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Biología Molecular > Tema 2.1 > Flashcards

Tema 2.1 Flashcards

1
Q

Qué es el superenrollamiento?

A

Propiedad topológica intrínseca de la estructura 3ª del DNA

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Q

Qué es el empaquetamiento?

A

Plegamiento o compactación de la molécula de DNA debido a la asociación con proteínas, para dar lugar a nucleoproteínas

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3
Q

Cómo se compacta el DNA en eucariotas?

A
  1. Neutralización de sus cargas negativas
  2. Superenrollamiento
  3. Empaquetamiento

Se neutraliza por medio de cationes divalentes como el Mg o poliaminas (derivados de la ornitina)

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4
Q

Cual es una propiedad topológica intrínseca de la estructura terciaria del DNA?

A

El superenrollamiento

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5
Q

Qué enzimas regulan el superenrollamiento?

A

Las topoisomerasas

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6
Q

En qué tipo de DNA las dos hebras no se pueden separar sin romper un enlace covalente?

A

En el DNA circular cerrado covalentemente

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7
Q

El superenrollamiento aparece en DNAs cerrados…

A

DNAccc y DNAs lineales con extremos anclados que no están libres para girar

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8
Q

Un DNA está relajado cuando…

A

No hay enrollamiento neto del eje sobre sí mismo y no hay cortes en las hebras

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9
Q

Cuánto rota un DNA con un extremo libre?

A

1 vuelta por cada 10 pb abiertos

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10
Q

Por qué están limitados topológicamente los DNA lineales de cromosomas eucarióticos?

A
  1. Longitudes extremas
  2. Incorporación a la cromatina (interacción con proteínas)
  3. Interacción con otros componentes celulares
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11
Q

Qué es el Lk?

A

El número de veces que 2 círculos están entrelazados. Es una propiedad topológica invariante en un DNAcc

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12
Q

Cuándo no es posible definir Lk?

A

Cuando las hebras están completamente separadas

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13
Q

Podemos encontrar Lk negativo en el DNA?

A

No

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14
Q

Cómo están superenrollados los DNAs circulares purificados de bacterias y eucariotas?

A

Negativamente

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15
Q

Cómo se relaciona Lk con Tw y Wr?

A

Lk = Tw + Wr

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16
Q

¿Cuánto rota el DNA2C con un extremo libre?

A

1 vuelta por cada 10 pb

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17
Q

El desenrollamiento de una vuelta helicoidal en fragmentos de DNA lineales de cromosomas genera…

A

Tensión superhelicoidal, abriendo la hélice

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18
Q

¿Puede tener decimales Lk?

A

No, debe ser un número íntegro

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19
Q

Si Lk es distinto de 0 significa que…

A

Que existen enlaces topológicos

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20
Q

Si Lk es igual a 0 quiere decir que…

A

Las hebras no están unidas, no hay enlace topológico.

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21
Q

Características del DNA lineal

A
  • Tiene los extremos libres
  • Puede rotar libremente
  • Lk = 0
  • Las dos hebras pueden separarse (sin romper enlaces covalentes)
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22
Q

¿Por qué están topológicamente limitados los DNA lineales de cromosomas eucarióticos?

A
  • Longitudes extremas
  • Interacción con otros componentes celulares
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23
Q

DNAccc significa

A

DNA circular covalentemente cerrado

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24
Q

En los DNAccc…

A
  • No hay rotura en ninguna de las hebras
  • Las 2 hebras no pueden ser separadas sin romper un enlace covalente (Lk distinto de 0).
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25
Q

En el DNA relajado…

A
  • No hay enrollamiento neto del eje sobre sí mismo
  • No hay cortes en las hebras (sin roturas) –> DNAccc
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26
Q

¿Qué introduce el desenrollamiento del DNA circular?

A

Superenrollamientos negativos

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27
Q

Características del DNA 2C circular cerrado (relajado):

A
  • El mismo nº de vueltas de hélice que el DNA lineal
  • Igual nº de pb/vuelta que el DNA lineal del que procede
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28
Q

¿Cómo es el Lk del DNA-B?

A

Definible (Lk distinto de 0, Lk = 25)

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29
Q

Si el nº de vueltas de hélice disminuye, el nº de pb/vuelta…

A

Aumenta

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30
Q

Si el mismo DNA se sobreenrollase…

A

La tensión estructural se podría relajar formando un superenrollamiento positivo (menor nº de pb/vuelta y mayor nº de vueltas de hélice)

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31
Q

¿Cómo se cuantifica la diferencia de enlace?

A

Lk - Lko

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32
Q

¿Cómo se obtiene el valor de Lk?

A

Dividiendo el nº de pb totales por el nº de pb por vuelta (10.5 en el DNA-B)

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33
Q

Si las hebras se entrelazan de forma dextrógira Lk tendrá un valor…

A

Positivo

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34
Q

¿Cómo se calcula la densidad superhelicoidal?

A

Dividiendo la diferencia de Lk entre Lko

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35
Q

La densidad superhelicoidal es independiente de…

A

La longitud del DNA

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36
Q

¿Qué mide la densidad superhelicoidal?

A

El nº de vueltas eliminadas en relación al nº presente en el DNA relajado

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37
Q

Las moléculas de DNA circulares purificadas de bacterias y eucariotas están usualmente superenrolladas…

A

Negativamente y tienen valores de densidad superhelicoidal de 6%

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38
Q

¿Cuáles son los componentes geométricos de Lk?

A

Tw y Wr

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39
Q

En el DNA relajado Tw y Lk…

A

Coinciden, Lk = Tw

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40
Q

En un DNAcc o un fragmento lineal constreñido en sus extremos Lk es … , pero Tw y Wr…

A

Constante, varían según la relación Lk = Tw + Wr

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41
Q

Para cambiar el valor de Lk se requiere la acción de enzimas…

A

Topoisomerasas

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42
Q

La acción de las topoisomerasas crea isómeros…

A

Topológicos

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43
Q

¿Los isómeros geométricos requieren la acción de algún enzima para interconvertirse?

A

No

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44
Q

La tensión de los superenrollamientos se puede relajar “in vitro” introduciendo una mella por medio de una enzima…

A

DNAsa

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45
Q

Los DNAs superenrollados pueden adoptar 2 formas…

A

Toroidal (solenoidal) y entrelazada (plectonémica)

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46
Q

En la cromatina encontramos la forma … del DNA superenrollado

A

Toroidal (solenoidal)

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47
Q

El eje longitudinal en el superenrollamiento toroidal…

A

Se enrosca de forma cilíndrica

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48
Q

El eje longitudinal en el superenrollamiento entrelazado…

A

Se enrosca sobre sí mismo

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49
Q

El DNA aislado suele adoptar la forma…

A

Entrelazada o plectonémica

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50
Q

La forma más observada en el DNA aislado es la…

A

Plectonémica o entrelazada

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51
Q

Los DNAs con superenrollamientos plectonémicos o toroidales son topológicamente…

A

Equivalentes (propiedades geométricas interconvertibles)

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52
Q

En el DNA superenrollado positivamente la forma toroidal presenta espirales de DNA …

A

Dextrógiras

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53
Q

Las formas entrelazadas del DNA superenrollado negativa o positivamente giran de forma…

A

Opuesta a la solenoidal

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54
Q

¿Qué forma es la más compacta; la solenoidal o la plectonémica?

A

La solenoidal

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55
Q

Los valores negativos de Wr se corresponden con enrrollamiento … en un solenoide, pero … en una estructura plectonémica.

A

Levógiro, dextrógiro

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56
Q

El DNA solenoidal puede aparecer de 2 formas:

A
  1. Enrollamiento alrededor del octámero de histonas (solenoide levógiro)
  2. Proteínas condensinas que participan en la formación de cromosomas mitóticos (solenoide positivo)
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57
Q

¿Dónde tiende a localizarse el DNA intrínsicamente curvado?

A

En los extremos de los superenrollamientos

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58
Q

¿Qué facilita el desenrollamiento del DNA?

A

La separación parcial de hebras necesarias para promover la formación de estructuras cruciformes.

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59
Q

El desenrollamiento de la hélice dextrógira del DNA facilita la formación…

A

De tramos cortos de DNA-Z levógiro

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60
Q

¿En qué secuencias suelen producirse tramos de DNA-Z levógiro?

A

Secuencias con alternancia de purinas (sin) y pirimidinas (anti), especialmente con residuos de C y G

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61
Q

¿Cuáles son las topoisomerasas de tipo I en E. coli?

A

La I y la III

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62
Q

¿Qué hacen las topoisomerasas de tipo I en E. coli?

A
  • Roturas monocatenarias
  • Relajan el DNA eliminando superenrollamientos negativos
  • Aumental Lk de uno en uno
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63
Q

¿Cuáles son las topoisomerasas de tipo II de E. coli?

A

La II y la IV

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64
Q

¿Qué hacen las topoisomerasas de tipo II en E. coli?

A
  • Roturas bicatenarias
  • Introducen superenrollamientos negativos
  • Reducen Lk de dos en dos
  • Utilizan ATP
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65
Q

¿Alguna topoisomerasa de eucariotas introduce superenrollamientos negativos?

A

No

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66
Q

¿Cuántos tipos de topoisomerasas tienen las eucariotas?

A
  • Tipo I (I y III)
  • Tipo II (II alpha y II beta)
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67
Q

Características de las topoisomerasas eucarióticas

A
  • No pueden desenrollar el DNA
  • Pueden relajar los superenrollamientos negativos y positivos
  • Son enzimas diméricas (a veces tetraméricas)
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68
Q

En las células tumorales las topoisomerasas se expresan…

A

A altos niveles

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69
Q

Sin la acción de las topoisomerasas la célula no puede…

A

Replicar o empaquetar su DNA o expresar sus genes y muere

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70
Q

¿Para qué emplean ATP las topoisomerasas tipo II de E. coli?

A

Para provocar cambios conformacionales del complejo DNA-topoisomerasa

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71
Q

¿Qué enzimas desanudan y desenmarañan moléculas de DNA?

A

Las topoisomerasas

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72
Q

Los únicos organismos encontrados con el DNA superenrollado positivamente son…

A

Microorganismos termófilos

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73
Q

¿Qué enzima emplean los organismos termófilos para mantener al DNA sin desnaturalizar a elevadas temperaturas?

A

DNA girasa inversa que es capaz de aumentar Lk

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74
Q

¿Una molécula de DNA superenrollado migrará más o menos rápido en una matriz de gel?

A

Más rápido

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75
Q

¿El DNA circular superenrollado es más o menos compacto que el DNA relajado?

A

Más compacto

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76
Q

El superenrollamiento negativo del DNA favorece los procesos de…

A

Desenrollamiento como la replicación y transcripción

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77
Q

Siempre que se abra una región de una hélice se eliminan los superenrollamientos … del DNA, … la tensión helicoidal

A

Negativos, reduciendo

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78
Q

En bacterias la actividad de la … introduce superenrollamientos … de forma continua en el DNA

A

DNA girasa, negativos

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79
Q

¿Los superenrollamientos positivos se generan por delante o por detrás de la enzima de replicación?

A

Por delante

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80
Q

¿Los superenrollamientos negativos se generan por delante o por detrás de la enzima de replicación?

A

Por detrás

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81
Q

Características del DNA superenrollado positivamente

A
  • En microorganismos termófilos
  • Compacta el DNA
  • Dificulta la apertura de hebras
  • Ayuda a mantener al DNA sin desnaturalizar a altas temperaturas.
  • Usan una DNA girasa especial (inversa) capaz de aumentar Lk
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82
Q

¿En qué fase del ciclo celular ocurre la condensación del DNA nuclear?

A

En la interfase

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83
Q

¿En qué fase del ciclo celular el DNA está en forma de doble hélice extendida?

A

En la fase S

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84
Q

¿En qué fase del ciclo celular el DNA está en forma de cromatina o cromosoma?

A

En la fase G2

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85
Q

¿Cuándo comienza el proceso de descondensación de la cromatina?

A

Después de la división celular (fase M) y continua durante la fase G1.

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86
Q

¿En qué fase no se produce división celular?

A

En la fase Go (quiescencia)

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87
Q

¿Por qué está formada la cromatina?

A

Por DNA unido a proteínas histonas y no histonas

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88
Q

La masa de las proteínas histona es igual a la…

A

Masa de proteínas NO histonas

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89
Q

La cromatina contiene una cantidad significativa de…

A

RNA asociado

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90
Q

¿Cuál es el primer nivel de empaquetamiento del DNA?

A

La unión del DNA a las proteínas histonas (proteínas básicas)

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91
Q

Función de las histonas

A

Estabilizar la estructura del DNA y contribuir a su compactación

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92
Q

Las histonas son ricas en aminoácidos…

A

Lys y Arg

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93
Q

Las histonas a pH fisiológico están cargadas…

A

Positivamente (básicas)

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94
Q

¿Con qué se neutralizan las histonas?

A

Con las cargas negativas de los P del DNA

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95
Q

¿La isoforma H5 tiene más o menos afinidad por la cromatina?

A

Más afinidad que la H1

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96
Q

¿Cuáles son las proteínas básicas no histonas?

A

Las protaminas

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97
Q

¿Cuáles son las proteínas ácidas no histonas?

A

Las HMG (high movility group)

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98
Q

¿Qué enzimas digieren a los nucleosomas?

A

Las desoxirribonucleasas

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99
Q

¿Qué es el cromatosoma?

A

La H1 + nucleosoma

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100
Q

¿Cómo afectan las altas concentraciones salinas a las histonas?

A

Con la disociación por cambio de fuerza iónica

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101
Q

¿Cuál es la subunidad de toda la cromatina?

A

El nucleosoma

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102
Q

¿Cuántas pares de bases tiene un nucleosoma?

A

200 pb

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103
Q

¿Cuántas vueltas da el DNA alrededor del nucleosoma?

A

1,7 vueltas

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104
Q

El octámero de histona tiene una estructura de…

A

Un tetrámero H3-H4 asociado con dos dímeros H2A-H2B

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105
Q

El nucleosoma forma una estructura de…

A

Solenoide levógiro

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106
Q

¿Qué histonas están muy conservadas?

A

Las H3 y H4

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107
Q

¿Dónde se encuentran más residuos básicos en los nucleosomas?

A

En las colas N-terminales del primer tramo de la proteína

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108
Q

¿Qué tipo de plegamiento tienen las proteínas histonas?

A

Hélices alpha

109
Q

¿Qué parte de la histona se une directamente al DNA asociado al nucleosoma?

A

El dominio plegamiento histona

110
Q

¿Cuál es la histona más básica?

A

La H1

111
Q

Dominios de la H1

A
  1. Globular (central)
  2. N-terminal corto
  3. C-terminal largo (rico en Lys y Arg)
112
Q

¿El extremo N-terminal de la H1 es corto o largo?

A

Corto

113
Q

¿El extremo C-terminal de la H1 es corto o largo?

A

Largo

114
Q

¿Cuál es la histona menos conservada en la evolución?

A

La H1

115
Q

¿Qué es el DNA ligador o linker?

A

Es el que se encuentra entre un cromatosoma y otro, está desnudo.

116
Q

¿Cómo se disponen los nucleosomas?

A

En forma de cuentas de collar

117
Q

Las colas N-terminal de las histonas sobresalen del core y se pueden modificar de forma…

A

Covalente y reversiblemente

118
Q

Las colas N-terminal que sobresalen de las histonas…

A
  • Estabilizan el enrollamiento del DNA alrededor del octámero
  • Interactúan con cromosomas adyacentes
  • Ayudan a definir el empaquetamiento de orden superior
119
Q

La H1 también se puede modificar…

A

Covalentemente

120
Q

Las histonas nucleosomales muestran diferentes modificaciones…

A

Postraduccionales covalentes en sus extremos N-terminal

121
Q

¿En qué residuos de las histonas suele darse la acetilación?

A

En los de Lys

122
Q

¿En qué grupo de la Lys se suelen dar las modificaciones?

A

En el épsilon-amino

123
Q

Las modificaciones covalentes postraduccionales de histonas forman parte del control…

A

Epigenético de la expresión génica

124
Q

Las modificaciones covalentes postraduccionales de histonas crean sitios de unión para…

A

Proteínas no histonas

125
Q

Todas las modificaciones de histonas son…

A

Reversibles

126
Q

Una modificación puede ser… o mantenerse … a través de múltiples divisiones celulares

A

Transitoria, estable

127
Q

Algunas modificaciones cambian de … a las moléculas

A

Carga

128
Q

Los residuos modificados son sitios de … e … con dominios proteicos de proteínas no histonas reclutadas específicamente que interactúan con la cromatina.

A

Reconocimiento e interacción

129
Q

¿En qué regiones suelen ocurrir la mayoría de modificaciones covalentes?

A

En las N-terminal

130
Q

¿Qué modificaciones covalentes pueden sufrir las colas terminales de las histonas?

A
  • Acetilación
  • Metilación
  • Fosforilación
  • Ubiquitinación
  • Sumoilación
  • ADP-ribosilación
131
Q

¿Qué modificación experimental los residuos de Arg?

A

Metilación

132
Q

¿La fosforilación de qué residuos confiere carga negativa a las histonas?

A

Serina o Treonina

133
Q

¿Con qué modificación se neutraliza la carga positiva de la Lys?

A

Acetilación

134
Q

¿Qué les pasa a las cargas de la Lys y la Arg con la metilación?

A

Que retienen sus cargas positivas

135
Q

¿Cómo puede ser metilada la Lys?

A

Mono-, di- o trimetilada

136
Q

¿Cómo puede ser metilada la Arg?

A

Mono- o dimetilada

137
Q

¿A qué pueden afectar las modificaciones covalentes postraduccionales de las regiones N-terminal de las histonas?

A

A la interacción de histonas con nucleosomas adyacentes o con el DNA y a la unión de proteínas reguladoras

138
Q

¿La metilación de histonas implica la pérdida de sus cargas positivas?

A

No

139
Q

El incremento de la metilación de histonas incrementa…

A

La hidrofobicidad y el radio del catión metilamonio

140
Q

¿La cola C-terminal de las H2A y H2B sufre modificaciones?

A

No

141
Q

¿Qué implica el código de histonas?

A

Combinaciones específicas de modificaciones postranscripcionales en diferentes regiones de cromatina que influyen en la función de la cromatina creando o eliminando sitios de unión a proteínas asociadas a la cromatina

142
Q

¿Qué cambia la acetilación?

A

Un átomo de H del grupo amino libre de la Lys por un grupo acetilo

143
Q

La acetilación provoca…

A

Que dejen de interaccionar los nucleosomas, volviéndose menos condensados

144
Q

La acetilación promueve la…

A

Desagregación de los nucleosomas vecinos

145
Q

¿Qué enzima cataliza la acetilación?

A

Histona/lisina acetil transferasa (HAT) o lisina acetil transferasa (KAT) o simplemente acetilasa

146
Q

¿Qué enzima cataliza la desacetilación?

A

La histona/lisina desacetilasa (HDAC/KDAC) o desacetilasa

147
Q

¿Qué sustrato emplean las acetilasas?

A

Acetil-CoA

148
Q

¿Qué son los bromodominios?

A

Dominios proteicos que reconocen e interactúan con lisinas acetiladas

149
Q

¿Qué hace que el complejo lector se una a la cromatina?

A

Una combinación específica de marcas de histonas que reconoce

150
Q

Los bromodominios aparecen en…

A

Proteínas lectoras

151
Q

¿A partir de qué se puede generar Acetil-CoA?

A

De citrato o de piruvato

152
Q

¿Dónde se produce principalmente el acetil-CoA?

A

En la mitocondria

153
Q

¿Qué proceso metabólico proporciona más acetil-CoA?

A

La glucólisis y la oxidación de los ácidos grasos

154
Q

¿Qué complejo oxida Piruvato para dar Acetil-CoA?

A

La piruvato deshidrogenasa (PDC)

155
Q

¿Cómo sale el Acetil-CoA de la mitocondria?

A

En forma de citrato

156
Q

¿La PDC puede salir de la mitocondria?

A

Sí, y localizarse en el núcleo

157
Q

¿Qué enzima produce citrato?

A

Citrato sintasa (CS)

158
Q

¿Qué productos genera la ATP-citrato liasa (ACL)?

A

Acetil-CoA y oxalacetato

159
Q

¿Qué enzima genera Acetil-CoA empleando acetato como sustrato?

A

La acetil-CoA sintetasa (ACS)

160
Q

¿Qué enzimas controlan el equilibrio de acetilación de las histonas?

A

Las KAT y las KDAC

161
Q

¿Cuáles son las principales histonas acetiladas?

A

Las H3 y H4

162
Q

Las formas hiperacetiladas de las histonas se asocian a…

A

Genes activos (sensibles a DNasa I)

163
Q

Las formas hipoacetiladas de las histonas se asocian a…

A

Regiones transcripcionalmente inactivas

164
Q

¿Las histonas core se modifican antes o después de que se ensamblen?

A

Antes

165
Q

¿Cuándo se eliminan los grupos acetilo de las histonas core?

A

Después de que se ensamblan en la cromatina

166
Q

Las histonas core recién sintetizadas llevan…

A

Patrones específicos de acetilación que se retiran una vez ensambladas en la cromatina

167
Q

¿Qué son los cronodominios?

A

Dominios proteicos que reconocen e interactúan con Lys metiladas

168
Q

¿De dónde procede el grupo metilo de la metilación?

A

De la coenzima S-adenosilmetionina (S-AdoMet)

169
Q

¿Qué enzima cataliza la metilación de las Arg?

A

La proteína arginina metiltrans-ferasa (PRMTs)

170
Q

¿En cuántos residuos se puede metilar una única molécula de histonas?

A

En uno, ninguno o múltiples residuos específicos

171
Q

Las HMT con dominios SET metilan…

A

Colas de histonas

172
Q

Las HMT sin dominios SET metilan…

A

Histonas core

173
Q

¿La metilación de qué aminoácidos activa la transcripción?

A

De Arg y Lys

174
Q

La metilación de otras Lys hace a la cromatina…

A

Más empaquetada, inhibiendo su transcripción

175
Q

¿Qué catalizan las PMRTs de tipo I?

A

La dimetilación asimétrica

176
Q

¿Qué catalizan las PMRTs de tipo II?

A

La dimetilación simétrica

177
Q

¿Quién lleva a cabo la desmetilación de la Arg?

A

La proteína arginina desmetilasa (PAD)

178
Q

¿Se puede metilar una Lys acetilada?

A

No

179
Q

¿Se puede acetilar una Lys metilada?

A

No

180
Q

¿Qué elimina la acetilación de una Lys?

A

Una carga positiva

181
Q

¿Qué hace el dominio de unión Tudor?

A

Une Arg metiladas y Lys

182
Q

¿Cuántos tipos de histonas desmetilasas hay?

A

Dos:
- KDM/LSD1
- Desmetilasas con dominios Jumonji

182
Q

¿Cuántos tipos de histonas desmetilasas hay?

A

Dos:
- KDM/LSD1
- Desmetilasas con dominios Jumonji

183
Q

¿Quién cataliza la desmetilación de Lys?

A

Las histonas desmetilasas

184
Q

¿De qué es dependiente KDM/LSD1?

A

De FAD

185
Q

¿Qué desmetilan las KDM/LSD1?

A

Lys-mono y dimetiladas

186
Q

¿Qué desmetilan las desmetilasas con dominios Jumonji?

A

Lys-mono, di y trimetiladas

187
Q

¿Quién cataliza la desmetilación de Arg?

A

Proteína arginina desmetilasa (PAD)

188
Q

¿Qué aminoácido origina la PAD?

A

Citrulina

189
Q

¿Quién es el donante universal de grupos metilo?

A

SAM

190
Q

¿Dónde metila la DMT al DNA?

A

En la posición 5’ de la C (5mC)

191
Q

¿En qué aminoácidos se produce la fosforilación de histonas?

A

En la Ser y Tre y Tyr

192
Q

¿En qué afecta la fosforilación a las histonas?

A
  • Interacciones con el DNA
  • Interacciones con otras histonas en nucleosomas adyacentes
  • Interacciones con proteínas reguladoras
193
Q

La fosforilación selectiva de Ser promueve la…

A

Interacción de histonas con HAT y HMT

194
Q

¿Quién lleva a cabo la fosforilación de las histonas?

A

Las proteína kinasas (PK)

195
Q

¿Quién lleva a cabo la desfosforilación de las histonas?

A

Las proteína fosfatasas (PP)

196
Q

La fosforilación promueve…

A
  • Activación transcripcional
  • Represión transcripcional
    *Según su localización
197
Q

¿A qué extremo se une la ubiquitina?

A

Al C-terminal

198
Q

¿Qué es la ubiquitinación de histonas?

A

La unión covalente (isopeptídica) entre la Gly C-terminal de la ubiquitina y el épsilon-amino de un residuo de Lys de la hsitona, formando una molécula ramificada

199
Q

¿En qué histonas se realiza la mono-Ub?

A

En las H2A y H2B

200
Q

¿La ubiquitinación aumenta o reduce las cargas positivas de las histonas?

A

Las reduce

201
Q

¿La mono-Ub reversible de Lys activa la degradación proteolítica?

A

No

202
Q

¿Qué ubiquitinación es más frecuente en las histonas?

A

La mono-Ub

203
Q

¿Por quién está catalizada la ubiquitinación?

A

Por E3 ligasas específicas

204
Q

¿Por quién está catalizada la desubiquitinación?

A

Por enzimas isopeptídicas desubiquitinizantes (DUBs)

205
Q

¿Qué son las DUBs?

A

Son proteasas especializadas sobre proteínas de alto pm que rompen el enlace isopeptídico entre un grupo amino de Lys y el C-ter de la Ub

206
Q

¿Qué se inhibe al metilar la H2A?

A

La elongación transcripcional al reprimir el reclutamiento de FACT por pausa de la RNA pol II y la transcripción

207
Q

La metilación de la Lys de la H3 provoca…

A

La activación del reclutamiento de FACT activando la elongación transcripcional

208
Q

La metilación de la H2B está asociada a la…

A

Expresión génica

209
Q

¿Qué provoca la sumoilación?

A

Cambia la forma de actuar de la proteína

210
Q

¿A qué se une SUMO?

A

Se une reversiblemente a FT y numerosas proteínas reguladoras de la estructura de la cromatina

211
Q

¿Dónde desempeña principalmente su función SUMO?

A

En el núcleo

212
Q

¿En qué histonas ocurre la sumoilación?

A

En todas las histonas core, en las Lys

213
Q

¿Qué es la ADP-ribosilación?

A

Es la unión reversible de uno o más restos de ADP-ribosa a una proteína

214
Q

¿Cuál es la fuente de ADP-ribosa para la ADP-ribosilación?

A

El cofactor redox. NAD+

215
Q

¿Qué dos tipos de modificaciones realiza la ADP-ribosiltransferasa?

A

mono-ADP-ribosilación y poli-ADP-ribosilación

216
Q

¿Qué es la MARilación?

A

La adición de 1 residuo de ADP-ribosa

217
Q

¿Qué es la PARilación?

A

La adición de múltiples residuos de ADP-ribosa

218
Q

¿Qué resto se produce en la PARilación y la MARilación?

A

Nicotinamida

219
Q

¿En respuesta a qué se produce la MARilación?

A

Al estrés genotóxico

220
Q

¿Qué sustrato emplea la lactilación?

A

El lactato

221
Q

¿Qué histona se puede modificar covalentemente por la adición de un residuo de azúcar?

A

La H2B

222
Q

¿Qué promueve la N-acetil-glucosaminación de la histona H2B?

A

La ubiquitinación de la histona H2B y la metilación de la H3

223
Q

¿Qué factores forman parte de la regulación epigenética de la cromatina?

A
  • Modificaciones covalentes de histonas
  • Metilación de citosinas
224
Q

¿Cuál es la única histona que no posee variantes no alélicas?

A

H4

225
Q

¿En qué fase del ciclo celular se sintetizan las histonas principales?

A

En la fase S

226
Q

¿En qué fase del ciclo celular se sintetizan las variantes de histonas?

A

En la interfase

227
Q

¿Dónde se insertan las variantes de las histonas?

A

En la cromatina ya formada

228
Q

La H1 promueve el reclutamiento de…

A

DMT

229
Q

Las DMT inhiben el reclutamiento de…

A

HMT

230
Q

La variante de histona H3.3 inhibe el reclutamiento de…

A

H1, promoviendo una estructura abierta de cromatina

231
Q

¿Qué provoca la fosforilación de la H1?

A

La activación de la cromatina por desplegamiento

232
Q

La heterocromatina es…

A

Inactiva

233
Q

La eucromatina es…

A

Activa

234
Q

En la eucromatina la H1 está…

A

Fosforilada

235
Q

¿Quién fosforila la H1?

A

H1K (histona 1 kinasa) y PKA

236
Q

¿La fosforilación de la H1 es reversible?

A

Sí, por las fosfatasas

237
Q

¿Qué activa la PKA?

A

El glucagón

238
Q

Los nucleosomas introducen superenrollamientos … en eucariotas

A

Negativos

239
Q

¿Las células eucariotas tienen enzimas que desenrollen el DNA?

A

No

240
Q

¿Qué requiere el fuerte enrollamiento del DNA alrededor del octámero de histonas?

A

La eliminación de 1 vuelta helicoidal

241
Q

¿Qué tipo de densidad superhelicoidal introduce el empaquetamiento del DNA en los nucleosomas?

A

Negativa

242
Q

El enrollamiento del DNA alrededor del octámero de histonas produce un solenoide…

A

Levógiro

243
Q

Las condensinas afectal al Wr formando grandes solenoides…

A

Positivos

244
Q

La mayor parte del tiempo los nucleosomas presentan una estructura de octasoma tipo…

A

L-octasoma

245
Q

¿Qué histonas se separan en el tetrasoma?

A

H2A y H2B

246
Q

¿Cuántas vueltas mantiene un tetrasoma?

A

Menos de una

247
Q

¿Cuántas vueltas contiene un hexasoma?

A

Más de una vuelta

248
Q

¿En qué cromatina aparecen los hemisomas?

A

Cromatina centromérica

249
Q

¿Cuántos pb contiene un nucleosoma?

A

147 pb

250
Q

¿Dónde se produce la unión más fuerte en las histonas?

A

En los dominios de plegamiento del tetrámero (H3-H4)

251
Q

¿Dónde se produce la unión más débil en las histonas?

A

En los dímeros H2A-H2B

252
Q

¿Qué estabilizan las colas N-ter de las histonas?

A

En enrollamiento del DNA alrededor del octámero

253
Q

Todos los sitios de contacto entre las histonas y el DNA implican…

A

-Surco menor
- Esqueleto P

254
Q

El posicionamiento del nucleosoma puede ser

A
  • Extrínseco
  • Intrínseco
255
Q

El posicionamiento del nucleosoma puede estar dirigido por…

A
  • Extrínseco: Proteínas que se unen al DNA (DNA-BP)
  • Intrínseco: Secuencias particulares del DNA y sitios hipersensibles
256
Q

Los nucleosomas se forman preferencialmente sobre el DNA que…

A

Se curva fácilmente

257
Q

¿Qué secuencias de bases tienden a curvar el DNA?

A

A:T

258
Q

¿Qué son los sitios hipersensibles?

A

Regiones de DNA libres de nucleosomas

259
Q

¿El DNA de un nucleosoma aislada está disponible para la unión de proteínas?

A

Sí

260
Q

¿Quién cataliza el deslizamiento del nucleosoma?

A

Las CRC-ATP-dependientes

261
Q

¿El deslizamiento de las histonas implcia gasto de ATP?

A

Sí

262
Q

La remodelación de la cromatina puede producir:

A
  1. Cambio conformacional del DNA en la superficie del octámero (más expuesto)
  2. Desplazamiento del octámero
  3. Reemplazamiento de histonas
  4. Eliminación parcial de histonas
  5. Eliminación total del octámero
263
Q

¿Qué son las chaperonas?

A

Proteínas cargadas negativamente que forman complejos con dímeros H3-H4 o H2A-H2B y lso escoltan a los sitios de ensamblaje

264
Q

¿Qué son las poliaminas?

A

Derivados de la ornitina

265
Q

¿Cómo es el DNA de muchos cromosomas bacterianos y virales?

A

DNA circular cerrado

266
Q

Los DNAcc cuando se purifican raramente están…

A

Relajados

267
Q

¿Qué es una propiedad topológica del DNA?

A

Aquella que no cambia cuando se distorsiona (sin rasgarse o romperse)

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