Picornavirus

Question 1

Comment se caractérise le génome des picornavirus de manières générale ?

Answer 1

C’est un génome à ARN+ avec des IRES.

Question 2

Donner deux caractérstiques notables des picornavirus.

Answer 2

Ils se mutiplient rapidement.

Ils sont stables dans le milieu extérieur.

Question 3

Qu’est-ce que les Enterovirus ?

Answer 3

Ce sont un genre de Picornaviridae, responsables des gastro etc par exemple.

Question 4

Quelle maladie est particulièrement connue pour être des enterovius ?

Answer 4

La poliomyélite.

Question 5

Donner : cibles, symptomes, traitement de la polio.

Answer 5

Cibles : surtout les enfants en bas âge.
Symptomes : si bénigne, juste fièvre etc sinon paralysie + mort éventuelle.
Traitement : aucun ! Il faut vacciner.

Question 6

Quelles sont les 4 phases de la pathogenèse de la polyo ?

Answer 6

1) Phase digestive : entre par pharynx et se pose dans l’intestin grêle.
2) Phase lymphatique : squatte les ganglions lymphatiques
3) Phase virémique : squatte les tissus extra-neuronaux.
4) Phase neuronale : franchit la barrière HC et attaque les neurones moteurs.

Question 7

Décrire le virion des PV.

Answer 7

C’est une nucléocapside non enveloppée, icosaédrique (T=3 de 180 SU) composée de 4 protéines.

Question 8

Donner la composition en protéines de la capside du PV.

Answer 8

VP1 : 60x
VP2 : 60x
VP3 : 60x
VP4 : 60x

on en compte ici 240 et non 180 car VP4 est invisible en S étant sur la phase interne.

Question 9

Que trouve-ton autour des pentamères des 12 pentamères de VP1 ?

Answer 9

On trouve des canyons d’une profondeur de 2nm mais formant 7% de la surface du virion : c’est le site de fixation au récepteur cellulaire.

Question 10

Décrire le génome de picornavirus en détail (Longueur, ORFs, protéines du génome, extrémités.

Answer 10

ARN sb + de 7433 nt
ORF unique, donc polyprotéine de 256 kd
Présence d'une VPg en 5' et non coiffe !
5'NTR avec IRES de classe 1
3'NTR avec polyA
Région CRE

Question 11

Quel genre de récepteur est ciblé par les virus tels la polio ?

Answer 11

Les IG like receptors (CD155)

Question 12

Décrire les 3 étapes de l’attachement et l’entrée des PV.

Answer 12

1) Interaction du virus avec la cellule : le canynon intéragit avec CD155.
2) Changement de conformation, externalisation de VP4 myristylée et de VP1 (N terminal).
3) Internalisation par endocytose et libération de l’ARN génomique dans le cytoplasme

Question 13

Une fois la particule virale PV dans le cytoplasme que se passe-t-il ?

Answer 13

Formation de pore dans la membrane endosomiale : l’ARN est viré dans le cytoplasme.

Question 14

Comment est-ce que le PV est en mesure de rejoindre les neurones ?

Answer 14

Il fait une interaction du domaine cytoplasmique de CD155 avec la dynéine, puis transport rétrograde le long des MT de l’axone jusqu’au corps neuronal.

Question 15

Quelle est la particularité de l’initiation de la traduction avec les PV ?

Answer 15

Elle se fait de manière interne .

Question 16

Décrire la région 5’ des PV.

Answer 16

Elle est non codante, conservée, et très importante pour la traduction l’encapsidation et la virulence : Elle contient l’IRES.

Question 17

Que veut dire IRES ?

Answer 17

Internal Ribosome Entry Site. Parce que normlement les ribosomes s’attachent à une coiffe, mais pas de coiffe ici : VPg !

Question 18

A quoi aboutit la traduction de l’ORF unique ?

Answer 18

Aboutit à une protéine clivée par deux protéases différentes : 2A et 3CD.

Question 19

Qu’est-ce que la protéase 2A clive ?

Answer 19

Le N terminl de elF4G (complexe de recrutement des ribosomes) donc empêchant la traduction des ARNm cellulaires, sans pour autant empêcher la traduction des ARN viraux par IRES.
Clive aussi des TF
Clive les protéines du spliceosome (epissage niqué)
Clive les nucléoporines (trafic nucléocytoplasmique niqué)

Question 20

Qu’est-ce que la protéase 3C clive ?

Answer 20

La PABP qui lie la polyA en 3’ et elF4G en 5’, inhibant la traduction des ARN, cellulaire.
TBP et Oct-1, des facteurs de transcription.

Question 21

Qu’est-ce que les rosettesmembranaires ?

Answer 21

Les virus à ARN+ affectent méchemment les membranes intrcellulaires, qui font qu’elles ont des tronches chelou. En effet, elles sont utilisées comme compartiments de répliction.

Question 22

De quoi est formé le complexe de réplication des PV ?

Answer 22

RdRp (prot 3D)
Vpg amorce (prot 3B)
NTPase et Hélicase (2C)
Protéines membranaires (2B 2C 3A)
protéines cellulaires

Question 23

De quoi sont responsables 2BC et 3 AB ?

Answer 23

Ce sont les précurseurs de la membrane : ils forment des vésicules membrnaires de réplication.

Question 24

Comment se fait la réplication de l’ARN du PV1 ?

Answer 24

L’ARN est circularisé par interactions P/P, puis la synthèse d’ARN est initiée par la VPg (3B) (amorce) au niveau de la Poly A.

Question 25

Quel est la protéine précurseur de VPg ?

Answer 25

3AB, qui va donc être clivée poru la libérer.

Question 26

Quel est la protéine précurseur de la RdRp ?

Answer 26

3CD.

Question 27

Comment a été obtenu le vaccin à la polio ?

Answer 27

En faisant passer des souches virales surdes cellules de rein de singes plein de fois jusqu’a ce qu’ils perdent leur neurovirulence : une fois que c’était fait, ça donnait des immunités aux patients.