Transcription de l'ADN Flashcards
Quel est le flux de l’Information génétique?
Réplication - ADN en ADN
Transcription - ADN en ARN
Traduction - ARN en Protéine
Le mécanisme de transcription génère un polymère de _ ?
ribonucléotides
Le polymère généré par le mécanisme de transcription est synthétisé par quoi?
par une ARN polymérase
Quelle est la polarité de la synthèse de l’ARN par l’ARN polymérase?
L’ARN polymérase synthétise de 5’ à 3’
L’ARN fait la synthèse du brin d’ARN à partir de quel brin de l’ADN?
L’ARN est synthétisé sur le brin matrice (il en est une copie complémentaire)
Le brin matrice de l’ADN (celui qui est transcrit) est lu de quel côté à quel côté?
De 3’ à 5
La synthèse de l’ARN par l’ARN polymérase se fait sur le brin _ et est donc complémentaire avec le brin _, puis est une copie presque conforme au brin _ en raison de la complémentarité des brins d’ADN.
- matrice
- matrice
- codant
L’ARN synthétisé a la séquence du brin d’ADN _, mais avec des _ au lieu de _, et des _ au lieu de T
- codant
- ribonucléotides
- désoxyribonucléotides
- U
Quelle sont les 3 différences entre la structure de l’ARN vs celle de l’ADN?
ARN:
- Possède un ribose (sucre, pentose) au lieu d’un désoxyribose
- Il y a donc la présence d’un OH sur le deuxième carbone du cycle qui rend la molécule beaucoup moins stable que l’ADN
- U au lieu de T
Par convention, dans un schéma/dessin, quel brin de l’ADN est toujours représenté sur le dessus?
Le brin codant
Quelles types de structures l’ARN a t-elle? Pour quelle(s) raison(s)?
- Structure secondaire
- Structure tertiaire
En raison des interactions entre ses bases (des ponts H formant des appariements, puis des boucles et des hélices)
Qu’est ce qu’un pseudoknot?
Appariement de bases entre deux régions simple-brin de boucles d’ARN
L’ARN possède t-elle des pseudoknot?
Oui
Quelle est la molécule/protéine qui permet/qui fait la transcription de l’ADN en ARN?
L’ARN POLYMÉRASE
Au fur et à mesure de la synthèse d’ARN par l’ARN polymérase on remarque quoi avec l’ADN et avec l’ARN?
Déroulement de l’ADN + polymérisation de l’ARN d’un côté de l’ARN polymérase (vers l’avant) et sortie de l’ARN nouvellement polymérisé de l’autre côté de l’ARN polymérase (vers l’arrière)
Après avoir effectué la transcription, que se passe-t-il avec l’ADN?
Reformation de la double hélice en arrière de l’ARN polymérase
Quelle structure particulière retrouve-t-on à l’intérieur de l’ARN polymérase?
L’hétéroduplex
Qu’est-ce que l’hétéroduplex?
Une courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement à l’intérieur de l’ARN polymérase lors de la transcription de l’ARN (~9 nucléotides)
Caractéristiques des ARN Polymérases (5)
- L’ARN polymérase synthétise l’ARN en copiant d’un brin matrice d’ADN
- Transcrit de 5’ à 3’ (brin matrice de l’ADN doit être lu de 3’ à 5’)
- Ne nécessite pas d’amorce (pas de besoin de bout 3’ -OH)
- La transcription n’a pas à être aussi précise que la réplication d’ADN
- Crée des liens phosphodiesters entre les nucléotides en son site actif
Pourquoi la transcription d’ARN faite par les ARN polymérases n’a pas à être aussi précise que la réplication d’ADN?
Puisque les erreurs ont une durée de vie limitée correspondant à la durée de vie du transcrit (ARN est synthétisé et dégradé juste après)
Comment se nomme le point précis où commence la transcription de l’ADN en ARN (site d’initiation de la transcription SUR L’ADN)?
Promoteur
Comment se nomme le point précis où se termine la transcription de l’ADN en ARN (site terminaison de la transcription SUR L’ADN)?
Terminateur
Le promoteur et le terminateur sont des séqueunces en _
ADN
Chez les procaryotes, lors de la transcription, de quoi a besoin la polymérase pour initier et terminer la transcription? (2)
- Des facteurs protéiques
- Des signaux dans l’ADN
Qu’est ce que le facteur sigma chez les procaryotes?
- Le facteur sigma s’associe à la polymérase avant de s’associer au promoteur pour former le complexe d’initiation de la transcription
- Il aide à choisir le type de promoteur: facteur de spécificité
Où est recrutée l’ARN polymérase lors de l’initiation de la transcription?
Au niveau du promoteur
Où est relâchée l’ARN polymérase de l’ADN lors de la terminaison de la transcription?
Au niveau d’un signal de STOP
Quelle est la fonction des facteurs sigmas chez les procaryotes?
Ils s’associent à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription et ainsi aider à trouver le bon promoteur
L’ARN polymérase est recrutée au niveau du _ avec le facteur _
- promoteur
- sigma
La transcription se fait dans quel sens?
5’ → 3’
Quand est-ce que le facteur sigma est relâché?
Le facteur sigma est relâché quelques 10 nucléotides après initiation de la transcription
Quand est-ce que l’ARN polymérase est relâchée?
L’ARN polymérase est relâchée de l’ADN au niveau d’un signal de stop (arrêt de la transcription)
Quelles sont les 3 grandes étapes de la transcription
- Initiation
- Élongation
- Terminaison
Qu’est ce qu’une séquence consensus/séquence canonique?
Ordre calculé (%) des nucléotidiques (acides nucléiques) ou acides aminés (protéines), trouvés à chaque position dans un alignement de séquences (on aligne plusieurs gènes pour voir s’il y a une séquence qui se répète)
Pourquoi la séquence consensus/séquence canonique est elle pertinente et utile?
- Elle permet de représenter les résultats d’alignements de séquences multiples dans lesquels des séquences apparentées sont comparées les unes aux autres
- Des pourcentages des motifs de séquences similaires sont calculés
Un exemple d’alignement de séquences et de séquence consensus important dans la transcription chez les procaryotes est…?
La région du promoteur des Procaryotes (+ on s’approche de cette séquence de promoteur, + le promoteur est fort)
Quelle est la conséquence du fait que le promotteur dans l’ADN s’approche physiquement de la séquence idéale (la séquence la plus fréquente)
Plus on s’approche de cette structure, plus le promotteur va être fort (et inversement)
Sigma est un facteur nécessaire à _ de la transcription qui permet
la _ du gène à transcrire
- l’initiation
- sélection du promoteur
Combien y a t-il de facteur(s) sigma chez les procaryotes?
Plusieurs facteurs sigma
Le facteur sigma chez les procaryotes s’associent à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription après ou avant de lier au promoteur?
Avant!
Qu’est-ce que les facteurs sigma bactériens reconnaissent?
Une paire de courts motifs (séquences) conservés appelés boîtes -10 et -35
Qu’est ce qui détermine les nom des boîtes -10 et -35?
Leur distance du site d’initiation de la transcription (le nombre de nucléotides qui les séparent)