir

165
Q

Quelles séqueuces peuvent sur l’ADN peut ralentir l’ARN pol?

A

Séq. riche en G/C suivis de séq riches en A/T semble induire la marche arrère et moment s de pauses : à cause température de fusion abruptement réduit : stabilité diminué

166
Q

Que fait TFIIS?

A
  • stimulent le taux gobal d’élongation (facteur d’élongation)
  • contribue à la correction sur épreuve effectuée par la polymérase
167
Q

Comment TFIIS sontribue à la correction sur épreuve fait par la polymérase?

A

-stimule une activité ARNase de la pol à l’extérieur du site actif ce uqi permet une voie alternative pour enlever les nucléotides incorrects (semblable à la correction hydrolytique chez bac)

168
Q

Euca. V-F. L’activité ARNase de l’ARN pol se trouve dans le site actif.

A

f. à l’extérieur du site actif

169
Q

Que en en commun TFIIS et GreB?

A

Syst de réparation de l’ARN semblable (TFIIS fait correction semblable à hydrolytique chez bac) ; interragissent de manière semblable sur leur pol

170
Q

Qu’ont de différents TFIIS et GreB?

A

Sont diférents au niveau de la structure et de la séquence

171
Q

V-F. FACT est utilile in vitro.

A

F. Pour l’ADN dans nucléosome

172
Q

Que fait FACT?

A

facilite la transcription en démentelant les nucléosome en retirant un dimère H2AH2B

173
Q

FACT contient quelles sous-unités?

A

Stp16 et SSRP1 (hétérodimère)

174
Q

Que fait Stp16?

A

se lie à un dimère H2AH2B

175
Q

SSRP1 se lie à quoi?

A

au tétramère H3H4

176
Q

V-F. FACT interagit avec STP5.

A

f. avec TFIIS

177
Q

ESt-ce que FACT réinsère le dimère H2AH2B dans l’histone?

A

Oui, immédiatement derrière la pol

178
Q

V-F. FACT est une chaperone.

A

v: peut réinséré le dimère H2AH2B

179
Q

Énumérez les enzymes nécessaire à la formation de la coiffe 5’ de l’arn

A
  1. ARN triphosphatase
  2. guanylyltransférase
  3. méthyltransférase
180
Q

V-F. La première modification de l’ARN est la formation de la coiffe 5’

A

V

181
Q

Que fait l’ARN triphosphatase

A

retrait d’un groupement phosphate de l’extrémité 5’ de l’ARN

182
Q

Que fait la guanylyl transférase?

A

Ajout d’un nucléotide GMP à l’extrémité

183
Q

V-F. la guanylyltransférase ajoute un GTP à l’extrémité 5’ de l’ARN. e

A

F. GMP

184
Q

la méthyltransférase fait la méthylation de quoi et en quelle position ?

A

méthylation de la guanine (ajout par guanylytransférase) en position 7

185
Q

En gros, la formation de la coiffe 5’ se par l’jout de…

A

ajout d’une guanine modifiée (7-méthyl-guanine-triphosphatase)

186
Q

V-F. L’Ajout de la coiffe 5’ émerge du canal de sortie de l’ARN de la pol lors de la transition de laphase d’initiation à la phase d’élongation

A

V

187
Q

V-F. Il y a phosphorylation de la Sérine 7 du CTD après l’ajour de la coiffe pour la désasemblage de la machinerie d’assemble de la coiffe.

A

F.

  • déphosphorylation
  • Sérine 5
188
Q

Quelles modifications l’ARN euca doit subir?

A
  • ajout d’une coiffe à l’extrémité 5’
  • polyadénylation de l’axtrémité 3’
  • Épissage des introns
189
Q

V-F. Des protéines participent àl’élongation et aux modifications de l’ARN.

A

V. ex. STP5 et TAT-SF1

190
Q

l’enzyme ajoutant la coiffe se position où?

A

Sur la sérine 5 de la queue CTD de l’ARN pol

191
Q

V-F. STP5 contribue au recrutement sur le CTD (sérine 5) de l’enzyme ajoutant la coiffe.

A

V. et stimule l’activité de l’enzyme

192
Q

Que fait TAT-SF1?

A

recrute des composantes de la machinerie d’épissage sur lanpolymérase (CTD, sérine 2) après le désasemblage de la machinerie ajoutant la coiffe

193
Q

V-F. L’élongation, la terminaison et la maturation de l’ARN sont interconnectées, ce uqi assure une coordination

A

V

194
Q

V-F. La queue CTD de la polymérase est impliquée dans le recrutement d’enzymes nécessaires à la polyadénylation

A

Vrai

195
Q

Qu’est-ce qu’il y à la fin d’un gène?

A

séquences signaux de polyadénylation (signaux poly-A)

196
Q

Qu’est-ce qui stimule le transfert des enzymes de terminaison sur l’ARN?

A

transcription du signaux poly-A

197
Q

Que fait CPSF?

A

forme un complexd instaable avec la signal poly-A

198
Q

Que fait CstF?

A

a’associe à la séq. riche en G/U après la séq. poly-A

199
Q

Quand est-ce que CF1 et CF2 s’ajoute?

A

après que CstF soit associé à la séq. G/U

200
Q

V-F. PAP n’utilise pas d’ATP.

A

F.

201
Q

V-F. PAP ajoute des nucléotides par un mécanisme enzymatique identique à celui de l’ARN pol

A

V. sau fqu’il n’utilise pas de matrice

202
Q

Donner la séquences des protéines qui font la terminaison et la polyadénylation sur
3’ et où il s’attache

A
  1. CPSF sur signal poly-A
  2. CstF sur séq. G/U
  3. CF1 et CF2 sur complexe protéique
  4. PAP
  5. PABPII
203
Q

La longueur de la queue poly-A est déterminé par quoi?

A

PABPII

204
Q

CPSF sert à quoi?

A
  • clivage

- polyadénylation

205
Q

CstF sert à quoi?

A

-clivage

206
Q

Que fait CF1 et CF2?

A

clivage de l’ARN

207
Q

Que fait PABPII?

A
  • stimule l’activité de la poly-A polymérse (PAP)

- signal d’arrêt de la polyadénylation

208
Q

V-F. La queue poly-A est essentielle à l’exportation du noyau.

A

V

209
Q

Quels sont les deux modèles de terminaison de la transcription

A
  • modèle de la torpille

- modèle allostérique

210
Q

Le modèle de la torpillle est semblable à quoi chez les eucaryotes?

A

-terminaison rho-dépendante

211
Q

Le modèle allostérique est semblable à quoi chez les eucaryotes?

A

Pas semblable, pas de structure secondaire, terminaison spontanée

212
Q

Que fait Rat1/Xrn2?

A

dégrade rapidement l’ARNde 5’ à 3’ jusqu’à ce qu’elle rattrape l’ARN ppolymérase

213
Q

Que qui charge Rat1/Xrn2 sur l’extrémité libre du second ARN?

A

Rtt103

214
Q

En ce qui concerne Rat1/Xrn2, lequel se retouve dans quel organisme?

A

Rat1 : nom chez la levure

Xrn2: humain

215
Q

V-F. Rat1/Xrn2 est une ARNase très processive.

A

V

216
Q

Qu’est-ce qui fait la terminaison de la transcription dans le modèle allostérique?

A

L’ARN pol devient moins processive à cause des signaux poly-A à cause de changements conformationnels. Même à une terminaison spontanée

217
Q

V-F. L’ARN pol I et III transcrivent des gènes encodant des ARN spécialisés

A

v

218
Q

Quel est le seul FGT universelle (pol I II III)

A

TBP

219
Q

V-F. Les ARN pol I II III ont les mêmes FGT

A

F. ont leur propre sous-groupe de FGT (sauf TBP universel)

220
Q

Quels sont les gènes les plus exprimés?

A

ARNr 45s (par ARN45s)

221
Q

De quoi est composé les gènes de l’ARNr 45s?

A
  • promoteur central

- UCE

222
Q

L’initiation de la trasncription par l’ARN pol I nécessite quel facteur?

A
  • SL1 sur le promoteur central

- UBF (2) sur UCE

223
Q

V-F. Sl1 recrute UBF qui recrute Pol1

A

F. UBF recrute SL1 ET Pol1 au promoteur

224
Q

de quoi est composé SL1?

A

TBP et 3 TAF spécifique pour pol 1

225
Q

V-F. SL1 se lie au pormoteur central uniquement en présence de UBF

A

V

226
Q

UBF se lie à quoi?

A

UCE

227
Q

V-F. Les promoteurs de pol III se retrouvent habituellement en amont du site de début de la transcription.

A

F. Aval

228
Q

La promoteur d’un ARNt est composé de quoi?

A

Boite A et B séparé par un court élément

229
Q

La promoteur d’un ARNr 5S est composé de quoi?

A

Boite A et C

230
Q

V-F. Les promoteurs de l’ARN pol III peuvent contenir TATA

A

V

231
Q

Quel FGT sont nécessaires pour la transcription d’un gène ARNr 5S?

A

TFIIIA B et C

232
Q

Qu’est-ce qui contient TBP dans le transcription avec pol III?

A

TFIIIB

233
Q

Dans la transcription d’un ARNt, quel FGT fait quoi.

A
  1. TFIIIC recrute TFIIIB en amont du site de début de transcription
  2. TFIIIB recrute la pol III au site de début de transcription
234
Q

V-F. Dans la transcription avec l’ARN pol III, TFIIIB se trouve, comme les boites, en aval du site de début de transcription.

A

F. En amont.

235
Q

Quel est la seul polymérase qui fait la transcription dans le noyau?

A

pol I