T11 - T15 Flashcards

1
Q

Porque razão conseguimos manipular DNA?

A
  • Múltiplas espécies , uma mesma linguagem genética.
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2
Q

O que é cDNA Cloning?

A
  • A clonagem a partir de moléculas de mRNA depende de uma polimerase incomum, a transcriptase reversa, que pode usar uma molécula de RNA de fita simples como molde e sintetizar um DNA complementar (cDNA).
  • O cDNA resultante em comprimento total contém uma sequência ininterrupta que codifica a proteína de interesse.
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3
Q

Que tipos de cromossomas são geneticamente instáveis?

A
  • Aqueles sem centrómero ou com mais de um.
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4
Q

Caso um cromossoma apresente 2 centrómeros um deles pode ser desativado, qual?

A
  • O do braço comprido, isto é o do braço Q.
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5
Q

Porque razão as bandas citogenéticas aparentam cores diferentes após coloração específica?

A
  • Devido à variação na composição de bases e estrutura cromatínica das diferentes regiões do DNA.
  • Regiões ricas em adenina e timina (A-T) ⭢ coram mais intensamente, aparecendo como bandas escuras (bandas G);
  • Regiões ricas em guanina e citosina (G-C) ⭢ coram menos, aparecendo como bandas claras.
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6
Q

Como pode descrever a localização de um dado gene num cromossoma?

A
  1. Nº do cromossoma;
  2. Braço Q ou P;
  3. Região;
  4. Banda;
  5. Sub-banda.
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7
Q

Qual a importância do centrómero?

A
  • Crucial para a correta segregação dos cromossomas durante a divisão celular.
  • É o ponto de ligação para as fibras do fuso mitótico.
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8
Q

Identifique os três tipos de cromossomas no que diz respeito à localização do centrómero.

A
  1. Metacêntrico: centrómero está aproximadamente no meio, braços de comprimento quase igual.
  2. Submetacêntrico: centrómero está deslocado do centro, criando um braço curto (p) e um braço longo (q).
  3. Acrocêntrico: centrómero está muito próximo de uma extremidade, criando um braço muito curto e um braço muito longo.
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9
Q

O que distingue os centrómeros dos diferentes cromossomas humanos?

A
  • Cada centrómero possui um padrão único de sequência de DNA satélite que facilita a correta segregação dos cromossomos durante a divisão celular.
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10
Q

Identifique as regiões importantes do cromossoma Y humano.

A
  • Região pseudo-autossômica (PAR): áreas que recombinam com o cromossoma X durante a meiose.
  • Região não recombinante do Y (NRY): contém genes específicos do Y.
  • Gene SRY: responsável pela determinação do sexo masculino.
  • Euchromatina e heterocromatina: diferentes regiões estruturais e funcionais do cromossoma.
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11
Q

Qual a importância do gene SRY?

A
  • É crucial para a determinação do sexo masculino.
  • Codifica um fator de transcrição que inicia o desenvolvimento dos testículos, levando à diferenciação sexual masculina.
  • A ausência ou mutação deste gene geralmente resulta no desenvolvimento de características femininas.
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12
Q

O que significa um organismo ser hermafrodita sequencial? Dê exemplos.

A
  • Pode mudar de sexo durante sua vida.
  • Existem dois tipos principais:
  1. Protândrico: inicialmente macho e depois se torna fêmea (ex. peixes-palhaço).
  2. Protogínico: inicialmente fêmea e depois se torna macho (ex. peixes-labrídeos).
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13
Q

Defina SNP e SSR no contexto de mapeamento genético.

A
  • SNP ⭢ Single Nucleotide Polymorphism : variações de um único nucleotídeo no genoma que ocorrem com frequência na população. Marcadores genéticos para mapear genes associados a doenças.
  • SSR ⭢ Simple Sequence Repeat: repetições curtas de sequências de DNA (microssatélites) que são altamente polimórficas e usadas em estudos de ligação genética e identificação individual.
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14
Q

Defina RFLP e suas aplicações no mapeamento genético.

A
  • RFLP ⭢ Restriction Fragment Length Polymorphism: é uma técnica que explora variações no comprimento de fragmentos de DNA gerados por digestão com enzimas de restrição.
  • As diferenças nos padrões de fragmentos podem ser usadas para mapear a localização de genes, estudar a variabilidade genética e analisar a herança de características genéticas.
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15
Q

Quais são alguns exemplos de doenças resultantes de mutações em células germinativas?

A
  1. Fibrose Cística;
  2. Hemofilia;
  3. Anemia Falciforme.
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16
Q

O que é uma mutação condicional?

A
  • Uma mutação condicional é uma mutação cuja expressão fenotípica depende de certas condições ambientais específicas.
  • Isso significa que o efeito da mutação só se manifesta sob determinadas circunstâncias, como mudanças na temperatura, na presença ou ausência de determinados nutrientes, ou outros fatores ambientais.
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17
Q

O que é uma mutação de ganho de função?

A
  • Mutação que qualitativamente altera a ação de um gene, por exemplo, fazendo uma célula expressar um gene que normalmente não expressaria.
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18
Q

O que é uma Mutação Hipomórfica?

A
  • Mutação que reduz a expressão de um gene.
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19
Q

O que é uma Mutação Hipermórfica?

A
  • Mutação que aumenta a expressão de um gene.
20
Q

Qual a diferença entre uma Mutação de Tipo Transição e Transversão?

A
  • Mutação Tipo Transição alteram as bases para um do mesmo tipo, p.ex: uma pirimidina para uma pirimidina.
  • Mutação Tipo Transversão alteram as bases para um tipo diferente, p.ex: uma pirimidina para uma purina e vice-versa.
21
Q

Que 2 grandes tipos de mutações podem ocorrer a ORF?

A
  1. Mutação por Substituição de bases;
  2. Mutação por Adição ou Deleção de bases.
22
Q

O que acontece se o número de bases adicionadas ou deletadas numa mutação não forem múltiplos de 3?

A
  • Ocorre um Frameshift!
  • Existe uma mudança na estrutura de toda a proteína dessa mutação para a frente.
23
Q

O que é uma mutação sem sentido?

A
  • É codificado um codão STOP onde não deveria e a tradução pára.
24
Q

O que é um Hot Spot de mutação?

A
  • Locais na cadeia e DNA onde é mais provável ocorrer uma mutação.
  • P.ex: sítios de metilação da citosina.
25
Q

Qual o efeito dos seguintes agentes sobre o DNA?

  1. Água;
  2. Agente Oxidante;
  3. Agente Alquilante;
  4. Agente Intercalante;
  5. Raios Ultra-violeta.
A
  1. Depurinação ⭢ Retirada de A e G das deoxirriboses;
  2. Deaminação ⭢ -NH2 para O;
  3. Adição de um grupo metil ou etil nas bases;
  4. Moléculas que se enfiam na cadeia de DNA de maneira intercalada e faz a topoisomerase II deixar uma quebra de DNA e faz haver erros no reparo do DNA;
  5. Forma dímeros de pirimidinas (ligações covalentes entre pirimidinas adjacentes, especialmente T).
26
Q

Qual o efeito dos seguintes agentes sobre o DNA?

  1. Radiação ionizante;
  2. Análogo de base azotada como o 5-bromouracil;
  3. Análogos de nucleótidos.
A
  1. Quebra de DNA de cadeia única ou de cadeia dupla e causa danos a nucleótidos;
  2. Aumenta o mispairing entre bases;
  3. Alguns análogos podem ser erroneamente incorporados no lugar dos nucleótidos normais, resultando em mutações.
27
Q

Qual é o resultado da radiação UV sobre o DNA? Quais as alterações moleculares que resultam deste processo?

A
  • Pode formar dímeros de pirimidinas (especialmente timina) através da formação de ligações covalentes entre pirimidinas adjacentes;
  • Causando a distorção da dupla hélice de DNA e formação de fotoprodutos 6-4 (ligações entre o carbono 6 de uma timina e o carbono 4 de uma citosina adjacente).
28
Q

Quais os mecanismos de reparação envolvidos nas mutações resultantes da radiação UV?

A
  • Reparação por Excisão de Nucleotídeos (NER): Remove e substitui segmentos de DNA contendo dímeros de timina e outros fotoprodutos. Envolve as etapas de reconhecimento do dano, excisão do segmento danificado, síntese de DNA complementar e ligação.
29
Q

Em que circunstâncias mutações associadas à radiação UV podem ter piores consequências?

A
  • Exposição prolongada a radiação.
  • Pessoa com sistema de reparação deficiente.
30
Q

Quais os efeitos de radioatividade no DNA?

A
  • Quebra de cadeia dupla e simples de DNA, e danos em nucleótidos, que podem causar tumores e mutações que podem ser transmitidas hereditariamente (germinativas).
31
Q

O que são mutações dinâmicas?

A
  • Mutações dinâmicas são um tipo específico de mutação genética caracterizada pela expansão instável de sequências repetitivas trinucleotídicas de nucleotídeos no DNA.
  • Essas mutações são dinâmicas porque a quantidade de repetições pode aumentar (ou, menos frequentemente, diminuir) de uma geração para a outra, tornando-as instáveis ao longo das gerações.
32
Q

Qual é uma patologia resultante de uma mutação dinâmica e qual a sua causa molecular?

A
  • A Síndrome do X frágil, causada pela expansão do trinucleotídeo CGG no gene FMR1.
33
Q

Qual é o efeito das aflatoxinas no DNA?

A
  • Elas são um potente carcinógeno.
  • Elas geram sítios apurínicos após a formação de um produto de adição na posição N-7 da guanina.
34
Q

Qual o mecanismo /enzimas responsável por reparar alterações provocadas pela presença de bases modificadas quimicamente?

A
  • Excisão de base realizado por DNA glicosilases específicas para cada base!
35
Q

Qual é o mecanismo /enzimas responsável por reparar alterações provocadas pela presença de bases mal emparelhadas?

A
  • O sistema de reparo de incompatibilidade, que reconhece o grau de metilação de uma fita e prefere excisar nucleotídeos da fita menos metilada, que deve ser a fita recém-sintetizada.
36
Q

Qual é o mecanismo /enzimas responsável por reparar alterações provocadas pela presença de nucleótidos que perdem as suas purinas /pirimidinas?

A
  • Sistema de reparação de endonucleases AP que retiram os açúcares sem base (espaço que vai ser posteriormente preenchido por DNA polimerase).
37
Q

Qual é o mecanismo /enzimas responsável por reparar alterações provocadas pela existência de um fragmento na cadeia de DNA contendo uma sequencia de 10 nucleótidos mutados?

A
  • Através do mecanismo de NER (nucleotide excision repair), que retira a porção de DNA mutada e usa a cadeia que restou como template para preencher o espaço vazio.
38
Q

Qual é o mecanismo /enzimas responsável por reparar alterações provocadas pela radiação ultravioleta?

A
  • Uso de enzimas para excisão de nucleótidos ou bases (NER e BER).
39
Q

Descreva o mecanismo que permite que a replicação prossiga apesar de existir uma sequência mutada que não foi reparada numa das cadeias do DNA.

A
  • Reparo Pós-Replicação (Sistema SOS).
  • Síntese Translesão (TLS).
  • Mecanismo: O sistema SOS é uma resposta global ao dano no DNA em bactérias (principalmente Escherichia coli), ativado pela presença de lesões que bloqueiam a replicação. Ele envolve a indução de um conjunto de genes que codificam várias proteínas de reparo e tolerância a danos.
40
Q

Qual o complexo responsável pela reparação por excisão de nucleótidos e qual a sua constituição?

A
  • O complexo responsável pela reparação por excisão de nucleótidos (NER) é composto por:
  1. XPC-RAD23B: Detecta lesões distorcidas na hélice de DNA.
  2. XPA, RPA: Estabilizam a região do dano e recrutam outras proteínas.
  3. TFIIH: Um complexo proteico com atividade helicase (XPB e XPD) que desenrola a hélice de DNA ao redor do dano.
  4. ERCC1-XPF: Nuclease que corta o DNA no lado 5’ da lesão.
  5. XPG: Nuclease que corta o DNA no lado 3’ da lesão.
41
Q

Em que situações da célula é que o complexo de reparação por excisão de nucleótidos vai atuar? Exemplifique.

A
  • Danos por radiação UV, produtos quimicos, oxidação e toxinas.
42
Q

Qual a função do XPD, membro do complexo NER?

A
  • Separa as cadeias de DNA na direcção 5’-3’ e ancora o complexo CAK.
43
Q

Qual o fenótipo e alteração molecular de um individuo com Xeroderma pigmentoso?

A
  • Hiperpigmentação da pele após exposição a luz solar
  • Aumento do risco em 1000x = de desenvolver cancro de pele
  • A nível molecular: mutações no domínio helicase no XPD sem alterar a sua estrutura (altera a NER).
44
Q

Qual o fenótipo e alteração molecular de um individuo com Tricotiodistrofia?

A
  • Atraso mental e de desenvolvimento severo;
  • Características de envelhecimento precoce;
  • A nível molecular: Causa alterações na estrutura geral do XPD
45
Q

Qual o fenótipo e alteração molecular de um individuo com a síndrome de Cockayne?

A
  • Fotossensibilidade;
  • Malformações ósseas e estatura reduzida;
  • A nível molecular: Mutações numa glicina no dominio helicase (altera a NER e a transcrição).