Síntesis de proteínas Flashcards
Ribosomas
Es una estructura formada por dos subunidades con dos grandes moléculas de ARN que forman un núcleo estructural y una serie de proteínas que se colocan en la superficie. Es una ribozima, el ARN que lo conforma tiene actividad catalítica. Las dos subunidades forman en medio una hendidura a través de la cual pasa el ARNm a medida que el ribosoma se mueve.
ARNt
Son moléculas relativamente pequeñas que encontramos en el citosol de eucariotas y bacterias. Están formadas por 73-93 nucleótidos. Las células tiene al menos una clase de ARNt para cada aa, se necesitan por lo menos 32 para reconocer todos los codones posibles.
La mayoría de los ARNt tienen un residuo de guanilato en el extremo 5’ y todos tienen una secuencia de CCA en el extremo 3’. Dos de sus brazos son esenciales:
1) Brazo del aminoácido: lleva un aa específico esterilizado por su grupo COOH al grupo 2’ OH o 3’ del residuo A del extremo 3’ del ARNt.
2) Brazo del anticodón: contiene el anticodón
3) Brazo D: nucleótido dihidrouridina
4) Brazo TYC: ribotimidina y pseudouridina, este brazo interactúa con la subunidad grande del ribosoma.
- ACTIVACIÓN DE AMINOÁCIDOS
a) Unión de aminoácidos a sus ARNt
b) Corrección de pruebas
c) Interacción entre aminoacil-ARNt-sintetasa y un ARNt
Los 20 aas se unen a sus respectivos ARNt mediante una esterilización canalizada por una aminoacil-ARNt-sintetasa. Es específica para cada aminoácido en gran parte de los organismos. Si a un aa le corresponden a más de dos ARNt, la misma enzima suele aminoacilarlos todos. La reacción ocurre:
1. Primero se forma un intermediario unido a la enzima (aminoacil-AMP) mediante una reacción del grupo COOH del aa con el grupo alfa-fosforilo del ATP para formar un enlace anhídrido con desplazamiento pirofosfato.
2. Se transfiere el grupo aminoácido desde el aminoacil-AMP unido a la enzima a su correspondiente ARNt.
Algunos aminoacil-ARNt-sintetasas tienen función correctora de pruebas.
2a. INICIO en procariotas
Las bacterias tienen 2 ARNt diferentes para la metionina. ARNt(fmet) se encarga de colocar la metionina en la posición inicial. ARNt (met) se encarga de colocar la metionina en posiciones internas del polipéptido.
La N-formilmetionina llega al ribosoma en forma de Fmet-ARNT(fmet) y se forma en dos reacciones sucesivas:
- Met-ARNt sintetasa une la metionina al ARNtfmet
- Una transformilasa transfiere un grupo formilo que viene del N10-formiltetrahidrofolato al grupo aminoácido del residuo de Met. Esto impide que la fMet se incorpore en las posiciones interiores de los polipéptidos.
2b. INICIO en eucariotas
También hay distintos ARNt para residuos de Met según donde haya que colocarlos. Todos los polipéptidos que sintetizan los ribosomas citosólicos en las eucariotas comienzan con Met. Los que se sintetizan en las mitocondrias y cloroplastos de eucariotas empiezan con fMet.
1) La subunidad 30S del ribosoma une dos factores de inicio IF1 y IF3. IF3 impide que se unan las subunidades 30S y 50S prematuramente. El ARNm se une a la subunidad 30S y el iniciador AUG es guiado hasta su posición correcta por la secuencia Shine-Dalgarno del ARNm. Esta es una señal de inicio de 4-9 residuos purísimos en el lado 5’ del codón de inicio. Se aparea con una secuencia del ARNr 16S de la subunidad 30S. Esta interacción ARNm-ARNr situa la secuencia de inicio del ARNm en la posición correcta de la 30S. El AUG específico se distingue entre otros codones de Met por su proximidad a las secuencias de Shine-Delarno del ARNm.
El iniciador AUG se coloca en el sitio P donde se une fMet-ARNt(fmet), este es el único aminoacil-ARNt que se une primero al sitio P el resto se unen primero al A. IF1 se une al sitio A para que no se una ARNt en iniciación.