SUMBER PROTEIN: DENATURASI DAN IMPLIKASINYA PART 2 Flashcards
Glutation
– suatu antioksidan
Menentukan struktur primer polipetida atau protein
* Langkah pertama adalah mereduksi jembatan disulfida untuk mendapatkan
rantai polipeptida tunggal.
* Zat pereduksi yang umum digunakan adalah …
* Reaksi gugus tiol protein dengan asam iodoasetat mencegah pembentukan
kembali jembatan disulfida akibat ….
Ketika mereduksi jembatan disulfida, 2-merkaptoetanol dioksidasi menjadi …
2-merkaptoetanol, oksidasi
disulfida
Menentukan jumlah dan jenis asam amino
1. Sampel polipeptida dilarutkan dalam … dan dipanaskan pada …
selama ….
2. Perlakuan ini menghidrolisis semua ikatan amida pada polipeptida,
termasuk ikatan amida pada rantai samping asparagin dan glutamin.
Polipeptida + 6M HCL > Asam amino (lalu dianlisis amino acid analyzer )
Suhu 100 °C (selama 24 jam)
> Dengan menentukan … dari polipeptida
> Bisa juga dengan …
> Dengan amino acid sequencer
- HCl 6 M, 100 °C, 24 jam
>N terminal dan C terminal
>Edman’s reagent.
Struktur sekunder polipeptida
1. … > protein pada wool dan otot (bisa direntang)
2. … > serat sutra dan rumah laba-laba
- Ulir alfa ( α-helix)
- Lembar beta (β-sheet)
Struktur tersier
1. Meningkatkan … protein
2. Meliputi ikatan ….
3. Bisa terjadi antara kelompok …
- stabilitas
- disulfida, ikatan
hidrogen, gaya tarik elektrostatik
(antara muatan yang berlawanan),
dan interaksi hidrofobik - peptida, antara kelompok rantai
samping, dan antara peptida dan
kelompok rantai samping.
Struktur Kuartener
1. Beberapa protein memiliki lebih
dari satu rantai polipeptida. Setiap
rantai polipeptida disebut ….
2. Protein dengan subunit tunggal
disebut monomer; protein dengan
dua subunit dimer; protein dengan tiga subunit trimer; dan protein dengan empat subunit tetramer.
3. Struktur kuaterner protein
menggambarkan ….
- subunit
- cara subunit
diatur sehubungan satu sama lain
Hemoglobin (tetramer)
Empat ikatan mendukung Struktur Kuartener
- Ikatan ion – antar rantai samping
asam amino - Ikatan hidrogen.
- Ikatan disulfida. Dua unit asam amino sistein dapat disatukan saat molekul protein terlipat.
- Gaya dispersi. Gaya dispersi muncul ketika atom yang biasanya nonpolar menjadi polar sesaat karena distribusi elektron yang tidak merata, yang mengarah ke dipol sesaat yang menginduksi pergeseran elektron di atom nonpolar tetangga.
Tahapan Struktur protein
- Primer (Amino acid recidu)
- Sekunder ( α-helix)
- Tersier (polipeptida chain)
- Quaterner (assembled subunit)
Denaturasi adalah penghancuran struktur … protein yang sangat
terorganisir. Kerusakan bentuk … protein akan menyebabkan
protein terdenaturasi. Karena interaksi ini lemah, protein ….
tersier, tiga dimensi, mudah
didenaturasi
Berikut ini adalah beberapa cara protein dapat didenaturasi:
1. Mengubah … mendenaturasi protein karena mengubah muatan pada banyak rantai
samping. Ini mengganggu daya tarik … dan ikatan ….
2. Reagen tertentu seperti … mendenaturasi protein
dengan membentuk ikatan … pada gugus protein yang lebih kuat daripada
ikatan hidrogen yang terbentuk antar gugus.
3. Pelarut … mengubah sifat protein dengan mengasosiasikan dengan kelompok nonpolar protein, sehingga mengganggu interaksi … normal.
4. Protein juga dapat didenaturasi oleh …. Keduanya meningkatkan
gerakan molekul, yang dapat mengganggu …. Contoh yang terkenal
adalah perubahan yang terjadi pada putih telur ketika dipanaskan atau dikocok.
- pH, elektrostatik, hidrogen
- urea dan guanidin hidroklorida, hidrogen
- organik, hidrofobik
- panas atau agitasi, gaya tarik menarik
Panas atau radiasi UV memasok energi kinetik ke
molekul protein, menyebabkan atomnya bergetar
lebih cepat dan mengganggu ikatan hidrogen dan
gaya dispersi yang relatif lemah.
Suhu di atas 50°C atau radiasi
ultraviolet (UV) x
Senyawa ini mampu terlibat dalam ikatan
hidrogen antarmolekul dengan molekul protein,
sehingga mengganggu ikatan hidrogen
intramolekul dalam protein.
Senyawa organik, seperti alkohol
Ion-ion ini membentuk ikatan kuat dengan anion
karboksilat dari asam amino yang asam atau
gugus SH dari sistein, sehingga mengganggu
ikatan ionik dan ikatan disulfida.
Garam atau ion logam berat, seperti
mercury, silver, dan timbal
Reagen ini bergabung dengan gugus amino
bermuatan positif dalam protein sehingga
mengganggu ikatan ionik.
Reagen alkaloid, seperti tannic acid
(untuk menyamak kulit)
Dapat mengubah muatan pada banyak rantai
samping. Ini mengganggu daya tarik elektrostatik
dan ikatan hidrogen.
Mengubah pH