Tema 2.1 Flashcards
1
Q
Qué es el superenrollamiento?
A
Propiedad topológica intrínseca de la estructura 3ª del DNA
2
Q
Qué es el empaquetamiento?
A
Plegamiento o compactación de la molécula de DNA debido a la asociación con proteínas, para dar lugar a nucleoproteínas
3
Q
Cómo se compacta el DNA en eucariotas?
A
- Neutralización de sus cargas negativas
- Superenrollamiento
- Empaquetamiento
Se neutraliza por medio de cationes divalentes como el Mg o poliaminas (derivados de la ornitina)
4
Q
Cual es una propiedad topológica intrínseca de la estructura terciaria del DNA?
A
El superenrollamiento
5
Q
Qué enzimas regulan el superenrollamiento?
A
Las topoisomerasas
6
Q
En qué tipo de DNA las dos hebras no se pueden separar sin romper un enlace covalente?
A
En el DNA circular cerrado covalentemente
7
Q
El superenrollamiento aparece en DNAs cerrados…
A
DNAccc y DNAs lineales con extremos anclados que no están libres para girar
8
Q
Un DNA está relajado cuando…
A
No hay enrollamiento neto del eje sobre sí mismo y no hay cortes en las hebras
9
Q
Cuánto rota un DNA con un extremo libre?
A
1 vuelta por cada 10 pb abiertos
10
Q
Por qué están limitados topológicamente los DNA lineales de cromosomas eucarióticos?
A
- Longitudes extremas
- Incorporación a la cromatina (interacción con proteínas)
- Interacción con otros componentes celulares
11
Q
Qué es el Lk?
A
El número de veces que 2 círculos están entrelazados. Es una propiedad topológica invariante en un DNAcc
12
Q
Cuándo no es posible definir Lk?
A
Cuando las hebras están completamente separadas
13
Q
Podemos encontrar Lk negativo en el DNA?
A
No
14
Q
Cómo están superenrollados los DNAs circulares purificados de bacterias y eucariotas?
A
Negativamente
15
Q
Cómo se relaciona Lk con Tw y Wr?
A
Lk = Tw + Wr
16
Q
¿Cuánto rota el DNA2C con un extremo libre?
A
1 vuelta por cada 10 pb
17
Q
El desenrollamiento de una vuelta helicoidal en fragmentos de DNA lineales de cromosomas genera…
A
Tensión superhelicoidal, abriendo la hélice
18
Q
¿Puede tener decimales Lk?
A
No, debe ser un número íntegro
19
Q
Si Lk es distinto de 0 significa que…
A
Que existen enlaces topológicos
20
Q
Si Lk es igual a 0 quiere decir que…
A
Las hebras no están unidas, no hay enlace topológico.
21
Q
Características del DNA lineal
A
- Tiene los extremos libres
- Puede rotar libremente
- Lk = 0
- Las dos hebras pueden separarse (sin romper enlaces covalentes)
22
Q
¿Por qué están topológicamente limitados los DNA lineales de cromosomas eucarióticos?
A
- Longitudes extremas
- Interacción con otros componentes celulares
23
Q
DNAccc significa
A
DNA circular covalentemente cerrado
24
Q
En los DNAccc…
A
- No hay rotura en ninguna de las hebras
- Las 2 hebras no pueden ser separadas sin romper un enlace covalente (Lk distinto de 0).
25
En el DNA relajado...
- No hay enrollamiento neto del eje sobre sí mismo
- No hay cortes en las hebras (sin roturas) --> DNAccc
26
¿Qué introduce el desenrollamiento del DNA circular?
Superenrollamientos negativos
27
Características del DNA 2C circular cerrado (relajado):
- El mismo nº de vueltas de hélice que el DNA lineal
- Igual nº de pb/vuelta que el DNA lineal del que procede
28
¿Cómo es el Lk del DNA-B?
Definible (Lk distinto de 0, Lk = 25)
29
Si el nº de vueltas de hélice disminuye, el nº de pb/vuelta...
Aumenta
30
Si el mismo DNA se sobreenrollase...
La tensión estructural se podría relajar formando un superenrollamiento positivo (menor nº de pb/vuelta y mayor nº de vueltas de hélice)
31
¿Cómo se cuantifica la diferencia de enlace?
Lk - Lko
32
¿Cómo se obtiene el valor de Lk?
Dividiendo el nº de pb totales por el nº de pb por vuelta (10.5 en el DNA-B)
33
Si las hebras se entrelazan de forma dextrógira Lk tendrá un valor...
Positivo
34
¿Cómo se calcula la densidad superhelicoidal?
Dividiendo la diferencia de Lk entre Lko
35
La densidad superhelicoidal es independiente de...
La longitud del DNA
36
¿Qué mide la densidad superhelicoidal?
El nº de vueltas eliminadas en relación al nº presente en el DNA relajado
37
Las moléculas de DNA circulares purificadas de bacterias y eucariotas están usualmente superenrolladas...
Negativamente y tienen valores de densidad superhelicoidal de 6%
38
¿Cuáles son los componentes geométricos de Lk?
Tw y Wr
39
En el DNA relajado Tw y Lk...
Coinciden, Lk = Tw
40
En un DNAcc o un fragmento lineal constreñido en sus extremos Lk es ... , pero Tw y Wr...
Constante, varían según la relación Lk = Tw + Wr
41
Para cambiar el valor de Lk se requiere la acción de enzimas...
Topoisomerasas
42
La acción de las topoisomerasas crea isómeros...
Topológicos
43
¿Los isómeros geométricos requieren la acción de algún enzima para interconvertirse?
No
44
La tensión de los superenrollamientos se puede relajar "in vitro" introduciendo una mella por medio de una enzima...
DNAsa
45
Los DNAs superenrollados pueden adoptar 2 formas...
Toroidal (solenoidal) y entrelazada (plectonémica)
46
En la cromatina encontramos la forma ... del DNA superenrollado
Toroidal (solenoidal)
47
El eje longitudinal en el superenrollamiento toroidal...
Se enrosca de forma cilíndrica
48
El eje longitudinal en el superenrollamiento entrelazado...
Se enrosca sobre sí mismo
49
El DNA aislado suele adoptar la forma...
Entrelazada o plectonémica
50
La forma más observada en el DNA aislado es la...
Plectonémica o entrelazada
51
Los DNAs con superenrollamientos plectonémicos o toroidales son topológicamente...
Equivalentes (propiedades geométricas interconvertibles)
52
En el DNA superenrollado positivamente la forma toroidal presenta espirales de DNA ...
Dextrógiras
53
Las formas entrelazadas del DNA superenrollado negativa o positivamente giran de forma...
Opuesta a la solenoidal
54
¿Qué forma es la más compacta; la solenoidal o la plectonémica?
La solenoidal
55
Los valores negativos de Wr se corresponden con enrrollamiento ... en un solenoide, pero ... en una estructura plectonémica.
Levógiro, dextrógiro
56
El DNA solenoidal puede aparecer de 2 formas:
1. Enrollamiento alrededor del octámero de histonas (solenoide levógiro)
2. Proteínas condensinas que participan en la formación de cromosomas mitóticos (solenoide positivo)
57
¿Dónde tiende a localizarse el DNA intrínsicamente curvado?
En los extremos de los superenrollamientos
58
¿Qué facilita el desenrollamiento del DNA?
La separación parcial de hebras necesarias para promover la formación de estructuras cruciformes.
59
El desenrollamiento de la hélice dextrógira del DNA facilita la formación...
De tramos cortos de DNA-Z levógiro
60
¿En qué secuencias suelen producirse tramos de DNA-Z levógiro?
Secuencias con alternancia de purinas (sin) y pirimidinas (anti), especialmente con residuos de C y G
61
¿Cuáles son las topoisomerasas de tipo I en E. coli?
La I y la III
62
¿Qué hacen las topoisomerasas de tipo I en E. coli?
- Roturas monocatenarias
- Relajan el DNA eliminando superenrollamientos negativos
- Aumental Lk de uno en uno
63
¿Cuáles son las topoisomerasas de tipo II de E. coli?
La II y la IV
64
¿Qué hacen las topoisomerasas de tipo II en E. coli?
- Roturas bicatenarias
- Introducen superenrollamientos negativos
- Reducen Lk de dos en dos
- Utilizan ATP
65
¿Alguna topoisomerasa de eucariotas introduce superenrollamientos negativos?
No
66
¿Cuántos tipos de topoisomerasas tienen las eucariotas?
- Tipo I (I y III)
- Tipo II (II alpha y II beta)
67
Características de las topoisomerasas eucarióticas
- No pueden desenrollar el DNA
- Pueden relajar los superenrollamientos negativos y positivos
- Son enzimas diméricas (a veces tetraméricas)
68
En las células tumorales las topoisomerasas se expresan...
A altos niveles
69
Sin la acción de las topoisomerasas la célula no puede...
Replicar o empaquetar su DNA o expresar sus genes y muere
70
¿Para qué emplean ATP las topoisomerasas tipo II de E. coli?
Para provocar cambios conformacionales del complejo DNA-topoisomerasa
71
¿Qué enzimas desanudan y desenmarañan moléculas de DNA?
Las topoisomerasas
72
Los únicos organismos encontrados con el DNA superenrollado positivamente son...
Microorganismos termófilos
73
¿Qué enzima emplean los organismos termófilos para mantener al DNA sin desnaturalizar a elevadas temperaturas?
DNA girasa inversa que es capaz de aumentar Lk
74
¿Una molécula de DNA superenrollado migrará más o menos rápido en una matriz de gel?
Más rápido
75
¿El DNA circular superenrollado es más o menos compacto que el DNA relajado?
Más compacto
76
El superenrollamiento negativo del DNA favorece los procesos de...
Desenrollamiento como la replicación y transcripción
77
Siempre que se abra una región de una hélice se eliminan los superenrollamientos ... del DNA, ... la tensión helicoidal
Negativos, reduciendo
78
En bacterias la actividad de la ... introduce superenrollamientos ... de forma continua en el DNA
DNA girasa, negativos
79
¿Los superenrollamientos positivos se generan por delante o por detrás de la enzima de replicación?
Por delante
80
¿Los superenrollamientos negativos se generan por delante o por detrás de la enzima de replicación?
Por detrás
81
Características del DNA superenrollado positivamente
- En microorganismos termófilos
- Compacta el DNA
- Dificulta la apertura de hebras
- Ayuda a mantener al DNA sin desnaturalizar a altas temperaturas.
- Usan una DNA girasa especial (inversa) capaz de aumentar Lk
82
¿En qué fase del ciclo celular ocurre la condensación del DNA nuclear?
En la interfase
83
¿En qué fase del ciclo celular el DNA está en forma de doble hélice extendida?
En la fase S
84
¿En qué fase del ciclo celular el DNA está en forma de cromatina o cromosoma?
En la fase G2
85
¿Cuándo comienza el proceso de descondensación de la cromatina?
Después de la división celular (fase M) y continua durante la fase G1.
86
¿En qué fase no se produce división celular?
En la fase Go (quiescencia)
87
¿Por qué está formada la cromatina?
Por DNA unido a proteínas histonas y no histonas
88
La masa de las proteínas histona es igual a la...
Masa de proteínas NO histonas
89
La cromatina contiene una cantidad significativa de...
RNA asociado
90
¿Cuál es el primer nivel de empaquetamiento del DNA?
La unión del DNA a las proteínas histonas (proteínas básicas)
91
Función de las histonas
Estabilizar la estructura del DNA y contribuir a su compactación
92
Las histonas son ricas en aminoácidos...
Lys y Arg
93
Las histonas a pH fisiológico están cargadas...
Positivamente (básicas)
94
¿Con qué se neutralizan las histonas?
Con las cargas negativas de los P del DNA
95
¿La isoforma H5 tiene más o menos afinidad por la cromatina?
Más afinidad que la H1
96
¿Cuáles son las proteínas básicas no histonas?
Las protaminas
97
¿Cuáles son las proteínas ácidas no histonas?
Las HMG (high movility group)
98
¿Qué enzimas digieren a los nucleosomas?
Las desoxirribonucleasas
99
¿Qué es el cromatosoma?
La H1 + nucleosoma
100
¿Cómo afectan las altas concentraciones salinas a las histonas?
Con la disociación por cambio de fuerza iónica
101
¿Cuál es la subunidad de toda la cromatina?
El nucleosoma
102
¿Cuántas pares de bases tiene un nucleosoma?
200 pb
103
¿Cuántas vueltas da el DNA alrededor del nucleosoma?
1,7 vueltas
104
El octámero de histona tiene una estructura de...
Un tetrámero H3-H4 asociado con dos dímeros H2A-H2B
105
El nucleosoma forma una estructura de...
Solenoide levógiro
106
¿Qué histonas están muy conservadas?
Las H3 y H4
107
¿Dónde se encuentran más residuos básicos en los nucleosomas?
En las colas N-terminales del primer tramo de la proteína
108
¿Qué tipo de plegamiento tienen las proteínas histonas?
Hélices alpha
109
¿Qué parte de la histona se une directamente al DNA asociado al nucleosoma?
El dominio plegamiento histona
110
¿Cuál es la histona más básica?
La H1
111
Dominios de la H1
1. Globular (central)
2. N-terminal corto
3. C-terminal largo (rico en Lys y Arg)
112
¿El extremo N-terminal de la H1 es corto o largo?
Corto
113
¿El extremo C-terminal de la H1 es corto o largo?
Largo
114
¿Cuál es la histona menos conservada en la evolución?
La H1
115
¿Qué es el DNA ligador o linker?
Es el que se encuentra entre un cromatosoma y otro, está desnudo.
116
¿Cómo se disponen los nucleosomas?
En forma de cuentas de collar
117
Las colas N-terminal de las histonas sobresalen del core y se pueden modificar de forma...
Covalente y reversiblemente
118
Las colas N-terminal que sobresalen de las histonas...
- Estabilizan el enrollamiento del DNA alrededor del octámero
- Interactúan con cromosomas adyacentes
- Ayudan a definir el empaquetamiento de orden superior
119
La H1 también se puede modificar...
Covalentemente
120
Las histonas nucleosomales muestran diferentes modificaciones...
Postraduccionales covalentes en sus extremos N-terminal
121
¿En qué residuos de las histonas suele darse la acetilación?
En los de Lys
122
¿En qué grupo de la Lys se suelen dar las modificaciones?
En el épsilon-amino
123
Las modificaciones covalentes postraduccionales de histonas forman parte del control...
Epigenético de la expresión génica
124
Las modificaciones covalentes postraduccionales de histonas crean sitios de unión para...
Proteínas no histonas
125
Todas las modificaciones de histonas son...
Reversibles
126
Una modificación puede ser... o mantenerse ... a través de múltiples divisiones celulares
Transitoria, estable
127
Algunas modificaciones cambian de ... a las moléculas
Carga
128
Los residuos modificados son sitios de ... e ... con dominios proteicos de proteínas no histonas reclutadas específicamente que interactúan con la cromatina.
Reconocimiento e interacción
129
¿En qué regiones suelen ocurrir la mayoría de modificaciones covalentes?
En las N-terminal
130
¿Qué modificaciones covalentes pueden sufrir las colas terminales de las histonas?
- Acetilación
- Metilación
- Fosforilación
- Ubiquitinación
- Sumoilación
- ADP-ribosilación
131
¿Qué modificación experimental los residuos de Arg?
Metilación
132
¿La fosforilación de qué residuos confiere carga negativa a las histonas?
Serina o Treonina
133
¿Con qué modificación se neutraliza la carga positiva de la Lys?
Acetilación
134
¿Qué les pasa a las cargas de la Lys y la Arg con la metilación?
Que retienen sus cargas positivas
135
¿Cómo puede ser metilada la Lys?
Mono-, di- o trimetilada
136
¿Cómo puede ser metilada la Arg?
Mono- o dimetilada
137
¿A qué pueden afectar las modificaciones covalentes postraduccionales de las regiones N-terminal de las histonas?
A la interacción de histonas con nucleosomas adyacentes o con el DNA y a la unión de proteínas reguladoras
138
¿La metilación de histonas implica la pérdida de sus cargas positivas?
No
139
El incremento de la metilación de histonas incrementa...
La hidrofobicidad y el radio del catión metilamonio
140
¿La cola C-terminal de las H2A y H2B sufre modificaciones?
No
141
¿Qué implica el código de histonas?
Combinaciones específicas de modificaciones postranscripcionales en diferentes regiones de cromatina que influyen en la función de la cromatina creando o eliminando sitios de unión a proteínas asociadas a la cromatina
142
¿Qué cambia la acetilación?
Un átomo de H del grupo amino libre de la Lys por un grupo acetilo
143
La acetilación provoca...
Que dejen de interaccionar los nucleosomas, volviéndose menos condensados
144
La acetilación promueve la...
Desagregación de los nucleosomas vecinos
145
¿Qué enzima cataliza la acetilación?
Histona/lisina acetil transferasa (HAT) o lisina acetil transferasa (KAT) o simplemente acetilasa
146
¿Qué enzima cataliza la desacetilación?
La histona/lisina desacetilasa (HDAC/KDAC) o desacetilasa
147
¿Qué sustrato emplean las acetilasas?
Acetil-CoA
148
¿Qué son los bromodominios?
Dominios proteicos que reconocen e interactúan con lisinas acetiladas
149
¿Qué hace que el complejo lector se una a la cromatina?
Una combinación específica de marcas de histonas que reconoce
150
Los bromodominios aparecen en...
Proteínas lectoras
151
¿A partir de qué se puede generar Acetil-CoA?
De citrato o de piruvato
152
¿Dónde se produce principalmente el acetil-CoA?
En la mitocondria
153
¿Qué proceso metabólico proporciona más acetil-CoA?
La glucólisis y la oxidación de los ácidos grasos
154
¿Qué complejo oxida Piruvato para dar Acetil-CoA?
La piruvato deshidrogenasa (PDC)
155
¿Cómo sale el Acetil-CoA de la mitocondria?
En forma de citrato
156
¿La PDC puede salir de la mitocondria?
Sí, y localizarse en el núcleo
157
¿Qué enzima produce citrato?
Citrato sintasa (CS)
158
¿Qué productos genera la ATP-citrato liasa (ACL)?
Acetil-CoA y oxalacetato
159
¿Qué enzima genera Acetil-CoA empleando acetato como sustrato?
La acetil-CoA sintetasa (ACS)
160
¿Qué enzimas controlan el equilibrio de acetilación de las histonas?
Las KAT y las KDAC
161
¿Cuáles son las principales histonas acetiladas?
Las H3 y H4
162
Las formas hiperacetiladas de las histonas se asocian a...
Genes activos (sensibles a DNasa I)
163
Las formas hipoacetiladas de las histonas se asocian a...
Regiones transcripcionalmente inactivas
164
¿Las histonas core se modifican antes o después de que se ensamblen?
Antes
165
¿Cuándo se eliminan los grupos acetilo de las histonas core?
Después de que se ensamblan en la cromatina
166
Las histonas core recién sintetizadas llevan...
Patrones específicos de acetilación que se retiran una vez ensambladas en la cromatina
167
¿Qué son los cronodominios?
Dominios proteicos que reconocen e interactúan con Lys metiladas
168
¿De dónde procede el grupo metilo de la metilación?
De la coenzima S-adenosilmetionina (S-AdoMet)
169
¿Qué enzima cataliza la metilación de las Arg?
La proteína arginina metiltrans-ferasa (PRMTs)
170
¿En cuántos residuos se puede metilar una única molécula de histonas?
En uno, ninguno o múltiples residuos específicos
171
Las HMT con dominios SET metilan...
Colas de histonas
172
Las HMT sin dominios SET metilan...
Histonas core
173
¿La metilación de qué aminoácidos activa la transcripción?
De Arg y Lys
174
La metilación de otras Lys hace a la cromatina...
Más empaquetada, inhibiendo su transcripción
175
¿Qué catalizan las PMRTs de tipo I?
La dimetilación asimétrica
176
¿Qué catalizan las PMRTs de tipo II?
La dimetilación simétrica
177
¿Quién lleva a cabo la desmetilación de la Arg?
La proteína arginina desmetilasa (PAD)
178
¿Se puede metilar una Lys acetilada?
No
179
¿Se puede acetilar una Lys metilada?
No
180
¿Qué elimina la acetilación de una Lys?
Una carga positiva
181
¿Qué hace el dominio de unión Tudor?
Une Arg metiladas y Lys
182
¿Cuántos tipos de histonas desmetilasas hay?
Dos:
- KDM/LSD1
- Desmetilasas con dominios Jumonji
182
¿Cuántos tipos de histonas desmetilasas hay?
Dos:
- KDM/LSD1
- Desmetilasas con dominios Jumonji
183
¿Quién cataliza la desmetilación de Lys?
Las histonas desmetilasas
184
¿De qué es dependiente KDM/LSD1?
De FAD
185
¿Qué desmetilan las KDM/LSD1?
Lys-mono y dimetiladas
186
¿Qué desmetilan las desmetilasas con dominios Jumonji?
Lys-mono, di y trimetiladas
187
¿Quién cataliza la desmetilación de Arg?
Proteína arginina desmetilasa (PAD)
188
¿Qué aminoácido origina la PAD?
Citrulina
189
¿Quién es el donante universal de grupos metilo?
SAM
190
¿Dónde metila la DMT al DNA?
En la posición 5' de la C (5mC)
191
¿En qué aminoácidos se produce la fosforilación de histonas?
En la Ser y Tre y Tyr
192
¿En qué afecta la fosforilación a las histonas?
- Interacciones con el DNA
- Interacciones con otras histonas en nucleosomas adyacentes
- Interacciones con proteínas reguladoras
193
La fosforilación selectiva de Ser promueve la...
Interacción de histonas con HAT y HMT
194
¿Quién lleva a cabo la fosforilación de las histonas?
Las proteína kinasas (PK)
195
¿Quién lleva a cabo la desfosforilación de las histonas?
Las proteína fosfatasas (PP)
196
La fosforilación promueve...
- Activación transcripcional
- Represión transcripcional
*Según su localización
197
¿A qué extremo se une la ubiquitina?
Al C-terminal
198
¿Qué es la ubiquitinación de histonas?
La unión covalente (isopeptídica) entre la Gly C-terminal de la ubiquitina y el épsilon-amino de un residuo de Lys de la hsitona, formando una molécula ramificada
199
¿En qué histonas se realiza la mono-Ub?
En las H2A y H2B
200
¿La ubiquitinación aumenta o reduce las cargas positivas de las histonas?
Las reduce
201
¿La mono-Ub reversible de Lys activa la degradación proteolítica?
No
202
¿Qué ubiquitinación es más frecuente en las histonas?
La mono-Ub
203
¿Por quién está catalizada la ubiquitinación?
Por E3 ligasas específicas
204
¿Por quién está catalizada la desubiquitinación?
Por enzimas isopeptídicas desubiquitinizantes (DUBs)
205
¿Qué son las DUBs?
Son proteasas especializadas sobre proteínas de alto pm que rompen el enlace isopeptídico entre un grupo amino de Lys y el C-ter de la Ub
206
¿Qué se inhibe al metilar la H2A?
La elongación transcripcional al reprimir el reclutamiento de FACT por pausa de la RNA pol II y la transcripción
207
La metilación de la Lys de la H3 provoca...
La activación del reclutamiento de FACT activando la elongación transcripcional
208
La metilación de la H2B está asociada a la...
Expresión génica
209
¿Qué provoca la sumoilación?
Cambia la forma de actuar de la proteína
210
¿A qué se une SUMO?
Se une reversiblemente a FT y numerosas proteínas reguladoras de la estructura de la cromatina
211
¿Dónde desempeña principalmente su función SUMO?
En el núcleo
212
¿En qué histonas ocurre la sumoilación?
En todas las histonas core, en las Lys
213
¿Qué es la ADP-ribosilación?
Es la unión reversible de uno o más restos de ADP-ribosa a una proteína
214
¿Cuál es la fuente de ADP-ribosa para la ADP-ribosilación?
El cofactor redox. NAD+
215
¿Qué dos tipos de modificaciones realiza la ADP-ribosiltransferasa?
mono-ADP-ribosilación y poli-ADP-ribosilación
216
¿Qué es la MARilación?
La adición de 1 residuo de ADP-ribosa
217
¿Qué es la PARilación?
La adición de múltiples residuos de ADP-ribosa
218
¿Qué resto se produce en la PARilación y la MARilación?
Nicotinamida
219
¿En respuesta a qué se produce la MARilación?
Al estrés genotóxico
220
¿Qué sustrato emplea la lactilación?
El lactato
221
¿Qué histona se puede modificar covalentemente por la adición de un residuo de azúcar?
La H2B
222
¿Qué promueve la N-acetil-glucosaminación de la histona H2B?
La ubiquitinación de la histona H2B y la metilación de la H3
223
¿Qué factores forman parte de la regulación epigenética de la cromatina?
- Modificaciones covalentes de histonas
- Metilación de citosinas
224
¿Cuál es la única histona que no posee variantes no alélicas?
H4
225
¿En qué fase del ciclo celular se sintetizan las histonas principales?
En la fase S
226
¿En qué fase del ciclo celular se sintetizan las variantes de histonas?
En la interfase
227
¿Dónde se insertan las variantes de las histonas?
En la cromatina ya formada
228
La H1 promueve el reclutamiento de...
DMT
229
Las DMT inhiben el reclutamiento de...
HMT
230
La variante de histona H3.3 inhibe el reclutamiento de...
H1, promoviendo una estructura abierta de cromatina
231
¿Qué provoca la fosforilación de la H1?
La activación de la cromatina por desplegamiento
232
La heterocromatina es...
Inactiva
233
La eucromatina es...
Activa
234
En la eucromatina la H1 está...
Fosforilada
235
¿Quién fosforila la H1?
H1K (histona 1 kinasa) y PKA
236
¿La fosforilación de la H1 es reversible?
Sí, por las fosfatasas
237
¿Qué activa la PKA?
El glucagón
238
Los nucleosomas introducen superenrollamientos ... en eucariotas
Negativos
239
¿Las células eucariotas tienen enzimas que desenrollen el DNA?
No
240
¿Qué requiere el fuerte enrollamiento del DNA alrededor del octámero de histonas?
La eliminación de 1 vuelta helicoidal
241
¿Qué tipo de densidad superhelicoidal introduce el empaquetamiento del DNA en los nucleosomas?
Negativa
242
El enrollamiento del DNA alrededor del octámero de histonas produce un solenoide...
Levógiro
243
Las condensinas afectal al Wr formando grandes solenoides...
Positivos
244
La mayor parte del tiempo los nucleosomas presentan una estructura de octasoma tipo...
L-octasoma
245
¿Qué histonas se separan en el tetrasoma?
H2A y H2B
246
¿Cuántas vueltas mantiene un tetrasoma?
Menos de una
247
¿Cuántas vueltas contiene un hexasoma?
Más de una vuelta
248
¿En qué cromatina aparecen los hemisomas?
Cromatina centromérica
249
¿Cuántos pb contiene un nucleosoma?
147 pb
250
¿Dónde se produce la unión más fuerte en las histonas?
En los dominios de plegamiento del tetrámero (H3-H4)
251
¿Dónde se produce la unión más débil en las histonas?
En los dímeros H2A-H2B
252
¿Qué estabilizan las colas N-ter de las histonas?
En enrollamiento del DNA alrededor del octámero
253
Todos los sitios de contacto entre las histonas y el DNA implican...
-Surco menor
- Esqueleto P
254
El posicionamiento del nucleosoma puede ser
- Extrínseco
- Intrínseco
255
El posicionamiento del nucleosoma puede estar dirigido por...
- Extrínseco: Proteínas que se unen al DNA (DNA-BP)
- Intrínseco: Secuencias particulares del DNA y sitios hipersensibles
256
Los nucleosomas se forman preferencialmente sobre el DNA que...
Se curva fácilmente
257
¿Qué secuencias de bases tienden a curvar el DNA?
A:T
258
¿Qué son los sitios hipersensibles?
Regiones de DNA libres de nucleosomas
259
¿El DNA de un nucleosoma aislada está disponible para la unión de proteínas?
Sí
260
¿Quién cataliza el deslizamiento del nucleosoma?
Las CRC-ATP-dependientes
261
¿El deslizamiento de las histonas implcia gasto de ATP?
Sí
262
La remodelación de la cromatina puede producir:
1. Cambio conformacional del DNA en la superficie del octámero (más expuesto)
2. Desplazamiento del octámero
3. Reemplazamiento de histonas
4. Eliminación parcial de histonas
5. Eliminación total del octámero
263
¿Qué son las chaperonas?
Proteínas cargadas negativamente que forman complejos con dímeros H3-H4 o H2A-H2B y lso escoltan a los sitios de ensamblaje
264
¿Qué son las poliaminas?
Derivados de la ornitina
265
¿Cómo es el DNA de muchos cromosomas bacterianos y virales?
DNA circular cerrado
266
Los DNAcc cuando se purifican raramente están...
Relajados
267
¿Qué es una propiedad topológica del DNA?
Aquella que no cambia cuando se distorsiona (sin rasgarse o romperse)
