Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Cell Biology > The Endoplasmic Reticulum > Flashcards

The Endoplasmic Reticulum Flashcards

You may prefer our related Brainscape-certified flashcards:
AP® Biology flashcards Biology 101 flashcards
1
Q

מה הקשר בין הER לגרעין התא?

A

בין ממברנות הגרעין יש חלל שנקרא לומן.
הממברנות והלומן המשכיים עם הממברנה והלומן של הER.
זה אומר שהגרעין יכול לתקשר בקלות עם הלומן של הER שמגיע רחוק בתא - הer חשוב מבחינת חישה של הגרעין את הציטופלזמה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מה מאפיין את הנוזל בלומן של הER?

A

הוא אינו דומה לנוזל התאי אלא לנוזל החוץ תאי, בין השאר בגלל וזיקולות שמגיעות מבחוץ (vesicular trafficking).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

כמה נפח ממברנה יש בer לעומת מקומות אחרים בתא?

A

יש בer הרבה יותר ממברנה משאר התא, כולל ממברנת התא.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מדוע יש יותר er במרכז התא?

A

רוב התא הוא שטוח, אבל במרכז, איפה שהגרעין, הוא יותר גבוה ולכן יש יותר נפח, אז יש שם גם יותר er.
חשוב לזכור שיש er בכל התא, פשוט יש יותר ליד הגרעין.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

לאיזה שתי קבוצות ניתן לחלק ריבוזומים?

A

ציטופלזמטיים וכאלה שצמודים לממברנה של הer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

איזה מבנים יש בer?

A

er tubules, er sheets.
כל התא בעצם מכוסה ברשת של הטובולים.
המבנה של הer הוא דינמי, הצינוריות יכולות לגדול לכל מיני כיוונים ולהתחבר לצינוריות אחרות.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מהוא הrough er?

A

דפים של ממברנות בer שמכוסים בריבוזומים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מה קורה כאשר תא b נהיה תא אפקטורי?

A

הוא צריך להתחיל לייצר חלבונים, ולכן הוא מגדיל מאוד את הer שלו.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

איזה חלבונים נוצרים בer?

A

חלבונים מופרשים וטרנס ממברנליים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

באיזה סוג של תאים נצפה לראות הרבה smooth er?

A

בתאים שיש להם הרבה מטבוליזם של ליפידים, כמו תא כבד שמייצר כולסטרול.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

איזה מידע מקבל הer מאברונים אחרים בתא וכיצד?

A

הer מקבל וזיקולות מבחוץ, ולכן הוא יכול לחוש את ריכוז הסידן בסביבה החוץ תאית לדוגמה.
הוא נמצא באינטראקציה עם כל האברונים האחרים בתא.
הוא מקבל מידע לגבי רמות האנרגיה, ריכוז הסידן, מידע על ליפידים ועוד מהמיטוכונדריה.
בגלל שהמיטוכונדריה היא לא חלק מהמערכת הוזיקולרית (לא מקבלת וזיקולות מבחוץ), הer מעביר אליה ליפידים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

כיצד הer מעביר חומרים אל המיטוכונדריה?

A

ליפידים מהציטופלזמה עוברים דרך הer אל המיטוכונדריה.
סידן מגיע ישירות מהסביבה החיצונית אל הer ומשם למיטוכונדריה, ללא מעבר בציטופלזמה. זה קורה דרך תעלות סידן שנמצאות בmembrane contact sites של הer עם הממברנה הפלזמטית.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

כיצד הer מגדיל את הסתברות המפגש בין שתי מולקולות?

A

בציטופלזה מולקולות נעות בשלושה מימדים, אבל אם מולקולה תקועה בממברנה של הer היא יכולה לנוע רק בשני מימדים.
כלומר, הגיפוזיה בממברנה של הer מעודדת אינטראקציה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מה זה membrane contact sites?

A

מפגש בין ממברנת הer לממברנות של אורגנלות ליפידיות אחרות כמו הגולג׳י וממברנת התא.
במקומות אלה יש חלבון אחד שנמצא בתוך הer ומקיים אינטראקציה מתווכת מידע עם חלבון שנמצא בתוך ממברנה אחרת.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

כיצד הפרידו בין הrough er , smooth er?

A

באמצעות סריקציה - גלי קול בעוצמה גבוהה ששוברים את הממברנה והתאים.
הer נשבר אבל הליפידים מתחברים לכדי וזיקולות שמתפקדות כמו er בתא. ההבדל בין הוזיקולות הוא הריבוזומים - הוזיקולות שהגיעו מהrough הן בעלות משקל סגולי גבוה יותר. ניתן להפריד בין המשקלים הסגוליים השונים בעזרת גרדיאנט סוכר.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

כיצד היום מפרידים בין הrough, smooth er?

A

בעזרת צנטריפוגות, כוח המשיכה מפריד בין הוזיקולות לפי צפיפות ונוכל לראות שתי טבעות, כל אחת באזור אחר של הסוכר.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

כמה חלבונים בתא הם טרנסממברנליים?

A

בערך 40%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

מדוע יש צורך שחלבונים טרנס ממברנליים יווצרו בer?

A

יש להם חלק הירופובי ואם הם ייוצרו בסביבה מימית כמו הציטופלזמה הם יכולים ליצור אגרגטים. לכן חשוב שהם יווצרו בסביבה שומנית.
הם עוברים תרגום בממברנת הer ומשם עוברים אל הממברנות האחרות.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

כיצד mrna מגיע לer?

A

יש בקוד הגנטי רצפים שמזוהים על ידי חלבונים שיודעים להעביר אותו אל הer.
לפעמים זה קורה תוך כדי התרגום ולפעמים אחרי התרגום.
על הריבוזומים בתא יש שפרונים שחשים את הפפטיד שיוצא, וכשיש רצף הידרופובי מסוים זה סיגנל שהחלבון צריך לעבור תרגום בer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

כיצד גילו את הסיגנלים שאומרים שחלבון צריך להיות מתורגם בer?

A

חקרו תאים שפוצצו אותם ויש בהם את כל מכונת התרגום.
נשארו רק עם מרנא וציטוזול, ובחלק השאירו גם את הrough er.
נתנו למרנא לעבור תרגום בכל אחת מהמבחנות, וראו שבמבחנה שיש רק ציטופלזמה נוצר חלבון ארוך יותר.
כך הבינו שיכול להיות שיש סיגנל שקשור להפרשה שגם עובר חיתוך בריבוזום.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

מהו SRP?

A

signal recognition particle - קומפלקס של רנא וחלבון שיודע לזהות רצפים מסוימים בקוד ולדעת לאיזה אורגנלה החלבון צריך להגיע.
בנוי ממולקולת רנא ושלוש מולקולות חלבון.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

כיצד הsrp עובד?

A

באחד החלבונים שלו יש אזור בשם signal sequence binding pocket שיודע לזהות את הסיגנל ההידרופובי כשהוא מתחיל לצאת מהריבוזום. הוא עוצר את התרגום עד שהריבוזום יגיע אל ממברנת הer. אז הsrp ייקשר לsrp receptor והתרגום ימשיך.
זה נקרא translational insertion.
הsrp יביא את הריבוזום לtranslocation channel ב-er, והרצף ההידרופובי יפתח אותה. החלק ההדירופילי של החלבון יווצר לתוך הלומן, כאשר החלק ההידרופובי נמצא על הממברנה. יש גם סיגנל שעוצר טרנסלוקציה.

הsrp לא רק מביא את הריבוזום לממברנת הer אלא גם מלווה את התרגום בכל פעם שמגיע חלבון הידרופובי חדש לריבוזום.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

כיצד עובדת תעלת הטרנסלוקציה בer?

A

ברגע שנכנס אל התעלה דומיין טרנס ממברנלי, החלבון נוצר לכיוון הלומן. כאשר יש סיגנל עצירת טרנסלוקציה, הרצף הזה נשאר בתוך התעלה, ותרגום החלבון ממשיך כלפי חוץ (ציטופלזמה).
התעלה נפתחת הצידה, מוציאה את החלבון אל הממברנה, וממשיכה את התרגום.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

כיצד עוברים חלבונים מהציטופלזמה לer לאחר התרגום?

A

יש שפרונים ששומרים עליהם במצב בטוח בציטופלזמה עד שמגיעים לתעלה (אחרת מתעלת הטרנסלוקציה) בer שדרכה מעבירים את החלבונים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

מה זה sec61 complex translocon?

A

תעלה לשינוי מקום תוך כדי התרגום co translational translocation
הומולגית מחיידקים לבני אדם

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

מה זה secY, secATPase?

A

תעלות של post translational translocation בבקטריות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

מה זה sec62, sec63?

A

תעלות של post translational translocation בבאוקריוטים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

מה מאפיין את תהליך הpost translational translocation?

A

הוא דורש אנרגיה.
בתהליכים מעורבים חלבונים שלצורך ההעברה עושים unfolding לחלבון כדי להעביר אותו דרך התעלה, תוך שימוש באנרגיה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

אלו מהתפקידים של הer קוראים בrough, smooth?

A

בrough כל מה שקשור לחלבונים למעט ייצוא לגולג׳י, תפקודים אחרים בsmooth.
יש דברים שיכולים לקרות בשניהם.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

מהו חלבון טרנסממברנלי מסוג 1?

A

קצה הc שלו בציטוזול והn בחוץ (בלומן).
זה נעשה באמצעות signal peptide שעובר חיתוך בסוף

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

מהו חלבון טרנסממברנלי מסוג 2?

A

קצה הn בציטוזול והc בלומן.

32
Q

כיצד מטען משפיע על הטופולוגיה של חלבונים טרנס ממברנליים?

A

בגלל שפנים התא שלילי יחסית לחוץ התא בסביבת הממברנה, חומצות אמינו טעונות חיובית גורמות לכך שהאזור המסיס יהיה בציטוזול, בפנים התא השלילי. זה קורה הרבה פעמים תוך כדי הסינתזה של החלבון.

33
Q

מה הם tail anchored proteins?

A

חלבונים עם דומיין טרנסממברנלי בקצה הc, כלומר אין להם עוד דומיין הידרופילי אחרי הדומיין הטרנסממברנלי.

34
Q

מה זה pre targeting complex?

A

שפרונים שמלווים את הריבוזום וכאשר הם רואים דומיין הידרופובי בקצה הם ישר מעבירים את החלבון לGet3 GTPase. שם יש כיס הידרופובי שמאפשר להחזיק את הדומיין הטרנסממברנלי בציטופלזמה מבלי שהוא יבוא במגע עם אף חלבון אחר (ולא יצור אגרגטים).
החלבון get3 עובר אינטראקציה עם תעלה שמורכבת מget1-get2 ומעביר אליה את הזנב ההידרופובי שנכנס לממברנה.
לאחר מכן get3 משתחרר.

התהליך דורש atp.

35
Q

מה זה gpi anchored?

A

חלבונים שנעוצים בממברנה על ידי קישור לליפידים.

36
Q

מה זה transamidase?

A

חלבון שמאפשר קישור קוולנטי בין פוספוליפיד בממברנה לבין חלבון.
לפוספוליפיד רגיל מתווסף אינוזיטול שבקצה שלו יש קבוצת פוספט שיכולה לקשור את החלבון.
במקרה כזה הקישור לליפיד מחליף את הדומיין הטרנסממברנלי.

37
Q

מה הקשר בין הer והציטופלזמה לקשרים דיסולפידיים?

A

הציטופלזמה היא סביבה מחזרת ולכן אין קשרים דיסולפידיים.
בer הסביבה מחמצנת וpdi קולט כל חלבון חדש שנכנס ומחמצן את הציסטאינים שלו.

38
Q

מה זה pdi?

A

אנזים שנמצאים בer ומחמצן ציסטאינים של חלבונים שמגיעים.

39
Q

מה הקשר בין הציטופלזמה והer לגליקוזילציה?

A

גליקוזילציה היא תהליך שבו סוכר מוצמד לחלבון.
זה קורה רק בer, לחלבונים ציטופלזמטיים אין סוכרים עליהם.

40
Q

מהי הגליקוזילציה הקנונית?

A

הגליקוזילציה שתמיד קורית לחלבונים בer
A-glycosylation
aspargin-not proline-serine/tyrosine
הרצף הזה גורם לגליקוזילציה בחלבונים שמגיעים לer, אבל בחלבונים ציטוזוליים אין לו משמעות.
לכן, ההתפלגות של הרצף הזה באאוקריוטים בין חלבונים ציטופלזמטיים לחלבוני בer היא שונה, וכנ״ל גם לגבי דומיינים טרנסממברנליים לעומת אוזרים לומינליים.

41
Q

מה זה oligosaccharyl transferase?

A

אנזים שנמצא בer שתוך כדי מערב של חלבון בתעלת טרנסלוקציה (טרנסלוקון) מזהה את הרצף של הגליקוזילציה ומדביק לו סוכר.
חשוב - זה קורה תוך כדי המעבר בטרנסלוקון, כלומר שהוא עדיין לא מקופל.

42
Q

מה זה dolichol?

A

אנזים בer שמייצר את שרשראות הסוכר שיודבקו על חלבונים בתהליך הגליקוזילציה.
זה בעצם הסובסטרט של oligosaccharyl transferase.
הוא נמצא באינטראקציה עם הטרנסלוקון, ומעביר את שרשראות הסוכר תוך כדי התרגום (כדי שייקשרו לאספרגין).

43
Q

מה זה dolichol?

A

אנזים בer שמייצר את שרשראות הסוכר שיודבקו על חלבונים בתהליך הגליקוזילציה.
זה בעצם הסובסטרט של oligosaccharyl transferase.
הוא נמצא באינטראקציה עם הטרנסלוקון, ומעביר את שרשראות הסוכר תוך כדי התרגום (כדי שייקשרו לאספרגין).

44
Q

דוגמה ללמה גליקוזילציה היא חשובה

A

לרגולציה על קיפול בer

45
Q

מה זה calnexin?

A

חלבון שנמצא על ממברנת הer מהצד של הלומן.
הוא קושר אוליסכריד (שקשור לחלבון) בקצה שלו, וכך הוא מחזיק את החלבון.
כל עוד החלבון קשור לcalnexin, הוא לא יכול לצאת מהer.

46
Q

מה זה glucosidase?

A

אנזים שמתחיל לחתוך סוכר הקשור לחלבון ולשחרר את החלבון מהאחיזה של calnexin.
אם הסוכר חשוף הוא חותך אותו, ואם לא אז לא.

47
Q

מה קורה לחלבון שהיה קשור לcalnexin לאחר שחתכו את הסוכר שלו?

A

אם הוא עבר קיפול נכון הוא יכול להמשיך בדרכו ולצאת מהer
הוא יכול גם לעבור אינטראקציה עם glucosyl transferase שמחזיר את הסוכר לחלבון כך שהוא שוב נקשר לcalnexin.

48
Q

כיצד עובד glucosyl transferase?

A

אם יש לו גישה לסוכר סימן שהחלבון עדיין לא מקופל ולכן הוא יחזיר את הסוכר כדי שהחלבון יישאר במקום.
אם אין לו גישה אז החלבון מקופל כמו שצריך ולא תהיה ביניהם אינטראקציה.

49
Q

מה מסמן הרצף של aspargine-not proline-serin/tyrosine?

A

אזורים שכשהחלבון מקופל הם לא אמורים להיות חשופים.

50
Q

מהו scramblase?

A

אנזים שמערבל את החלק הפנימי והחיצוני של ממברנת הer, כך שפוספוליפידים שנוצרים בחלק הפנימי מגיעים גם לחלק החיצוני

51
Q

מה ההבדל בין ההרכב הפוספוליפידי של ממברנת הer לממברנת התא?

A

ההרכב של הממברנה החיצונית והפנימית של הer זהים, בניגוד לממברנות אחרות.

52
Q

איפה בER יש קיפול ובקרת איכות של חלבונים?

A

rough/smooth

53
Q

איפה נוצרים קשרים דיסולפידים?

A

rough ER

54
Q

מאיפה חלבונים יוצאים לגולג’י?

A

smooth ER

55
Q

איפה יש סינתזה של ליפידים בER?

A

smooth ER

56
Q

מאיפה יוצאים הליפידים שמגיעים למיטוכונדריה?

A

smooth ER

57
Q

מאיפה יש ייצוא של לפידים וחלבונים לפרוקסיזומים?

A

smooth ER

58
Q

איפה יש אחסון של סידן בER?

A

rough/smooth ER

59
Q

איזה קבוצות פונקציונאליות מתחברות בקשר פפטידי?

A

קרבוקסילית ואמינית

60
Q

באיזה רמה מבנית כבר נמצאת כל האינפורמציה לצורך קיפול החלבון והמבנה הסופי שלו?

A

כבר ברצף הראשוני יש את כל המידע (ניסוי אוריאה)

61
Q

מהו הדבר הבסיסי ביותר שגורם לחלבונים להתקפל?

A

השאיפה של חלקים הידרופוביים לברוח ממים וחלקים הידרופילים להתקרב למים.
זה גורם למצב שכל החלקים ההידרופובים מתקפלים כלפי פנים, ליצירת hydrophobic core והחלקים ההידרופילים נמצאים בחוץ אינטראקציה בינם לבין עצמם ועם הממס.

62
Q

מה זה water cage?

A

מולקולות מים שעוטפות חלבון על מנת לתווך אותו לסביבה מימית.
צריך שיהיה ריכוז מסוים של מלחים, יותר או פחות יגרמו לשקיעה של החלבון.

63
Q

מה זה induced fit?

A

מנגנון שלפיו חלק מסוים בחלבון הינו במבנה לא מוגדר, אך כשמגיע ליגנד מסוים הוא תופס מבנה מסוים.

64
Q

מה ישתנה בקיפול של חלבון או חלק ממנו כאשר הוא נמצא בתוך ממברנה?

A

החלקים ההדירופוביים יצאו החוצה וההידרופילים יצרו את הליבה, להפך מסביבה מימית, כי פה הממס הוא הידרופובי.

65
Q

מה גורם ליצירה של coiled coil?

A

בסביבה מימים הצד ההידרופובי ירצה להיות בפנים (בשני ההליקסים), כך שהם יתלפפו אחד סביב השני. בממברנה זה יהיה הפוך.

66
Q

מה זה אזור אליפטי?

A

הידרופובי, אזור לא פולרי

67
Q

מה זה הליקס אמפיפטי?

A

הליקס שיש לו צד אחד פולרי וצד אחד לא פולרי (אליפטי)

68
Q

מהן שתי הדרכים שבהן ליגנד יכול להשפיע על המבנה של חלבון?

A

השפעה על הצורה והשפעה אינטראקציות

69
Q
A
70
Q

מהי ההשפעה של קשרי גופרית על מבנה החלבון?

A

הם נותנים יציבות לחלבון, וקשרים שנוצרים בשלב מוקדם בקיפול יכול למנוע קונפורמציות לא רצויות

71
Q

מה זה ER asociated degradation?

A

אם חלבון עבר כמה סייקלים של glucosyl transferase ולא התקפל כמו שצריך, הוא יוצא החוצה בכוח תוך שימוש באנרגיה דרך תעלה בממרנה של הER. בציטופלזמה הוא נשחל לדגרדציה בפרוטאוזום כמו כל חלבון שלא הצליח להתקפל.

72
Q

דוגמאות למצבים שעבורם יש מצב מוכן לחיזוק הER?

A

למקרה שיש יותר מדי חלבונים לא מקופלים וצריך סיוע, אקטיבציה של תא B שצריך לייצר הרבה חלבונים, ועוד.

73
Q

כיצד מתבצעת רגולציה על תפקוד הER בשמרים?

A

אם התפקוד של הER לא מספק, יש סנסורים בתא שגורמים לאקטיבציה של חלבון ire1. החלבון הזה עושה ספלייסינג למולקולות mRNA שקטה שנמצאת ליד ממברנת הER.
tRNA ligase מחבר את חלקי המולקולה, והא מתחילה לעבור תרגום בציטופלזמה, ולייצר גורם שעתוק שמגיע לגרעין וגורם לביטוי גנים שמחזקים את הER.
מנגנון נוסף גורם להורדה בכמות הmRNA שנכנסים לייצור בER.

74
Q

מה זה הUPR ואיזה חלבונים משתתפים בה?

A

unforlded protein response
תגובה כללית למצבים שבהם הER לא מתפקד טוב
Ire1 - splicing
PERK - הורדת התרגום ותעדוף של גורמי שעתוק ספציפיים
ATF6 - גורם שעתוק בפני עצמו.

75
Q

מה זה bip?

A

שפרון שנקשר לire. כשיש יותר מדי חלבונים שלא מקופלים טוב הוא עוזר להם להתקפל, ire נשאר חופשי, ועובר אקטיבציה שתתחיל את שרשרת הUPR.

76
Q

כיצד PERK גורם לתרגום של פחות חלבונים ספציפית בER?

A

הוא מזרחן פקטור תרגום וגורם לכיבוי שלו רק אם אותו פקטור קרוב לממברנת הER. בשאר התא עדיין יש תרגום.

77
Q

כיצד עובד ATF6?

A

כשישER incapacity הוא עובר לגולג’י, שם נחתך לו הדומיין הטרנסממברנלי והוא משתחרר בציטופלזמה, משם הוא מגיע לגרעין (הוא פקטור שעתוק).

Cell Biology (13 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions