KATALIS DAN PERAN ENZIM PADA REAKSI ORGANIK PART 2 Flashcards
Ketika substrat berikatan dengan sisi aktif, Zn2+ sebagian kompleks dengan … dari gugus karbonil amida yang akan dihidrolisis. Jadi, Zn2+ mempolarisasi rangkap karbon-oksigenikatan, membuat karbon karbonil lebih rentan terhadap … dan menstabilkan muatan … yang berkembang pada atom oksigen dalam keadaan transisi yang mengarah ke…
oksigen, adisi nukleofilik, negatif, intermediet tetrahedral.
meningkatkan elektrofilisitas gugus karbonil dan menstabilkan muatan negatif yang berkembang pada atom oksigen
Arg 127
Selain itu, Zn2+ kompleks dengan …, menjadikannya nukleofil yang lebih baik
air
katalis basa umum, yang semakin meningkatkan nukleofilisitas air
Glu 270
Pada langkah berikutnya, Glu 270 adalah katalis asam umum, meningkatkan kecenderungan …. Pada langkah terakhir reaksi, asam karboksilat … dan amina … karena amina merupakan basa yang lebih kuat daripada ionkarboksilat.
meninggalkan gugus amino, kehilangan proton, memperoleh proton
KESAMAAN DAN SPESIFITAS ENZIM
Tripsin, Kimotripsin, dan elastase adalah anggota dari kelompok endopeptidase yang dikenal secara kolektif sebagai … karena mengkatalisis …
protease serin, hidrolisis ikatan peptida protein
Struktur kantong panjang pada tripsin, kimotripsin, dan elastase menjelaskan
- Mengapa tripsin mengikat panjang
- asam amino bermuatan positif
- kimotripsin mengikat asam amino nonpolar datar
- Elastase hanya mengikat kecil asam amino
Informasi tentang mekanisme reaksi yang dikatalisis oleh enzim telah dikuatkan denngan model …, suatu teknik yang menggantikan …
mutagenesis spesifik lokasi, satu asam amino protein dengan yang lain.
SITE SPECIFIC MUTAGENESIS
Contoh, ketika Asp 102 dari kimotripsin diganti dengan Asn 102, kemampuan enzim untuk mengikat substrat tidak berubah, tetapi kemampuannya untuk mengkatalisis reaksi berkurang menjadi kurang dari 0.05% dari nilai enzim asli yang menunjukkan bahwa Asp 102 harus terlibat dalam proses katalitik. Karena perannya adalah
untuk memposisikan histidin dan menggunakan muatan negatifnya untuk menstabilkan muatan positifhistidin.
Reaksi yang dikatalisis enzim yang melibatkan dua reaksi SN2 berurutan
Kerja Lisozim
Lisozim adalah enzim yang menghancurkan … yang terdiri dari unit asam … berseling yang dihubungkan oleh ikatan …. Lisozim menghancurkan dinding sel dengan ….
dinding sel bakteri, N-asetilmuramat (NAM) dan N-asetilglukosamin (NAG), b- 1,4-glikosidik, mengkatalisis hidrolisisikatanNAM-NAG
Hubungan Reaksi enzim dengan pH
Pada enzim Lisozim, tingkat maksimum terjadi pada sekitar …. PH di mana enzim 50% aktif adalah … pada kaki kurva naik dan … pada kaki menurun. Nilai pH ini sesuai dengan nilai pka dari kelompok katalitik enzim.
pH 5,3 , 3,8 , 6,7
pKa yang ditunjukkan oleh kurva menaik adalah pKa dari grup yang aktif secara katalitik dalam bentuk …
pKa yang ditunjukkan oleh kurva menurun adalah pKa dari grup yang aktif secara katalitik dalam bentuk …
Basa, asam
Ketika gugus tersebut terprotonasi penuh (-pH=2)
enzim tidak aktif
Ketika pH meningkat, fraksi yang lebih besar dari kelompok hadir dalam bentuk … dan sebagai hasilnya enzim menunjukkan aktivitas yang …
basa, meningkat