ARN non codant - miRNA / siRNA Flashcards
Qu’est-ce qu’un ARN non codant
ARN fonctionnelle qui est transcrite mais pas traduite en protéine
Vrai ou faux
Les ncRNA ne sont pas impliqués dans des phénomènes épigénétiques
Faux
Quelle est la différence entre lncRNA et sncRNA
lncRNA : plus que 200 nucélotides
sncRNA : moins que 200 nucléotides
Les iRNA (RNA interference) joue un rôle important dans quoi
Défense des cellules contres les séquences nucléotidiques pasasites - virus et transposons
Comment les iRNA agissent dans leur rôle de défense
Molécule d’ARN inhibitent l’expression / traduction des gènes en neutralisant les ARNm ciblées
Qu’est-ce qu’un microARN (miRNA)
ncRNA d’environ 22 nucléotides
Fonctionne dans la régulation post-transcriptionnelle
Quelles sont les façons que les microARN silencent les ARNm cibles
- Clivage du brin d’ARNm
- Déstabilisation par raccourcissement de sa queue poly A
- Réduction de l’efficacité de traduction de l’ARNm
Les gènes de miRNA sont généralement transcrits par quel ARN polymérase
ARN polymérase II
*certains sont transcrit par pol III
Quelle est la forme du miRNA primaire (pri-miARN)
boucle-tige d’ARN de 70-80 nucléotides contenant 1-6 précurseurs de miRNA
*il est coiffé, polyadénylé et épissé
Quel est le rôle de DGCR8 / Pasha (chez les invertébrés)
S’associe à l’enzyme Drosha, une protéine qui couple l’ARN pour former le complexe du microprocesseur
Quel est le résultat du cropping de Drosha
pré-miRNA a deux nucléotides non-appariés à son extrémité 3’
Les pré-miRNAqui sont épissé directement à partir d’introns contournent le complexe du microprocesseur.
Quel est leur nom et ils sont processés par quel enxyme
Mitrons
Debranching enzyme
Quel est le produit des pri-miRNA provenant du microprocesseur ou des RNA provenant directement des introns
pré-miRNA
Possède des groupe OH en 3’ et phosphate en 5’
Comment s’effectue l’exportation des pré-miRNA du noyau vers le cytosol
Par Exportin-5
-Reconnait les 2 nucléoties laissés à l’extrémité 3’ par Drosha
Le transport par l’exportine-5 est dépendant de quel type d’énergie
GTP lié à protéine RAN
RAN-GTP
Décrit le rôle de l’endoribonucléase Dicer
Processe le pré-miRAN
- Coupe la boucle reliant le bras
- Done un duplex miARN : miARN* imparfait d’environ 22 nucléotides
QUel brin est généralement incorporé au RISC (complexe de silencing induit par l’RNA)
Brin guide
*brin passager dégradé
Quelle protéine est essentielle dans la fonction RISC
Argonaute
-Nécessaire pour le silençage induit par miRNA
Quel est le rôle des Ago dans le RISC
Lient le miRNA mature et le guide pour une interaction avec ARNm cible
-Si appariement étendu, mRNA est clivé et dégradé
Qu’est-ce qui arrive si l’apariement des miRNA est partiellement complémentaire avec ARNm cible
Inhibe la traduction
ex:
- Accélère déadénylation
- Modification d’histone et méthylation ADN
- …
Les mRNA inhibés sont séquestrés / dégradés dans quoi
P-bodies
-Contient enzyme Dcp1 (decaping enzyme) et enzymes de dégradations
Vrai ou faux
Tous les miRNA sont intracellulaires
Faux
Certains (miRNA circulant) peuvent se trouver dans environnement extracellulaire
Quelle est la différence entre les miRNA et siRNA
miRNA : dérive de régions de transcrits en ARN qui se replient pour former de courtes épingles à cheveux
siRNA: dérive de régions plus longue d’ARN double brin (dsRNA)
Quel est le mécanisme de biogenèse des siRNA
La même que pour les miRNA
i.e. coupage, passe par RISC….
Parmi les miRNA et siRNA, laquelle offre une inhibition plus efficace
siRNA
Production de multiple fragments de dsRNA de 23bp
Plus de cites ciblés
Le RITS (silençage pré-transcriptionnel de l'interférence ARN) peut également inhibé la transcription Comment fonctionne le RITS
Méthylation de l’ADN à des positions complémentaire à des siRNA / complexe miRNA
Quel est un “avantage” du RITS comparé au RISC
L’inhibition peut se maintenir même après la disparition des iRNA
-hétérochromatine s’auto-propage
