TDs

Question 1

Caractériser un icosaèdre (nombre de faces, centres de symétries)

Answer 1

20 faces
12 sommets 30 arrêtes
3 types de centres de symétrie : 30 d’ordre 2, 20 d’ordre 3 et 12 d’ordre 5

Question 2

De quoi est formée la capside virale ?

Answer 2

D’un multiple T x 60 SU protéiques.

Question 3

C= ?

Answer 3

P + H = 12 + H

Question 4

Que veut dire monocystronique ? En quoi est-ce un problème pour les virus que les ARN de la cellule sont monocytroniques ?

Answer 4

Monocystroniques : 1 ARNm pour 1 protéine. Problèmes car les ribosomes de la cellule sonthabitués a des ARN monocystroniques alors que les ARN viraux sont polycistroniques.

Question 5

Pourquoi les ARN cellulaires sont favorisés aux ARN viraux par rapport aux ribosomes ?

Answer 5

Parce que les ARN viraux sont polycistroniques.

Question 6

A quoi sert la région 5’ UTR des ARN ?

Answer 6

C’est très important pour initier la traduction car porte la coiffe.

Question 7

Quel est le rôle de la coiffe ?

Answer 7

Protège l’ARN des exonucléases et recrute la machinerie traductionelle.

Question 8

A quoi sert la poly A tail ?

Answer 8

stabilisation et protection.

Question 9

Qu’est-ce que EIF 4G ?

Answer 9

C’est un facteur d’ini. de traduction.

Question 10

Quel interêt de circulariser l’ARN viral et comment se fait ce procédé ?

Answer 10

Si on circularise l’ARN viral, les ribosomes, une fois atteint le codon stop, resteront très proches de l’extrémité 5’ et reprendront donc la traduction.
Se fait quand EIF 4g interagit avec 4e.

Question 11

Qu’est-ce que VPG ?

Answer 11

C’est une protéines fixée de manière covalente au génome chez les virus à l’extrémité 5’, joue rôle protecteur mais pas analogue de la coiffe !

Question 12

Comment est organisée l’extrémité 3’ des virus ?

Answer 12

Repliée sur elle même dans une structure qui ressemble à un ARNt.

Question 13

Qu’est-ce qu’une polyprotéine ?

Answer 13

C’est une protéine contentant plusieurs protéines fonctionnelles inactives jusqu’a ce qu’elle se fasse cliver par une protéase.

Question 14

Quelle différence entre une polyprotéine qui se coupe elle-même et une polyprotéine qui exise une autr ?

Answer 14

Si s’auto excise : coupe en cis, sinon en trans.

Question 15

Quel avantage et inconvénients d’avoir 1 seul ORF et donc une polyprot ?

Answer 15

Rapide mais obilge a assigner de l’espace codant pour une protéase, et les quantités sont toujours identiques : gaspillage de matériel.

Question 16

Comment est-ce que les ARN polycistroniques (avec pluseurs ORFs disons 3) sont alors transcrits ?

Answer 16

L’orf 1 est traduit, codon stop arrête. Si l’orf1 code pour une polymérase virale, celle ci code le génome en partant de 3’ (miroir) et ajoute un nouveau promoteur interne qui fait que l’orf1 ne sera plus traduit. Le gène n’est plus que bicystronique

Question 17

Qu’est-ce que le Leaky Scanning ?

Answer 17

Il s’agit d’une traduction jusqu’au codon AUG qui est entouré de structures dites complexe de Kozac. si ces structures sont “favorables”, par d’arrêt de la traduction et les deux protéines sont traduites, pour 1 seul ORF, avec des taux différents (80% fav 20% defav).

Question 18

qu’est-ce que la translecture ?

Answer 18

ORF 1 et 2 collés ensemble juste séparés par un codon stop : si ARNt suppresseur disponible, le codon stop est ignoré et conduit à la production d’une protéine fusionnée P1+P2. P1 est donc majoritaire aussi.