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master > ARN régulateur > Flashcards

ARN régulateur Flashcards

1
Q

A quoi servent les ARN non codant ?

A

Regulation

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Q

Quelle est la différence principale entre les ARN codants et non codants ?

A

Les ARN codants sont traduits en protéines, alors que les ARN non codants régulent divers processus sans être traduits.

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Q

Quelles caractéristiques permet de classer les ARN non codants en différentes catégories ?

A

Leur longueur, localisation et/ou fonction.

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4
Q

Quels types d’ARN sont impliqués dans la synthèse des protéines ?

A

rRNAs (ARN ribosomiques) et tRNAs (ARN de transfert).

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Q

Quel critère distingue les longs ARN non codants (long ncRNA) des petits ARN non codants (small ncRNA) ?

A

Leur taille.
Les long ncRNA **≥ 200 **nucléotides et les small ncRNA < 200 nucléotides.

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6
Q

En combien de grandes catégories sont divisés les ARN

A

ARN codants et ARN non codants.

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7
Q

Quels types d’ARN appartiennent à la catégorie des ARN codants ?

A

mRNAs (ARN messagers).

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8
Q

Quels types d’ARN appartiennent à la catégorie des ARN non codants ?

A

rRNAs,** t**RNAs, **longs **ARN non codants et petits ARN non codants.

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9
Q

Quel ARN est impliqué dans l’expression des protéines ?

A

mRNAs (ARN messagers).

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10
Q

Quelle est la fonction des rRNAs et des tRNAs ?

A

Synthèse des protéines.

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11
Q

A quoi servent les longs ARN non codants

A

régule la structure de la chromatine et la transcription
regulation **post transcriptionelle **

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12
Q

Quels sont les 5 types d’ARN présents dans les petits ARN non codants (small ncRNAs) ?

A

microRNAs (miRNAs)
small interfering RNAs (siRNAs)
small nucleolar RNAs (snoRNAs)
small nuclear RNAs (snRNAs)
PIWI-interacting RNAs (piRNAs).

Mimi Si Snoopy Sonne le Piano

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13
Q

Fonction de miRNAs?

A

régule spécifiquement les mRNAs cibles

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14
Q

Fonction de siRNAs

A

silence post-transcriptionnel

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15
Q

Fonction des snoRNAs ?

A

Modifications chimiques des autres ARN.

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16
Q

Fonction snRNAs

A

maturation des ARN

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17
Q

fonction des piRNAs ?

A

Silence des transposons pendant le développement des cellules germinales

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18
Q

Quel type de séquence est nécessaire pour que le “silencing” fonctionne ?

A

Une séquence d’ARN

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19
Q

Où se déroule le mécanisme d’ARN interférence dans la cellule ?

A

cytoplasme

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20
Q

Un ARN immature peut-il fonctionner dans le mécanisme d’interférence ?

A

Non, seule une séquence d’ARN mature et fonctionnelle peut participer au mécanisme d’interférence.

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21
Q

Quelle quantité d’ARN double brin est nécessaire pour déclencher le mécanisme d’interférence ?

A

Quelques molécules d’ARN double brin suffisent pour activer le processus d’interférence.

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22
Q

siRNA
décrire les étapes du mécanisme d’interférence ARN impliquant Dicer et le complexe RISC.

A

Dicer clive le dsRNA pour **produire des siRNA.
Les siRNA s’incorporent dans le complexe RISC et seul le brin antisens est retenu.
Le brin antisens guide le RISC vers l’ARNm cible** grâce à la complémentarité de séquence.
Enfin, RISC clive l’ARNm cible, **bloquant sa traduction **et inhibant l’expression génique.

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23
Q

Quel est le rôle de l’enzyme Dicer dans le mécanisme d’interférence ARN ?

A

Dicer est une **RNase III **qui clive l’ARN double brin (dsRNA) en fragments courts appelés siRNA

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24
Q

Quelle est la taille des fragments d’ARN produits après l’action de Dicer ?

A

Les siRNA produits ont une taille de 21-25 nucléotides.

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25
Q

Pourquoi parle-t-on d’une “coupure asymétrique” lors du clivage du dsRNA ?

A

La coupure asymétrique signifie que chaque siRNA présente 2-3 nucléotides libres en 3’, ce qui donne une structure caractéristique.

26
Q

Que signifie l’acronyme RISC ?

A

RNA-Induced Silencing Complex

27
Q

Quelle protéine du complexe RISC est responsable du clivage de l’ARNm cible ?

A

La protéine Ago2 (Argonaute 2)

28
Q

Pourquoi le brin antisens est-il retenu dans le complexe RISC ?

A

Le brin antisens (guide) est retenu car il est complémentaire à l’ARNm cible, ce qui permet au complexe RISC de reconnaître spécifiquement cet ARNm.

29
Q

Quel est le rôle de la protéine TRBP dans le complexe RISC ?

A

TRBP est un cofacteur qui stabilise le complexe RISC et influence la cinétique et la position du clivage.

30
Q

Comment le complexe RISC reconnaît-il spécifiquement l’ARNm cible ?

A

Le complexe RISC reconnaît l’ARNm cible grâce à la complémentarité de séquence entre le brin antisens du siRNA et l’ARNm.

31
Q

Pourquoi parle-t-on de “silencing” dans ce processus ?

A

On parle de “silencing” car ce mécanisme conduit à la répression de l’expression génique en empêchant la traduction des ARNm ciblés.

32
Q

Quelle est la méthode la plus efficace pour inhiber l’expression d’un gène et comprendre sa fonction ?

A

L’ARN interférence (ARNi).

33
Q

Pourquoi l’ARNi est-elle efficace dans toute cellule ou tout organisme ?

A

Parce qu’elle utilise la machinerie cellulaire existante pour agir.

34
Q

Quel type d’applications l’ARNi permet-il de développer ?

A

développer de nouvelles cibles thérapeutiques.

35
Q

Explique

A
36
Q

Comment est produit le shRNA et quel est son devenir ?

A

Le shRNA est produit à partir de plasmides.
Il forme une structure en épingle à cheveux, qui est clivée par Dicer pour produire des** siRNA actifs.**

37
Q

Quelle est la différence principale entre les siRNA et les miRNA ?

A

Les siRNA sont synthétisés chimiquement et utilisés pour induire la dégradation des ARN messagers, tandis que les miRNA sont des ARN endogènes produits naturellement par la cellule et impliqués dans la régulation de l’expression génique.

38
Q

Quel type de précurseur est directement fonctionnel pour l’interférence ARN ?

A

siRNA

39
Q

Quelle étape transforme les miRNA en siRNA actifs ?

A

Le clivage par Dicer

40
Q

entre siRNA, shRNA,miRNA lequel est un précurseur inddirect

A

shRNA,miRNA

41
Q

Combien de siRNA faut-il choisir pour cibler un gène ?

A

au moins 3 siRNA

42
Q

comment bien choisir une séquence siRNA dispo dans le commerce ?

A
  • séq de 21 nt avec de bons critères
  • séquence spécifique du gène à **cibler (BLAST**)
  • commander la séquence et son contrôle
43
Q

Quelles techniques permettent de mesurer l’effet RNAi au niveau de l**’ARNm **?

A

**Northern blot **et la RT-PCR.

44
Q

Quelles techniques peuvent être utilisées pour évaluer l’effet de RNAi au niveau de la protéine ?

A

Western Blot
immunofluorescence
cytométrie en flux
des tests phénotypiques ou fonctionnels

45
Q

Quelles sont les étapes nécessaires pour rendre un gène silencieux grâce à l’ARNsh ?

A

Le shRNA en résultant est exporté du noyau par l’exportine 5.
Ce produit est ensuite pris en charge par Dicer et chargé dans le complexe RISC (RNA-induced silencing complex).
Le** brin sens** (brin passager) est dégradé. Le brin anti-sens (brin guide) dirige le complexe RISC vers les ARNm possédant une séquence complémentaire.
Dans le cas d’une complémentarité parfaite, RISC clive l’ARNm. Dans le cas d’un appariement incomplet, RISC réprime seulement la **traduction de l’ARNm. Dans les deux cas le shRNA entraîne l’xetinction du gène ciblé.**

46
Q

Donne les différences entre miRNA et siRNA

A

miRNA: synthetisé dans le noyau vs siRNA dans le cyto
miRNA: possède une boucle alors que siRNA non

47
Q

Quelle est la taille approximative des microARN ?

A

Environ 20 nucléotides.

48
Q

À quel niveau les microARN contrôlent-ils l’expression génique ?

A

Au niveau post-transcriptionnel.

49
Q

Quels sont les deux mécanismes d’action des microARN sur leurs cibles ?

A

Répression de la traduction des protéines cibles.
**Clivage de l’ARNm **cible en cas de forte complémentarité.

50
Q

Les siRNA et miRNA sont-ils complémentaires à leurs cibles ? Quelle est la différence ?

A

Les siRNA sont totalement complémentaires à leur cible.
Les miRNA sont partiellement complémentaires à leur cible.

51
Q

Quel ARN est capable de cibler spécifiquement un seul type d’ARNm ?
Quel ARn une centaine en une fois ?

A
52
Q

compare siRNA miRNA

A
53
Q

Par quelle enzyme les lncRNA sont-ils transcrits ?

A

ARN polymérase II

54
Q

Quels sont les rôles connus des lncRNA dans la cellule ?

A

Régulation de l’expression génique
Remodelage de la chromatine
Guidage des facteurs de transcription

55
Q

Comment les IncRNA peuvent-ils intéragir avec les miRNA ?

A

Les lncRNA peuvent séquestrer les miRNA, empêchant ainsi leur interaction avec leurs cibles d’ARNm.

56
Q

Les siARN sont efficaces pour cibler les transcrits nucléaires ? v ou f

A

FAUX
Les siARN agissent principalement dans le cytoplasme et ont une faible capacité à pénétrer dans le noyau.

57
Q

Qu’est-ce qu’un LNA (Locked Nucleic Acid) et quel est son avantage ?

A

base modifiée qui offre une meilleure stabilité et **résistance **aux nucléases

58
Q

Explique une méthode pour étudier la perte de fonction des lncRNA et leur rôle dans la régulation génétique ?

A

Le schéma montre qu’en utilisant des GapmeRs pour cibler un lncRNA spécifique (DNM3OS) :

L’ARN cible est dégradé grâce au recrutement de RNase H.
Cela interrompt la production des microARN dérivés de ce lncRNA.
Cette inhibition a un effet en cascade sur l’expression génique, car ces microARN ne peuvent plus réguler leurs ARNm cibles.

59
Q

Quelle est la molécule clé qui stimule l’activation des fibroblastes en myofibroblastes.

A

TGF-B

60
Q

Qui suis-je ?
Un marqueur moléculaire caractéristique des myofibroblastes. Il leur confère des propriétés contractiles, contribuant à la rétraction tissulaire.

A

α-SMA
(α- smooth muscle actin)

61
Q

dans un contexte de fibrose pulmonaire dans quelles cellules DNM3OS est -il présent ?

A

dans les fibroblastes

62
Q
A

master (3 decks)

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