Structures de l'ADN et de l'ARN (cours 1) Flashcards
Quel est le nom de la civilisation qui avait émis les premières théories sur l’hérédité (pangénèse)?
Les Grecs
Quelle était la théorie des Grecs sur l’hérédité?
Lors de relations sexuelles, la transmission s’effectuait par le biais de fragments corporels miniaturisés. L’embryon serait assemblé de ces composantes miniatures puis il y aurait une dissociation au cours du développement
Qu’à fait Gegor Mendel pour la génétique?
Il a tenté de comprendre les mécanismes de la génétique en effecutant des expériences sur l’hérédité. C’est lui qui propose le modèle des pois
D’où vient l’origine du mot gène?
Du terme pangène
Qui a définit les notions de dominance et récessivité dans les gènes?
Gregor Mendel
Qui suis-je: naturaliste anglais ayant fait des travaux sur l’évolution des espèces?
Charles Darwin
Qui suis-je: j’ai découvert l’origine des espèces (théorie de l’évolution). J’ai aussi découvert que les gènes utiles sont ++ conservés alors que ceux moins utiles ne le sont pas
Charles Darwin
Qui adhèrent aux idées de Darwin et décide de les appliquer aux humains?
Les Victoriens
Quelles étaient les idées des Victoriens?
Les vices et vertus sont héréditaires donc transmis de générations en générations.
Qui suis-je: homme de science britannique, ami de Darwin qui donna naissance au mouvement de l’eugénisme
Francis Galton
Qu’est-ce que l’eugénisme?
Ensemble de méthodes qui visent à transformer le patrimoine génétique de l’espèce humaine dans le but de faire tendre vers un idéal.
Quelles étaient les idées de Francis Galton?
Il pensait qu’on pouvait orienter la race humain en favorisant la reproduction des individus doués et en empêchant la reproduction des individus moins doués.
Qui suis-je : Biologiste et meneur du mouvement eugéniste aux USA?
Charles Davenport
Qui suis-je: avocat américain connu pour son travail comme eugéniste et conservateur naturaliste. Il publie le déclin de la grande race. Son ouvrage va inspirer les Nazis
Madison Grant
Qui a été le premier a établir que l’ADN était une longue molécule composée de 4 bases différentes ?
James Watson
Qui suis-je: j’étais convaincu au début que l’ADN était une hélice formée de 3 brins?
Wilkins
Qui a finalement découvert que l’ADN était constitué de 2 brins et que A s’associait avec T et C avec G
James Watson
De quoi est constitué l’ADN
Chaines polynucléotidiques
Comment nomme-t-on le lien entre les nucléotides de l’ADN?
Liens phosphodiester
Quelles sont les pyrimidines?
Cytosine
Thymine
Quelles sont les purines?
Adénine
Guanine
Qu’est-ce qu’un état tautomérique?
2 configurations que les bases azotées peuvent prendre et qui sont en équilibre
Quels sont les 2 états tautomériques pour la cytosine et l’adénine?
+ mentionner quel est l’état préférentiel
imino
amino (préférentiel)
Quels sont les 2 états tautomériques pour la guanine et la thymine?
+ mentionner quel est l’état préférentiel
Céto (préférentiel)
Énol
Pourquoi l’appariement est plus fort pour C-G que pour A-T?
Car C-G sont liées ensemble par 3 liens H alors que A-T sont liées par 2 liens H
Quelles sont les 3 choses qui aident à stabiliser la double hélice de l’ADN?
1- entropie
2- empilement des bases
3- influences hydrophile/hydrophobe
Décrire le processus de pivotement des bases
Lorsque les bases azotées pivotent et ressortent de la double hélice
Les protéines (enzyme de restriction) font retourner les bases une à une, lorsque la protéine trouve sa séquence cible, elle coupe un seul brin d’ADN et s’y lie
Vrai ou Faux: en général, le pas de la double hélice de l’ADN est un pas à droite
Vrai
Quelle est la périodicité de l’ADN
de cb de degré les bases sont-elles décalées entre elles?
10 Pb/tour
les pb sont décalées de 36° par rapport à la suivante
Par quoi peut-on avoir accès au bases azotées présentent dans l’ADN
En passant par le petit ou le grand sillon
Vrai ou Faux: si une protéine se promène dans le petit et le grand sillon, elle trouvera la même information
Faux, le grand sillon contient plus di’nformations et une protéine qui s’y promène pourra reconnaitre n’importe quelle combinaison de pb alors que non dans le petit sillon
Quelles sont les 3 formes d’ADN qu’on connait?
ADN-B
ADN-A
ADN-Z
Décrire l’ADN-B
périodicité = 10pb/tour
contient un grand et un petit sillon
le +près des conditions physiologiques
forme de Watson et Crick
Décrire l’ADN-A
11pb/tour
grand sillon plus étroit
petit sillon plus large et moins profond
retrouvé dans des solutions pauvre en eau/riche en sel
Décrire l’ADN-Z
ziz zag
12 pb/tour
grand sillon applati à la surface
petit sillon très étroit et plus profond
forme de la répétition d’une purine-pyrimidine (cgcgcgcgcg)
Quelles sont les conséquences de l’arrangement en hélice-avion dans l’ADN?
1- Cela modifie localement le nb de pb/tour (périodicité)
2- Les grands et les petits sillons sont de largeurs différentes
Vrai ou Faux: l’ADN ne peut jamais être retrouvé avec un pas d’hélice gauche
Faux, dans l’ADN-Z on retrouve un pas d’hélice gauche
En fait, une partie s’enroule à droite et l’autre à gauche
Quelles sont les 2 configurations que la liaison glycosyle peut avoir
anti= avec avec hélice droite
syn = hélice gauche pour les purines A et G
anti= hélice gauche pour les pyrimidines (C et T)
Vrai ou Faux: l’ADN peut se dénaturer et se renaturer à haute température
VRAI
De quoi dépend la dénaturation de l’ADN?
De son contenu en C+G et de la concentration saline
Vrai ou Faux: le nb de tours d’un brin autour de l’autre pour un ADN linéaire est limité
Vrai, cela varie, mais c’est limité
Vrai ou Faux: le nb de tour d’un brin autour de l’autre pour un ADN circulaire est illimité
Vrai
Quels sont les 2 types de supertours que peut former l’ADNccc?
Supertours plectonémiques
Supertours toroïdaux
Quelle est l’enzyme qui permet de dérouler et de relâcher l’ADN ccc?
DNAsel
Qu’est-ce qu’un surenroulement négatif?
un déroulement
cela crée des superboucles négatuves
Qu’est-ce qu’un surenroulement positif?
Un ressérement dans le même sens que le pas
Cela crée des superboucles positives
Qu’est-ce qui introduit le surenroulement négatif chez les eucaryotes?
Les nucléosomes
Définir: nucléosome
petite structure particulière dont la double hélice s’enroule 2 fois autour d’un coeur protéique. Le pas de l’enroulement est à gauche
Qu’est-ce que des topoisomérases?
Enzymes pouvant relâcher l’ADN surenroulé
Décrire et définir les 2 types de topoisomérases
Topoisomérase 1= modifie la valeur de l’enlacement d’un facteur 1, ne demande pas d’énergie
Topoisomérase 2= modifie la valeur de l’enlacement d’un facteur 2, utilise l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP
Vrai ou Faux: les topoisomérases de l’ADN peuvent être séparées par électrophorèse sur gel d’agarose
Vrai
Décrire le fonctionnement du bromure d’éthidium
- il va s’insérer entre les bases azotées et va dérouler l’ADN (diminuer son enroulement)
- il détord l’ADN de 26°
- relâche l’ADNccc
En quoi la structure de l’ARN varie de celle de l’ADN
monocaténaire ou bicaténaire
bases azotées?
- ARN est monocaténaire
- Uracile remplace la thymine
- ARN contien du ribose au lieu du désoxyribose
Quels sont les différents types d’ARN (4)?
1-ARNm
2-ARNribosomaux
3-ARN de transfert
4- microARN
Décrire l’ARNm
Sert d’intermédiaire entre le gène et la machinerie cellulaire de synthèse des protéines
Décrire ARN de transfert
Sert d’adaptateur entre les codons des ARNm et les acides aminés correspondant
Décrire l’ARN ribosomaux
sert à la synthèse des ribosomes
peut aussi être une enzyme et catalyser certaines rxn
Quel est le rôle des micro-ARN
Ont un rôle de régulation dans l’expression des gènes
Quelles sont les 3 strucures secondaires de type tige-boucle que peut avoir l’ARN
- épingle à cheveux
- hernie
- simples boucles
Comment la tétra-boucle peut-elle se former?
Grâce à la séquence UUCG
Quelle est la particularité de l’ARN qui lui permet de former des structures d’une double hélice?
ARN contient l’uracile qui n’est pas présent dans l’ADN
Possibilité de former G-U
Comment sont former les pseuso-noeuds?
Appariement des bases en régions éloignées créer ses structures secondaires complexes
De quoi a besoin un ARN pour être considérée comme une enzyme?
Site actif
Site de fixation à un cofacteur
Site de fixation au substrat
Quel a été le premier ribozyme à être découvert?
Rnase P
De combien de degrés sont séparés les sucres de chaque paire?
120 et 240°
Quelle est la formule pour calculer le nb d’enlacement?
Nb enlacement = nb de torsion+ nb de supertours
