Transcripcion Flashcards
Diferencias de ARN respecto a ADN
-ribosa
-uracilo
-1 hebra
Carbono en el que estan las bn del RNA
1
Carbono en el que esta grupo OH del RNA
2
Carbono al que se unen + nucleótidos
3
Durante la transcripción se forma un enlace del tipo fosfodiéster entre
un nucleótido trifosfato libre y el C3’ de la pentosa presente en la cadena de RNA en síntesis
formación de enlace fosfodiester es catalizado por
RNApol
RNApol lee de (…) y el transcrio crece de (…)
3 a 5
5 a 3
RNApol I
RNAr (5.8s, 18s, 28s)
RNApol II
RNAm
RNApol III
RNAt, RNAr (5s)
Promotor basal
Sec de nucleótidos, esencial para que ocurra transcripción
Factor de transcripción
Proteínas entre PB y RNApol
Aminoácidos de TBP (TF) establecen ph con
Bases nucleotídicas de secuencia TATA (PB)
La forma de TBP le permite
introducirse en los surcos de la doble hebra del DNA
TBP es parte de
TFIID
TFIIH tienen actividad
Helicasa: separa hebra
Kinasa: fosforila cola carboxilo terminal de la RNApol produciendo que esta se libere de su unión a los TF del PB y avance por el DNA
Que hacen las acetil transferasas de histonas (HAT)
agregan grupos acetilo a las colas de algunas histonas
descompactación del DNA que permite
acceso de la maquinaria de transcripción al DNA
Regulación nivel pre transcripcional
estado de compactación o accesibilidad de la cromatina
Regulación nivel transcripcional
factores activadores o represores de la transcripción
Sec de DNA que participan en la regulación de la transcripción
-promotores proximales (cercanas al PB)
-potenciadores (enhancers)
-silenciadores (silencers)
Sec de DNA que participan en la regulación de la transcripción requieren para su funcionamiento
Presencia y unión de TF específicos
Al unirse los TF específicos a las secuencias potenciadoras (enhancers) activan la transcripción basal mediante la participación de otro complejo proteico denominado
mediador
Son especificos para un grupo de genes, relacionandose con la regulación diferencial de la expresión génica
enhancer, silenciadores y TF que se les unen
Adición de capuchón (CAP) en extremo 5’
co-transcripcional
adición de un nucleótido de guanina metilado al extremo 5’ del mRNA
Esta unión 5’- 5’ (ver figura 6) es catalizada por enzimas asociadas a la cola de la RNA Pol II
Utilidad de CAP en extremo 5´
-mayor vida media del mRNA por disminución de su degradación
-reconocimiento en el proceso de la traducción, ya que hay un factor de traducción que se une específicamente al capuchón
Splicing o corte y empalme
-Remocion de intrones
-dado x señales moleculares y una maquinaria de reconocimiento (spliceosoma)
spliceosoma composición y función
snRNA + protes
-corta enlaces fosfodiester
-empalma
Poliadenilación (cola Poli A) en extremo 3’
asociada al término de la transcripción
-RNApol II sintetiza sec AAUAAA
-Se unen proteínas que producen un corte en el RNA
-PoliA polimerasa adiciona adeninas
-RNApol sigue transcribiendo x un corto periodo de tiempo y luego se libera del templado debido a que el corto segmento de RNA que lleva unido comienza a ser degradado por una RNAsa
Utilidad cola de Poli A
-protege al RNA de la degradación y, por ello, se relaciona con la vida media del mRNA
-rol relacionado con el proceso de traducción*
Más proteínas que genes: Mecanismos
-Promotores Alternativos: para algunos genes se ha descrito la existencia de más de un PB (más de un sitio de inicio de la transcripción)
-Splicing Alternativo: diferentes lecturas de un mRNA por parte de la maquinaria de splicing, de manera que genera transcritos maduros con diferentes secuencias
-Corte y Poliadenilación alternativa: reconocimiento diferencial del sitio de corte y adición de la Cola Poli A del mRNA
Splicing alternativo e un mecanismo
Post transcripcional
Promotores alternativos es un mecanismo
Transcripcional
Donde se encuentran las genes ribosomales o citrones
Cr 13, 14, 15 y 22, especificamente en regiones NOR
Cada gen ribosomal origina un transcrito llamado
45s
45s es procesado originando
segmentos más cortos de rRNA (18s, 28s y 5,8s)
Forman subunidad ribosomal menor
rRNA 18s + proteínas ribosomales
Forman subunidad ribosomal mayor
rRNA 28s y 5,8s se asocian con un rRNA denominado 5S, que es sintetizado fuera del nucléolo, y con múltiples proteínas ribosomales
Procesamientos del tRNA
● Remoción de segmentos de tRNA
● Modificaciones químicas de algunos
nucleótidos: conversión de adenina (A) a pseudouridina (𝛹); de adenina a inosina (I); y de uridina a dihidrouridina (D)
● Modificación del extremo 3’ (se le agrega la secuencia CCA)
En el extremo 3’ del tRNA se une covalentemente un aminoácido, dando lugar a un
aminoacil-tRNA
Aminoacil tRNA sintetasas sustentan
Especificidad tRNA-aminoacido
Aminoacil tRNA sintetasas tienen sitios de unión para
-tRNA con sitios de reconocimiento específicos para la región del anticodón (cuya secuencia es diferente entre los distintos tipos de tRNA)
-aminoácido en específico
-ATP
Regulación de la exp génica nivel pre transcripcional
estructura de la cromatina
Regulación de la exp génica nivel transcripcional
aumento o disminución de la transcripción, promotores alternativos
Regulación de la exp génica nivel post transcripcional
vida media de los mensajeros, splicing alternativo
Regulación de la exp génica nivel traduccional
aumento o disminución de la traducción
Regulación de la exp génica nivel post traduccional
vida media de la proteína y modificaciones químicas
