Tema 2.1 Flashcards
Qué es el superenrollamiento?
Propiedad topológica intrínseca de la estructura 3ª del DNA
Qué es el empaquetamiento?
Plegamiento o compactación de la molécula de DNA debido a la asociación con proteínas, para dar lugar a nucleoproteínas
Cómo se compacta el DNA en eucariotas?
- Neutralización de sus cargas negativas
- Superenrollamiento
- Empaquetamiento
Se neutraliza por medio de cationes divalentes como el Mg o poliaminas (derivados de la ornitina)
Cual es una propiedad topológica intrínseca de la estructura terciaria del DNA?
El superenrollamiento
Qué enzimas regulan el superenrollamiento?
Las topoisomerasas
En qué tipo de DNA las dos hebras no se pueden separar sin romper un enlace covalente?
En el DNA circular cerrado covalentemente
El superenrollamiento aparece en DNAs cerrados…
DNAccc y DNAs lineales con extremos anclados que no están libres para girar
Un DNA está relajado cuando…
No hay enrollamiento neto del eje sobre sí mismo y no hay cortes en las hebras
Cuánto rota un DNA con un extremo libre?
1 vuelta por cada 10 pb abiertos
Por qué están limitados topológicamente los DNA lineales de cromosomas eucarióticos?
- Longitudes extremas
- Incorporación a la cromatina (interacción con proteínas)
- Interacción con otros componentes celulares
Qué es el Lk?
El número de veces que 2 círculos están entrelazados. Es una propiedad topológica invariante en un DNAcc
Cuándo no es posible definir Lk?
Cuando las hebras están completamente separadas
Podemos encontrar Lk negativo en el DNA?
No
Cómo están superenrollados los DNAs circulares purificados de bacterias y eucariotas?
Negativamente
Cómo se relaciona Lk con Tw y Wr?
Lk = Tw + Wr
¿Cuánto rota el DNA2C con un extremo libre?
1 vuelta por cada 10 pb
El desenrollamiento de una vuelta helicoidal en fragmentos de DNA lineales de cromosomas genera…
Tensión superhelicoidal, abriendo la hélice
¿Puede tener decimales Lk?
No, debe ser un número íntegro
Si Lk es distinto de 0 significa que…
Que existen enlaces topológicos
Si Lk es igual a 0 quiere decir que…
Las hebras no están unidas, no hay enlace topológico.
Características del DNA lineal
- Tiene los extremos libres
- Puede rotar libremente
- Lk = 0
- Las dos hebras pueden separarse (sin romper enlaces covalentes)
¿Por qué están topológicamente limitados los DNA lineales de cromosomas eucarióticos?
- Longitudes extremas
- Interacción con otros componentes celulares
DNAccc significa
DNA circular covalentemente cerrado
En los DNAccc…
- No hay rotura en ninguna de las hebras
- Las 2 hebras no pueden ser separadas sin romper un enlace covalente (Lk distinto de 0).
En el DNA relajado…
- No hay enrollamiento neto del eje sobre sí mismo
- No hay cortes en las hebras (sin roturas) –> DNAccc
¿Qué introduce el desenrollamiento del DNA circular?
Superenrollamientos negativos
Características del DNA 2C circular cerrado (relajado):
- El mismo nº de vueltas de hélice que el DNA lineal
- Igual nº de pb/vuelta que el DNA lineal del que procede
¿Cómo es el Lk del DNA-B?
Definible (Lk distinto de 0, Lk = 25)
Si el nº de vueltas de hélice disminuye, el nº de pb/vuelta…
Aumenta
Si el mismo DNA se sobreenrollase…
La tensión estructural se podría relajar formando un superenrollamiento positivo (menor nº de pb/vuelta y mayor nº de vueltas de hélice)
¿Cómo se cuantifica la diferencia de enlace?
Lk - Lko
¿Cómo se obtiene el valor de Lk?
Dividiendo el nº de pb totales por el nº de pb por vuelta (10.5 en el DNA-B)
Si las hebras se entrelazan de forma dextrógira Lk tendrá un valor…
Positivo
¿Cómo se calcula la densidad superhelicoidal?
Dividiendo la diferencia de Lk entre Lko
La densidad superhelicoidal es independiente de…
La longitud del DNA
¿Qué mide la densidad superhelicoidal?
El nº de vueltas eliminadas en relación al nº presente en el DNA relajado
Las moléculas de DNA circulares purificadas de bacterias y eucariotas están usualmente superenrolladas…
Negativamente y tienen valores de densidad superhelicoidal de 6%
¿Cuáles son los componentes geométricos de Lk?
Tw y Wr
En el DNA relajado Tw y Lk…
Coinciden, Lk = Tw
En un DNAcc o un fragmento lineal constreñido en sus extremos Lk es … , pero Tw y Wr…
Constante, varían según la relación Lk = Tw + Wr
Para cambiar el valor de Lk se requiere la acción de enzimas…
Topoisomerasas
La acción de las topoisomerasas crea isómeros…
Topológicos
¿Los isómeros geométricos requieren la acción de algún enzima para interconvertirse?
No
La tensión de los superenrollamientos se puede relajar “in vitro” introduciendo una mella por medio de una enzima…
DNAsa
Los DNAs superenrollados pueden adoptar 2 formas…
Toroidal (solenoidal) y entrelazada (plectonémica)
En la cromatina encontramos la forma … del DNA superenrollado
Toroidal (solenoidal)
El eje longitudinal en el superenrollamiento toroidal…
Se enrosca de forma cilíndrica
El eje longitudinal en el superenrollamiento entrelazado…
Se enrosca sobre sí mismo
El DNA aislado suele adoptar la forma…
Entrelazada o plectonémica
La forma más observada en el DNA aislado es la…
Plectonémica o entrelazada
Los DNAs con superenrollamientos plectonémicos o toroidales son topológicamente…
Equivalentes (propiedades geométricas interconvertibles)
En el DNA superenrollado positivamente la forma toroidal presenta espirales de DNA …
Dextrógiras
Las formas entrelazadas del DNA superenrollado negativa o positivamente giran de forma…
Opuesta a la solenoidal
¿Qué forma es la más compacta; la solenoidal o la plectonémica?
La solenoidal
Los valores negativos de Wr se corresponden con enrrollamiento … en un solenoide, pero … en una estructura plectonémica.
Levógiro, dextrógiro
El DNA solenoidal puede aparecer de 2 formas:
- Enrollamiento alrededor del octámero de histonas (solenoide levógiro)
- Proteínas condensinas que participan en la formación de cromosomas mitóticos (solenoide positivo)
¿Dónde tiende a localizarse el DNA intrínsicamente curvado?
En los extremos de los superenrollamientos
¿Qué facilita el desenrollamiento del DNA?
La separación parcial de hebras necesarias para promover la formación de estructuras cruciformes.
El desenrollamiento de la hélice dextrógira del DNA facilita la formación…
De tramos cortos de DNA-Z levógiro
¿En qué secuencias suelen producirse tramos de DNA-Z levógiro?
Secuencias con alternancia de purinas (sin) y pirimidinas (anti), especialmente con residuos de C y G
¿Cuáles son las topoisomerasas de tipo I en E. coli?
La I y la III
¿Qué hacen las topoisomerasas de tipo I en E. coli?
- Roturas monocatenarias
- Relajan el DNA eliminando superenrollamientos negativos
- Aumental Lk de uno en uno
¿Cuáles son las topoisomerasas de tipo II de E. coli?
La II y la IV
¿Qué hacen las topoisomerasas de tipo II en E. coli?
- Roturas bicatenarias
- Introducen superenrollamientos negativos
- Reducen Lk de dos en dos
- Utilizan ATP
¿Alguna topoisomerasa de eucariotas introduce superenrollamientos negativos?
No
¿Cuántos tipos de topoisomerasas tienen las eucariotas?
- Tipo I (I y III)
- Tipo II (II alpha y II beta)
Características de las topoisomerasas eucarióticas
- No pueden desenrollar el DNA
- Pueden relajar los superenrollamientos negativos y positivos
- Son enzimas diméricas (a veces tetraméricas)
En las células tumorales las topoisomerasas se expresan…
A altos niveles
Sin la acción de las topoisomerasas la célula no puede…
Replicar o empaquetar su DNA o expresar sus genes y muere
¿Para qué emplean ATP las topoisomerasas tipo II de E. coli?
Para provocar cambios conformacionales del complejo DNA-topoisomerasa
¿Qué enzimas desanudan y desenmarañan moléculas de DNA?
Las topoisomerasas
Los únicos organismos encontrados con el DNA superenrollado positivamente son…
Microorganismos termófilos
¿Qué enzima emplean los organismos termófilos para mantener al DNA sin desnaturalizar a elevadas temperaturas?
DNA girasa inversa que es capaz de aumentar Lk
¿Una molécula de DNA superenrollado migrará más o menos rápido en una matriz de gel?
Más rápido
¿El DNA circular superenrollado es más o menos compacto que el DNA relajado?
Más compacto
El superenrollamiento negativo del DNA favorece los procesos de…
Desenrollamiento como la replicación y transcripción
Siempre que se abra una región de una hélice se eliminan los superenrollamientos … del DNA, … la tensión helicoidal
Negativos, reduciendo
En bacterias la actividad de la … introduce superenrollamientos … de forma continua en el DNA
DNA girasa, negativos
¿Los superenrollamientos positivos se generan por delante o por detrás de la enzima de replicación?
Por delante
¿Los superenrollamientos negativos se generan por delante o por detrás de la enzima de replicación?
Por detrás
Características del DNA superenrollado positivamente
- En microorganismos termófilos
- Compacta el DNA
- Dificulta la apertura de hebras
- Ayuda a mantener al DNA sin desnaturalizar a altas temperaturas.
- Usan una DNA girasa especial (inversa) capaz de aumentar Lk
¿En qué fase del ciclo celular ocurre la condensación del DNA nuclear?
En la interfase
¿En qué fase del ciclo celular el DNA está en forma de doble hélice extendida?
En la fase S
¿En qué fase del ciclo celular el DNA está en forma de cromatina o cromosoma?
En la fase G2
¿Cuándo comienza el proceso de descondensación de la cromatina?
Después de la división celular (fase M) y continua durante la fase G1.
¿En qué fase no se produce división celular?
En la fase Go (quiescencia)
¿Por qué está formada la cromatina?
Por DNA unido a proteínas histonas y no histonas
La masa de las proteínas histona es igual a la…
Masa de proteínas NO histonas
La cromatina contiene una cantidad significativa de…
RNA asociado
¿Cuál es el primer nivel de empaquetamiento del DNA?
La unión del DNA a las proteínas histonas (proteínas básicas)
Función de las histonas
Estabilizar la estructura del DNA y contribuir a su compactación
Las histonas son ricas en aminoácidos…
Lys y Arg
Las histonas a pH fisiológico están cargadas…
Positivamente (básicas)
¿Con qué se neutralizan las histonas?
Con las cargas negativas de los P del DNA
¿La isoforma H5 tiene más o menos afinidad por la cromatina?
Más afinidad que la H1
¿Cuáles son las proteínas básicas no histonas?
Las protaminas
¿Cuáles son las proteínas ácidas no histonas?
Las HMG (high movility group)
¿Qué enzimas digieren a los nucleosomas?
Las desoxirribonucleasas
¿Qué es el cromatosoma?
La H1 + nucleosoma
¿Cómo afectan las altas concentraciones salinas a las histonas?
Con la disociación por cambio de fuerza iónica
¿Cuál es la subunidad de toda la cromatina?
El nucleosoma
¿Cuántas pares de bases tiene un nucleosoma?
200 pb
¿Cuántas vueltas da el DNA alrededor del nucleosoma?
1,7 vueltas
El octámero de histona tiene una estructura de…
Un tetrámero H3-H4 asociado con dos dímeros H2A-H2B
El nucleosoma forma una estructura de…
Solenoide levógiro
¿Qué histonas están muy conservadas?
Las H3 y H4
¿Dónde se encuentran más residuos básicos en los nucleosomas?
En las colas N-terminales del primer tramo de la proteína
¿Qué tipo de plegamiento tienen las proteínas histonas?
Hélices alpha
¿Qué parte de la histona se une directamente al DNA asociado al nucleosoma?
El dominio plegamiento histona
¿Cuál es la histona más básica?
La H1
Dominios de la H1
- Globular (central)
- N-terminal corto
- C-terminal largo (rico en Lys y Arg)
¿El extremo N-terminal de la H1 es corto o largo?
Corto
¿El extremo C-terminal de la H1 es corto o largo?
Largo
¿Cuál es la histona menos conservada en la evolución?
La H1
¿Qué es el DNA ligador o linker?
Es el que se encuentra entre un cromatosoma y otro, está desnudo.
¿Cómo se disponen los nucleosomas?
En forma de cuentas de collar
Las colas N-terminal de las histonas sobresalen del core y se pueden modificar de forma…
Covalente y reversiblemente
Las colas N-terminal que sobresalen de las histonas…
- Estabilizan el enrollamiento del DNA alrededor del octámero
- Interactúan con cromosomas adyacentes
- Ayudan a definir el empaquetamiento de orden superior
La H1 también se puede modificar…
Covalentemente
Las histonas nucleosomales muestran diferentes modificaciones…
Postraduccionales covalentes en sus extremos N-terminal
¿En qué residuos de las histonas suele darse la acetilación?
En los de Lys
¿En qué grupo de la Lys se suelen dar las modificaciones?
En el épsilon-amino
Las modificaciones covalentes postraduccionales de histonas forman parte del control…
Epigenético de la expresión génica
Las modificaciones covalentes postraduccionales de histonas crean sitios de unión para…
Proteínas no histonas
Todas las modificaciones de histonas son…
Reversibles
Una modificación puede ser… o mantenerse … a través de múltiples divisiones celulares
Transitoria, estable
Algunas modificaciones cambian de … a las moléculas
Carga
Los residuos modificados son sitios de … e … con dominios proteicos de proteínas no histonas reclutadas específicamente que interactúan con la cromatina.
Reconocimiento e interacción
¿En qué regiones suelen ocurrir la mayoría de modificaciones covalentes?
En las N-terminal
¿Qué modificaciones covalentes pueden sufrir las colas terminales de las histonas?
- Acetilación
- Metilación
- Fosforilación
- Ubiquitinación
- Sumoilación
- ADP-ribosilación
¿Qué modificación experimental los residuos de Arg?
Metilación
¿La fosforilación de qué residuos confiere carga negativa a las histonas?
Serina o Treonina
¿Con qué modificación se neutraliza la carga positiva de la Lys?
Acetilación
¿Qué les pasa a las cargas de la Lys y la Arg con la metilación?
Que retienen sus cargas positivas
¿Cómo puede ser metilada la Lys?
Mono-, di- o trimetilada
¿Cómo puede ser metilada la Arg?
Mono- o dimetilada
¿A qué pueden afectar las modificaciones covalentes postraduccionales de las regiones N-terminal de las histonas?
A la interacción de histonas con nucleosomas adyacentes o con el DNA y a la unión de proteínas reguladoras
¿La metilación de histonas implica la pérdida de sus cargas positivas?
No
El incremento de la metilación de histonas incrementa…
La hidrofobicidad y el radio del catión metilamonio
¿La cola C-terminal de las H2A y H2B sufre modificaciones?
No
¿Qué implica el código de histonas?
Combinaciones específicas de modificaciones postranscripcionales en diferentes regiones de cromatina que influyen en la función de la cromatina creando o eliminando sitios de unión a proteínas asociadas a la cromatina
¿Qué cambia la acetilación?
Un átomo de H del grupo amino libre de la Lys por un grupo acetilo
La acetilación provoca…
Que dejen de interaccionar los nucleosomas, volviéndose menos condensados
La acetilación promueve la…
Desagregación de los nucleosomas vecinos
¿Qué enzima cataliza la acetilación?
Histona/lisina acetil transferasa (HAT) o lisina acetil transferasa (KAT) o simplemente acetilasa
¿Qué enzima cataliza la desacetilación?
La histona/lisina desacetilasa (HDAC/KDAC) o desacetilasa
¿Qué sustrato emplean las acetilasas?
Acetil-CoA
¿Qué son los bromodominios?
Dominios proteicos que reconocen e interactúan con lisinas acetiladas
¿Qué hace que el complejo lector se una a la cromatina?
Una combinación específica de marcas de histonas que reconoce
Los bromodominios aparecen en…
Proteínas lectoras
¿A partir de qué se puede generar Acetil-CoA?
De citrato o de piruvato
¿Dónde se produce principalmente el acetil-CoA?
En la mitocondria
¿Qué proceso metabólico proporciona más acetil-CoA?
La glucólisis y la oxidación de los ácidos grasos
¿Qué complejo oxida Piruvato para dar Acetil-CoA?
La piruvato deshidrogenasa (PDC)
¿Cómo sale el Acetil-CoA de la mitocondria?
En forma de citrato
¿La PDC puede salir de la mitocondria?
Sí, y localizarse en el núcleo
¿Qué enzima produce citrato?
Citrato sintasa (CS)
¿Qué productos genera la ATP-citrato liasa (ACL)?
Acetil-CoA y oxalacetato
¿Qué enzima genera Acetil-CoA empleando acetato como sustrato?
La acetil-CoA sintetasa (ACS)
¿Qué enzimas controlan el equilibrio de acetilación de las histonas?
Las KAT y las KDAC
¿Cuáles son las principales histonas acetiladas?
Las H3 y H4
Las formas hiperacetiladas de las histonas se asocian a…
Genes activos (sensibles a DNasa I)
Las formas hipoacetiladas de las histonas se asocian a…
Regiones transcripcionalmente inactivas
¿Las histonas core se modifican antes o después de que se ensamblen?
Antes
¿Cuándo se eliminan los grupos acetilo de las histonas core?
Después de que se ensamblan en la cromatina
Las histonas core recién sintetizadas llevan…
Patrones específicos de acetilación que se retiran una vez ensambladas en la cromatina
¿Qué son los cronodominios?
Dominios proteicos que reconocen e interactúan con Lys metiladas
¿De dónde procede el grupo metilo de la metilación?
De la coenzima S-adenosilmetionina (S-AdoMet)
¿Qué enzima cataliza la metilación de las Arg?
La proteína arginina metiltrans-ferasa (PRMTs)
¿En cuántos residuos se puede metilar una única molécula de histonas?
En uno, ninguno o múltiples residuos específicos
Las HMT con dominios SET metilan…
Colas de histonas
Las HMT sin dominios SET metilan…
Histonas core
¿La metilación de qué aminoácidos activa la transcripción?
De Arg y Lys
La metilación de otras Lys hace a la cromatina…
Más empaquetada, inhibiendo su transcripción
¿Qué catalizan las PMRTs de tipo I?
La dimetilación asimétrica
¿Qué catalizan las PMRTs de tipo II?
La dimetilación simétrica
¿Quién lleva a cabo la desmetilación de la Arg?
La proteína arginina desmetilasa (PAD)
¿Se puede metilar una Lys acetilada?
No
¿Se puede acetilar una Lys metilada?
No
¿Qué elimina la acetilación de una Lys?
Una carga positiva
¿Qué hace el dominio de unión Tudor?
Une Arg metiladas y Lys
¿Cuántos tipos de histonas desmetilasas hay?
Dos:
- KDM/LSD1
- Desmetilasas con dominios Jumonji
¿Cuántos tipos de histonas desmetilasas hay?
Dos:
- KDM/LSD1
- Desmetilasas con dominios Jumonji
¿Quién cataliza la desmetilación de Lys?
Las histonas desmetilasas
¿De qué es dependiente KDM/LSD1?
De FAD
¿Qué desmetilan las KDM/LSD1?
Lys-mono y dimetiladas
¿Qué desmetilan las desmetilasas con dominios Jumonji?
Lys-mono, di y trimetiladas
¿Quién cataliza la desmetilación de Arg?
Proteína arginina desmetilasa (PAD)
¿Qué aminoácido origina la PAD?
Citrulina
¿Quién es el donante universal de grupos metilo?
SAM
¿Dónde metila la DMT al DNA?
En la posición 5’ de la C (5mC)
¿En qué aminoácidos se produce la fosforilación de histonas?
En la Ser y Tre y Tyr
¿En qué afecta la fosforilación a las histonas?
- Interacciones con el DNA
- Interacciones con otras histonas en nucleosomas adyacentes
- Interacciones con proteínas reguladoras
La fosforilación selectiva de Ser promueve la…
Interacción de histonas con HAT y HMT
¿Quién lleva a cabo la fosforilación de las histonas?
Las proteína kinasas (PK)
¿Quién lleva a cabo la desfosforilación de las histonas?
Las proteína fosfatasas (PP)
La fosforilación promueve…
- Activación transcripcional
- Represión transcripcional
*Según su localización
¿A qué extremo se une la ubiquitina?
Al C-terminal
¿Qué es la ubiquitinación de histonas?
La unión covalente (isopeptídica) entre la Gly C-terminal de la ubiquitina y el épsilon-amino de un residuo de Lys de la hsitona, formando una molécula ramificada
¿En qué histonas se realiza la mono-Ub?
En las H2A y H2B
¿La ubiquitinación aumenta o reduce las cargas positivas de las histonas?
Las reduce
¿La mono-Ub reversible de Lys activa la degradación proteolítica?
No
¿Qué ubiquitinación es más frecuente en las histonas?
La mono-Ub
¿Por quién está catalizada la ubiquitinación?
Por E3 ligasas específicas
¿Por quién está catalizada la desubiquitinación?
Por enzimas isopeptídicas desubiquitinizantes (DUBs)
¿Qué son las DUBs?
Son proteasas especializadas sobre proteínas de alto pm que rompen el enlace isopeptídico entre un grupo amino de Lys y el C-ter de la Ub
¿Qué se inhibe al metilar la H2A?
La elongación transcripcional al reprimir el reclutamiento de FACT por pausa de la RNA pol II y la transcripción
La metilación de la Lys de la H3 provoca…
La activación del reclutamiento de FACT activando la elongación transcripcional
La metilación de la H2B está asociada a la…
Expresión génica
¿Qué provoca la sumoilación?
Cambia la forma de actuar de la proteína
¿A qué se une SUMO?
Se une reversiblemente a FT y numerosas proteínas reguladoras de la estructura de la cromatina
¿Dónde desempeña principalmente su función SUMO?
En el núcleo
¿En qué histonas ocurre la sumoilación?
En todas las histonas core, en las Lys
¿Qué es la ADP-ribosilación?
Es la unión reversible de uno o más restos de ADP-ribosa a una proteína
¿Cuál es la fuente de ADP-ribosa para la ADP-ribosilación?
El cofactor redox. NAD+
¿Qué dos tipos de modificaciones realiza la ADP-ribosiltransferasa?
mono-ADP-ribosilación y poli-ADP-ribosilación
¿Qué es la MARilación?
La adición de 1 residuo de ADP-ribosa
¿Qué es la PARilación?
La adición de múltiples residuos de ADP-ribosa
¿Qué resto se produce en la PARilación y la MARilación?
Nicotinamida
¿En respuesta a qué se produce la MARilación?
Al estrés genotóxico
¿Qué sustrato emplea la lactilación?
El lactato
¿Qué histona se puede modificar covalentemente por la adición de un residuo de azúcar?
La H2B
¿Qué promueve la N-acetil-glucosaminación de la histona H2B?
La ubiquitinación de la histona H2B y la metilación de la H3
¿Qué factores forman parte de la regulación epigenética de la cromatina?
- Modificaciones covalentes de histonas
- Metilación de citosinas
¿Cuál es la única histona que no posee variantes no alélicas?
H4
¿En qué fase del ciclo celular se sintetizan las histonas principales?
En la fase S
¿En qué fase del ciclo celular se sintetizan las variantes de histonas?
En la interfase
¿Dónde se insertan las variantes de las histonas?
En la cromatina ya formada
La H1 promueve el reclutamiento de…
DMT
Las DMT inhiben el reclutamiento de…
HMT
La variante de histona H3.3 inhibe el reclutamiento de…
H1, promoviendo una estructura abierta de cromatina
¿Qué provoca la fosforilación de la H1?
La activación de la cromatina por desplegamiento
La heterocromatina es…
Inactiva
La eucromatina es…
Activa
En la eucromatina la H1 está…
Fosforilada
¿Quién fosforila la H1?
H1K (histona 1 kinasa) y PKA
¿La fosforilación de la H1 es reversible?
Sí, por las fosfatasas
¿Qué activa la PKA?
El glucagón
Los nucleosomas introducen superenrollamientos … en eucariotas
Negativos
¿Las células eucariotas tienen enzimas que desenrollen el DNA?
No
¿Qué requiere el fuerte enrollamiento del DNA alrededor del octámero de histonas?
La eliminación de 1 vuelta helicoidal
¿Qué tipo de densidad superhelicoidal introduce el empaquetamiento del DNA en los nucleosomas?
Negativa
El enrollamiento del DNA alrededor del octámero de histonas produce un solenoide…
Levógiro
Las condensinas afectal al Wr formando grandes solenoides…
Positivos
La mayor parte del tiempo los nucleosomas presentan una estructura de octasoma tipo…
L-octasoma
¿Qué histonas se separan en el tetrasoma?
H2A y H2B
¿Cuántas vueltas mantiene un tetrasoma?
Menos de una
¿Cuántas vueltas contiene un hexasoma?
Más de una vuelta
¿En qué cromatina aparecen los hemisomas?
Cromatina centromérica
¿Cuántos pb contiene un nucleosoma?
147 pb
¿Dónde se produce la unión más fuerte en las histonas?
En los dominios de plegamiento del tetrámero (H3-H4)
¿Dónde se produce la unión más débil en las histonas?
En los dímeros H2A-H2B
¿Qué estabilizan las colas N-ter de las histonas?
En enrollamiento del DNA alrededor del octámero
Todos los sitios de contacto entre las histonas y el DNA implican…
-Surco menor
- Esqueleto P
El posicionamiento del nucleosoma puede ser
- Extrínseco
- Intrínseco
El posicionamiento del nucleosoma puede estar dirigido por…
- Extrínseco: Proteínas que se unen al DNA (DNA-BP)
- Intrínseco: Secuencias particulares del DNA y sitios hipersensibles
Los nucleosomas se forman preferencialmente sobre el DNA que…
Se curva fácilmente
¿Qué secuencias de bases tienden a curvar el DNA?
A:T
¿Qué son los sitios hipersensibles?
Regiones de DNA libres de nucleosomas
¿El DNA de un nucleosoma aislada está disponible para la unión de proteínas?
Sí
¿Quién cataliza el deslizamiento del nucleosoma?
Las CRC-ATP-dependientes
¿El deslizamiento de las histonas implcia gasto de ATP?
Sí
La remodelación de la cromatina puede producir:
- Cambio conformacional del DNA en la superficie del octámero (más expuesto)
- Desplazamiento del octámero
- Reemplazamiento de histonas
- Eliminación parcial de histonas
- Eliminación total del octámero
¿Qué son las chaperonas?
Proteínas cargadas negativamente que forman complejos con dímeros H3-H4 o H2A-H2B y lso escoltan a los sitios de ensamblaje
¿Qué son las poliaminas?
Derivados de la ornitina
¿Cómo es el DNA de muchos cromosomas bacterianos y virales?
DNA circular cerrado
Los DNAcc cuando se purifican raramente están…
Relajados
¿Qué es una propiedad topológica del DNA?
Aquella que no cambia cuando se distorsiona (sin rasgarse o romperse)
