Tema 2.2 Flashcards
¿Cuál es una de las enzimas más abundantes del cromosoma?
La topoisomerasa II
¿Qué hacen los inhibidores de la topoisomerasa II?
Matan células que se dividen rápidamente
¿Qué son los TAD?
Dominios asociados topológicamente
Los TAD están rodeados de sitios de reconocimiento del DNA para la proteína…
CTCF (factor de unión a CCCTC)
¿Qué hace la proteína CTCF?
Une sitios del DNA que de otra forma estarían distantes
Los TAD están separados por…
Elementos barrera
Los elementos barrera impiden…
La expansión de la heterocromatina
¿Qué son los aisladores?
Estructuras especializadas de cromatina que típicamente contienen sitios hipersensibles
¿Qué hacen los aisladores?
Mantienen la independencia de los TADs evitando interacciones entre dominios adyacentes
Los elementos aisladores se emplear para:
- Bloquear el paso de cualquier efecto de activación o inactivación de los elementos control
- Proporcionar barreras contra la propagación de la heterocromatina
Las secuencias barrera contienen sitios de unión para…
HAT
Los elementos barrera de DNA que separan previenen los efectos de … sobre los …
“Enhacer”/”Silencers”, promotores
¿Cuándo se produce el efecto de posición?
Cuando un fragmento de un cromosoma que está como eucromatina se transloca a heterocromatina
El fenómedo de efecto posicional expande el estado…
Heterocromatínico
¿La heterocromatina se autopropaga?
Sí
La extensión de la heterocromatina … genes
Inactiva
¿De qué depende la probabilidad de que un gen sea inactivado?
De su distancia de la región de heterocromatina
¿La cromatina en el núcleo interfásico está empaquetada de manera uniforme?
No
Características de la eucromatina
- Conformación del DNA relativamente más abierta
- Forma de la masa general de la cromatina interfásica
- Diferentes estados de condensación durante la interfase y la mitosis
- Transcripcionalmente activa (muchos genes)
Características de la heterocromatina
- Grado de condensación máxima
- Nucleosomas mucho más próximos que en eucromatina
- Estructura en lazos más extensa y empaquetada
- No accesible
- Transcripcionalmente inactiva (pocos genes)
- Incluye secuencias altamente repetitivas
¿Qué tiene mayor grado de condensación, la heterocromatina o el cromosoma metafásico?
El cromosoma metafásico
La heterocromatina solo se descondensa para…
Replicarse (fase S)
¿Qué incluye la heterocromatina?
Centrómeros, telómeros y genes transcripcionalmente inactivos
¿En qué tipo de cromatina están más acetiladas las histonas?
En la eucromatina
¿La HP1 contribuye a condensar o descondensar la cromatina?
Condensar
¿A dónde se une la HP1?
A las colas N-ter de la H3 trimetiladas y a otras moléculas HP1
¿Qué recluta HP1?
HMT
HP1 potencial la actividad de…
DMT1 (incrementando la metilación de la C)
La masa total de las histonas asociadas con DNA en la cromatina es … a la masa del DNA
Igual
¿Qué significa lncRNA?
RNA no codificante largo
Los lncRNA pueden…
- Adoptar diversas estructuras
- Interactuar con el DNA, proteínas y otros RNA
¿Qué son los territorios cromosómicos?
Regiones (dominios subnucleares) que limitan la estructura completa de cada cromosoma interfásico
¿Los cromosomas interfásicos están más o menos condensados que los metafásicos?
Menos condensados
¿Hay mezcla de DNA en los territorios cromosómicos?
No
¿En qué parte del núcleo tienden a situarse los cromosomas más grandes (con más heterocromatina)?
En la periferia
¿Qué abunda en los compartimentos intercromatínicos?
- Maquinaria transcripcional
- Genes transcripcionalmente activos
¿Qué separa a los territorios cromosómicos?
Regiones no cromatínicas
¿Qué une a las cromátidas hermanas?
Las cohesinas
Las condensinas crean superenrollamientos…
Positivos
¿Qué es el valor C?
Es la cantidad de DNA por genoma haploide (23 cromosomas en humanos)
Los cromosomas eucarióticos requieren 3 cosas durante su división celular.
- Orígenes de replicación
- Centrómeros
- Telómeros
¿Cuántos orígenes de replicación tiene un cromosoma eucariótico?
Varios
Las regiones teloméricas son ricas en bases…
G y C
¿Qué bases sobresalen del telómero?
Guanina
Funciones de las proteínas ligantes del telómero:
- Protección física de los extremos
- Mantenimiento de la longitud del telómero
¿Qué hacen las proteínas implicadas en la replicación completa de los telómeros?
Reclutan una DNA polimerasa inusual (telomerasa)
¿Qué son las TBPs?
Proteínas ligantes del telómero
La mayoría de organismos tiene 3 clases de TBPs:
- Las que unen extremos monohebra (ricos en G): POT1
- Las que unen DNA doble hebra (TRF1, TRF2)
- Proteínas asociadas al telómero (Rap1, Tin2)
¿Cuántas proteínas forman la caperuza protectora del cromosoma?
Seis
¿Por qué nombre se conoce a la caperuza protectora del cromosoma?
Complejo shelterin
Secuencia de repetición telomérica:
TTAGGG
¿Qué hace el complejo TRF1?
Regula el mantenimiento del telómero mediado por telomerasa
¿Qué hace el complejo TRF2?
Protege los extremos del cromosoma
El DNA telomérico puede existir como…
- Lazo T
- Forma lineal
Los largos salientes de la cadena G favorecen la formación de…
G-cuadruplex
¿Qué inhibe la estructura de G-cuadruplex?
El proceso de reparación del DNA
¿Los telómeros cortos de eucariotas inferiores son o no nucleosomales?
No
¿Qué tipo de proteína es la telomerasa?
Una ribonucleoproteína que actúa como reverso transcriptasa
¿Cuáles son los 2 componentes de la telomerasa?
- Proteico
- RNA
¿Qué extremo extiende la telomerasa?
El 3’
¿Cuáles son las subunidades de la telomerasa?
hTR y hTERT
¿Qué es hTR?
Subunidad RNA de 451 ribonnucleótidos de la telomerasa
¿Qué es hTERT?
Subunidad catalítica DNA pol RNA dependiente de la telomerasa
¿En qué células es activa la telomerasa?
En células madre y en eucariotas unicelulares
¿Qué detiene al ciclo celular en la fase G1?
La activación de p21, activado por la fosforilación de p53 ante el daño celular
¿A qué se une p21?
A una Cdk-ciclina, desactivándolo y deteniendo el ciclo
Los mecanismos de reparación del DNA activan a la proteína…
Protein kinasa de p53
¿Qué estimula p53?
La expresión de p21
¿Qué es el límite de Hayflick?
Es el número de duplicaciones que puede sufrir una célula eucariota antes de entrar en senescencia
¿Qué inhiben lasTBPs?
La telomerasa
La elongación de los telómeros también se puede llevar a cabo por…
Recombinación
¿Qué es un alelo?
Secuencia de DNA situada en un locus
¿Qué es un locus?
Posición definida ocupada por un gen en ambos cromosomas homólogos
¿Qué son las proteínas HU?
Proteínas inestables al calor de procariotas
¿Qué es IHF?
Factor de integración del hospedador de procariotas
IHF tiene muchas cargas…
Positivas
