Maturation de l'ARNm Flashcards
Quel est le devenir/destin des transcrits primaires ARN des procaryotes et pourquoi est-ce ainsi?
L’ARNm ne nécessitent pas d’être maturé, car l’information des gènes est contigüe/continue
Quel est le devenir/destin des transcrits primaires ARN des eucaryotes et pourquoi est-ce ainsi?
Les ARN primaires (préARNm) doivent être maturés par des modifications en ARNm puisque l’information des gènes est morcelée/discontinue
(exons-introns)
Chez les procaryotes l’ADN bactérien est directement en contact avec quoi? Où est l’ADN?
En contact avec le cytoplasme, car il est dans le cytoplasme (pas de noyau)
Chez les eucaryotes l’ADN est en contact avec quoi? Où est l’ADN?
En contact avec le noyau, car dans le noyau
Chez les procaryotes où se fait la transcription, la maturation et où se fait la traduction?
PAS DE MATURATION
Les deux autres dans le cytoplasme (l’ARN synthétisé est tout de suite en contact avec les ribosomes qui effectuent la traduction)
Chez les eucaryotes où se fait la transcription, la maturation et où se fait la traduction?
- La transcription et la maturation des ARN se font dans le noyau.
- La traduction se fait dans le cytoplasme
Les préARNm des eucaryotes doivent être (1) et transportés dans le cytoplasme pour (2)
- maturés par modifications en ARNm
2. la traduction en protéine
Que veut dire « eucaryote »
“vrai noyau”
Que veut dire « procaryote »
“avant le noyau”
Chez les procaryotes, combien de protéines peuvent être codées par un même ARNm?
Plusieurs protéines différentes peuvent être codées par un ARNm polycistronique
Chez les procaryotes, comment appelle-t-on les ARNm pouvant coder pour plusieurs protéines?
ARNm polycistronique
Qu’est ce que le concept d’opéron chez les procaryotes?
Plusieurs gènes contrôlés par un seul promoteur en amont (1 seul promoteur, 1 seul messager = plusieurs protéines)
Chez les eucaryotes, combien de protéines peuvent être codées par un ARNm (après épissage)?
1
1 ARNm donne en générale 1 protéine
Malgré le fait que chez les eucaryotes 1 ARNm, (après épissage) donne en générale 1 protéine y a-t-il une façon de générer plusieurs isoformes d’une même protéine?
OUI! Plusieurs isoformes d’une même protéine peuvent être obtenus à partir du Pré-ARNm s’il y a épissage alternatif
Chez les procaryotes l’information des gènes est _ et les ARNm _ être maturés
- contigüe
- ne doivent pas
Chez les eucaryotes l’information des gènes est _ et les ARNm _ être maturés
- discontinue
- doivent
Chez les eucaryotes, quelles sont les 3 grandes étapes de la maturation du pré-ARNm?
1- Addition de la coiffe en 5’
2- Épissage des introns
3- Polyadénylation (queue poly-A)
(les étapes de ce processus sont détaillées dans le document sur la maturation)
Chez les eucaryotes, qu’est ce que la coiffe en 5’?
La séquence codante
Chez les eucaryotes, quand est-ce que la queue poly-A est ajoutée?
Après la transcription
Les ARN des eucaryotes sont transcrits et maturés _ dans le noyau
simultanément
Au fur et à mesure que l’ARN polymérase synthétise le pré-ARNm le processus de maturation commence déjà pourquoi?
Pour économiser du temps
Outre son rôle dans la
transcription, qu’est ce que l’ARN polymérase fait d’important pour le processus de la maturation?
Elle recrute via sa queue hyperphosphorylée des protéines impliquées dans la maturation de l’ARN en voie de synthèse (= co transcriptionnelle)
Les exons correspondent la pluspart du temps aux séquences dites _ que l’on retrouve dans l’ARN messager après élimination des introns
- « codantes »
Se peut-il que parfois les exons contiennent des séquences non-codantes?
Oui! Souvent, les premiers exons et derniers exons, contiennent également des séquences non-codantes en 5’ et 3’, respectivement (appelées 5’ Untranslated region (UTR) et 3’ Untranslated region (UTR))
Qu’est ce que l’épissage?
Un processus par lequel les séquences des introns sont excisées du pré-ARNm et les exons sont reliés entre eux pour donner naissance au ARNm mature
L’épissage du pré-ARNm donne naissance à…
… l’ARNm mature
Pour exciser un intro des _ sont nécessaires afin de _
- séquences nucléotidiques spécifiques
- reconnaître où sont le début et la fin des introns
Qu’est-ce que le site receveur/accepteur sur l’ARN?
Le site de passage de l’intron à l’exon
Qu’est-ce que le site donneur sur l’ARN?
Le site de passage de l’exon à l’intron
Le site donneur est toujours du côté…
5’ entre l’exon 1 et l’intron (jonction 5’)
Le site accepteur est toujours du côté…
3’ entre l’intron et l’exon 2 (jonction 3’)
Des séquences spécifiques identifient les jonctions 5’ et 3’ des introns et sont, elles,
reconnues par quoi?
Des petites ribonucléoprotéines nucléaires (snRNP= small nuclear ribonucleic particles)
Que font les petites ribonucléoprotéines nucléaires (snRNP= small nuclear ribonucleic particles) qui identifient les séquences spécifiques?
Elles assistent la coupure de l’ARN aux jonctions intron-exon et relient les exons entre eux de façon covalente
Les différentes séquences spécifiques sur le pré-ARN retrouvées ne sont pas à apprendre appart laquelle?
Savoir qu’il y a un A obligatoirement au milieu (4e nuclétide de la séquence de 3 nucléotides) du point de branchement d’un intron
Où retrouve-t-on le fameux A dans le point de branchement d’un intron?
~30 nucléotides avant le début d’un exon (donc à 30 nucléotides de la fin de l’intron)
Les exons sont des (1) qui ont grandement contribué à (2) de par l’apparition de (3)
- modules d’information (ex: codant des domaines)
- l’évolution
- nouvelles protéines
Quelles sont les deux manières qui ont permis à de nouvelles protéines d’apparaitre à travers l’évolution via les exons?
- Duplication d’un exon à l’intérieur d’un même gène
2. Insertion d’un exon à l’intérieur d’un gène déjà existant via un mécanisme de recombinaison
Quand l’épissage du pré-ARNm se fait-il par rapport à la transcription (avant/après/en même temps)?
En même temps (simultanément)
Combien de gènes ont été identifiés dans le génome humain?
30000
Le nombre de gène dans le génome humain peut-il expliquer la diversité des protéines et des phénotypes?
Pas vraiment, car nous n’avons pas vrm un nombre de gènes très différent d’un vers (21 000 gènes) ou d’une poule (23 000 gènes).
*Comme référence, la levure a 6,000 gènes
Comment pouvons nous expliquer la diversité des protéines (d’où vient le fait qu’on a beaucoup plus de protéines que de gènes?)
Par l’épissage alternatif (tissu-spécifique)
Qu’est ce que l’épissage alternatif?
Le fait qu’un transcrit primaire peut être épissé différemment selon le type cellulaire, permettant aux eucaryotes d’augmenter le potentiel de codage de leur génome
Est-ce que beaucoup de gènes humains codent pour des pré-ARNm qui subissent un épissage alternatif?
Oui, la majorité! Environ 60% des gènes humains
On peut dire que la maturation des ARN permet de…
… contrôler l’expression génique
Lors d’un épissage alternatif, on peut avoir _ ou _ de certains exons, produisant de cette manière _ qui seront traduits en _
- élimination
- inclusions
- différents ARNm
- protéines différentes
Les formes dépistage alternatif varient selon le…
… tissu
Qu’est-ce qui résulte du fait que les tissus peuvent faire varier les formes d’épissages alternatifs?
Une diversité tissu-spécifique
Quels sont les 6 différents mécanismes dépistage alternatif possibles?
Les exons peuvent coder pour quoi?
Des domaines de protéines
L’épissage alternatif donne naissance à _ composées chacune de modules (domaines) _ et _
- des variantes de protéines (des protéines avec des domaines différents)
- identiques
- différents
Qu’est ce que la régulation positive de l’épissage (fait par quoi et mène à quoi)?
- Fait par un activateur de l’épissage (facteur/protéine)
- Mène à l’exclusion d’un intron dans
l’ARNm mature du tissu suite à la mise en évidence du site d’épissage par l’activateur
Qu’est ce que la régulation négative de l’épissage (fait par quoi et mène à quoi)?
- Fait par un répresseur de l’épissage
- Mène à l’inclusion d’un intron dans l’ARNm mature du tissu suite au masquage du site d’épissage par le répresseur, empêchant le spliceosome de voir le site à épisser
Comment un répresseur de l’épissage agit-il?
C’est une protéine (un facteur) qui va bloquer la jonction intron et exon ainsi le spliceosome ne verra pas ce site, car la séquence est masquée, c’est comme si ça n’existant pas ce site d’épissage
Comment un activateur de l’épissage agit-il?
Le facteur (protéine) met en évidence le site d’épissage
Les introns sont normalement _ par épissage mais certains introns peuvent se comporter comme des _
- éliminés
- exons optionnels
Que veut-on dire quand on dit qu’un intron peut se comporter comme un exon optionnel?
Il peut être présent dans ARNm mature puis traduit en protéine s’il n’est pas épissé
Avant d’être exporté au noyau, les ARNm des eucaryotes doivent être…
… maturés
Vrai ou faux? Seuls les ARNm maturés correctement peuvent sortir du noyau
Vrai
Quelle structure reconnaît et exporte seulement les ARNm qui on terminé leur maturation?
Le complexe de pores nucléaires
Comment le complexe de pores nucléaires reconnaît-il les ARNm qui on terminé leur maturation?
Un ensemble de protéines signale que l’ARNm a bien subi une maturation
correcte et est prêt à l’exportation
Quelles 3 protéines sont inclues dans l’ensemble de protéines qui signalent que l’ARNm a bien subi une maturation
correcte et est prêt à l’exportation (après la maturation)?
- La protéine de liaison à la poly A (PABP)
- La protéine de liaison à la coiffe (Cap-binding protein)
- Un complexe de protéines qui se lie à la jonction d’exons (EJC; Exon Jonction Complex) et qui se dépose après excision des introns
Quelle est l’étape principale pour la régulation de la plupart des gènes eucaryotes?
La transcription
