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MMD1042 (module 3) > Transcription De L’ADN > Flashcards

Transcription De L’ADN Flashcards

1
Q

Que génère la transcription?

A

Polymère de ribonucleotides (ARN)

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2
Q

En gros, comment se fait la transcription?

A

ARN polymérase synthétise l’ARN de 5’ à 3’ en faisant une copie complémentaire du brin matrice (U au lieu de T)
Donc l’ARN est la séquence de brin d’ADN codant mais avec des ribonucleotides au lieu de des désoxyribonucléotides

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3
Q

Dans quel sens l’ARN polymérase lit le brin matrice.

A

3’ à 5’ (mais ARN synthétisé est quand même 5’ à 3’)

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4
Q

Quel est la différence de structure de l’ADN et de l’ARN?

A

Adn : 2 brins complémentaires donc appariements intramoléculaires
Arn : 1 brin donc interactions avec lui-meme

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5
Q

Qu’est-ce qui définit les structures secondaires et tertiaires de l’ARN?

A

Secondaire: appariements de bases qui créent des boucles
Tertiaire : appariements de bases entre 2 régions simple brin des boucles

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6
Q

Quel enzyme déroule l’ADN au fur et à mesure de la synthèse d’arn ?

A

ARN polymérase déroule et synthétise

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7
Q

Vrai ou faux. La double hélice constituée uniquement d’ADN se reforme tout de suite après l’ARN polymérase ?

A

Vrai mais faux parce que tellement tout de suite après que courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement (heteroduplex)

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8
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’ARN polymérase ?

A

Synthétise l’ARN en copiant un brin matrice (lu de 3’ à 5’ même si polymérase transcrit de 5’ à 3’)
Ne nécessite pas d’amorce
Crée des liens phosphodiester entre les nucleotides en son site actif
Fait plus d’erreur que l’ADN polymérase

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9
Q

Pour quoi la transcription n’a pas à être aussi précise que la réplication de l’ADN ?

A

Les erreurs ont une durée de vie limitée correspondant à la durée de vie du transcrit

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10
Q

Comment l’ARN polymérase sait ou commencer et où terminer la transcription ?

A

Séquence sur l’ADN qui signalent l’initiation et la terminaison :
Promoteur (initiation)
Terminateur (terminaison)

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11
Q

En plus des signaux sur l’ADN que nécessite la polymérase pour initier et terminer la transcription?

A

Facteurs protéiques (essentiels parce que donnent spécificités d’expression des gènes):
Facteur sigma chez les procaryotes s’associe à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription

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12
Q

Vrai ou faux. Lors de l’élongation, le facteur sigma est présent?

A

Faux, il est relâché quelques nucleotides (environ 10) après l’initiation et donc l’ARN polymérase continue seule jusqu’au signal stp où elle est relâchée

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13
Q

Qu’est-ce qu’une séquence consensus (ou canonique)?

A

Ordre calculé des nucleotides (acides nucléiques) ou des acides aminés (protéines) trouvés à chaque position dans un alignement de séquences
Le but est de calculer des pourcentages des motifs de séquences similaires pour chaque position (consensus = séquences qui reviennent le plus souvent)

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14
Q

Nommer un exemple de séquence consensus?

A

Promoteur procaryote

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15
Q

Vrai ou faux. Il y a plusieurs facteurs sigma chez les procaryotes?

A

Vrai, pour leurs différentes affinités avec les différents promoteurs (qu’ils choisissent)

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16
Q

Quelles sont les boîtes des séquences promotrices typiques procaryotes?

A

Courtes séquences conservées à -10 et -35 (séparées parce que les protéines sont trop grosses, il y aurait de l’encombrement)

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17
Q

A quoi servent les boîtes promotrices?

A

Dicter le brin à utiliser et le sens de la transcription

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18
Q

Comment est-ce que l’efficacité d’un promoteur peut être influencée ?

A

Plus la sequence dun promoteur est similaire à la séquence consensus (idéale), plus grande sera l’affinité du facteur sigma et plus grande sera l’efficacité d’initiation de la transcription (promoteur plus fort)

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19
Q

Quelle séquence se trouve à -10?

A

TATAAT : repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription

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20
Q

Comment se fait la reconnaissance moléculaire entre l’ARN polymérase avec le facteur sigma et le promoteur?

A

Liaisons chimiques faibles

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21
Q

Quel est le rôle du facteur sigma?

A

Reconnaître la séquence promotrice sur l’ADN

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22
Q

À quel moment le facteur sigma s’associe avec l’ARN polymérase?

A

Avant la transcription (avant de s’associer avec le promoteur vu qu’il le reconnaît)

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23
Q

Quelles sont les étapes de la transcription ?

A

Association ARN polymérase et facteur sigma
Contact polymérase avec promoteur don ouverture locale de la double hélice = bulle de transcription
Initiation de la synthèse d’ARN
Relâchement du facteur sigma après la synthèse d’environ 10 ribonucleotides
Élongation
Rencontre du signal de terminaison (forme que prend l’ARN)
Arn polymérase se détache libérant l’ARN

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24
Q

Rai ou faux. Une ARN polymérase ne peut faire qu’une transcription ?

A

Faux, elle peut se trouver un autre facteur sigma et faire une nouvelle transcription apres

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25
Q

Qu’est-ce que le signal de terminaison de la transcription?

A

Séquence consensus à l’extrémité 3’ de l’ARN Néo-synthétisé qui permet de former une tige boucle

26
Q

Comment est-ce que la tige boucle se forme et induit l’arrêt de la transcription?

A

Appariement des bases complementaires de l’ARN nouvellement synthétise
Cela crée une contrainte au niveau du complexe de l’ARN polymérase qui favorise le détachement de l’ARN polymérase

27
Q

De quoi est composée la séquence tige-boucle?

A

Riche en G-C (2 A-U) suivi d’une série de U
Stable

28
Q

Quelle est la différence entre les cellules procaryotes et eucaryotes?

A

Procaryotes : une seule ARN polymérase
Eucaryotes : 3 ARN polymérase

29
Q

Que transcribent les différentes ARN polymerases?

A

I : ARNr (qui composent les ribosomes)
II : ARNm (qui codent pour les protéines)
III : ARNt (qui servent d’adaptateur lors de la synthèse protéique) et petits ARN (qui sont utilisés dans différents processus cellulaires)

30
Q

Quelle est la nature du signal d’initiation de polymérase II?

A

Promoteur eucaryotes (2 parties):
Éléments contrôlés proximal : GC box (-100) et CAAT box (-80)
Promoteur core : TATA box (-25)

31
Q

A quoi sert la tata box?,

A

Point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription

32
Q

Qu’est-ce qui forme le complexe d’initiation chez les eucaryotes?

A

Facteurs généraux de la transcription reconnaissent et se lient à la séquence tata box

33
Q

Quels sont les facteurs généraux de la transcription?

A

TFIID (qui fait intervenir d’autre complexes soit TBP et TAF)
TBP : reconnaît tata box
TAF : reconnaît les autres séquences d’ADN proche du site d’initiation
TFIIB : positionne l’ARN polymérase au début du site de transcription
TFIIF : stabilise l’interaction entre l’ARN polymérase et TBP et TFIIB et contribue à l’attraction entre TFIIE et TFIIH
TFIIE : attire et régule TFIIH
TFIIH : déroule la double hélice d’ADN et commence la transcription

34
Q

A quoi servent les caat box et gC box du promoteur basal?

A

Augmentation de son efficacité
Régulation de la transcription des gènes

35
Q

Qu’est-ce qui lié la caat box et la gC box?

A

Facteurs généraux de la transcription
Facteurs activateurs spécifiques

36
Q

Quelles séquences sont impliquées dans la régulation des gènes?

A

Facteurs spécifiques d’activation liés à des séquences : enhancer
Facteurs spécifiques de répression liés à des séquences : silencer

37
Q

Où se trouve les enhancer et les silencer?

A

A des milliers de paire paires de bases en amont ou en aval du promoteur

38
Q

Comment se déroule l’initiation chez les eucaryotes?

A

Reconnaissance de la boîte tata par TBP
Facteurs généraux de transcription (TBP avec TFIID et TFIIB) s’associent à la boîte tata (-25)
Arn polymérase II se lie
TFIIF, TFIIE, TFIIH sont ajoutés après ce qui complète la formation du complexe d’initiation
TFIIH cause une séparation des 2 brins de l’ADN (ouverture locale)
TFIIH effectue une phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase ce qui cause la libération des autres facteurs de transcription (TFIIB, TFIIE, TFIIF, TFIIH) = signal de départ

39
Q

Vrai ou faux. Sans les facteurs généraux de transcription, ArN polymère ne reconnaît pas le promoteur?

A

Vrai

40
Q

Quel facteur général de transcription n’est pas libéré au début de l’élongation ?

A

TFIIB avec son TBP sont toujours la

41
Q

Quand commenced la maturation de l’ARN?

A

Facteurs de maturation du pré-ARNm se lient à la queue C-terminal de l’ARN polymérase II et donc dès que ARNm est formé ça commence
Transcription et modification en simultané

42
Q

Comment se fait la terminaison chez les eucaryotes?

A

ARN polymérase II se rend au terminateur (séquence dans le pré-ARN transcrit ) : AAUAAA
Pré-ARNm est clivé et poliadénylé
Polymérase se détache

43
Q

Quel est le double rôle du terminateur chez les eucaryotes?

A

Arrêter la transcription
Signal de polyadénylation (ajout d’une longue queue de A)

44
Q

Vrai ou faux. L’ARN est constamment synthétiser et dégrade ?

A

Vrai, pour assurer une régulation stricte de son abondance

45
Q

Qu’est-ce qui régule l’abondance d’ARN?

A

Au niveau de l’initiation de la synthèse
Au niveau de sa dégradation

46
Q

Comment se caractérise la demi-vie des ARNm des eucaryotes ?

A

Quelques minutes à quelques heures

47
Q

Qu’est-ce qu’une demi-vie?

A

Le temps que ça prend pour arriver à 50% de la quantité initiale

48
Q

Comment se fait le contrôle de la transcription ?

A

Changement des patrons d’expression des gènes qui sont induits ou réprimés (voir diapo)

49
Q

Que permet la régulation de la transcription ?

A

Expression d’un gène au bon moment (selon les besoins de la cellule)

50
Q

Vrai ou faux. L’efficacité de la transcription détermine la quantité d’arn produit et a donc un impact sur la quantité de protéine traduite?

A

Vrai

51
Q

Quand se fait ka regulation du taux de transcription d’un gène?

A

Au niveau de l’initiation par la séquence du promoteur et les facteurs de transcription spécifiques qui s’y attachent

52
Q

Vrai ou faux. La vitesse d’élongation varie avec l’efficacité de la transcription ?

A

Faux, elle reste toujours la même (c’est la régulation qui change)

53
Q

Comment se fait la régulation de la transcription?

A

Régions de contrôle spécifique pour facteurs protéiques spécifiques
Activateurs se lient à des séquences enhancer
Dépresseurs se lient à des séquences silencers

54
Q

Comment est-ce que la liaison entre les protéines spécifiques et les régions spécifiques entraîne l’activation ou la répression de la transcription?

A

Changement de conformation de ces complexes

55
Q

Comment la transcription est elle stimulée ou inhibée ?

A

Facteurs d’activation peuvent :
Recruter des facteurs généraux de la transcrip et l’ARN polymérase II
Attirer les complexes du remodelage de la chromatine qui vont decondenser la chromatine
Attirer des modificateurs de la chromatine

Dépresseurs font le contraire

56
Q

Quel est l’exemple de facteur qui remodele la structure de la chromatine?.

A

Activateur : recrutement d’acetylase d’histone (queues d’histone acetylees donnent une meilleure accessibilité à l’ADN)
Dépresseur : recrutement des déacetykases d’histone

57
Q

Comment se lient les protéines activatrices sur les sérances enhancers au complexe d’initiation, malgré leur éloignement ?

A

En créant une boucle

58
Q

Que comprennent les facteurs spécifiques de trans crispation?

A

Domaine spécifique de liaison à l’ADN
Domaine d’activation l’un un domaine de répression

59
Q

Rai ou faux. Il est possible pour une cellule ou un organisme de s’adapter aux conditions changeantes de leur environnement ?

A

Vrai par modulation de l’activité des facteurs protéiques

60
Q

Comment les hormones glucocoticoides modulent l’activité des facteurs protéiques?

A

Effort physique : transformation du glycogène en glucose (utilisation de la réserve énergétique) grâce à l’enzyme convertissant le glycogène qui n’est pas constamment présente (synthétise au besoin selon la présence de glucocorticoids)

61
Q

Qu’est-ce qui détermine la butées deinitiation de la transcription?

A

Facteurs de transcriptions (qui s’associent aux régions régulatrices des gènes) varient d’un gène à l’autre et d’une conditions à l’autre

62
Q

Vrai ou faux. Le complexe d’initiation de la transcription est identique pour la transcription de tous les gènes ?

A

Vrai (ARN polymérase et facteurs généraux de transcription)

MMD1042 (module 3) (11 decks)

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