Traduction Flashcards
Qu’est-ce que la traduction?
Processus par lequel l’info génétique contenue dans l’ARNm est interprétée pour produire la séquence linéaire en a-a des protéines
Qui suis-je: un des processus les plus conservés parmi les organismes et les plus couteux en énergie pour la cellule
Traduction
Quel pourcentage de l’énergie cellulaire est consacrée à la synthèse des protéines
80%
Quelle est la machinerie de la traduction?
ARNm
ARNt
aminocayl-ARNt synthétases
ribosomes
Quelle est l’objectif de la traduction?
Traduire un langage avec un alphabet à 4 bases (A,C,T,G) dans un autre langage utilisant un alphabet de 20 acides aminés
Quelle est la matrice pour la traduction?
ARNm
Que contient l’ARNm?
une série ordonnée d’unités de 3 nt (codons)
À quoi sert l’ARNt dans la machinerie de la traduction?
Il sert d’interface entre les a-a et les codons dans l’ARNm
il transporte les a-a jusqu’au ribosome
À quoi servent les aminoacyl-ARNt synthétases dans la machinerie de la traduction?
Ils servent à lier les a-a aux ARNt spécifiques à un codon
C’est spécifique pour faire le moins d’erreur possible
Quel est l’acteur principal de la traduction?
Le ribosome
- machinerie de plusieurs MDa
- composé de protéines et d’ARN (surtout ARNr)
- coordonne la reconnaissance de l’ARNm par chaque ARNt
- catalyse la formation des liens peptidiques
Vrai ou Faux: l’ARNm est un cadre de lecture ouvert
Vrai (c’est un ORF)
Comment l’ARNm peut-il être un cadre de lecture ouvert?
Il est en fait une suite de codons adjacents et non chevauchants (ceci est un cadre de lecture ouvert)
Quel est le codon d’initiation?
AUG (une méthionine)
Comment démarre la traduction?
Par la reconnaissance du codon d’inititation en 5’ de l’ORF et on procède codon par codon jusqu’à l’extrémité 3’
À quoi sert le codon d’initiation?
Il spécifie le premier a-a
Il définit le cadre de lecture
Combien de cadres de lecture sont possibles en absence d’un codon d’initiation?
3
Quels sont les codons stop?
5’- UAG-3’
5’- UGA-3’
5’- UAA-3’
Combien y a-t-il de cadre de lecture pour les codons stop?
1 seul bon cadre de lecture
Chez les eucaryotes, cb y a -t-il d’ORF par ARNm
1 seul
on dit que c’est monocistroniques
Nommer 2 modifications très importantes dans la traduction
Polyadénylation
ajout de la coiffe 5’
En quoi la coiffe 5’ est elle importante dans la traduction?
Elle est requise pour le recrutement du ribosome
Après la liaison de la coiffe, le ribosome scanne de 5’ en 3’ jusqu’au codon d’initiation (AUG)
En quoi une polyadénylation est elle importante dans la traduction?
Lorsqu’il y a un G après AUG et un GA avant AUG, cela augmente significativement la production de protéine (augmente l’efficacité)
Que fait la queue poly-A dans la traduction?
Elle favorise un recyclage efficace des ribosomes
Qu’est-ce que le bras acccepteurs des ARNt
CCA (site conservé d’attachement de l’acide aminé)
Quelles sont les bases inhabituelles qu’on retrouve dans l’ARNt
uridine
pseudouridine
dihydrouridine
Que contient le bras accepteur de l’ARNt
liaison de l’acide aminé (bras accepteur CCA simple brin)
Que contient la boucle YU de l’ARNt
la pseudouridine
Que contient la boucle D de l’ARNt?
contient la dihydrouridine
À quoi sert le boucle de l’anticodon dans l’ARNt
reconnaitre le codon dans l’ARNm
Quelle est la taille de la boucle variable de l’ARNt
entre 3 à 21 bases
Quels sont les 2 processus qui servent à faire le chargement des acides aminés sur l’ARNt par les aminoacyl-ARNt synthétases?
Adénynylation (transfert d’AMP)
Chargement de l’ARNt
Combien y a-t-il d’aminoacyl-ARNt-synthétase par acide aminé
1 seul
Vrai ou Faux: il y a un seul codon par acide aminé
Faux, il peut y en avoir un ou plusieurs
Que font les aminoacyl-ARNt synthétase?
Elles font le chargement de tous les ARNt d’un acide aminé spécifiques
Combien y a-t-il d’aminoacyl-ARNT synthétase différentes
20 (une par acide aminé)
Quelles sont les 2 classes d’aminoacyl-ARNt synthétases?
classe 1 = l’attachement de l’acide aminé au OH se fait en 3’ de l’ARNt
(dimérique ou tétramérique)
classe 2 = l’attachement de l’acide aminé au OH se fait en 2’ de l’ARNt
(monomérique ou dimérique)
Vrai ou Faux: la boucle de l’anticodon joue un rôle dans la reconnaissance du codon
Vrai
Le ribosome peut-il distinguer les ARNt incorrectement chargés?
Non, il ne différencie pas le
Ala-ARNt Cys du
Cys-ARNt Cys
Qu’est-ce qui joue le rôle majeur dans la sélection du bon acide aminé par l’ARNt
ARNt aminoacyl synthétases
Donner des caractéristiques du ribosome?
- plus gros et plus complexe que la machinerie pour la synthèse de l’ADN
- masse moléculaire de 4,2 MDa (eucaryote)
- aide à la synthèse de l’ADN et à la synthèse des protéines chez les eucaryotes
Quelle est la technique qui sert à séparer les composantes du ribosomes?
Ultracentrifugation sur gradient de sucrose
Les sous-unités ribosomiques sédimentent à une vitesse qui dépend de leur taille
Ils migrent dans la gradient de densité de sucrose jusqu’`à atteindre une densité qui dépend de leur taille et de leur densité
Ils vont tous atteindre leur sous unité ribosomique spécifique selon leur densité
Vrai ou Faux: le ribosome représente le 2/3 de la masse de l’ARNr
Vrai (surtout la grande sous-unité)
Résumer le cycle du ribosome
(c’est-à-dire l’association et la dissociation des 2 sous-unités)
- petite sous unité s’attache à l’ARNm
- grande sous unité s’attache aussi
- aminocayl ARNt synthétase apporte un a-a spécifique et le lie (on a un polypeptide en croissance)
- le ribosome balaye l’ARNm jusqu’à atteindre le codon STOP
- codon stop atteint = dissociation des 2 sous unités
Vrai ou Faux: un ARNm peut être traduit par plusieurs ribosomes à la fois
Vrai
Plusieurs ribosomes peuvent s’attacher au même ARNm et le traduire
Polyribosome ou polysome (multiples ribosomes pour 1 ARNm)
Qui suis-je: je catalyse la formation de liaison peptidiques
Le ribosome
Quelles sont les 2 fonctions clés du ribosome?
- être un centre peptidyltransférase (dépendant de l’ARNr)
- protéines en périphérie
Quels sont les 3 sites de liaison pour les ARNt dans le ribosome?
site A = aminoacyl-ARNt
site P= peptidyl-ARNt
site E = exit (sortie)
Où sont situés les sites de liaison des ARNt dans le ribosome?
À l’interface entre les sous-unités du ribosome
Où se situe le centre peptidyl-transférase?
Grande sous-unité
Où se site le centre de décodage (canal où passe l’ARNm)?
Petite sous-unité
Comment nomme-t-on le tunnel dans la petite sou-unité du ribosome qui sert au passage de l’ARNm
Centre de décodage
le tunnel étroit laisser passer ARNm simple brin
Résumer l’initiation de la traduction chez les procaryotes
- recrutement du ribosome par la petite sous-unité sur l’ARNm
- insertion de l’ARNt initiateur au site P
- positionnement précis du ribosome au site d’initiation de l’ARNm (cadre de lecture)
Résumer l’initiation de la traduction chez les procaryotes?
- reconnaissance de la coiffe par elF4E
- liaison de elF4G et elF4A à l’ARNm
- liaison de elF4G à elF4E
- liaison de elFAB qui vient stimuler l’activité hélicase de elF4A qui vient désagréger les structures secondaires dans l’ARNm pour avoir un ARNm simple brin
- 4 facteurs se lient à la petite sous-unité
- ARNt initiateur est convoyé dans le site P
- formation du complexe de pré-initiation 43S
- recrutement de la petite sous-unité sur l’ARNm
- formation du complexe de pré-initiation 48S
Nommer les 3 mécanismes pour garantir un appariement correct ARNt-ARNm
1) liaison H avec 2 adénines du petit sillon de l’ARNr 16S
2) hydrolyse du GTP par EF-Tu seulement lorsque l’appariement est correct
3) ARNt pivote vers le centre P pour faciliter le transfert du peptide du site P vers le site A
Vrai ou Faux: l’ARNr de la petite sous-unité catalyse la formation du lien peptidique
Faux, c’est l’ARNr de la grande sous-unité
elle peut former des protéines sans liens peptidiques, car c’est une ribozyme
La vitesse de synthèse est 10^7 fois plus rapide par le ribosome
Résumer la translocation des ARNt et de l’ARNm
- extrémité 3’ de l’ARNt du site A dans le site P et du site P dans le siteE
- liaison du EF-G-GTP (prend la place dans le site A)
- contact avec le centre de liaison des facteurs
4.stimulation de l’activité GTPase de EF-G
- changement de conformation de EF-G = translocation ARNt du site A vers le site P qui tire l’ARNm
- dissociation de EF-G-GDP et ARNt du site E
Décrire les facteurs de terminaison de la traduction
(les étapes)
- reconnaissance des codons STOP par l’erF1
- activation de la séparation du polypeptide du peptidyl-ARNt
Qu’est-ce qu’un anticodon peptidique?
structure protéique qui reconnait l’anticodon
À quoi sert le motif GGQ?
Il est situé à proximité du centre peptidyl transférase et catalyse l’hydrolyse de l’attachement du peptide à l’ARNt au site P
Comparer la structure de RF-1 et d’un ARNt
ce sont des mimes moléculaires
l’anticodon et le CCA sont aux extrémités de l’ARNt
l’anticodon peptidique et GGQ sont aux extrémités de RF1
donc très semblable
À quoi servent les ARNt
Ils servent d’interface entre les codons de l’ARNm et les acides aminés
Qui suis-je: je charge les acides aminés spécifques sur l’ARNt
Aminoacyl-ARNt synthétases
Vrai ou Faux: la traduction d’une protéine implique un cycle d’association et de dissociation de la petite et de la grande sous-unité du ribosome
Vrai
Quelles spnt les 3 étapes de la traduction?
initiation
élongation
terminaison
Que se passe-t-il durant l’initiation de la traduction?
les ARNm des eucaryotes recrutent la petite sous-unité par la reconnaissance de la coiffe 5’ et l’action de nombreux facteurs d’initiation
Parmi les étapes de la traduction, laquelle implique l’introduction d’un ARNt chargé dans le site A?
Élongation
Qu’est-ce qui cause l’arrêt de la traduction?
Lorsque le ribosome rencontre un codon stop qui est reconnu par la facteur de terminaison de classe 1 (RF1)
