Syndromes Microdélétionnels S.Boucquillon Flashcards
Qu’est-ce qu’un CNV ?
Variation du nombre de copies : perte (délétion) ou gain (duplication, amplification) de copie d’une région chromosomique (>1000 bases)
Terme neutre : bénin, pathogène, de signification incertaine.
Que désignent les ‘genomic disorders’ ?
Pathologies résultant d’un gain ou d’une perte de matériel chromosomique (CNV)
Ces troubles peuvent avoir des conséquences cliniques variées.
Comment définit-on un syndrome microdélétionnel ?
Syndrome = association de signes cliniques, microdélétionnel = non visible au caryotype
Plus de 200 syndromes microdélétionnels sont décrits.
Quel est le pourcentage de variabilité intra et extra familiale pour la délétion 22Q11.21 ?
70%
Cela indique une grande variabilité dans l’expression clinique.
Quel est le mécanisme de détection par caryotype ?
Caryotype (pangénomique, résolution 10 Mb)
Utilisé pour détecter des anomalies chromosomiques.
Quel est le principe de la méthode CGH-array ?
CGH-array (pangénomique, résolution 100kb)
Permet de détecter des gains et des pertes de matériel génétique.
Qu’est-ce que la méthode FISH ?
FISH (ciblée, résolution 150-200kb)
Utilise des sondes spécifiques pour détecter des anomalies chromosomiques.
Quelles sont les techniques de biologie moléculaire ciblée mentionnées ?
MLPA, qPCR, QMPSF, PCR digitale
Utilisées pour des analyses plus précises des CNV.
Qu’est-ce que le NGS ?
NGS (panels, exome, génome)
Permet une analyse approfondie des variations génétiques.
Comment classifie-t-on les délétion selon leur localisation chromosomique ?
Interstitiel : 2 points de cassure, Terminal ou Télomérique : un point de cassure
Exemple : Syndrome de Williams et délétion 22q11.21.
Quelle est la distinction entre délétion simple et complexe ?
Simple : 1-2 points de cassure, complexe : >2 points de cassure
La complexité peut influencer le phénotype et les conséquences cliniques.
Qu’est-ce que la chromoanagenesis ?
Réarrangement complexe résultant d’un seul événement catastrophique
Peut entraîner des phénotypes sévères.
Qu’est-ce que la chromothripsis ?
Impliquent des chromosomes différents, réarrangement neutre, parfois délétion
Mécanisme associé à des événements catastrophiques dans la cellule.
Quel est le rôle des LCR dans les points de cassure récurrents ?
Les LCR (Low Copy Repeat) sont des séquences d’ADN qui favorisent la recombinaison non allélique
Risque élevé de NAHR (Non allelic Homologous Recombination).
Que signifie NHEJ ?
Non Homologous End Joining : mécanisme de réparation des cassures double brin de l’ADN
Implique l’absence d’homologie de séquence.
Qu’est-ce que le dosage génique ?
Effet de la quantité de gènes sur l’expression des protéines
Tous les gènes ne sont pas sensibles à l’effet de dosage génique.
Quel est l’effet de position dans le contexte des CNV ?
Suppression d’un régulateur : dérégulation de l’expression du gène qui n’est pas délété
Peut conduire à des pathologies variées.
Qu’est-ce que le syndrome des gènes contigus ?
Syndrome où plusieurs gènes contigus sont affectés par une délétion ou duplication
Exemple : Syndrome de Wolf-Hirschhorn.
Quelles sont les conséquences des microdélétions ?
Interruption de gène, fusion de gènes, perte de fonction
Peut entraîner des phénotypes variés en fonction des gènes impliqués.
Quel est le lien entre génotype et phénotype ?
Corrélation génotype-phénotype reste un outil important de compréhension et d’interprétation
Utilisé même à l’ère du Genotype First.
