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Biología Molecular > Tema 5 > Flashcards

Tema 5 Flashcards

1
Q

¿Las proteínas adaptadoras suelen tener actividad enzimática?

A

No, solo permiten que una molécula diferente active a otra

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Q

Las interacciones ente moléculas son mayoritariamente…

A

No covalente (débiles)

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Q

Las interacciones débiles permiten la asociación fuerte entre proteínas que muestren…

A

Complementariedad molecular

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4
Q

La intensidad de las interacciones débiles depende del … y … de ellas

A

Número y fuerza

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5
Q

Las interacciones se producen entre proteínas señalizadoras y…

A
  1. Metabolitos
  2. Ácidos nucleicos: DNA y RNA
  3. Proteínas
  4. Lípidos
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6
Q

¿Qué interacciones producen los metabolitos?

A
  1. Interacciones alostéricas
  2. Cambios conformacionales
  3. Cambios de actividad
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7
Q

Las proteínas señalizadoras que se unen al DNA pueden unirse…

A
  • A cualquier sitio
  • Al esqueleto altamente cargado (-), partes con Lys y Arg
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8
Q

¿Qué función desempeñan las proteínas señalizadoras en el DNA?

A
  • Mantener regiones monohebra
  • Protección de degradación
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9
Q

¿Las interacciones entre las proteínas señalizadoras y el DNA son específicas o no?

A

Pueden ser las dos

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10
Q

¿Las interacciones entre las proteínas señalizadoras y el RNA son específicas o no?

A

Son específicas

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11
Q

¿Qué funciones suelen llevar a cabo los complejos RNA-proteínas?

A

Funciones catalíticas

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12
Q

¿Qué funciones suelen llevar a cabo los complejos DNA-proteínas?

A

Funciones reguladoras

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13
Q

Las interacciones proteína-proteína son…

A

No covalentes (débiles)

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14
Q

La unión entre proteínas se puede alterar por…

A
  1. Abundancia o distribución en la célula
  2. Cambios en sus modificaciones postraduccionales
  3. Cambios en la forma (conformación)
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15
Q

Las interacciones entre proteínas pueden afectar a su comportamiento permitiendo:

A

Formar estructuras multifuncionales con actividades más complejas a partir de componentes proteicos más simples.

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16
Q

¿Qué hacen las Scaffold proteins?

A

Incrementan la especificidad y eficiencia (evitan la unión de otro sustrato que puede ser más competitivo)

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17
Q

¿De qué depende la probabilidad de que ocurra una interacción?

A

De la afinidad y especificidad de unión

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18
Q

¿Qué es la afinidad?

A

La medida de la fuerza intrínseca de la interacción de unión

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19
Q

La unión entre proteínas puede ser medida por…

A
  1. Péptidos lineales cortos
  2. Amplias superficies de interacción
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20
Q

La base de la unión de una proteína a otra macromolécula es…

A

La especificidad de encaje (complementariedad entre las 2 superficies que interactúan

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21
Q

¿Mediante qué uniones se estabiliza la unión de proteínas?

A
  1. Uniones de H
  2. Interacciones hidrofóbicas
  3. Interacciones electrostáticas
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22
Q

Las interacciones entre lípidos y proteínas de señalización son…

A

No covalentes

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23
Q

¿Qué es un motivo?

A

Es un patrón de plegamiento reconocible que implica a 2 o más elementos de estructura secundaria conectados (estructura supersecundaria)

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24
Q

Una región de la cadena polpeptídica que tiene más elementos de la estructura secundaria se llama…

A

Motivo

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25
Q

Una región de la proteína que tiene una estructura tridimensional identificable se llama…

A

Dominio proteico

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26
Q

Ejemplo de proteína multidominio

A

Proteína Src

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27
Q

¿Qué es la proteína Src?

A

Una proteína multidominio tirosina kinasa citosólica anclada a la membrana

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28
Q

¿Qué partes tiene la proteína Src?

A
  1. Un ácido graso (unión a la membrana)
  2. Un sitio de reconocimiento
  3. Dominio kinasa (actividad catalítica –> Fosforilación)
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29
Q

Todos los dominios pueden sufrir modificaciones…

A

Covalentes

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30
Q

¿Qué reconocen los dominios 14-3-3?

A

p-Ser/p-Tre [FHA] en proteínas reguladoras 14-3-3 [WW]

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31
Q

¿Qué reconocen los bromodominios?

A

Lys acetiladas

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32
Q

¿Qué reconocen los cromodominios?

A

Lys metiladas

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33
Q

¿Qué reconocen los dominios Tudor?

A

Lys-Arg metiladas en histonas nucleosomales

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34
Q

¿Qué reconocen los dominios PH (plecstrina)?

A

Subgrupos que unen PIP2 y PIP3

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35
Q

¿Qué reconocen los dominios PTB?

A

Tyr fosforilada

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36
Q

Las Scaffold proteins pueden tener capacidad enzimática?

A

Sí

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37
Q

¿Qué forman las Scaffold proteins?

A

Un módulo ordenado que permite la activación secuencial de laca enzima

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38
Q

¿Qué hacen las proteínas de anclaje?

A

Localizan su complemento de enzima cerca de su lugar de acción

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39
Q

¿Dónde se localizan las proteínas de acoplamiento?

A

En la membrana plasmática

40
Q

4 vías de actuación de las Scaffold proteins

A
  1. Anclar componentes de señalización
  2. Localizar en áreas específicas de la célula
  3. Regular la transducción de señales (retroalimentación + y -)
  4. Aislar de la interacción con otras proteínas o sustratos alternativos
41
Q

Mecanismos de transmisión de la información de las Scaffold proteins

A
  1. Aproximan e incrementan la concentración efectiva de 2 enzimas
  2. Aislamiento
  3. Reguladores alostéricos
42
Q

Hay dos grandes tipos de complejos de señalización…

A
  1. Complejos de señalización preformados sobre una Scaffold protein
  2. Complejos de señalización ensamblados sobre un receptor activado o sobre sitios de acoplamiento de fosfoinosítidos
43
Q

Las proteínas pueden estar modificadas covalentemente con… después de la traducción

A

Lípidos

44
Q

3 anclajes lipídicos son…

A
  1. Glucofosfatidilinositol
  2. Acilación
  3. Prenilación
45
Q

¿Con qué no puede interactuar una proteína señalizadora que contiene un residuo de miristoilo inaccesible (escondido)?

A

Con una proteína efectora

46
Q

¿Qué es la miristoilación?

A

Modificación estable catalizada por la N-miristoil transferasa, es cotraduccional y también postraduccional y es un proceso constitutivo y permanente.

47
Q

¿Qué permite la miristoilación?

A

Permite a las proteínas localizarse en la membrana o en el citosol

48
Q

¿Qué subunidad de la PKA está miristoilada?

A

La subunidad C

49
Q

La subunidad C de la PKA está…

A

Miristoilada

50
Q

¿Qué son los Rafts?

A

Son microdominios fluidos de membranas variables en tamaño

51
Q

En las balsas de membrana se concentran muchas proteínas con anclajes…

A

GPI

52
Q

Muchas proteínas de las balsas citoplasmáticas están…

A

Miristoiladas o palmitoiladas

53
Q

Las Rafts están enriquecidas con más…

A

Glucoesfingolípidos (cerebrósidos y gangliósidos)

54
Q

Características comunes de las enzimas señalizadoras:

A
  1. Aparecen como pares complementarios catalizando rutas opuestas.
  2. Capacidad de amplificación
55
Q

¿Qué son los cambios conformacionales alostéricos?

A

Son cambios en la estructura de la proteína inducidos por ligando.

56
Q

¿Cuáles son las superfamilias de las Proteínas G monoméricas?

A
  • Superfamilia Ras
  • GTPasas de síntesis proteica y traslocación
57
Q

¿Qué regulan las RGS?

A

Proteínas G3

58
Q

¿Qué son los GEF?

A

Factores de intercambio de nucleótidos de guanina

59
Q

¿Qué son las GDI?

A

Inhibidoras de disociación del nucleótido GDP o la actividad GTPasa

60
Q

¿Qué son las GAP?

A

Proteínas activadoras de la actividad GTPasa, regulan G monoméricas

61
Q

¿Qué tipo de proteínas G regulan las RGS?

A

G heteroméricas

62
Q

¿Qué tipo de proteínas G regulan las GAP?

A

G monoméricas

63
Q

¿Cuántas cargas negativas aporta la fosforilación de proteínas?

A

2

64
Q

La fosforilación permite interacciones específicas con…

A
  • Grupos amida libres sucesivos en N-ter de una hélice alpha
  • 2 N en grupo guanidino de Arg
65
Q

Sitios de unión de la fosforilación:

A
  1. Tyr
  2. Ser
  3. Tre
66
Q

¿PTEN es una proteína kinasa o fosfatasa?

A

Fosfatasa

67
Q

¿Qué dominio del RPTP tiene actividad catalítica?

A

El dominio citosólico

68
Q

¿Qué inactiva el dominio fosfatasa en las RPTP?

A

La unión del ligando

69
Q

La actividad de las RPTP puede ser inhibida por … del receptor.

A

Dimerización

70
Q

Las PTP son…

A

Tirosina fosfatasas

71
Q

A través del complejo del poro nuclear (CPN) pueden pasar moléculas por…

A
  • Difusión facilitada
  • Transporte activo
72
Q

La clase más prominente de proteínas de transporte nuclear son las…

A

Karioferinas

73
Q

¿Qué significa NLS?

A

Secuencia de localización nuclear

74
Q

El transporte nuclear se controla por…

A
  • Proteínas lanzadera
  • Proteína G Ran
75
Q

¿Dónde hay más proporción de Ran-GTP?

A

En el núcleo

76
Q

¿Dónde hay más Ran-GDP?

A

En el citosol

77
Q

Algunos sitios de reconocimiento palindrómico unen…

A

Dímeros

78
Q

La forma activa de un TF típico es un…

A

Dímero

79
Q

La dimerización de las proteínas reguladoras transcripcionales reduce las posibilidades de…

A

Apareamientos aleatorios e incrementa la especificidad y la afinidad de unión del regulador

80
Q

Las repeticiones directas son regiones de reconocimiento del DNA…

A

Específicas

81
Q

Las proteínas que unen DNA como dímeros u oligómeros pueden formar…

A

Lazos en el DNA

82
Q

Los complejos de reordenamiento de la cromatina contienen siempre…

A

ATPasa

83
Q

Indica 3 dominios de unión al DNA:

A
  1. HTH (hélice-giro-hélice)
  2. Dedos de Zinc
  3. Cremallera de leucina
84
Q

Las proteínas que se unen al surco menor causan…

A

Una curvatura (doblamiento) en el DNA

85
Q

¿Todos los factores de transcripción son proteínas reguladoras génicas?

A

No

86
Q

¿Pueden los TF regular la expresión génica por sí mismos?

A

No. Precisan la asistencia de coactivadores/correpresores

87
Q

¿Los elementos promotores basales son específicos o generales?

A

Generales

88
Q

Hay 3 tipos de secuencias promotoras:

A
  1. Elementos promotores basales
  2. Elementos promotores proximales
  3. Elementos promotores distales
89
Q

Los factores de transcripción pueden ser fosforilados por:

A
  1. RTK
  2. PK activadas por 2 mensajeros
  3. Cascadas de múltiples PK
90
Q

Cuando veo un elemento de respuesta pienso en…

A

Una secuencia CIS reguladora que une un factor específico

91
Q

Los TF contienen por lo menos 3 dominios:

A
  1. RB
  2. DBD
  3. TAD
92
Q

El RD es el dominio…

A

Regulador

93
Q

El BDB es el dominio…

A

De unión al ligando

94
Q

El TAD es el dominio…

A

Transactivante

95
Q

Las secuencias de DBD suelen contener motivos estructurales como…

A

Dedos de Zinc o Cremalleras de Leucina

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