Conrol of Gene Expression

Question 1

מה קרה כשלקחו גרעין של תא בגוף ועשו איחוי עם ביצית לא מופרית (שהוציאו לה את הגרעין)

Answer 1

נוצר ראשן
כלומר, לכל גרעין בגוף יש את היכולת לייצר יצור שלם

Question 2

מהם housekeeping genes?

Answer 2

גנים הנחוצים לשימור מצב התא הקיים
יתבטאו בכל הרקמות, בניגוד לTissue specific genes

Question 3

מהם Master genes?

Answer 3

גנים שמיועדים לבקרת שעתוק
תת קבוצה של גנים רגולטוריים

Question 4

כיצד עובדת העברת סיגנלים דרך מיאלין?

Answer 4

יש כל הזמן חלבונים שמוכנים לשחרור וברגע שיש סיגנל הוא מהווה פקודה מיידית, לדוגמה לפעילות סינפטית. תהליך זה לא דורש שעתוק של גנים.

Question 5

מתי זה הזמן היחיד שבו גדילי הDNA נפרדים זה מזה?

Answer 5

בזמן שכפול הDNA

Question 6

מדוע minor, major groove מאפשרים בקרה על הגנים?

Answer 6

כי האינפורמציה המבנית של רצף הDNA באה לידי ביטוי גם מבחוץ במקומות אלה

Question 7

האם קשירה של רגולוטורי שעתוק לDNA נעשית משני הצדדים?

Answer 7

כן
זה cis regulatory sequences.
אין טראנס.

Question 8

מה צריך להיות ברצף נוקליאוטידים כדי שרגולטור שעתוק יזהה אותו?

Answer 8

הרצף צריך להיות בכיוון מסוים ועם שכיחות מסוימת של נוקלאוטידים ברצף
כלומר, יש גמישות מסוימת ברצף המסוים שהחלבון קושר.

Question 9

מהו האורך של רצף שרגולטור שעתוק מזהה?

Answer 9

7 ח”א

Question 10

כיצד עובדת קואופרטיביות של רגולטורי DNA?

Answer 10

הקשר בין שני הרגולטורי הכי חזק כאשר שניהם מוצאים את הרצף המתאים (אלמנט ציס, לא טראנס).
זה מעלה את רמת הזיהוי של הרצף

Question 11

כמה אחוזים מכל הגנים שלנו הם רגולטורי שעתוק?

Answer 11

10%

Question 12

מה קורה למבנה הDNA ברגע שנקשרים רגולטורי שעתוק?

Answer 12

הכרומטין נפתח קצת, הנוקלאוזומים משתחררים קצת. זה נותן לרגולטורים גישה נוחה יותר.

Question 13

מהו פרומוטר?

Answer 13

מבנה של זיהוי להפעלת גן

Question 14

מה ההבדל במיקום פרומוטרים בין תא פרוקריוטי לאאוקריוטי?

Answer 14

בפרוקריוטי הפרומוטר קרוב לגן שאותו רוצה לשעתק, באאוקריוטי לא.

Question 15

כיצד עובד טריפטופן רפרסור?

Answer 15

כשנקשר אליו טריפטופן הוא יכול לעכב את השעתוק של גן מסוים

Question 16

כיצד שונה המיקום של אזורי רגולציה בין פרו ואאוקריוטים?

Answer 16

בפרוקריוטים האזור הרגולטורי קרוב, ובאווקריוטים דרושים כמה אזורי רגולציה שנמצאים מאוד רחוק.

Question 17

מהו TF2D?

Answer 17

פקטור שעתוק שמזהה RNA פולימראז ועוזר לו להתחיל.

Question 18

כיצד “קוראים” לTF2D?

Answer 18

רק קישור של כל הרגולטורים של השעתוק יאפשר קריאה לפקטור השעתוק הכללי TF2D, ופה מתבטאת הבקרה.

Question 19

מהם mediators בDNA?

Answer 19

קומפלקס של חלבונים כאלה אמור לקפל את הDNA כדי להביא את האזורים הרחוקים להיות קרובים כדי לאפשר שעתוק. זה נקרא bending.

Question 20

לאיזה שינויים רגולטורים שונים של שעתוק יכולים לגרום?

Answer 20

רגולטור שעתוק על אלמנט מסוים יכול לגרום לשינוי מבני שניוני של הכרומטין.
עיצוב מחדש של הנוקלאוזומים מצריך הפעלה של אקטיבטורים שיגשו לאזור סגור יותר.
הפתיחה יכולה לאפשר גישה לאלמנטי שעתוק אחרים.

Question 21

האם כשיש רגולטור שעתוק על האלמנט שלו זה מספיק כדי שיתחיל שעתוק?

Answer 21

לא, צריך גם שRNA פולימראז יגיע וגם יש אקטיבטור שדרוש בשביל להתחיל שעתוק (שהוא לא הראשון)

Question 22

כיצד מתבצע השעתוק (באופן כללי מאוד)?

Answer 22

בהפסקות, השעתוק מתחיל בצורה זהירה, איטית, ואז מגביר. בדרך כלל רנא פולימראז משעתק רצף מסוים, עוצר, מחכה לסיגנל, ואז ממשיך.

Question 23

איזה אפקט סינרגטי יש בשעתוק גנים?

Answer 23

אקטיבטור אחד יביא לשעתוק מסוים, אקטביטור אחר אולי לקצת יותר גדול, אבל ביחד הם יביאו לאפקט סינרגטי הרבה יותר גדול (ההבדל היה בין 1-2 ל100).
מדובר על אקטיבטורים שבאים אחד אחרי השני, בלי קשר לעניין הציס.

Question 24

כיצד עובדים פקטורי שעתוק?

Answer 24

מופרשים לדם, מגיעים להרבה תאים, מתחברים לרצפטור שהוא עצמו רגולטור שמיד מגיע לגרעין ומתחיל שעתוק.
יש להם יכולת הפעלה מיידית, מ0 ל100, כך שבבת אחת יש הפעלה מערכתית.

Question 25

מה זה competetive DNA binding?

Answer 25

הרפרסור מעיף את האקטיבטור כי יש לו אפיניות טובה יותר לרצף

Question 26

מה זה masking the activation surface?

Answer 26

הרפרסור נקשר לDNA (באתר קישור לרפרסור) וגם לאקטיבטור ועושה לו אינאקטיבציה

Question 27

מה זה direct interaction with the general transcription factors?

Answer 27

בזמן הקיפול של הDNA יש רפרסורים שמונעים מTF2D להתקדם (גם אם יש רנא פולימראז מוכן).
לאקטיבציה במקרה כזה אין משמעות.

Question 28

מהם שלבי הסגירה של כרומטין בעקבות רפרסיה?

Answer 28

רפרסור על גבי האלמנט שלו סוגר במידה מסוימת, יש אנזימים שמביאים לסגירה יותר הרמטית, והורדה של האצטיל והוספה של מתיל סוגרת לגמרי (עדיין אפשר לפתוח כשצריך).

Question 29

ביטוי של גן במיקום מסוים תלוי ב…

Answer 29

מינונים הספציפיים של רפרסורים ואקטיבטורים

Question 30

למה הכוונה שבקרה על שעתוק היא קומבינטורית?

Answer 30

יש אקטיבטורים שמשפיעים ורפרסורים שמשפיעים וההשפעה המצטברת של כולם תקבע את ההסתברות שבסוף יקרה שעתוק.

Question 31

כיצד משוב חיובי יכול ליצור זיכרון תאי בנוגע לבקרה על שעתוק גנים?

Answer 31

ברגע שמשופעל גן ואז התא מתחלק, גם בתאי הבת הגן ישפועל גם ללא סיגנל, הם זוכרים את זה מתא האם.

Question 32

מה ניתן לעשות עם שלושה master genes?

Answer 32

להמיר תא שאמור היה להיות תא כבד לנוירון
התהליך היה קשה, הרבה תאים מתו

Question 33

מהם פקטורי יאמאקה?

Answer 33

שלושה master genes שמאפשרים לפיברובלסט להפוך להיות תא גזע.

Question 34

כיצד פקטורי יאמאקה עובדים?

Answer 34

האינטראקציה בין שלושתם מפעילה המון גנים שמאפשרים לתא להיות תא גזע פוליפוטנטי. עם זאת, הם עושים רפרסיה לגנים שקשורים להתמיינות. בתהליך ההתמיינות חלק מתאי הגזע יתחילו לבטא פקטורים אחרים (על בסיס מיקום) ולהתמיין