ARN non codant - miRNA / siRNA Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un ARN non codant

A

ARN fonctionnelle qui est transcrite mais pas traduite en protéine

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Q

Vrai ou faux

Les ncRNA ne sont pas impliqués dans des phénomènes épigénétiques

A

Faux

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3
Q

Quelle est la différence entre lncRNA et sncRNA

A

lncRNA : plus que 200 nucélotides

sncRNA : moins que 200 nucléotides

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4
Q

Les iRNA (RNA interference) joue un rôle important dans quoi

A

Défense des cellules contres les séquences nucléotidiques pasasites - virus et transposons

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5
Q

Comment les iRNA agissent dans leur rôle de défense

A

Molécule d’ARN inhibitent l’expression / traduction des gènes en neutralisant les ARNm ciblées

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6
Q

Qu’est-ce qu’un microARN (miRNA)

A

ncRNA d’environ 22 nucléotides

Fonctionne dans la régulation post-transcriptionnelle

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7
Q

Quelles sont les façons que les microARN silencent les ARNm cibles

A
  1. Clivage du brin d’ARNm
  2. Déstabilisation par raccourcissement de sa queue poly A
  3. Réduction de l’efficacité de traduction de l’ARNm
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8
Q

Les gènes de miRNA sont généralement transcrits par quel ARN polymérase

A

ARN polymérase II

*certains sont transcrit par pol III

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9
Q

Quelle est la forme du miRNA primaire (pri-miARN)

A

boucle-tige d’ARN de 70-80 nucléotides contenant 1-6 précurseurs de miRNA
*il est coiffé, polyadénylé et épissé

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10
Q

Quel est le rôle de DGCR8 / Pasha (chez les invertébrés)

A

S’associe à l’enzyme Drosha, une protéine qui couple l’ARN pour former le complexe du microprocesseur

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11
Q

Quel est le résultat du cropping de Drosha

A

pré-miRNA a deux nucléotides non-appariés à son extrémité 3’

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12
Q

Les pré-miRNAqui sont épissé directement à partir d’introns contournent le complexe du microprocesseur.
Quel est leur nom et ils sont processés par quel enxyme

A

Mitrons

Debranching enzyme

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13
Q

Quel est le produit des pri-miRNA provenant du microprocesseur ou des RNA provenant directement des introns

A

pré-miRNA

Possède des groupe OH en 3’ et phosphate en 5’

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14
Q

Comment s’effectue l’exportation des pré-miRNA du noyau vers le cytosol

A

Par Exportin-5

-Reconnait les 2 nucléoties laissés à l’extrémité 3’ par Drosha

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15
Q

Le transport par l’exportine-5 est dépendant de quel type d’énergie

A

GTP lié à protéine RAN

RAN-GTP

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16
Q

Décrit le rôle de l’endoribonucléase Dicer

A

Processe le pré-miRAN

  • Coupe la boucle reliant le bras
  • Done un duplex miARN : miARN* imparfait d’environ 22 nucléotides
17
Q

QUel brin est généralement incorporé au RISC (complexe de silencing induit par l’RNA)

A

Brin guide

*brin passager dégradé

18
Q

Quelle protéine est essentielle dans la fonction RISC

A

Argonaute

-Nécessaire pour le silençage induit par miRNA

19
Q

Quel est le rôle des Ago dans le RISC

A

Lient le miRNA mature et le guide pour une interaction avec ARNm cible
-Si appariement étendu, mRNA est clivé et dégradé

20
Q

Qu’est-ce qui arrive si l’apariement des miRNA est partiellement complémentaire avec ARNm cible

A

Inhibe la traduction

ex:
- Accélère déadénylation
- Modification d’histone et méthylation ADN
- …

21
Q

Les mRNA inhibés sont séquestrés / dégradés dans quoi

A

P-bodies

-Contient enzyme Dcp1 (decaping enzyme) et enzymes de dégradations

22
Q

Vrai ou faux

Tous les miRNA sont intracellulaires

A

Faux

Certains (miRNA circulant) peuvent se trouver dans environnement extracellulaire

23
Q

Quelle est la différence entre les miRNA et siRNA

A

miRNA : dérive de régions de transcrits en ARN qui se replient pour former de courtes épingles à cheveux

siRNA: dérive de régions plus longue d’ARN double brin (dsRNA)

24
Q

Quel est le mécanisme de biogenèse des siRNA

A

La même que pour les miRNA

i.e. coupage, passe par RISC….

25
Q

Parmi les miRNA et siRNA, laquelle offre une inhibition plus efficace

A

siRNA
Production de multiple fragments de dsRNA de 23bp
Plus de cites ciblés

26
Q
Le RITS (silençage pré-transcriptionnel de l'interférence ARN) peut également inhibé la transcription 
Comment fonctionne le RITS
A

Méthylation de l’ADN à des positions complémentaire à des siRNA / complexe miRNA

27
Q

Quel est un “avantage” du RITS comparé au RISC

A

L’inhibition peut se maintenir même après la disparition des iRNA
-hétérochromatine s’auto-propage