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Biologie moléculaire > Suite de la réparation de l'ADN > Flashcards

Suite de la réparation de l'ADN Flashcards

1
Q

Quelles sont les 5 conditions pour que la recombinaison homologue ait lieu ?

A
  1. Alignement de 2 séquences présentant un haut niveau d’homologie
  2. Introduction d’une cassure dans l’ADN
  3. Appariement sur de courtes régions, l’invasion du brin
  4. Formation de la Jonction de Holliday et de la migration
  5. Clivage de la jonction de Holliday ou résolution
    VOIR DIAPO 7 : QUESTIONS EXAMEN!
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Q

Décrire le mécanisme de l’excision-réparation de base.

A

Mécanisme parfait

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3
Q

Décrire le mécanisme de l’excision-réparation de nucléotide.

A

Mécanisme parfait

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4
Q

Décrire le mécanisme de la photoréactivation.

A

Mécanisme parfait

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5
Q

Décrire le mécanisme de l’enlèvement d’un groupe méthyle.

A

Mécanisme parfait

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6
Q

Décrire le mécanisme de la jonction d’extrémités non homologues(NHEJ).

A

Mécanisme imparfait

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7
Q

Décrire le mécanisme de la translésion/SOS.

A

Mécanisme imparfait

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8
Q

Vrai ou faux.

Tous les organismes peuvent contenir des transposons.

A

Faux, seulement les organismes vivants

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9
Q

En quoi consiste l’insertion des transposons ?

A
  • Se fait sans spécificité

- Peut donc interrompe des gènes ou des séquences régulatrices

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10
Q

Quel est le pourcentage de génome humain qui est issu de transposons ?

A

50%

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11
Q

Qu’est-ce qu’un transposons ?

A
  • Élément d’ADN qui possède la capacité de changer de localisation dans le génome.
  • Source la plus commune de mutations
  • Pas réparable
  • Peuvent être autonomes ou non-autonomes
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12
Q

Qu’est-ce qu’un transposons autonome ?

A

Transposon qui possède tout le nécessaire pour effectuer sa propre transposition.

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13
Q

Qu’est-ce qu’un transposons non-autonome ?

A

Transposon qui ne possède que les séquences terminales nécessaire à la transposition et incapable de se déplacer.

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14
Q

Quels sont les 3 types de transposons ?

A
  1. Transposons à ADN
  2. D’origine virale
  3. Rétrotransposons de type poly-A
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15
Q

Vrai ou faux.
Après la transposition, il y une cicatrice sur le génome, ainsi il est possible de savoir s’il y avait un transposons même après la transposition.

A

Vrai

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16
Q

Quels sont les deux effets possibles lors d’un déplacement ?

A
  1. Déplacement sans duplication : Excision de l’ancien site et insertion dans le nouveau site
  2. Déplacement avec duplication : Copies de l’élément dans les sites ancien et nouveau.
17
Q

Qu’est-ce qu’un transposons à ADN ?

A
  • Contiennent un gène codant pour une transposase.
  • N’ont aucun intermédiaire d’ARN
  • Les répétitions contiennent le site de reconnaissance de la recombinase
  • Contiennent la transposase et parfois d’autres gènes
  • Encode sa propre transposase a de courtes séquences répétées
18
Q

Quel est le mécanisme de transposons d’ADN ?

A

Mécanisme de copié-collé

19
Q

En quoi consiste le mécanisme de copié-collé d’un transposon d’ADN ?

A
  • Transposon autonome.
  • Besoin de répétitions terminales inversées
    1. Liaison d’un multimère de transposase
    2. Coupure des deux brins de l’ADN (coupe 6 nucléotides au début et à la fin du transposon)
    3. Transposon excisé
    4. Transfert des brins de l’ADN
    5. Synthèse d’ADN réparatrice pour remplir les brèches
    6. Ligature des césure => Élément dans la nouvelle localisation.
    Voir diapo 15
20
Q

Comment se déplacent les transposons non autonomes ?

A

À l’aide d’une transposase d’un autre transposons.

21
Q

Qu’est-ce qu’un transposon d’origine virale ?

A
  • Les répétitions terminales sont plus longues
  • Ils codent pour deux protéines : Reverse transcriptase (RT) et integrase
  • Ont un intermédiaire d’ARN
  • Comme un virus mais ne peut quitter la cellule car n’a pas de protéine de capside
22
Q

Comment s’effectue le mécanisme de copié-collé d’un transposon d’origine virale?

A
  1. Transcription (Élément d’ARN)
  2. Transcription inverse
  3. Coupure des extrémités 3’ catalysée par l’intégrase
  4. Transfert des brins catalysé par l’intégrase.
  5. Réparation des brèches et ligature
    Voir diapo 18
23
Q

Qu’est-ce qu’un transposon de type Poly-A ?

A
  • Ressemblent à des gènes
  • Ont un poly-A à même le gène
  • Ont des séquences répétés au début et fin
  • Contiennent deux gènes : ORF1 et ORF2
  • Attaque un site riche en T
  • Code RT et intégrase.
24
Q

Quel est le rôle de ORF1 ?

A

Code pour une RNA-binding protein

25
Q

Quel est le rôle de ORF2?

A

Code pour une reverse transcriptase ayant une activité endonucléase.

26
Q

En quoi consiste le mécanisme de copié-collé pour les transposons de type Poly-A ?

A

ARN exporté dans le cytoplasme, les protéine RT et intégrase se lie à l’ARN et entre dans le noyau.

27
Q

Comment s’effectue le mécanisme de copié-collé pour les transposons de type Poly-A ?

A
  1. Transcription
  2. Traduction
  3. Protéine ORF1 et ORF2 se lient à l’ARNm LINE
  4. Liaison à l’ADN cible
  5. Coupure du site cible. Formation de l’hybride ARN-ADN
  6. Synthèse du premier brin de l’ADNc
  7. Dégradation de l’ARN et synthèse du deuxième brin
  8. Réparation et ligature de l’ADN.
    Voir diapo 20-21

Biologie moléculaire (6 decks)

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