Les enzymes coupant l'ADN Flashcards
Quels sont les deux types d’enzyme qui sont en mesure de couper l’ADN?
L’endonucléase et l’exonucléase.
En quoi consiste les enzymes endonucléases?
Enzymes capables de cliver les liaisons phosphodiester entre deux nucléotides à l’INTÉRIEUR d’une séquence d’acide nucléique.
En quoi consiste les enzymes exonucléases?
Enzymes qui dégradent la molécule d’ADN à partir d’une de ses extrémités (3’-OH ou 5’-P).
Nommez 4 généralités des enzymes de restriction.
1- Appartiennent à la classe des endonucléases
2-Utilisées en labo pour cliver l’ADN
3- La coupure de l’ADN se fait en un site spécifique reconnu par l’enzyme
4- Les séquences reconnues sont dites PALINDROMIQUES (4-10 paires de base)
Qu’est-ce qu’une séquence palindromique?
Ce sont des séquences dont la succession des nucléotides lue dans le sens 5’-3’ pour le 1er brin est identique à la séquence lue dans le sens 5’-3’ pour le 2e brin.
Vrai ou faux, les enzymes de restriction sont capables de cliver des ADN étrangers.
Vrai.
De quelle origine proviennent les enzymes de restriction?
Extraites de microorganismes (bactérie).
Lors que des enzymes de restriction sont retirées de la bactérie, qu’arrive-t-il?
Modification ou absence des sites de restriction correspondant à ces enzymes.
Nommez les 5 règles à suivre pour la nomenclature des enzymes de restriction.
1- 3 ou 4 lettres
2- 1er lettre majuscule (désigne le genre de la bactérie d’ou vient l’enzyme)
3-La 2e et 3e lettre en minuscule (espèce)
4- Des fois il peut avoir une 4e lettre en majuscule (souche)
5- Un chiffre romain (ordre de caractérisation)
Comment se nomme l’enzyme de restriction de Escherichia coli RYB (nomenclature)?
Eco RI.
Qu’est-ce qu’un isoschizomère?
Ce sont des enzymes de restriction différentes reconnaissant les mêmes sites spécifiques, mais ne laisse pas nécessairement les mêmes extrémités.
Vrai ou faux; Les isoschizomères ne laissent pas nécessairement les mêmes extrémités donc elles vont pouvoir s’assembler entre elles.
Faux, elles ne pourront pas s’assembler entre elles si leurs extrémités sont différentes. Exemple diapo 30.
Nommez les deux types de coupure réalisée par l’enzyme de restriction.
1- La coupure à bouts cohésifs
2- La coupure à bouts francs
En quoi consiste la coupure à bouts cohésifs?
Correspond à une coupure qui se fait de part et d’autre du centre de symétrie.
Vrai ou faux; Lors des coupures à bouts cohésifs, lorsque la flèche pointe du côté gauche de l’axe central, les protubérantes 5’ sont présentes.
Vrai. Exemple diapo 31
Vrai ou faux; Les extrémités de l’ADN sont 5’ protubérantes mais TOUJOURS cohésives.
Faux, les extrémités sont 3’ protubérantes mais toujours cohésives.
Qu’arrive-t-il si lors d’une coupure à bouts cohésifs, les flèches pointent directement au centre?
Cela signifie qu’il n’a pas de protubérantes.
En quoi consiste la coupure à bouts francs?
Coupure au milieu de la séquence palindromique.
Vrai ou faux; La coupure à bouts francs est cohésive.
Faux, elle est non-cohésive.
Comment les sites de restriction sont repérés dans l’ADN?
Par l’enzyme qui coupe autant de fois qu’il a de sites.
Une coupure se fait dans de positions différentes sur l’ADN. Cela dépend de quoi?
Dépend de l’enzyme choisie.
Vrai ou faux; Lorsque l’ADN est découpé, les fragments sont de tailles variés.
Vrai.
Qu’est-ce qu’une carte de restriction?
Représentent les molécules d’ADN avec les points de clivage (des sites) obtenus grâce à des enzymes de restriction. Diapo 35
Nommez les trois classes d’enzymes de restriction.
1- Type I
2-Type II
3-Type III
