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Intro. génétique moléculaire > Réplication de l'ADN (cours 2) > Flashcards

Réplication de l'ADN (cours 2) Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que le dogme de la biologie moléculaire?

A

Réplication de l’ADN –> Transcription en ARN puis traduction en protéine

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2
Q

Combien de temps prend la division cellulaire?

A

16h et sur ces 16h, 10h représente la réplication de l’ADN

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3
Q

Pourquoi dit-on que dans la réplication de l’ADN, celui-ci agit comme moule?

A

Car chaque brin mère sert de moule pour le brin fille complémentaire

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4
Q

Donnez des caractéristiques de la réplication de l’ADN (décrire le processus)

A
  • hautement spécialisé
  • complexe
  • avec une vitesse impressionante
  • fidélité quasi parfaite
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5
Q

La réplication de l’ADN nécessite 2 choses, quelles sont-elles?

A

des dnTps
jonction amorce-matrice

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6
Q

Dans quel sens se fait la réplication de l’ADN?

A

Dans le sens 5’ vers 3’

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7
Q

À quoi compare-t-on la structure des ADN polymérase?

A

À une main

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8
Q

Où se trouve la jonction amorce-matrice (dans la main)?

A

Au niveau de la paume

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9
Q

Quelles sont les 2 fonctions de la paume de la main des ADN polymérase?

A
  • polymérisation
  • exonucléase
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10
Q

Quel est souvent l’ion métalique divalent le plus souvent retrouvé?

A

Magnésium

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11
Q

Qu’est-ce qu’un ion métalique divalent?

A

Ions rendant la réaction plus facile

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12
Q

À quoi servent exactement les ions divallents?

A

Ils modifient l’environnement chimique du 3’OH et du dntp

un des ions réduit le 3’OH en 3’O

l’autre stabilise les phosphate b et y

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13
Q

Quelle est la fonction principale des exonucléase?

A

Couper l’ADN à partir d’une des 2 extrémités

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14
Q

Pourquoi les exonucléases sont-elles importantes?

A

Lorsqu’une base est impliquée dans un mauvais appariement, la paume reconnait que le nt n’est pas le bon. Le brin se détache et va s’attacher proche de l’exonucléase. Celle-ci mange le mauvais nucléotide et quelques-uns de plus. Le brin fille retourne près des doigts et l’appariement continue.

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15
Q

Vrai ou Faux: le pouce aide à la catalyse

A

Faux, il maintien l’amorce et le site actif de la paume en position optimale

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16
Q

Vrai ou Faux: les doigts de la main aident à la catalyse

A

Vrai, ils se referment sur le dntp lorsque l’appariement est bon donc ils augmentent la catalyse

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17
Q

En quoi les doigts aident à permettre au nucléotide entrant sur quelle base se lier?

A

Les doigts induisent une courbure de 90° entre le 1ère et la 2ème base. De ce fait, la seule base où le nucléotide peut se lier, c’est la première donc les doigts assurent l’appariement du nt à la bonne base

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18
Q

Si on veut répliquer de l’ADN dans un tube, qu’avons-nous besoin?

A
  • dntp
  • ADN polymérase (qui contient des ions métalliques)
  • jonction amorce-matrice
  • brin-mère
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19
Q

Pourquoi peut-on dire que les ADN polymérases sont processives?

A

Car à chaque liaison à son substrat, l’ADN polymérase catalyse l’ajout de plusieurs autres nucléotides

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20
Q

Quelle est l’étape limitante dans la réaction de polymérisation?

A

La liaison de l’ADN polymérase à la jonction amorce-matrice

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21
Q

Qu’est-ce que la fourche de réplication?

A

Endroit où l’ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaire

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22
Q

Quel est le nom de l’enzyme qui s’occupe d’éliminer les amorces d’ARN?

A

RNase H

Elle va dégrader spécifiquement les ARN appariés à l’ADN. Elle enlève tout sauf le dernier ribonucléotide

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23
Q

Puisque la RNase H enlève tout sauf le dernier ribonucléotide, comment le dernier va-t-il pouvoir être enlevé?

A

Grace à l’éxonucléase 5’

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24
Q

Quel est le rôle de l’hélicase?

A

Enzyme qui ouvre la double hélice et défait les liens entre les nt

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25
Q

Décrire l’hélicase

A
  • hexamère en forme d’anneau
  • processive
  • polarité 5’-3’ ou 3’-5’ selon sur quel brin elle est située
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26
Q

L’ouverture de l’ADN linéaire représente-t-elle un surenroulement positif ou négatif?

A

Surenroulement positif

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27
Q

Qu’est-ce que des SSB?

A
  • Protéines qui lie l’ADN simple brin (va l’englober et le protéger en attendant qu’il soit répliqué)
28
Q

Pourquoi dit-on que la liaison des SSB est coopérative?

A

Car la liaison d’un SSB entraine la liaison d’autres SSB

29
Q

Quel est le rôle des topoisomérases?

A

Couper l’ADN (enlever le surenroulement)

Ouvrir la double hélice en créant un surenroumement négatif et ainsi de suite (faire passer les brins dans la coupure)

30
Q

Quel est le rôle de la primase?

A

Permet d’initier la synthèse sur n’importe quel segment d’ADN simple brin

31
Q

Si on classifie les ADN polymérases en utilisant des chiffres romains, sommes-nous en présence de procaryotes ou d’eucaryotes?

A

Procaryotes

32
Q

Si on décrit les ADN polymérases en utilisant des lettres grecques, est-ce pour décrire les procaryotes ou les eucaryotes?

A

Eucaryotes

33
Q

Décrire le rôle de l’ADN polymérase alpha/primase

A
  • initiation des brins neufs
  • la primase fait l’amorce
  • polymérase alpha commence la réplication (peu processive)
34
Q

Décrire le rôle des ADN polymérase d et E

A
  • prennent le relais de la polymérase alpha
  • processivité élevée
  • pol d pour le brin discontinu
  • pol E pour le brin continu (processivité plus élévée)
35
Q

Qu’est-ce que l’anneau coulissant?

A

Structure +++ importante pour la réplication

Formé de plusieurs sous-unité

36
Q

À quoi sert l’anneau coulissant?

A
  • il augmente bcp la processivité
  • il encercle la double hélice,
  • il est fortement lié à l’ADN polymérase
37
Q

Expliquer ce que fait l’anneau coulissant dans la réplication de l’ADN

A
  • l’ADN polymérase se détache habituellement toutes les 20 à 100 pb
  • L’anneau l’empêche de s’éloigner (il garde l’ADN pol. près de son substrat)
  • L’ADN polymérase et l’anneau coulissant ont une forte affinité tant que l’ADN pol est dans une jonction amorce-matrice
38
Q

Vrai ou Faux: on retrouve des anneaux coulissants chez les procaryotes, les virus et les eucaryotes?

A

Vrai

C’est une structure très bien conservée

39
Q

Quelle structure place l’anneau coulissant sur chaque jonction amorce-matrice?

A

Les poseurs d’anneau coulissants

40
Q

Que contient le réplisome?

A

ADN polymérase holoenzyme
Hélicase
Primase

41
Q

Décrire/résumer le fonctionnement de l’holoenzyme

A
42
Q

Décrire l’initiation de la réplication

A

En premier, il faut ouvrir la double hélice pour former une fourche de réplication où l’hélicase pourra se fixer

43
Q

Où se fait l’initiation du processus de réplication?

A

Dans les séquences internes des chromosomes et non aux extrémités

44
Q

Comment nomme-t-on les sites spécifiques où débute la replication?

A

Les origines de la réplication

45
Q

Quelles sont les 2 composantes de l’initiation?

A

1- le réplicateur

2- l’initiateur

46
Q

Décrire le réplicateur

A
  • séquences d’ADN suffisantes pour l’initiation de la réplication
  • séquences très riches en A-T = plus facilement déroulable
47
Q

Décrire l’initiateur

A
  • protéine qui aide à la dénaturation et au recrutement de l’hélicase
  • elle reconnait spécifiquement une séquence du réplicateur et active l’initiation de la réplication
48
Q

Quels sont les rôles des initiateurs?

A
  • lient l’ADN aux réplicateurs
  • recrutent les protéines nécessaires à l’initiation de la réplication
  • déforment /dénaturent parfois la région adjacente à leur site de liaison
49
Q

Quels sont les 2 évènements de l’initiation de la réplication chez les eucaryotes?

A

1- sélection des réplicateurs

2- activation des origines de réplication

50
Q

Décrire l’évènement de la sélection des réplicateurs

A
  • en phase G1 (mitose= on se prépare à se diviser)
  • identification des séquences qui dirigent l’initiation
  • assemblage d’un complexe de protéines sur chaque réplicateur (mais rien ne bouge)
51
Q

Décrire l’évènement de l’activation des origines de réplication

A
  • en phase S (synthèse)
  • Séparation des brins aux réplicateurs
  • Recrutement des ADN polymérases
52
Q

Décrire la formation du préréplicatif (Pré-RC)

A

1- reconnaissance du réplicateur par l’initiateur (ORC)

2- ORC recrute 2 poseurs d’hélicases

3- recurtement de l’ADN hélicase

53
Q

À quel moment se produit l’assemblage des fourches?

A

À l’entrée de la phase S

54
Q

Décrire la fin de la réplication chez les procaryotes où les chromosomes sont circulaires

A

Division en 2 cellules filles

55
Q

Décrire la fin de la réplication chez les eucaryotes (chromosomes linéaires)

A

pour le brin continu tout est ok

pour le brin discontinu, on doit enlever les amorces d’ARN

56
Q

Est-ce que le fait que chez les eucaryotes, il y a un ADN répliqué incomplètement pause problème?

A

Oui et non,
Pour quelques nt seulement non, mais après des millions de divisions, il y a une perte de plusieurs millions de nt ce qui devient problématique

57
Q

Qu’est-ce qu’un télomère?

A

Extrémité des chromosomes

58
Q

À quoi servent les télomères?

A

ils servent de tampon au racourcissement et protège les régions codantes

59
Q

Quel est le rôle des télomérases?

A

Allonger les télomères ( rajouter des nt pour combler la perte)

Elle allonge l’extrémité 3’

60
Q

Qu’est-ce qu’une télomérase?

A

C’est une ADN polymérase qui n’a pas besoin de matrice exogène, elle utilise l’ARN comme matrice

61
Q

Définir: ribonucléoprotiéine

A
  • nucléoprotéine dont l’ARN sert de matrice
  • forme une jonction amorce-matrice pour la TERT
62
Q

Décrire: TERT

A
  • sous unité catalytique
  • réverse transcriptase
  • rétro-transcript l’ARN en ADN
63
Q

En quoi l’action de la télomérase est utile?

A

La télomérase allonge l’extérmité 3’ du télomère

L’extension 3’ sert de matrice pour la synthèse d’un nouveau fragment d’Okazaki. Il y a réparation du fragment d’Okazaki

64
Q

Quel est le nom des protéines qui inhibent la télomérase?

A

Les protéines liant l’ADN double brin télomérique

65
Q

Comment l’ADN enfouit-il le petit bout simple brin restant malgré l’action des télomérases?

A

Avec des boucles-T
il va y avoir apprition d’un ADN triple-brin sur une courte séquence

Intro. génétique moléculaire (3 decks)

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