Tema 5 Flashcards

1
Q

¿Las proteínas adaptadoras suelen tener actividad enzimática?

A

No, solo permiten que una molécula diferente active a otra

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Q

Las interacciones ente moléculas son mayoritariamente…

A

No covalente (débiles)

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3
Q

Las interacciones débiles permiten la asociación fuerte entre proteínas que muestren…

A

Complementariedad molecular

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4
Q

La intensidad de las interacciones débiles depende del … y … de ellas

A

Número y fuerza

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5
Q

Las interacciones se producen entre proteínas señalizadoras y…

A
  1. Metabolitos
  2. Ácidos nucleicos: DNA y RNA
  3. Proteínas
  4. Lípidos
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6
Q

¿Qué interacciones producen los metabolitos?

A
  1. Interacciones alostéricas
  2. Cambios conformacionales
  3. Cambios de actividad
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7
Q

Las proteínas señalizadoras que se unen al DNA pueden unirse…

A
  • A cualquier sitio
  • Al esqueleto altamente cargado (-), partes con Lys y Arg
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8
Q

¿Qué función desempeñan las proteínas señalizadoras en el DNA?

A
  • Mantener regiones monohebra
  • Protección de degradación
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9
Q

¿Las interacciones entre las proteínas señalizadoras y el DNA son específicas o no?

A

Pueden ser las dos

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10
Q

¿Las interacciones entre las proteínas señalizadoras y el RNA son específicas o no?

A

Son específicas

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11
Q

¿Qué funciones suelen llevar a cabo los complejos RNA-proteínas?

A

Funciones catalíticas

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12
Q

¿Qué funciones suelen llevar a cabo los complejos DNA-proteínas?

A

Funciones reguladoras

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13
Q

Las interacciones proteína-proteína son…

A

No covalentes (débiles)

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14
Q

La unión entre proteínas se puede alterar por…

A
  1. Abundancia o distribución en la célula
  2. Cambios en sus modificaciones postraduccionales
  3. Cambios en la forma (conformación)
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15
Q

Las interacciones entre proteínas pueden afectar a su comportamiento permitiendo:

A

Formar estructuras multifuncionales con actividades más complejas a partir de componentes proteicos más simples.

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16
Q

¿Qué hacen las Scaffold proteins?

A

Incrementan la especificidad y eficiencia (evitan la unión de otro sustrato que puede ser más competitivo)

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17
Q

¿De qué depende la probabilidad de que ocurra una interacción?

A

De la afinidad y especificidad de unión

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18
Q

¿Qué es la afinidad?

A

La medida de la fuerza intrínseca de la interacción de unión

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19
Q

La unión entre proteínas puede ser medida por…

A
  1. Péptidos lineales cortos
  2. Amplias superficies de interacción
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20
Q

La base de la unión de una proteína a otra macromolécula es…

A

La especificidad de encaje (complementariedad entre las 2 superficies que interactúan

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21
Q

¿Mediante qué uniones se estabiliza la unión de proteínas?

A
  1. Uniones de H
  2. Interacciones hidrofóbicas
  3. Interacciones electrostáticas
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22
Q

Las interacciones entre lípidos y proteínas de señalización son…

A

No covalentes

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23
Q

¿Qué es un motivo?

A

Es un patrón de plegamiento reconocible que implica a 2 o más elementos de estructura secundaria conectados (estructura supersecundaria)

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24
Q

Una región de la cadena polpeptídica que tiene más elementos de la estructura secundaria se llama…

A

Motivo

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25
Una región de la proteína que tiene una estructura tridimensional identificable se llama...
Dominio proteico
26
Ejemplo de proteína multidominio
Proteína Src
27
¿Qué es la proteína Src?
Una proteína multidominio tirosina kinasa citosólica anclada a la membrana
28
¿Qué partes tiene la proteína Src?
1. Un ácido graso (unión a la membrana) 2. Un sitio de reconocimiento 3. Dominio kinasa (actividad catalítica --> Fosforilación)
29
Todos los dominios pueden sufrir modificaciones...
Covalentes
30
¿Qué reconocen los dominios 14-3-3?
p-Ser/p-Tre [FHA] en proteínas reguladoras 14-3-3 [WW]
31
¿Qué reconocen los bromodominios?
Lys acetiladas
32
¿Qué reconocen los cromodominios?
Lys metiladas
33
¿Qué reconocen los dominios Tudor?
Lys-Arg metiladas en histonas nucleosomales
34
¿Qué reconocen los dominios PH (plecstrina)?
Subgrupos que unen PIP2 y PIP3
35
¿Qué reconocen los dominios PTB?
Tyr fosforilada
36
Las Scaffold proteins pueden tener capacidad enzimática?
37
¿Qué forman las Scaffold proteins?
Un módulo ordenado que permite la activación secuencial de laca enzima
38
¿Qué hacen las proteínas de anclaje?
Localizan su complemento de enzima cerca de su lugar de acción
39
¿Dónde se localizan las proteínas de acoplamiento?
En la membrana plasmática
40
4 vías de actuación de las Scaffold proteins
1. Anclar componentes de señalización 2. Localizar en áreas específicas de la célula 3. Regular la transducción de señales (retroalimentación + y -) 4. Aislar de la interacción con otras proteínas o sustratos alternativos
41
Mecanismos de transmisión de la información de las Scaffold proteins
1. Aproximan e incrementan la concentración efectiva de 2 enzimas 2. Aislamiento 3. Reguladores alostéricos
42
Hay dos grandes tipos de complejos de señalización...
1. Complejos de señalización preformados sobre una Scaffold protein 2. Complejos de señalización ensamblados sobre un receptor activado o sobre sitios de acoplamiento de fosfoinosítidos
43
Las proteínas pueden estar modificadas covalentemente con... después de la traducción
Lípidos
44
3 anclajes lipídicos son...
1. Glucofosfatidilinositol 2. Acilación 3. Prenilación
45
¿Con qué no puede interactuar una proteína señalizadora que contiene un residuo de miristoilo inaccesible (escondido)?
Con una proteína efectora
46
¿Qué es la miristoilación?
Modificación estable catalizada por la N-miristoil transferasa, es cotraduccional y también postraduccional y es un proceso constitutivo y permanente.
47
¿Qué permite la miristoilación?
Permite a las proteínas localizarse en la membrana o en el citosol
48
¿Qué subunidad de la PKA está miristoilada?
La subunidad C
49
La subunidad C de la PKA está...
Miristoilada
50
¿Qué son los Rafts?
Son microdominios fluidos de membranas variables en tamaño
51
En las balsas de membrana se concentran muchas proteínas con anclajes...
GPI
52
Muchas proteínas de las balsas citoplasmáticas están...
Miristoiladas o palmitoiladas
53
Las Rafts están enriquecidas con más...
Glucoesfingolípidos (cerebrósidos y gangliósidos)
54
Características comunes de las enzimas señalizadoras:
1. Aparecen como pares complementarios catalizando rutas opuestas. 2. Capacidad de amplificación
55
¿Qué son los cambios conformacionales alostéricos?
Son cambios en la estructura de la proteína inducidos por ligando.
56
¿Cuáles son las superfamilias de las Proteínas G monoméricas?
- Superfamilia Ras - GTPasas de síntesis proteica y traslocación
57
¿Qué regulan las RGS?
Proteínas G3
58
¿Qué son los GEF?
Factores de intercambio de nucleótidos de guanina
59
¿Qué son las GDI?
Inhibidoras de disociación del nucleótido GDP o la actividad GTPasa
60
¿Qué son las GAP?
Proteínas activadoras de la actividad GTPasa, regulan G monoméricas
61
¿Qué tipo de proteínas G regulan las RGS?
G heteroméricas
62
¿Qué tipo de proteínas G regulan las GAP?
G monoméricas
63
¿Cuántas cargas negativas aporta la fosforilación de proteínas?
2
64
La fosforilación permite interacciones específicas con...
- Grupos amida libres sucesivos en N-ter de una hélice alpha - 2 N en grupo guanidino de Arg
65
Sitios de unión de la fosforilación:
1. Tyr 2. Ser 3. Tre
66
¿PTEN es una proteína kinasa o fosfatasa?
Fosfatasa
67
¿Qué dominio del RPTP tiene actividad catalítica?
El dominio citosólico
68
¿Qué inactiva el dominio fosfatasa en las RPTP?
La unión del ligando
69
La actividad de las RPTP puede ser inhibida por ... del receptor.
Dimerización
70
Las PTP son...
Tirosina fosfatasas
71
A través del complejo del poro nuclear (CPN) pueden pasar moléculas por...
- Difusión facilitada - Transporte activo
72
La clase más prominente de proteínas de transporte nuclear son las...
Karioferinas
73
¿Qué significa NLS?
Secuencia de localización nuclear
74
El transporte nuclear se controla por...
- Proteínas lanzadera - Proteína G Ran
75
¿Dónde hay más proporción de Ran-GTP?
En el núcleo
76
¿Dónde hay más Ran-GDP?
En el citosol
77
Algunos sitios de reconocimiento palindrómico unen...
Dímeros
78
La forma activa de un TF típico es un...
Dímero
79
La dimerización de las proteínas reguladoras transcripcionales reduce las posibilidades de...
Apareamientos aleatorios e incrementa la especificidad y la afinidad de unión del regulador
80
Las repeticiones directas son regiones de reconocimiento del DNA...
Específicas
81
Las proteínas que unen DNA como dímeros u oligómeros pueden formar...
Lazos en el DNA
82
Los complejos de reordenamiento de la cromatina contienen siempre...
ATPasa
83
Indica 3 dominios de unión al DNA:
1. HTH (hélice-giro-hélice) 2. Dedos de Zinc 3. Cremallera de leucina
84
Las proteínas que se unen al surco menor causan...
Una curvatura (doblamiento) en el DNA
85
¿Todos los factores de transcripción son proteínas reguladoras génicas?
No
86
¿Pueden los TF regular la expresión génica por sí mismos?
No. Precisan la asistencia de coactivadores/correpresores
87
¿Los elementos promotores basales son específicos o generales?
Generales
88
Hay 3 tipos de secuencias promotoras:
1. Elementos promotores basales 2. Elementos promotores proximales 3. Elementos promotores distales
89
Los factores de transcripción pueden ser fosforilados por:
1. RTK 2. PK activadas por 2 mensajeros 3. Cascadas de múltiples PK
90
Cuando veo un elemento de respuesta pienso en...
Una secuencia CIS reguladora que une un factor específico
91
Los TF contienen por lo menos 3 dominios:
1. RB 2. DBD 3. TAD
92
El RD es el dominio...
Regulador
93
El BDB es el dominio...
De unión al ligando
94
El TAD es el dominio...
Transactivante
95
Las secuencias de DBD suelen contener motivos estructurales como...
Dedos de Zinc o Cremalleras de Leucina