Technologies de l'ADN - séquence ADN Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qui peut causer une dénaturation de l’ADN

A

Augmentation température

Augmentation pH

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2
Q

L’ADN dénatur. peut-elle se rénaturer?

A

Oui si on revient aux bonnes conditions

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3
Q

Qu’est-ce que la méthode de Sanger

A

Méthode pour connaître la séquence de l’ADN par l’ajout des amorces de didéoxynucléotide

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4
Q

Quelle est la particularité des didéoxtribonucléoside

A

Pas de OH au carbone 3

-Ne peut pas faire de lien phosphodiester

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5
Q

Nomme les étapes de la méthode de Sanger

A
  1. Séparation des brins
  2. Ajout amorces, déoxynucléotides, ADN polymérase et un des didéoxynucléotides
  3. Séparation sur gel
  4. Lecture de la séquence
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6
Q

Quel est le principle / cycle du PCR

A
  1. Séparation des brins (95)
  2. Hybridation des amorces (55)
  3. Synthèse par ADN pol E coli (37) ou Taql (72)
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7
Q

Quel est le but du PCR

A

Amplification d’une chaîne d’ADN spécifique

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8
Q

Les séquences répétées en tandem (STR, VNTR) peuvent être utilisé dans quoi

A

DNA fingerprinting

*Le nombre varie dans un même locus pour chaque individu

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9
Q

Dans une réaction de PCR, pourquoi faut-il chauffer à 95 C

A

Pour pouvoir séparer les brins

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10
Q

Quelles sont les différences entre VNTR et STR

A

VNTR : 10-100 nucléotides

STR : 2-6 nucléotides

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11
Q

Comment peut-on déterminer l’identité d’un individu en laboratoire en utilisant un échantillon contenant de l’ADN

A
  1. PCR pour amplifier l’ADN

2. DNA fingerprinting avec le nombre de séquences répétées en tandem

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12
Q

Qu’est ce que le polymorphisme de nucléotides simples (SNP)

A

Site dans la séquence d’ADN où les individues diffèrent selon une seule base d’ADN
Maintenu par l’hérédité

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13
Q

Quelle est la différence entre un SNP et une mutation

A

SNP : variation de base trouvé dans plus 1% de la population

Mutation : variation trouvé dans moins 1% de la population

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14
Q

Les SNP peuvent être associé à quoi

A
Risque de maladies (cancer, fibrose kystique..)
Comportement social
Performance musculaire
Couleur des yeux / cheveux
Réponse aux médicaments
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15
Q

Qu’est-ce qu’un SNP causatif

A

Causent un trait génétique, maladie, susceptibilité, différence à traitement….

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16
Q

Qu’est-ce qu’un SNP liés

A

À proximité d’un gène causant un trait génétique….

Ils ne causent pas le trait mais servent de marqueur

17
Q

Quelle est l’action possible d’un SNP des régions codante

A

Peuvent affecter la séquence / fonction des protéines

18
Q

Quelle est l’action possible d’un SNP des régions non codante

A

Peuvent affecter

  1. Épissage de pré-ARNm
  2. Régulation d’un gène
  3. Niveau d’expression
19
Q

Qu’est-ce qu’un haplotype

A

Ensemble de variation d’ADN qui ont tendance à être hérités ensemble
*combinaison d’allèles/ ensemble de SNP trouvé sur le même chromosome

20
Q

Quel est l’utilité des SNP dans la médecine personnalisée

A

Prédire la susceptibilité à des maladies

Offrir un traitement individualisé

21
Q

Quel composé provoque la terminaison de chaine dans la méthode de séquençage d’ADN de Sanger

A

Didéoxynucléotides

22
Q

Comment on obtient de l’ADN simple brin in vitro

A

Dénaturation thermique

23
Q

Quelles sont les composantes essentielles d’une réaction de polymérisation de l’ADN in vitro

A
  1. Amorce
  2. Matrice (Oligonucléotide ADN / ARN)
  3. Désoxynucléotides
  4. ADN polymérase