Transcripción en eucariotas Flashcards
Tipos de ARN polimerasas
- ARN polimerasa I: transcribe un solo gen, el de la síntesis de ARN prerribosomático. Este tiene que ser transcrito muchas veces por eso tiene una polimerasa propia. La enzima reconoce solo un promotor.
- ARN polimerasa II: se encarga de transcribir todos los ARNm que se encarguen de la síntesis de proteínas y de algún ARN especializado. Reconoce muchos promotores distintos con secuencias diferentes.
- ARN polimerasa III: se encarga d ela transcripción del ARNt, ARNr 5S y algún ARN especializado. Reconoce promotores bien caracterizados con secuencias reguladoras upwards.
La caja TATA
Es una secuencia consenso en la posición -30
La secuencia Inr
Es la secuencia iniciadora, que indica dónde está el primer nucleótido en la posición +1.
ARN polimerasa I
Es mucho más grande en eucariotas que en bacterias. Tiene 12 subunidades, RBP1 a RBP12. RBP1 se parece a beta’, RBP2 se parece a beta y RBP3 y RBP11 se parecen a alfa.
La subunidad RBP1 es la más grande. Tiene un dominio carbonizo terminal (CDT). La larga cola carbonizo terminal está formada por repeticiones de una secuencia consenso de 7 aa que son mayoritariamente polares y tienen todos un grupo OH donde se suele colocar un P para regular la enzima.
A diferencia de los procariotas, la ARN polimerasa necesita ayuda de muchos compuestos diferentes.
Compuestos necesarios para la transcripción
- TBP (tata binding protein)
- TFIIA: estabiliza unión de TFIIB y TBP al promotor
- TFIIB: binds to TBP y recruta a Pol II-TFIIF
- TFIIE: recruta TFIIH tiene ATPasa y helicasa
- TFIIF: une a Pol II y TFIIB, no deja que la pol II se una a ADN randomly.
- TFIIH: 12 subunidades diferentes con muchas funciones entre ellas la actividad helicasa, quinas y tiene que ver con la reparación por escisión de nucleótidos.
INICIACIÓN
- Se une la TATA bingind proteína a la caja TATA.
- Se une TFIIB a TBP y al ADN, si el promotor es débil también se une TFIIA.
- TFIIF trae a la polimerasa II y se unen al complejo TFIIB-TBP.
- Se unen TFIIE y TFIIH formando el complejo final cerrado
- TFIIH con su actividad helicasa hace que se abra la burbuja de ADN formando el complejo abierto. Ahora se puede hacer la transcripción también porque TFIIH ha fosforilado los OH del extremo CTD.
ELONGACIÓN
Durante la elongación el TFIIH permanece asociado y los factores de elongación potencian la actividad polimerasa (magnesio).
TERMINACIÓN
Para cada polimerasa el proceso de terminación y liberación son diferentes:
1) ARN polimerasa I: parecido a la dependiente de rho
2) ARN polimerasa II: acoplado a la maduración del ARN, proteína Rat1.
3) ARN polimerasa III: parecido a la independiente de Rho.
Terminación ARN polimerasa II
Los mensajeros tienen una señal que cuando llega ahí la horquilla, hace que se corte el ARN. La ARN polimerasa II sigue transcribiendo mientras. Llega una exopolimerasa (rat1) que va cortando el ARN y hace que se termine. Para que la transcripción pueda volver a empezar, la polimerasa ha de ser desfosforilada antes de ser liberada. De esto se encarga una fosfatasa que elimina los grupos fosfato.
Funciones de TFIIH
Se descubrió que tenía una función reparadora ya que los genes que se transcriben tienen una mayor eficacia de reparación que los que no y que ocurre más en la hebra que actúa de molde. Si la ARN Pol II se detiene en una lesión de ADN, TFIIH actúa como componente esencial del complejo de reparación por escisión de nucleótidos. Una mutación en este factor puede causa Xeroderma pigmentos y sindrome de cockayne.
Regulación
Proteínas reguladoras interactúan con factores de transcripción y la ARN polimerasa II.
Inhibición de la ARN polimerasa
- Actinomicina D y acridina: deforma el ADN e impide que pase la polimerasa, esto no se usa como antibiótico porque no afecta solo a procariotas.
- Rifampicina: se une a la subunidad beta de la ARN polimerasa bacteriana e impide el desalojo del promotor.
- Alfa-amanitina: bloquea la polimerasa II y cuando está en suficiente concentración también la polimerasa III, la única solución a este veneno es el transplante de hígado.
