Transcripción Flashcards
¿Qué es la transcripción?
La manera en la que se expresa la el genoma al crear un mRNA
¿Qué tipos de RNA se forman durante la transcripción?
RNA funcionales (tienen un papel por sí mismo)
mRNA
rRNA
tRNA
snRNA
¿Qué es la microscopía de fuerza?
Un microscopio en el que se puede trabajar en un medio acuoso pero con la resolución de un electrónico
¿Quién empaqueta el cromosoma X y que forma?
XIST formando el corpúsculo de barr
Cuales son las características del RNA en eucariotas y en procariotas
Procariotas: poligénico (codifica varias proteínas) / no tiene cabeza y cola
Eucariotas: monogénico (codifica solo una proteína) / tiene cabeza y cola (5’ siete metil guanosina y 3’ poli adenina)
El mRNA de las eucariotas y las procariotas tienen cabeza y cola? ¿Por qué?
Procariotas: NO porque la síntesis es continua
Eucariotas: SI (5’ siete metil guanosina y 3’ poli adenina) porque la síntesis es discontinua (transcripción: núcleo / Traducción: citoplasma)
¿Cuáles son las etapas de la transcripción?
Iniciación
Elongación
Terminación
Cual es el primer paso de la transcripción?
Reconocimiento de la secuencia promotora
la polimerasa se engancha a este
inicio de la transcripción
En que pasó de la transcripción se reconoce la secuencia promotora y la polimerasa se engancha a esta?
Iniciacion
¿Qué es la elongación en la transcripción?
La sintesis del RNA
¿Cuál es la terminación en la transcripción y quien lo hace?
Un complejo proteico llamado CPSF agrega la cola de poliA (cola)
Que hace el complejo proteico llamado CPSF?
Agrega la cola de poliA al RNA después de la transcripción
Que pasa durante la terminación de la transcripción?
Se agrega la cabeza en 5’ de siete metil guanosina y la cola en 3’ de poli A
Que son los promotores y cuantos hay en los procariotas y eucariotas?
Secuencias de DNA que enganchan la polimerasa
Procariotas: 1
Eucariotas: Varios
¿Donde podemos encontrar las islas cpg?
En las bandas cromosómicas R
Cuales son algunos ejemplos de promotores/primers en las eucariotas?
Cajas TATA CAT GC
Que son las islas CPG?
Secuencias promotoras
Las procariotas y las eucariotas tienen Enhacers y silencers?
NO, solo las eucariotas
Que hacen los enhancer en la transcripción?
Enganchan a las proteínas que acetilan las histonas (co-activadores)
Quienes enganchan a las enzimas que acetilan las histonas en la transcripción?
Los enhacers
Que son los silencer?
Enganchan proteínas que de-acetilan las histonas (co-represores)
Quien enganchan las proteínas que de-acetilan las histonas?
Los silencer
Que son los co-represores y que hacen?
Proteínas que de-acetilan las histonas (inhiben la expresión génica)
Que son los co-activadores y que hacen?
Proteínas que acetilan las histonas (fomentan la expresión génica)
Quien acetila las histonas?
Las proteínas co-activadoras
Quien de-acetila las histonas?
Las proteínas co-represoras
Cuales son mecanismos de la expresión génica y que hacen?
Las proteínas co-activadoras y co-represor que acetilan y de-acetilan las histonas
Donde están los elementos cis?
Los que estan dentro de los genes
Donde están los elementos trans?
Los que estan fuera de los genes
Como se le llama a los elementos dentro de los genes?
Cis
Como se le llama a los elementos fuera de los genes?
Trans
Que son los elementos trans en la transcripción?
Grupo de proteínas que reciben el nombre de factores de la transcripción
Que son los factores de la transcripción?
Proteínas involucradas en los procesos de transcripción
En que células podemos encontrar los factores de transcripción?
Todo tipo de células
Cuantos dominios tiene los factores de transcripción y para que sirven?
Dos, uno para enganchar la polimerasa 2 y otro para engancharse al promotor
En esencia que son los factores de transcripción?
Mediadores
Cuales son los tipos de factores de transcripción y que hacen?
Generales: los que enganchan a la polimerasa 2 al promotor
Específicos: los que están involucrados en la diferenciación celular
Regulación temporal: los que se forman de manera transitoria
Cual es un ejemplo de factor de transcripción temporal?
El complejo sinaptonemico durante la meiosis
Como se diferencian las células?
A través de factores de transcripción específicos
Como se llaman los factores de transcripción que enganchan a la polimerasa 2 al promotor?
Generales
Cuales son los diferentes dominios de los factores de transcripción que se enganchan al promotor?
Dedos de zinc
Cremalleras de leucina
Helice vuelta helice
Helice asa helice
Beta sheets
Cual es la diferencia en tamaño del gen con respecto al mRNA en procariotas y eucariotas y porque?
Procariotas: igual de largas porque no tiene intrones
Eucariotas: el mRNA es considerablemente mas pequeño porque tiene intrones
Que son los exones e intrones?
Exones: secuencias codificantes
Intrones: secuencias no codificantes
Que pasa si llega un intrón al ribosoma?
Lo interpreta como una señal de terminación
Como se llaman las secciones codificantes y no-codificantes del DNA?
Codificantes - exones
No-codificantes - intrones
Porque el mRNA en las eucariotas en considerablemente mas pequeño que el gen original?
Porque tiene intrones y exones
Que es el esplacing?
Proceso durante la transcripción en la que se remueven los intrones
Las procariotas hacen esplacing, porque?
No porque solo tienen exones
Como se le llama al proceso de la transcripción en la que se remueven los intrones?
Esplacing
Quien remueve los intrones y deja los exones y como se llama el proceso?
El esplacing lo realiza el espliceosoma
Que es el espliceosoma?
Un complejo de ribonucleoproteinas (RNP) que remueve los intrones (esplacing)
RNA pegado a proteina
Quién rompe los enlaces fosfodiester durante el esplacing y quién une los exones?
El snRNA (RNA con capacidades cataliticas)
La ligasa une los exones
Donde vemos el snRNA?
Durante el esplacing
Que es el mRNA maduro?
mRNA después de que se le remueven los intrones
Como sabe el espliceosoma quién es un intrón y quién es un exón?
A través de la secuencias de nucleótidos, al extremo 5’ tiene GU y al extremo 3’ AG
Cuales son las secuencias con las que el espliceosoma identifica quién es un intron y quién un exón?
5’ GU
3’ AG
Todo lo que esté entre estas secuencias es un intrón
Que son las fallas en el esplacing?
Cuando el espliceosoma no remueve correctamente el intrón
Los puntos de corte y empalme se alteran
Como hace el espliceosoma para reconocer las secuencias que indican el inicio y fin de un intrón?
A través de proteínas que se pegan a estas secuencias
U1 snRNP y U2 snRNP
Que proteínas en el espliceosoma reconocen el extremo 5’?
U1 snRNP
Que proteínas en el espliceosoma reconocen el extremo 3’?
U2 snRNP
Para qué usa la proteína U1 snRNP el espliceosoma?
Para reconocer el extremo 5’ del intron
Para qué usa la proteína U2 snRNP el espliceosoma?
Para reconocer el extremo 3’ del intron
Que es el lazo de vaquero en la transcripción?
El extremo colgante que se forma al cortar el extremo 5’ durante el esplacing
Como se llaman las estructuras que se puede formar al cortar el extremo 5’ durante el esplacing?
Lazo de vaquero o modelo del asa
En que orden se realizan los cortes durante el esplacing?
Primero se corta en 5’ y después en 3’
Que es el modelo del asa en la transcripción?
El modelo que se forma después de cortar el extremo 5’ y 3’ del intrón
Cuales son las patología relacionadas con las fallas en el esplacing?
Beta y alpha talasemia
Donde es más común la betatalasemia?
Europa
Donde es más común la alfa talasemia?
Chinos
Como se llama el método para establecer parentesco entre personas (no es genealogía) y como se hace?
Isolínea, se establece los posibles parentescos de la personas a través de sus 4 apellidos
Cual es el proceso para la transcripción?
- DNA pasa a un transcripto primario gracias a la polimerasa 2
- El espliceosoma remueve los intrones y la ligasa pega los exones
- Las proteínas chaperonas de RNA (carga positiva) sacan el mRNA hacia el citoplasma
Quién lleva al mRNA del núcleo al citoplasma?
Proteínas chaperonas de RNA
Que son las proteínas chaperonas de RNA?
Proteínas transportadoras que llevan el mRNA del nucleo al citoplasma
Para que son las modificaciones postranscripcionales?
Formas en las que la célula utilizando el mismo transcripto primario produce diferentes proteínas
Porque la célula utiliza el mismo transcripto primario para producir diferentes moléculas?
Para alcanzar el máximo de eficiencia con la menor cantidad de energía posible
Cuando se considera que se acaba la transcripción?
Cuando se pone la cola de poliA
Con qué amino ácido se comienza la transcripción de proteínas y cual es su secuencia? En que extremo se localiza?
Metionina
AUG
5’
Cual es la codificación para los codones de terminación en la traducción y en que extremo se localiza?
UAA
UGA
UAG
3’
Como termina la traducción de las proteínas?
Con un codón de terminación y el desensamble de los ribosomas
Que pasa al final de la síntesis de proteínas con los ribosomas?
Se desensamblan
Por medio de qué tipo de mecanismos puede una célula generar diferentes proteinasa partir de un mismo transcripto primario?
Mecanismos post transcripcionales
Que hacen los mecanismos post transcripcionales?
Crean diferentes proteínas a base del mismo transcripto primario
Cuales son los mecanismo post transcripcionales y sus características?
- Esplacing alternativo: se cambia el orden de los exones para producir proteínas distintas
- Edicion del RNA: jugar con las señales de terminación
- Trans-splicing: 2 transcriptos primarios intercambian exones
Como se llama el mecanismo post trasncipcional en el que se cambia el orden de los exones?
Esplacing alternativo
Como se llama el mecanismo post trasncipcional que juega con las señales de terminación?
Edición del RNA
Como se llama el mecanismo post trasncipcional en el que dos transcriptos primarios intercambian exones?
Trans-splicing
Por donde sale el mRNA hacia el citoplasma?
Poros nucleares
Las subunidades ribosomales son ensambladas en el núcleo y exportadas el mismo tiempo?
No, son exportadas por separado y ensambladas en el citoplasma
Cuantas asas tiene el tRNA?
3 y una que es variable (no se sabe su utilidad)
Cual asa del tRNA carga el codon?
2
Que asa del tRNA esta encargado de unirse al ribosoma?
1
3
Cuantas bases nitrogenadas existen y donde se encuentran?
20 o más (en el tRNA en las asas 1 y 3)
A donde se pega el amino acido en el tRNA?
En el OH
Quien pega los aminoacidos al tRNA?
La enzima Aminoacil-tRNA-sintetasa
La enzima Aminoacil-tRNA-sintetasa como pega el amino ácido al tRNA y que tipo de enlace forma?
A través de una reacción que requiere ATP formando un enlace covalente
Cual es la diferencia entre el snoRNA y el snRNA?
snoRNA rompe el rRNA en el nucleolo
snRNA se encuentra en el espliceosoma y rompe los enlaces fosfodiester para retirar los intrones
