Tema 5: Traducción Flashcards
Qué es el dogma central de la biología?
paradigma en el que se siguen los sig pasos:
adn se replica, se transcribe en ARNm y se traduce ese ARNm en una proteína
- De ADN a ARN a proteína
Qué es la traducción?
proceso en el que se sintetizan las proteínas a partir de la traducción de un ARNm
Qué es el código genético?
conjunto de reglas donde hay una correspondencia entre:
la secuencia de bases de nucléotidos y aa
El código genético está formado por los codones del ARN, que determinan la secuencia de aminoácidos en las proteínas.
Qué codifica un codón y qué es un codón?
- es un triplete de nucleótidos
- codifica un aa
De cuántas combinaciones dif. de nucleótidos se conforma el código genético, es decir, de cuántos codones?
de 64 combinaciones diferentes
En qué dirección se da la lectura del código genético?
de 5´a 3´
La tabla del código genético tiene 6 columnas, qué indica cada una de ellas?
- 1er columna: indica el nucleótido con el que comenzará el codón, se ubica en extremo 5´
- las 4 columnas centrales: inidican la base intermedia de los condones
- 6ta columna: indica el nucleótido con el que termina el codón 3´
Cuál es el codón de inicio y qué aa codifica?
codón de inicio es: AUG y codifica para el aa Metionina (Met)
Cuáles son los codones de terminación/paro o stop y no codifican aa?
son 3:
UAG (universidad autónoma de guadalajara)
UGA (universidad guadalajara autónoma)
UAA (universidad autónoma de aguscalientes)
Características del código genético: específico, a qué se refiere?
específico pq un codón en particular codifica un mismo aa
Características del código genético: universal, a qué se refiere?
aplica en todos los organismos vivos
en una ballena o para cualquier animal, el codón de inicio será tmb el AUG, a eso se refiere
Características del código genético: degenerado o redundante, a qué se refiere?
un aa puede ser codificado por más de un triplete (codón)
Arg se puede codificar a partir de 6 codones dif,, y Met y Triptofano por sólo 1 triplete que los codifica
Características del código genético: con ausencia de superposición y ausencia de puntuación, a qué se refiere?
se refiere a que se lee a partir de un punto fijo, de 3 en 3 bases (tripletes), y continua hasta que tiene el codón de stop
Cuáles son los 7 componentes necesarios para la traducción?
- aa
- arnt
- arnm
- ribosomas funcionales
- la enzima Aminoacil- tRNA- sintetasa
- factores proteícos
- ATP y GTP como fuente de energía
Se necesita un tipo de tRNA por cada aa, en los humanos, cuántos tipos de ARNt hay, y en las bacterias?
- en humanos hay 50 tipos
- en las bacterias hay al menos 30 tipos
El tRNA va de 3´a 5´?
qué se coloca en el extremo 3´?
- sí, va de 3’ a 5´
- en el extremo 3´ se unen los aa
A través de qué se unen los aa al extremo 3´del tRNA?
los aa se van a unir con su grupo carboxilo a través de un enlace ester con el hidroxilo (OH) 3´de la ribosa
Porqué se dice que un tRNA está activado?
porque tiene un aa unido covalentemente
Qué es la región anticodón?
es esa región del tRNA que es complementaria a un codón del mRNA
Qué enzima se usa para poder unir un aa específico a su tRNA correspondiente?
la aminoacil-tRNA- sintetasa
reconoce un aa específico y su tRNA específico; unen covalentemente el grupo carbolixo COOH a un aa al extremo 3´ con hidroxilo, de su tRNA correspondiente
Cuáles son las 2 etapas en las que la aminoacil-tRNA- sintetasa une el aa a su tRNA correspondiente?
está la enzima aminoacil-tRNA- sintetasa,
entra ATP y :
1. se hidroliza atp a pirofosfato (Pi)
2. pirofosfato se hidroliza para formar 2 moléculas defosfato orgánico y se libera AMP y con eso, se forma el amino acil tRNA que es el tRNA unido a su aa
Además de ayudar a pegar el aa al tRNA correspondiente, qué otra función tienen las aminoacil-tRNA- sintetasas?
tienen un función correctora, eliminan el aa incorrecto de la enzima
Ribosomas: de qué se conforman?
son complejos formados de proteínas y rRNA
Ribosoma de procarionte
1. cuánto pesa un ribosoma (su subunidad grande y pequeña juntas)
2. cuánto pesa su sub. peque. y grande?
3. qué RNA codifica cada parte?
4. cuántas protes. codifica cada parte?
estos parámetros se determinan a partir de su coeficiente de sedimentación: S de svedberg
- en conjunto: 70s
- sub grande: 50s;sub peque: 30s
- sub grande codifica: RNA 5s y 23s; sub peque codifica: RNA16s
- la sub grande codifica 35 protes., la sub peque codifica 20 protes.
estos parámetros se determinan a partir de su coeficiente de sedimentación: S de svedberg
Ribosoma de eucarionte
1. cuánto pesa un ribosoma (su subunidad grande y pequeña juntas)
2. cuánto pesa su sub. peque. y grande?
3. qué RNA codifica cada parte?
4. cuántas protes. codifica cada parte?
- en conjunto pesa 80s
- sub grande: 60s; sub. peque: 40s
- la sub grande: codifica RNA 5s, 5.8 y 28s; sub peque. codifica 18s
- sub grande codifica 50 protes.; sub peque: 35 protes.
En dónde se lleva a cabo la traducción?
en los ribosomas
En las células eucariotas, dónde están los ribosomas?
libres en el citosol o cerca del RER
Cuál es la diferencia entre los ribosomas que están en el citosol vs. los ribosomas que están asociados al RER?
- los del citosol: síntesis de protes. que serán usadas dentro de la célula (citosol, núcleo, peroxisoma y mitocondrias)
mientras que:
- los del RER: son protes que serán exportadas de la célula, o se pueden añadir al** RE, lisosomas, o A. Golgi**
Qué es el bamboleo?
cuando se genera el complejo codón-anticodón, las primeras 2 bases crean una unión estable y la 3ra base se balancea, NO es una unión estable y podemos meter bases que NO correspondan
- definición formal:
” es el apariamiento no tradicional de bases entre nucleótido 5´(primer nucleótido) del anticodón y el nucleótido 3´del codón (último nucleótido)”
Bamboleo: menciona dos ejemplos de bases no tradicionales
- H=hipoxantina, apareada con UCA
- Inosina, tmb puede ser apareada con la UCA
Cuántos aa hay en el ser humano?
20 aa
En qué dirección se lee/traduce el mRNA sintetizando una proteína desde qué extremos?
el mRNA se traduce de 5´a 3´sintetizando una proteína desde su extremo amino hacia su extremo carboxilo
En qué parte del tRNA se pegan los aa?
en su extremo 3´
recordemos que el tRNA va de 3´a 5´
Qué es policistrónico y monocristrónico??
- policistrónico: es en procariotas, se usa un ribosoma para sintetizar diferentes proteínas, es decir, tienen varias regiones codificadoras
- monocristrónico: es en eucariotas, sólo tiene una región codificadora, un sólo ribosoma para una sola proteína
Cuáles son las fases de la traducción?
- iniciación
- elongación
- terminación
Qué ocurre en la iniciación de la traducción en PROCARIOTAS?
va a haber una secuencia en el mARN, llamada Shine Dalgarno en la subuni. peque del ribosoma
se va a detectar gracias al rRNA 16s, y el tRNA iniciador que trae la fMET va a detectar el aa AUG (inicio)
y esto hace que se ensamblen las 2 partes del ribosoma para comenzar a sintetizar
el tRNA iniciador está en sitio P
se usa GTP (es como ATP)
tRNA tiene un aa FMet, sólo en procariotas la Met tiene una F
Qué es la secuencia Shine Dalgarno, qué bases tiene, en dónde se encuentra y qué rRNA lo lee?
- es la secuencia del mARN que tiene muchas purinas
- se encuentra en la subunidad PEQUEÑA del ribosoma de PROCARIOTAS, de 6 a 10 bases del codón inicio, en extremo 5´
- es leído por el rRNA 16s
Qué rARN lee la secuencia Shine Dalrgano?
la subunidad peque 30s del ribosoma de procaritoas tiene el rRNA 16s que reconoce la secuencia Shine Dalgarno
pq el rRNA 16s tiene una secuencia en su extremo 3´que es complementaria a la Shine Dalgarno del arnm (que está en extremo 5´)
Qué ocurre en la iniciación de la traducción en EUCARIOTAS?
NO hay secuencia Shine Dalgardo
- en la sub peque. 40s, las protes. iniciadoras asocian esta sub. a la parte 5´del mARN (la cap de guanina)
- se busca el codón de inicio AUG
- se unen las 2 subuni. del ribosoma
para comenzar a sintetizar
REQUIERE ATP
Cómo se forma un enlace peptídico y qué enzima participa?
esto ya ocurre en la enlongación
a través de la TRANSPEPTIDACIÓN
es por la transferencia del péptido del sitio P del tRNA al sitio A
gracias a la RIBOZIMA (RNA con act. catalítica)
En la iniciación de la traducción en PROCARIOTAS, qué factores de iniciación tenemos y qué hacen?
- IF 1 y IF 3, forma el complejo 30s del ribosoma
- tRNA iniciador se lleva al sitio P del ribosoma por el IF2 que tiene un GTP
Traducción: enlongación
qué ocurre
el factor EF-TU-GTP da el tARN cargado con su codón en el sitio vacio:
- llega aa con su tRNA al sitio A
- se hace la formación del enlace peptídico, pq el tARN del sitio P libera su aa y pasa el aa del sitio P a pegarse con el aa del sitio A y toda la unidad se mueve 3 bases y el sitio A SE QUEDA VACIO
el tARN sin su aa se mueve al sitio E
- así se va sintetizando la cadena hasta llegar a un codón de STOP
Qué ocurre en la etapa de terminación
se reconoce un codón de liberación gracias a los factores RF1 o RF2
se libera la prote ya sintetizada
el RF3 disocia el complejo de síntesis
Qué hace la estreptomicina?
altera estruc. subuni. 30s (sub peque del ribosoma procariota) inhibiendo la síntesis
Qué hace la tetraciclina?
inhibe sub 30s bloqueando acceso del aminoacil-tRNA al sitio A y bloquea ENLOGACIÓN
Qué hace la puromicina?
ACTÚA en PROCAS. Y EUCARIOTAS
semejante al amicoacil tRNA; acepta péptidos en el sitio P inhibiendo la elongación
Qué hace la cloranfenicol?
en procariotas
inhibe la pepetidiltransferasa afecta elongación
Qué hace la eritromicina?
se une de forma IRREVERSIBLE al sitio de sub. 50s (sub grande procariotas)
no deja que la proteína sea expulsada y no se siga formando
Qué hace la toxina diftérica?
inactiva el factor de elongación EF-2 en eucariotas previene la translocación
Qué es un poliribosoma
varios ribosomas traducen una sóla prote., varios ribosomas traducen simultáneamente un mRNA
